Малая ядрышковая РНК SNORD18 - Small nucleolar RNA SNORD18

Малая ядрышковая РНК SNORD18
RF00093.jpg
Идентификаторы
СимволSNORD18
Альт. СимволыU18
РфамRF00093
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; CD-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

SNORD18 (также известен как U18) это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.

U18 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]

У людей и Xenopus laevis есть три тесно связанных копии U18 (называемые U18A, U18B, U18C), которые закодированы в интроны рибосомного белка L1.[2] У дрожжей U18 находится в интронах фактора элонгации 1 бета (EF1-бета). Родственные snoRNA в Arabidopsis thaliana и рис Oryza sativa получили названия R63 и Z106 соответственно. Факторы, участвующие в процессинге интронной мяРНК, недавно были выяснены.[3]

Рекомендации

  1. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Бачи, А .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–6668. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Prislei S, Michienzi A, Presutti C, Fragapane P, Bozzoni I (1993). «Две разные мяРНК кодируются в интронах генов рибосомных белков L1 амфибий и человека». Нуклеиновые кислоты Res. 21 (25): 5824–30. Дои:10.1093 / nar / 21.25.5824. ЧВК  310460. PMID  7507233.
  3. ^ Джорджи С., Фатика А., Нагель Р., Боззони I. (2001). «Высвобождение мяРНК U18 из интрона хозяина требует взаимодействия Nop1p с эндонуклеазой Rnt1p». EMBO J. 20 (23): 6856–65. Дои:10.1093 / emboj / 20.23.6856. ЧВК  125767. PMID  11726521.

внешняя ссылка