Малая ядрышковая РНК SNORD43 - Small nucleolar RNA SNORD43
Малая ядрышковая РНК SNORD43 | |
---|---|
Предсказанный вторичная структура и сохранение последовательности из SNORD43 | |
Идентификаторы | |
Символ | SNORD43 |
Альт. Символы | U43 |
Рфам | RF00221 |
Прочие данные | |
РНК тип | Ген; мяРНК; snoRNA; CD-бокс |
Домен (ы) | Эукариоты |
ИДТИ | Термин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO: |
ТАК | ТАК: 0000593 |
PDB структуры | PDBe |
snoRNA U43 (также известен как SNORD43) это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.
snoRNA U43 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]
U43 закодирован в интрон 1 из рибосомальный белок Ген L3 у человека и коровы.[2] Три других мяРНК (U82, U83a и U83b) также кодируются одним и тем же геном-хозяином, но из разных интронов.[2] В Arabidopsis thaliana гомолог называется snoR41 в общедоступных базах данных последовательностей (Genbank). Гомолог риса экспрессируется из кластера, также содержащего snoR16.[3]
Предполагается, что U43 управляет метилированием 2'-O-рибозных остатков на 18S рибосомной РНК.[3]
Рекомендации
- ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–8. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК 134041. PMID 12215523.
- ^ а б Дуга С., Ассельта Р., Мальковати М., Тенчини М.Л., Рончи С., Симоник Т. (февраль 2000 г.). «Содержащий интрон ген рибосомного белка L3 (RPL3): анализ последовательности и идентификация U43 и двух новых интронных малых ядрышковых РНК». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1490 (3): 225–36. Дои:10.1016 / S0167-4781 (99) 00237-7. PMID 10684968.
- ^ а б Чен К.Л., Лян Д., Чжоу Х., Чжо М., Чен Ю.К., Цюй Л.Х. (май 2003 г.). «Высокое разнообразие snoRNA в растениях: идентификация и сравнительное исследование 120 генов snoRNA Oryza sativa». Исследования нуклеиновых кислот. 31 (10): 2601–13. Дои:10.1093 / нар / gkg373. ЧВК 156054. PMID 12736310.
внешняя ссылка
Этот молекулярный или же клеточная биология статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |