Малая ядрышковая РНК SNORA79 - Small nucleolar RNA SNORA79

Малая ядрышковая РНК SNORA79
RF00600.jpg
Идентификаторы
СимволСНОРА79
РфамRF00600
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; H / ACA-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000594
PDB структурыPDBe

Малая ядрышковая РНК SNORA79 (также известный как ACA65) является некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая участвует в биогенезе (модификации) других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК находится в ядрышке эукариотический клетка, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (мяРНК).

SNORA79 был идентифицирован компьютерным скринингом, а его экспрессия у мышей экспериментально подтверждена с помощью Нозерн-блот и анализ удлинения праймера.[1]Он принадлежит к Коробка H / ACA класс snoRNAs, поскольку он имеет предсказанную структуру шпилька-шарнир-шпилька-хвост и консервативные мотивы H / ACA-box.[2]

SNORA79 предлагается для управления псевдоуридилированием остатка U31 в U6 мяРНК.[3]Псевдоуридилирование - это изомеризация нуклеозида уридин в другую изомерную форму псевдоуридин.

Рекомендации

  1. ^ Шаттнер П., Барберан-Солер С., Лоу TM (январь 2006 г.). «Вычислительный экран для определения псевдоуридилирования H / ACA РНК млекопитающих». РНК. 12 (1): 15–25. Дои:10.1261 / rna.2210406. ЧВК  1370881. PMID  16373490.
  2. ^ Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T (июль 2004 г.). "Human box H / ACA pseudouridylation guide RNA machinery". Молекулярная и клеточная биология. 24 (13): 5797–807. Дои:10.1128 / MCB.24.13.5797-5807.2004. ЧВК  480876. PMID  15199136.
  3. ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H / ACA и C / D box snoRNAs". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. Дои:10.1093 / nar / gkj002. ЧВК  1347365. PMID  16381836.

внешняя ссылка