Малая ядрышковая РНК SNORD50 - Small nucleolar RNA SNORD50

Малая ядрышковая РНК SNORD50
RF00278.jpg
Идентификаторы
СимволSNORD50
Альт. СимволыU50
РфамRF00278
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; CD-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

snoRNA U50 (также известен как SNORD50) это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.

snoRNA U50 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1][2]

U50 - это интронный Ген snoRNA расположен на хромосоме 6q15, в точке излома хромосомной транслокации t (3; 6) (q27; q15). Ген U50HG состоит из шести экзоны, чьи сплайсированные транскрипты имеют небольшой потенциал для кодирования белка, а его интроны продуцируют как U50, так и U50-подобные (U50 ') мяРНК, локализованные в ядрышках.[3] Есть свидетельства того, что паралоги U50 образуют новое семейство генов, контролирующих онкогенез и чувствительность к терапии рака.[4][5]

Рекомендации

  1. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Бачи, А .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–6668. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Поцелуй-Ласло, Z; Генри Y; Bachellerie JP; Caizergues-Ferrer M; Поцелуй Т (1996). «Сайт-специфическое метилирование рибозы прерибосомальной РНК: новая функция для малых ядрышковых РНК». Клетка. 85 (7): 1077–1088. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81308-2. PMID  8674114.
  3. ^ Tanaka, R; Satoh H; Moriyama M; Satoh K; Моришита Y; Yoshida S; Watanabe T; Накамура Y; Мори С (2000). «Ген-хозяин малой ядрышковой РНК (мяРНК) Intronic U50, не обладающий потенциалом кодирования белка, картирован в точке разрыва хромосомы t (3; 6) (q27; q15) В-клеточной лимфомы человека». Гены Клетки. 5 (4): 277–287. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2000.00325.x. PMID  10792466.
  4. ^ Муртада-Маарабуни M, Pickard MR, Hedge VL, Farzaneh F, Williams GT (октябрь 2008 г.). «GAS5, небелковая РНК, контролирует апоптоз и подавляется при раке груди». Онкоген. 28 (2): 195–208. Дои:10.1038 / onc.2008.373. PMID  18836484.
  5. ^ Донг XY, Го П, Бойд Дж. И др. (Август 2009 г.). «Влияние snoRNA U50 на рак груди человека». J Genet Genomics. 36 (8): 447–54. Дои:10.1016 / S1673-8527 (08) 60134-4. ЧВК  2854654. PMID  19683667.

внешняя ссылка