Малая ядрышковая РНК SNORD93 - Small nucleolar RNA SNORD93
Малоядерная РНК SNORD93 | |
---|---|
Предсказанный вторичная структура и сохранение последовательности из SNORD93 | |
Идентификаторы | |
Символ | SNORD93 |
Рфам | RF00606 |
Прочие данные | |
РНК тип | Ген; мяРНК; snoRNA; C / D-бокс |
Домен (ы) | Эукариоты |
ИДТИ | Термин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO: |
ТАК | ТАК: 0000593 |
PDB структуры | PDBe |
Малоядерная РНК SNORD93 (также известный как HBII-336) является некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая участвует в биогенезе (модификации) других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.
SNORD93 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат мотивы бокса C (UGAUGA) и D (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1] Эта snoRNA - человеческая ортолог мышиной snoRNA MBII-336.[2]Предполагается, что SNORD93 управляет метилированием 2'O-рибозы 18S. рибосомная РНК (рРНК) остаток A576.[3]Кроме того, SNORD93 может быть преобразован в более мелкий микроРНК-подобный фрагмент (называемый РНК, производной от snoRNA (sdRNA)), который способствует злокачественному фенотипу рака молочной железы.[4]Было показано, что обработанный фрагмент (sdRNA-93) нацелен на Pipox, белок, связанный с метаболизмом саркозина, экспрессия которого значительно коррелирует с различными молекулярными подтипами рака груди.
Рекомендации
- ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–8. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК 134041. PMID 12215523.
- ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые, маленькие, не передающие РНК у мышей». Журнал EMBO. 20 (11): 2943–53. Дои:10.1093 / emboj / 20.11.2943. ЧВК 125495. PMID 11387227.
- ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H / ACA и C / D box snoRNAs". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. Дои:10.1093 / nar / gkj002. ЧВК 1347365. PMID 16381836.
- ^ Паттерсон Д.Г., Робертс Д.Т., Кинг В.М., Хаусрова Д., Барнхилл Е.К., Круселло А., Польска С.Дж., Брантли Л.В., Кауфман Г.С., Нгуен М., Сантана М.В., Шиллер И.А., Спиччиани Д.С., Сапата А.К., Миллер М.М., Шерман Т.Д., Ма Р. , Чжао Х., Арора Р., Коли А.Б., Зейдан М.М., Тан М., Си Й., Борхерт Г.М. (2017). «Человеческая snoRNA-93 преобразуется в микроРНК-подобную РНК, которая способствует инвазии клеток рака груди». NPJ рака груди. 3: 25. Дои:10.1038 / s41523-017-0032-8. ЧВК 5503938. PMID 28702505.
внешняя ссылка
Этот молекулярный или же клеточная биология статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |