Малая ядрышковая РНК SNORD32 - Small nucleolar RNA SNORD32

Малая ядрышковая РНК SNORD32
SNORD32
Идентификаторы
СимволSNORD32
РфамRF00219
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; гид; CD-бокс;
PDB структурыPDBe

snoRNA U32 (также известен как SNORD32) это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.

snoRNA U32 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]

U32 кодируется внутри интрона 2 рибосомальный белок Ген L13 у человека и мыши[2] и предсказано, что он управляет метилированием 2'O-рибозы как 18S рибосомная РНК (рРНК) остаток G1328 и остаток 28S рРНК A1511.[2][3] U32A имеет один и тот же ген-хозяин с C / D box snoRNAs U33, U34 и U35A (RPL13A).[3]

Рекомендации

  1. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Бачи, А .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–6668. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ а б Nicoloso, M; Qu LH; Michot B; Бакалавр JP (1996). «Кодируемые интроном антисмысловые малые ядрышковые РНК: характеристика девяти новых видов указывает на их прямую роль в качестве проводников для 2'-O-рибозы метилирования рРНК». Дж Мол Биол. 260 (2): 178–195. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0391. PMID  8764399.
  3. ^ а б Лестрейд, Лоран; Вебер, Мишель Дж. (2006). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H / ACA и C / D box snoRNAs". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Приложение 1: Проблема с базой данных): D158 – D162. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. Дои:10.1093 / nar / gkj002. ЧВК  1347365. PMID  16381836.

внешняя ссылка