Малая ядрышковая РНК SNORD88 - Small nucleolar RNA SNORD88

Малая ядрышковая РНК SNORD88
RF00604.jpg
Идентификаторы
СимволSNORD88
РфамRF00604
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; C / D-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

Малоядерная РНК SNORD88 (также известный как HBII-180) является некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая участвует в биогенезе (модификации) других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.

SNORD88 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат мотивы бокса C (UGAUGA) и D (CUGA). Большинство членов семейства C / D-боксов действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]Эта snoRNA - человеческая ортолог мышиной snoRNA MBII-180.[2] SNORD88 также родственен мышиной snoRNA MBII-211. Предполагается, что SNORD88 управляет метилированием 2'O-рибозы 28S. рибосомная РНК (рРНК) остаток C3680.[3]

Есть свидетельства того, что SNORD88 перерабатывается на более мелкие фрагменты аналогично микроРНК и может подавлять экспрессию белка.[4][5]

Рекомендации

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–6668. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые, маленькие, не передающие РНК у мышей». Журнал EMBO. 20 (11): 2943–2953. Дои:10.1093 / emboj / 20.11.2943. ЧВК  125495. PMID  11387227.
  3. ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H / ACA и C / D box snoRNAs". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Выпуск базы данных): D158–162. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. Дои:10.1093 / nar / gkj002. ЧВК  1347365. PMID  16381836.
  4. ^ Оно М., Ямада К., Аволио Ф., Скотт М.С., ван Конингсбругген С., Бартон Г.Дж., Ламонд А.И. (май 2010 г.). «Анализ малых ядрышковых РНК человека (мяРНК) и разработка модулятора мяРНК векторов экспрессии генов». Молекулярная биология клетки. 21 (9): 1569–1584. Дои:10.1091 / mbc.E10-01-0078. ЧВК  2861615. PMID  20219969.
  5. ^ Оно М., Скотт М.С., Ямада К., Аволио Ф., Бартон Г.Дж., Ламонд А.И. (май 2011 г.). «Идентификация человеческих предшественников miRNA, которые напоминают box C / D snoRNAs». Исследования нуклеиновых кислот. 39 (9): 3879–3891. Дои:10.1093 / nar / gkq1355. ЧВК  3089480. PMID  21247878.

внешняя ссылка