Малая ядрышковая РНК SNORD115 - Small nucleolar RNA SNORD115

Малая ядрышковая РНК SNORD115
RF00105.jpg
Идентификаторы
СимволSNORD115
Альт. СимволыsnoHBII-52; HBII-52
РфамRF00105
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; CD-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

SNORD115 (также известен как HBII-52) это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, известная как малая ядрышковая РНК который обычно управляет модификацией других некодирующие РНК. Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. HBII-52 относится к гену человека, тогда как RBII-52 используется для гена крысы, а MBII-52 используется для наименования гена мыши.

HBII-52 относится к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативная последовательность мотивы, известные как блок C (UGAUGA) и блок D (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]

В геноме человека HBII-52 кодируется тандемно повторяющимся массивом с другой C / D-бокс-мяРНК, HBII-85 (SNORD116), в Синдром Прадера-Вилли (PWS) регион хромосома 15.[2] Однако микроделеция в одном семействе snoRNA кластер HBII-52 исключил его из основной роли в заболевании.[3] HBII-52 обнаружен в 47 тандемных почти идентичных копиях на хромосоме 15q11-13 человека. Этот локус отпечатывается по материнской линии, что означает, что транскрибируется только отцовская копия локуса. HBII-52 экспрессируется исключительно в головном мозге, но отсутствует у пациентов с СПВ. HBII-52 не обладает значительной комплементарностью с рибосомные РНК, но имеет 18 нуклеотид область консервативной комплементарности к рецептор серотонина 2C мРНК.[4] Рецептор серотонина 2C также экспрессируется в головном мозге. Было показано, что эта snoRNA, вероятно, связывается с сайленсирующим элементом экзона Vb, увеличивая его включение и производство функциональной сплайс-формы рецептора серотонина 2C.

Хромосомный локус, содержащий кластер генов SNORD115, был дублирован у многих людей с аутичные черты.[5][6] Модель мыши, созданная так, чтобы дублировать кластер SNORD115, демонстрирует аутичное поведение.[7]

Есть данные, что усеченная форма MBII-52 (SNORD115, обнаруженная у мышей) регулирует альтернативный сплайсинг генов, кодирующих белок. DPM2, TAF1, RALGPS1, PBRM1, и CRHR1.[8]

Рекомендации

  1. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Бачи, А .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–6668. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Кавай Дж., Буитинг К., Кифманн М. и др. (2000). «Идентификация специфичных для мозга и импринтированных генов малых ядрышек РНК, демонстрирующих необычную геномную организацию». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (26): 14311–6. Bibcode:2000PNAS ... 9714311C. Дои:10.1073 / pnas.250426397. ЧВК  18915. PMID  11106375.
  3. ^ Рунте М., Варон Р., Хорн Д., Хорстхемке Б., Буйтинг К. (2005). «Исключение генного кластера HBII-52 C / D box snoRNA из основной роли в синдроме Прадера-Вилли». Hum Genet. 116 (3): 228–30. Дои:10.1007 / s00439-004-1219-2. PMID  15565282.
  4. ^ Кишор С., Штамм С. (январь 2006 г.). «SnoRNA HBII-52 регулирует альтернативный сплайсинг серотонинового рецептора 2C». Наука. 311 (5758): 230–2. Bibcode:2006Научный ... 311..230K. Дои:10.1126 / science.1118265. PMID  16357227.
  5. ^ Болтон П.Ф., Велтман М.В., Вайсблатт Э. и др. (Сентябрь 2004 г.). «Аномалии хромосомы 15q11-13 и другие заболевания у людей с расстройствами аутистического спектра». Психиатр. Genet. 14 (3): 131–7. Дои:10.1097/00041444-200409000-00002. PMID  15318025.
  6. ^ Cook EH, Scherer SW (октябрь 2008 г.). «Вариации числа копий, связанные с нервно-психическими расстройствами». Природа. 455 (7215): 919–23. Bibcode:2008Натура.455..919C. Дои:10.1038 / природа07458. PMID  18923514.
  7. ^ Накатани Дж., Тамада К., Хатанака Ф. и др. (Июнь 2009 г.). «Аномальное поведение в модели мыши, созданной с помощью хромосом, для дупликации человека 15q11-13, наблюдаемой при аутизме». Клетка. 137 (7): 1235–46. Дои:10.1016 / j.cell.2009.04.024. ЧВК  3710970. PMID  19563756.
  8. ^ Кишор С., Ханна А., Чжан З., Хуэй Дж., Бальвеж П.Дж., Стефан М., Бич С., Николлс Р.Д., Заволан М., Штамм С. (2010). «SnoRNA MBII-52 (SNORD 115) перерабатывается в более мелкие РНК и регулирует альтернативный сплайсинг». Хум Мол Генет. 19 (7): 1153–64. Дои:10.1093 / hmg / ddp585. ЧВК  2838533. PMID  20053671.

внешняя ссылка