Малая ядрышковая РНК SNORD48 - Small nucleolar RNA SNORD48
Малая ядрышковая РНК SNORD48 | |
---|---|
Предсказанный вторичная структура и сохранение последовательности из SNORD48 | |
Идентификаторы | |
Символ | SNORD48 |
Альт. Символы | U48 |
Рфам | RF00282 |
Прочие данные | |
РНК тип | Ген; мяРНК; snoRNA; C / D-бокс |
Домен (ы) | Эукариоты |
ИДТИ | Термин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO: |
ТАК | ТАК: 0000593 |
PDB структуры | PDBe |
SNORD48 (также известен как U48) это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.
U48 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]
Эта snoRNA была первоначально клонирована из HeLa ячеек и экспериментально подтвержден северный блоттинг.[2] Предполагается, что SNORD48 управляет метилированием 2'O-рибозы 28S рРНК C2279.[3] В геноме человека эта мяРНК расположена в интроны того же гена-хозяина (C6orf48), что и другой C / D-бокс snoRNA U52 (также известный как SNORD52).[3]
Рекомендации
- ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–8. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК 134041. PMID 12215523.
- ^ Kiss-László Z, Henry Y, Bachellerie JP, Caizergues-Ferrer M, Kiss T (июнь 1996 г.). «Сайт-специфическое метилирование рибозы прерибосомальной РНК: новая функция для малых ядрышковых РНК». Клетка. 85 (7): 1077–88. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81308-2. PMID 8674114.
- ^ а б Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H / ACA и C / D box snoRNAs". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. Дои:10.1093 / nar / gkj002. ЧВК 1347365. PMID 16381836.
внешняя ссылка
- Страница для малых ядрышковых РНК SNORD48 в Рфам
- Запись для SNORD52 в snoRNABase
- Запись для SNORD48 в snoRNABase
Этот молекулярный или же клеточная биология статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |