Малая ядрышковая РНК SNORD111 - Small nucleolar RNA SNORD111

Малоядерная РНК SNORD111
RF00611.jpg
Идентификаторы
СимволSNORD111
РфамRF00611
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; C / D-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

Малоядерная РНК SNORD111 (также известный как HBII-82) является некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая участвует в биогенезе (модификации) других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.

SNORD111 принадлежит C / D коробка класс snoRNA, которые содержат мотивы бокса C (UGAUGA) и D (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]

Предполагается, что SNORD111 управляет метилированием 2'O-рибозы 28S. рибосомная РНК (рРНК) по остатку G3923.[2][3]

Однако точная роль этих молекул в настоящее время неизвестна.

Рекомендации

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–6668. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H / ACA и C / D box snoRNAs". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Выпуск базы данных): D158–162. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. Дои:10.1093 / nar / gkj002. ЧВК  1347365. PMID  16381836.
  3. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые, маленькие, не передающие РНК у мышей». Журнал EMBO. 20 (11): 2943–2953. Дои:10.1093 / emboj / 20.11.2943. ЧВК  125495. PMID  11387227.

внешняя ссылка