Малая ядрышковая РНК R38 - Small nucleolar RNA R38

Малая ядрышковая РНК R38
RF00213.jpg
Идентификаторы
СимволsnoR38
РфамRF00213
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; CD-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

Малая ядрышковая РНК R38 это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК. snoRNA R38 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]snoRNA R38 была идентифицирована у человека, дрожжей,[2] Arabidopsis thaliana[3] и Oryza sativa.[4] snoRNA R38 управляет метилированием сайтов 2'-O-рибозы в 28S рРНК.

Рекомендации

  1. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Бачи, А .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–6668. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Bachellerie JP, Michot B, Nicoloso M, Balakin A, Ni J, Fournier MJ (1995). «Антисмысловые snoRNAs: семейство ядрышковых РНК с длинной комплементарностью к рРНК». Trends Biochem. Наука. 20 (7): 261–4. Дои:10.1016 / S0968-0004 (00) 89039-8. PMID  7667877.
  3. ^ Цюй Л.Х., Мэн К., Чжоу Х. и др. (2001). «Идентификация 10 новых кластеров гена snoRNA из Arabidopsis thaliana». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (7): 1623–30. Дои:10.1093 / nar / 29.7.1623. ЧВК  31268. PMID  11266566.
  4. ^ Чен К.Л., Лян Д., Чжоу Х., Чжо М., Чен Ю.К., Цюй Л.Х. (2003). «Высокое разнообразие snoRNA в растениях: идентификация и сравнительное исследование 120 генов snoRNA Oryza sativa». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (10): 2601–13. Дои:10.1093 / нар / gkg373. ЧВК  156054. PMID  12736310.

внешняя ссылка