Малая ядрышковая РНК SNORD42 - Small nucleolar RNA SNORD42

Малая ядрышковая РНК SNORD42
RF00150.jpg
Идентификаторы
СимволSNORD42
Альт. СимволыU42
РфамRF00150
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; CD-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

snoRNA U42 (также известен как SNORD42) это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.

snoRNA U42 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат мотивы консервативных последовательностей, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства C / D-боксов действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1][2]

В геноме человека есть две близкородственные копии U42 (называемые U42A и U42B), обе расположены в пределах интроны из рибосомальный белок Ген L23a (RPL23a). Предполагается, что обе snoRNA направляют сайт-специфическое метилирование 2'O-рибозы 18S. рибосомная РНК (рРНК) остаток U116.[3]Мышь ортолог (MBII-287) также был идентифицирован.[4]

Рекомендации

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–8. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Поцелуй Т (апрель 2002 г.). «Малые ядрышковые РНК: многочисленная группа некодирующих РНК с разнообразными клеточными функциями». Клетка. 109 (2): 145–8. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00718-3. PMID  12007400.
  3. ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H / ACA и C / D box snoRNAs". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. Дои:10.1093 / nar / gkj002. ЧВК  1347365. PMID  16381836.
  4. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые, маленькие, не передающие РНК у мышей». Журнал EMBO. 20 (11): 2943–53. Дои:10.1093 / emboj / 20.11.2943. ЧВК  125495. PMID  11387227.

внешняя ссылка