Генетическая структура H5N1 - H5N1 genetic structure
Эта статья поднимает множество проблем. Пожалуйста помоги Улучши это или обсудите эти вопросы на страница обсуждения. (Узнайте, как и когда удалить эти сообщения-шаблоны) (Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения)
|
Генетическая структура H5N1 молекулярная структура H5N1 вирус РНК.
H5N1 - это Вирус гриппа А подтип. Эксперты считают, что он может мутировать в форму, которая легко передается от человека к человеку. Если такая мутация произойдет, она может остаться подтипом H5N1 или сместить подтипы, как это произошло. H2N2 когда он превратился в Гонконгский грипп напряжение H3N2.
H5N1 имеет мутировавший [1] через антигенный дрейф на десятки очень патогенный разновидностей, но все в настоящее время принадлежат генотип Z вируса птичьего гриппа H5N1. Генотип Z возник благодаря перегруппировка в 2002 году из ранее очень патогенный генотипы H5N1, впервые появившиеся в Китай в 1996 году в птицы И в Гонконг в 1997 г. в люди.[2] «Вирусы H5N1 от человеческих инфекций и близкородственные вирусы птиц, выделенные в 2004 и 2005 годах, принадлежат к одному генотипу, часто называемому генотипом Z». [1]
Это заражение людей совпало с эпизоотический (ан эпидемия у животных) гриппа H5N1 среди домашней птицы Гонконга. Вспышка этой панзоотической болезни (болезни, поражающей животных многих видов, особенно на обширных территориях) была остановлена за счет гибели всей популяции домашней птицы на территории. Название H5N1 относится к подтипам поверхности антигены присутствует на вирус: гемагглютинин тип 5 и нейраминидаза Тип 1.
Генотип Z H5N1 теперь является доминирующим генотипом H5N1. Генотип Z является эндемическим для птиц Юго-Восточной Азии и представляет собой долгосрочную угрозу пандемии.
Вирусы гриппа А иметь 11 генов на восьми отдельных РНК молекулы [1]:
- PB2 (полимераза базовый 2)
- PB1 (полимераза основная 1)
- PB1-F2 (альтернативная открытая рамка считывания около 5 'конца гена PB1)
- PA (полимеразная кислота)
- HA (гемагглютинин )
- НП (нуклеопротеин )
- NA (нейраминидаза )
- M1 и M2 (матрица)
- NS1 (неструктурный)
- NEP / NS2 (ядерный экспорт vRNP)
Двумя наиболее важными молекулами РНК являются HA и PB1. HA создает поверхностный антиген, который особенно важен для передаваемость. PB1 создает вирусная полимераза молекула, которая особенно важна в вирулентность.
ГА РНК молекула содержит ген HA, который кодирует гемагглютинин, что является антигенный гликопротеин найден на поверхности грипп вирусы и отвечает за привязку вируса к клетка что заражается. Гемагглютинин образует шипы на поверхности вирусов гриппа, которые прикрепляют вирусы к клетки. Это прикрепление требуется для эффективного переноса генов вируса гриппа в клетки, процесса, который может быть заблокирован антителами, связывающимися с белками гемагглютинина.
Одним из генетических факторов различения вирусов человеческого гриппа и вирусов птичьего гриппа является то, что HA птичьего гриппа связывает альфа 2-3 сиаловая кислота рецепторы, в то время как HA гриппа человека связывают альфа 2-6 рецепторы сиаловой кислоты. Вирусы свиного гриппа обладают способностью связывать оба типа рецепторов сиаловой кислоты. У людей есть рецепторы птичьего типа с очень низкой плотностью, а у цыплят есть рецепторы человеческого типа с очень низкой плотностью. Было обнаружено, что некоторые изоляты, взятые от инфицированного H5N1 человека, имеют мутации HA в положениях 182, 192, 223, 226 или 228, и было показано, что эти мутации влияют на избирательное связывание вируса с ранее упомянутыми сиаловой кислотой птиц и / или или рецепторы на поверхности клеток человека. Это типы мутаций, которые могут изменить птичий грипп вирус в пандемия гриппа вирус.
2008 г. вирулентность исследование, которое сочеталось в лаборатории и Птичий грипп H5N1 вирус, который циркулировал в Таиланд в 2004 году и человеческий грипп H3N2 вирус восстановлен в Вайоминг в 2003 г. произведено 63 вируса, представляющих различные потенциальные комбинации человеческого и птичьего вирус гриппа А гены. Каждый пятый был смертельным для мышей в малых дозах. Вирус, который наиболее близко соответствовал вирулентности H5N1, был вирусом с гемагглютинин (HA), нейраминидаза (NA) и молекулы РНК вируса птичьего гриппа PB1 с их генами в сочетании с оставшимися пятью молекулами РНК (PB2, PA, NP, M и NS) с их генами из вируса гриппа человека. Оба вируса из Пандемия 1957 года и Пандемия 1968 года несет ген PB1 вируса птичьего гриппа. Авторы предполагают, что получение гена PB1 вируса птичьего гриппа может быть важным шагом в потенциальной пандемия гриппа вирус, возникающий через перегруппировка."[3]
PB1 кодирует белок PB1 и белок PB1-F2. Белок PB1 является важным компонентом вирусная полимераза. Белок PB1-F2 кодируется альтернативной открытой рамкой считывания сегмента РНК PB1 и «взаимодействует с 2 компонентами комплекса пор перехода митохондриальной проницаемости, ANT3 и VDCA1, [сенсибилизируя] клетки к апоптоз. [...] PB1-F2, вероятно, способствует вирусной патогенности и может играть важную роль в определении степени тяжести пандемического гриппа ».[4] Это было обнаружено Ченом. и другие. и сообщается в Природа.[5] «После сравнения вирусов, вызванных вспышкой H5N1 в Гонконге в 1997 году, в последовательности PB1-F2 в положении 66 было обнаружено одно аминокислотное изменение (N66S), которое коррелировало с патогенностью. Такое же аминокислотное изменение (N66S) было также обнаружено в PB1- Белок F2 пандемического вируса A / Brevig Mission / 18 1918 г. »[6]
Терминология
В Ортомиксовирус семья состоит из 5 родов: Грипп А, Грипп B, Грипп C, Isavirus, и Тоготовирус.
«РНК-вирусы» включают «вирусы оцРНК с отрицательным смыслом», которые включают семейство «Orthomyxoviridae», которое включает пять родов, классифицируемых по вариациям в нуклеопротеин (NP и M) антигены. Одним из них является род «Influenzavirus A», который состоит из одного вида под названием «Вирус гриппа А "; один из его подтипов - H5N1.
H5N1 (как и другие вирусы птичьего гриппа) имеет штаммы, которые называются «высокопатогенными» (HP) и «низкопатогенными» (LP). Вирусы птичьего гриппа, вызывающие HPAI, очень ядовитый, и уровень смертности инфицированных стаи часто приближаются к 100%. Вирусы LPAI обычно имеют более низкую вирулентность, но эти вирусы могут служить предшественниками вирусов HPAI. Нынешний штамм H5N1, ответственный за гибель домашних птиц в Азии, представляет собой штамм HPAI; другие штаммы H5N1, встречающиеся в других странах мира, менее вирулентны и поэтому классифицируются как штаммы LPAI. Все штаммы HPAI, идентифицированные на сегодняшний день, включают подтипы H5 и H7. Различие касается патогенности у домашней птицы, а не у человека. Обычно высокопатогенный птичий вирус не является высокопатогенным ни для людей, ни для птиц, не относящихся к домашней птице. Этот нынешний штамм H5N1 необычен тем, что является смертельным для многих видов.
И «грипп» (означает грипп), и «А» (означает вид типа А) могут использоваться как прилагательные к существительному «вирус», что приводит к существительной фразе «вирус гриппа А»; которое с заглавной буквы является существительным собственным Вирус гриппа А название вида существительная фраза также относится к.
Контекст
- Вирус
А вирус один из видов микроскопических паразит который заражает клетки в биологических организмах.
- Ортомиксовирусы
В Ортомиксовирусы семья РНК-вирусы которые заражают позвоночных. В него входят те вирусы что вызывает грипп. Вирусы этого семейства содержат от 7 до 8 сегментов линейного одноцепочечного отрицательного смысла. РНК.
- Вирус гриппа
«Вирус гриппа» относится к подгруппе Ортомиксовирусы которые создают грипп. Этот таксономический категория не основана на филогенетика.
- Вирус гриппа А
Вирусы гриппа А имеют 10 гены на восьми отдельных молекулах РНК, которые по причинам, указанным выше, названы PB2, PB1, PA, HA, NP, NA, M и NS. HA, NA и M уточнить структура белков, которые являются наиболее важными с медицинской точки зрения мишенями для противовирусных препаратов и антитела. (Одиннадцатый недавно открытый ген под названием PB1-F2 иногда создает белок, но отсутствует в некоторых изолятах вируса гриппа.[5]) Это сегментация гриппа геном облегчает генетическая рекомбинация путем пересортировки сегментов у хозяев, инфицированных одновременно двумя разными вирусами гриппа.[1] Вирус гриппа A - единственный вид в Грипп А род семьи Ортомиксовирусы и имеют отрицательный смысл, одноцепочечные, сегментированные РНК-вирусы.
«РНК-полимераза вируса гриппа представляет собой многофункциональный комплекс, состоящий из трех вирусных белков PB1, PB2 и PA, которые вместе с вирусным нуклеопротеином NP образуют минимальный комплемент, необходимый для синтеза и репликации вирусной мРНК». [7]
Поверхностные кодирующие генные сегменты
- Поверхность антиген кодирующие сегменты гена (молекула РНК): (HA, NA)
- Коды HA для гемагглютинин который является антигенный гликопротеин найден на поверхности грипп вирусы и отвечает за привязку вируса к клетка что заражается. Гемагглютинин образует шипы на поверхности вирусов гриппа, которые прикрепляют вирусы к клетки. Это прикрепление требуется для эффективного переноса генов вируса гриппа в клетки, процесса, который может быть заблокирован антителами, связывающимися с белками гемагглютинина. Одним из генетических факторов различения вирусов человеческого гриппа и вирусов птичьего гриппа является то, что «HA птичьего гриппа связывает альфа-2-3. сиаловая кислота рецепторы, в то время как HA гриппа человека связывают альфа 2-6 рецепторы сиаловой кислоты. Вирусы свиного гриппа обладают способностью связывать оба типа рецепторов сиаловой кислоты ». [8] Мутация обнаружена в индюк в 2006 г. "включает замену в одном образце аминокислоты в положении 223 гемоагглютинин рецепторный белок. Этот белок позволяет вирусу гриппа связываться с рецепторами на поверхности клеток-хозяев. Ранее эта мутация наблюдалась дважды - у отца и сына в Гонконг в 2003 году, и в одном смертельном случае в Вьетнам прошедший год. Это увеличивает способность вируса связываться с человеческими рецепторами и снижает его сродство к рецепторам домашней птицы, что делает штаммы с этой мутацией более приспособленными к заражению людей ». Другая мутация в том же образце в положении 153 имеет еще неизвестные эффекты.[9] «Аминокислотные остатки в положениях 226 и 228 рецепторного связывающего кармана НА, по-видимому, определяют сродство связывания с рецепторами клеточной поверхности и влияют на селективное связывание вируса с птичьим (сиаловая кислота -2,3-NeuAcGal) или человеком (сиаловая кислота -2,3-NeuAcGal). acid -2,6-NeuAcGal) рецепторов на поверхности клетки. Человеческие изоляты A / HK / 212/03 и A / HK / 213/03 сохраняют сигнатуру, связанную со связыванием с птичьим рецептором, но имеют уникальную аминокислотную замену (Ser227Ile) внутри рецепторного связывающего кармана, которого не было даже у близкородственного вируса A / Gs / HK / 739.2 / 02 (генотип Z +) ».[10] Недавние исследования показывают, что у людей есть рецепторы птичьего типа с очень низкой плотностью, а у цыплят есть рецепторы человеческого типа с очень низкой плотностью.[11] Исследователи «обнаружили, что мутации в двух местах гена, идентифицированных как 182 и 192, позволяют вирусу связываться как с птичьими, так и с человеческими рецепторами».[12][13] См. Исследовательские статьи Ограничение диапазона хозяев и патогенность в контексте пандемии гриппа (Центры по контролю и профилактике заболеваний, 2006 г.) (Габриэле Нойманн и Ёсихиро Каваока) и Структура и рецепторная специфичность гемагглютинина вируса гриппа H5N1 (Американская ассоциация развития науки, 2006 г.) (Джеймс Стивенс, Ола Бликст, Терренс М. Тампи, Джеффри К. Таубенбергер, Джеймс К. Полсон, Ян А. Уилсон) для получения дополнительных сведений.
- Коды NA для нейраминидаза который является антигенный гликопротеин фермент найден на поверхности грипп вирусы. Это помогает высвобождать потомство вирусов из инфицированных клеток. Препараты от гриппа Тамифлю и Реленза действуют, подавляя некоторые штаммы нейраминидаза. Они были разработаны на базе N2 и N9. «В форме белка N1 небольшой сегмент, называемый 150-петлей, перевернут, создавая полый карман, которого нет в белках N2 и N9. [...] Когда исследователи посмотрели, как существующие лекарства взаимодействуют с белка N1, они обнаружили, что в присутствии ингибиторов нейраминидазы петля меняет свою конформацию на конформацию, аналогичную конформации белков N2 и N9 ».[14]
Внутренние кодирующие генные сегменты
- Внутренний вирусный белок, кодирующий генные сегменты (молекула РНК): (M, NP, NS, PA, PB1, PB2) [15]
Матрица, кодирующая генные сегменты
- M кодирует матричные белки (M1 и M2), которые вместе с двумя поверхностными белками (гемагглютинин и нейраминидаза ), составляют капсид (защитная оболочка) вируса. Он кодируется с использованием разных рамок считывания из одного и того же сегмента РНК.
- M1 представляет собой белок, связывающийся с вирусной РНК.
- M2 представляет собой белок, который снимает оболочку вируса, тем самым подвергая его содержимое (восемь сегментов РНК) цитоплазме клетки-хозяина. М2 трансмембранный белок является ионный канал требуется для эффективного заражения.[16] Аминокислотная замена (Ser31Asn) в M2 некоторых генотипов H5N1 связана с устойчивостью к амантадину.[17]
Нуклеопротеин, кодирующий генные сегменты.
- Коды NP для нуклеопротеин.
- NS: NS кодирует два неструктурных белка (NS1 и NS2 - ранее называвшиеся Нэп ). «[T] он патогенность вируса гриппа была связана с неструктурным (NS) геном вируса H5N1 / 97».[18]
- NS1: неструктурный: ядро; влияние на клеточный транспорт РНК, сплайсинг, трансляцию. Белок антиинтерферона.[19] NS1 высокопатогенного птичьего вируса H5N1, циркулирующего у домашних птиц и водоплавающих птиц в Юго-Восточной Азии, может быть ответственным за усиление провоспалительного цитокин ответ (особенно TNFa ), индуцированные этими вирусами у человека макрофаги ".[4] H5N1 NS1 характеризуется одной заменой аминокислоты в положении 92. Заменив аминокислоту с глутаминовой кислоты на аспарагиновую кислоту, исследователи смогли отменить действие NS1 H5N1. [Это] изменение одной аминокислоты в гене NS1 значительно увеличило патогенность вируса гриппа H5N1 ». [20]
- NEP: «ядерный экспортный белок (NEP, ранее называвшийся белком NS2) опосредует экспорт vRNP ".[21]
Генные сегменты, кодирующие полимеразу
- Коды PA для Белок PA который является важным компонентом вирусная полимераза.
- Коды PB1 для Белок PB1 и Белок PB1-F2.
- Белок PB1 является важным компонентом вирусная полимераза.
- Белок PB1-F2 кодируется альтернативной открытой рамкой считывания сегмента РНК PB1 и «взаимодействует с 2 компонентами комплекса пор перехода митохондриальной проницаемости, ANT3 и VDCA1, [сенсибилизируя] клетки к апоптоз. [...] PB1-F2, вероятно, способствует вирусной патогенности и может играть важную роль в определении степени тяжести пандемического гриппа ».[4] Это было обнаружено Ченом. и другие. и сообщается в Природа.[5] «После сравнения вирусов, вызванных вспышкой H5N1 в Гонконге в 1997 году, в последовательности PB1-F2 в положении 66 было обнаружено одно аминокислотное изменение (N66S), которое коррелировало с патогенностью. Такое же аминокислотное изменение (N66S) было также обнаружено в PB1- Белок F2 пандемического вируса A / Brevig Mission / 18 1918 г. »[6]
- Коды PB2 для Белок PB2 который является важным компонентом вирусная полимераза. По состоянию на 2005 год 75% изолятов человеческого вируса H5N1 из Вьетнама имели мутацию, состоящую из лизина по остатку 627 в белке PB2; который, как полагают, вызывает высокий уровень вирулентности.[22] До H5N1 все известные вирусы птичьего гриппа имели Glu в положении 627, в то время как все вирусы гриппа человека имели лизин. По состоянию на 2007 год: «Появление 3 (или более) подсистем из EMA [EMA =Eуропе Mхолостой Восток Аfrica] clade открывает множество новых возможностей для развития птичьего гриппа (H5N1) в пандемический штамм человека. В отличие от штаммов, циркулирующих в Юго-Восточной Азии, вирусы EMA происходят от предшественника, имеющего мутацию PB2 627K. Ожидается, что эти вирусы будут обладать улучшенными репликационными характеристиками у млекопитающих, и действительно, распространение EMA совпало с быстрым появлением случаев заболевания у млекопитающих, включая людей в Турции, Египте, Ираке и Джибути, а также кошек в Германии, Австрии и Ираке. . К сожалению, вирусы типа EMA оказались столь же опасными, как и исключительно азиатские штаммы: из 34 случаев заражения людей за пределами Азии до середины 2006 года 15 закончились смертельным исходом ».[23] Считается, что Lys в PB2–627 наделяет вирусы птичьего H5N1 преимуществом эффективного роста в верхних и нижних дыхательных путях млекопитающих.[24]
Мутация
Вирусы гриппа имеют относительно высокую скорость мутации, что характерно для РНК-вирусы. Сегментация гриппа геном облегчает генетическая рекомбинация путем перегруппировки сегментов у хозяев, инфицированных двумя разными вирусами гриппа одновременно. Вирусы H5N1 могут пересортировать гены с другими штаммами, которые одновременно инфицируют организм-хозяин, например свинью, птицу или человека, и мутируют в форму, которая может легко передаваться среди людей. Это один из многих возможных путей к пандемии.
Способность различных штаммов гриппа проявлять видовую селективность во многом обусловлена различиями в гемагглютинин гены. Генетический мутации в гене гемагглютинина, которые вызывают одиночные аминокислота замены могут значительно изменить способность вирусных белков гемагглютинина связываться с рецепторы на поверхности клеток-хозяев. Такие мутации в вирусах птичьего гриппа H5N1 могут изменить штаммы вирусов с неэффективных для инфицирования клеток человека на столь же эффективные в отношении инфицирования человека, как и более распространенные типы вирусов гриппа человека.[25] Это не означает, что замена одной аминокислоты может вызвать пандемию, но это означает, что замена одной аминокислоты может привести к тому, что вирус птичьего гриппа, не являющийся патогенным для человека, станет патогенным для человека.
H3N2 ("свиной грипп ") эндемичен для свиней в Китае и был обнаружен у свиней во Вьетнаме, что усиливает опасения по поводу появления новых вариантных штаммов. Доминирующим штаммом вируса годового гриппа в январе 2006 г. был H3N2, который теперь устойчив к стандартным противовирусным препаратам амантадин и римантадин. Возможность обмена генами H5N1 и H3N2 посредством реассортации вызывает серьезную озабоченность. Если происходит перегруппировка H5N1, он может остаться подтипом H5N1 или может сместить подтипы, как H2N2 сделал, когда он превратился в штамм гонконгского гриппа H3N2.
Оба H2N2 и H3N2 пандемические штаммы содержали птичий грипп сегменты РНК вируса. «В то время как пандемические вирусы гриппа человека 1957 года (H2N2) и 1968 года (H3N2) явно возникли в результате перегруппировки вирусов человека и птиц, вирус гриппа, вызвавший« испанский грипп »в 1918 году, по всей видимости, полностью произошел от птичьего источника».[26]
В июле 2004 г. исследователи во главе с Х. Дэн из Харбинский научно-исследовательский ветеринарный институт, Харбин, Китай и профессор Роберт Г. Вебстер из Детская исследовательская больница Св. Иуды, Мемфис, Теннесси, сообщил о результатах экспериментов, в которых мышей были подвергнуты воздействию 21 изолята подтвержденного штамма H5N1, полученного от уток в Китае в период с 1999 по 2002 год. Они обнаружили «четкую временную закономерность прогрессивно возрастающей патогенности».[27] Результаты, представленные д-ром Вебстером в июле 2005 г., показывают дальнейшее развитие патогенности у мышей и более длительное время. распространение вирусов утками.
Азиатская линия HPAI A (H5N1) делится на две антигенный клады. "Clade 1 включает изоляты человека и птицы из Вьетнам, Таиланд, и Камбоджа и птичьи изоляты от Лаос и Малайзия. Вирусы Clade 2 были впервые идентифицированы в изолятах птиц из Китай, Индонезия, Япония, и Южная Корея перед распространением на запад к Средний Восток, Европа, и Африка. По данным ВОЗ, вирусы клады 2 были в первую очередь ответственны за инфицирование человека H5N1, которое произошло в конце 2005 и 2006 годов. Генетический анализ выявил шесть субкладов клады 2, три из которых имеют четкое географическое распространение и были замешаны в инфекциях человека: карта
- Субклад 1, Индонезия
- Подклад 2, Европа, Ближний Восток и Африка (так называемый EMA)
- Субклад 3, Китай "[28][29][30]
Исследование 2007 года, посвященное субкладу EMA, пролило дополнительный свет на мутации EMA. «36 новых изолятов, представленных здесь, значительно расширяют объем данных о последовательностях полногенома, доступных для недавних изолятов птичьего гриппа (H5N1). До нашего проекта GenBank содержал только 5 других полных геномов из Европы за период 2004–2006 годов, и он содержал нет полных геномов с Ближнего Востока или Северной Африки. Наш анализ показал несколько новых открытий. Во-первых, все европейские, ближневосточные и африканские образцы попадают в кладу, отличную от других современных азиатских клад, все из которых имеют общее происхождение с оригинальный гонконгский штамм 1997 года. Филогенетические деревья, построенные на каждом из 8 сегментов, показывают последовательную картину трех линий, как показано на дереве HA, показанном на Рисунке 1. Две из клад содержат исключительно вьетнамские изоляты; меньшая из них, с 5 Мы маркируем изоляты V1; более крупная клада с 9 изолятами - это V2. Все остальные 22 изолята попадают в третью, четко различимую кладу, обозначенную EMA, которая включает образцы из Европы, Средней Азии. ле Восток и Африка. Деревья для остальных 7 сегментов имеют аналогичную топологию, с четко разделенными кладами V1, V2 и EMA в каждом случае. Анализ всех доступных полных геномов гриппа (H5N1) и 589 последовательностей НА выявил кладу EMA в отличие от основных клад, циркулирующих в Китайской Народной Республике, Индонезии и Юго-Восточной Азии ».[23]
Видеть https://web.archive.org/web/20090709040039/http://who.int/csr/disease/avian_influenza/H5CompleteTree.pdf для генетического древа 1342 вирусов H5N1 на основе их гена HA с указанием их кладовых обозначений.
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б c Глобальная сеть эпиднадзора за программой Всемирной организации здравоохранения за гриппом (2005 г.). «Эволюция вирусов H5N1 в Азии». Возникающие инфекционные заболевания. 11 (10): 1515–1526. Дои:10.3201 / eid1110.050644. ЧВК 3366754. PMID 16318689. Рисунок 1 статьи дает схематическое представление о генетическом родстве азиатского H5N1 гемагглютинин гены из различных изолятов вируса.
- ^ ВОЗ (28 октября 2005 г.). «Птичий грипп H5N1: хронология» (PDF). Архивировано из оригинал (PDF) 27 июля 2011 г.
- ^ Канадская пресса статья Исследование показывает, что гибриды вирусов птичьего и человеческого гриппа подходят друг другу, могут возникнуть опубликовано 1 июня 2008 г. В архиве 5 июня 2008 г. Wayback Machine
- ^ а б c Гарсия-Састре А (январь 2006 г.). «Противовирусный ответ на вирусы пандемического гриппа». Возникающий зараз. Дис. 12 (1): 44–7. Дои:10.3201 / eid1201.051186. ЧВК 3291409. PMID 16494716.
- ^ а б c Вейсан Чен; Пол А. Кальво; и другие. (2001). «Новый митохондриальный белок вируса гриппа А, который вызывает гибель клеток». Природа Медицина. 7 (12): 1306–12. Дои:10,1038 / нм1201-1306. PMID 11726970.
- ^ а б Ученый Live В архиве 2007-10-20 на Wayback Machine статья Единичная мутация в PB1-F2 вирусов H5N1 (HK / 97) и гриппа A 1918 г. способствует повышению вирулентности опубликовано 18 октября 2007 г.
- ^ М. Т. Майкл Ли, Конрад Бишоп, Лиз Медкалф, Дебра Элтон, Пол Дигард и Лоуренс Тили (15 января 2002 г.). «Определение минимальных вирусных компонентов, необходимых для инициации синтеза непраймированной РНК РНК-полимеразой вируса гриппа». Исследования нуклеиновых кислот. 30 (2): 429–438. Дои:10.1093 / nar / 30.2.429. ЧВК 99831. PMID 11788704.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- ^ Алекс Гренингер (16 июля 2004 г.). «Определение и оценка опасных исследований» (PDF). Рабочий документ CISSM. Архивировано из оригинал (PDF) 8 ноября 2006 г.. Получено 2006-12-09.
- ^ Батлер Д. (январь 2006 г.). «Тревога звонит по мутации птичьего гриппа». Природа. 439 (7074): 248–9. Bibcode:2006Натура.439..248Б. Дои:10.1038 / 439248a. PMID 16421529.
- ^ Грипп H5N1: угроза пандемии различных видов
- ^ Отчет о гриппе 2006 г. Интернет-книга стр. 51
- ^ CIDRAP статья Исследование обнаружило 2 мутации, которые помогают H5N1 инфицировать людей опубликовано 21 ноября 2006 г.
- ^ Новости Bloomberg статьи Две мутации гена птичьего гриппа могут привести к более быстрому распространению среди людей опубликовано 15 ноября 2006 г.
- ^ Новости Scidev.net статья "Карман" белка птичьего гриппа может стать источником более эффективных лекарств опубликовано 16 августа 2006 г.
- ^ Угроза пандемического гриппа: готовы ли мы? Стр. Решебника 118
- ^ Репликация вируса гриппа в Медицинская микробиология, 4-е издание под редакцией Сэмюэля Барона. 1996 Глава 58. ISBN 0-9631172-1-1.
- ^ Гуан Ю., Пун Л.Л., Чунг С.Й. и др. (Май 2004 г.). «Грипп H5N1: угроза пандемии разных видов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (21): 8156–61. Bibcode:2004ПНАС..101.8156Г. Дои:10.1073 / pnas.0402443101. ЧВК 419573. PMID 15148370.
- ^ Ли К.В., Суарес Д.Л., Тумпи TM и др. (Март 2005 г.). «Характеристика высокопатогенных вирусов птичьего гриппа A H5N1, выделенных из Южной Кореи». Дж. Вирол. 79 (6): 3692–702. Дои:10.1128 / JVI.79.6.3692-3702.2005. ЧВК 1075707. PMID 15731263.
Также, Пандемический грипп В архиве 2010-01-06 на Wayback Machine Центр исследований инфекционных заболеваний и политики Академический центр здоровья - Университет Миннесоты - ^ NS1 описан в Ингибирование белком NS1 - усиление вирулентности / вирусного патогенеза, позволяя вирусу обезвредить систему защиты IFN-типа клетки-хозяина Pathobiologics International
- ^ «Определение и оценка опасных исследований Алекса Гренингера» (PDF). Архивировано из оригинал (PDF) на 2006-03-06. Получено 2006-04-10.
- ^ Парагас Дж., Талон Дж., О'Нил Р. Э., Андерсон Д. К., Гарсия-Састре А., Палезе П. (август 2001 г.). «Белки NEP (NS2) вирусов гриппа B и C обладают ядерной экспортной активностью». Дж. Вирол. 75 (16): 7375–83. Дои:10.1128 / JVI.75.16.7375-7383.2001. ЧВК 114972. PMID 11462009.
- ^ Угроза пандемического гриппа: готовы ли мы? Стр. Решебника 126
- ^ а б Зальцберг С.Л., Кингсфорд С., Каттоли Г. и др. (Май 2007 г.). «Анализ генома, связывающий недавние вирусы европейского и африканского гриппа (H5N1)». Возникающий зараз. Дис. 13 (5): 713–8. Дои:10.3201 / eid1305.070013. ЧВК 2432181. PMID 17553249.
- ^ Ученый Live В архиве 2007-10-18 на Wayback Machine статья Рост вирусов гриппа H5N1 A в верхних дыхательных путях мышей опубликовано 18 октября 2007 г.
- ^ Гамбарян А., Тузиков А., Пазынина Г., Бовин Н., Балиш А., Климов А. (2006). «Фатальная эволюция рецепторного фенотипа вирусов гриппа A (H5)». Вирусология. 344 (2): 432–438. Дои:10.1016 / j.virol.2005.08.035. PMID 16226289.
- ^ Harder, T. C .; Вернер, О. (2006). «Птичий грипп». In Kamps, B.S .; Hoffman, C .; Прайзер, W. (ред.). Отчет о гриппе 2006 г.. Париж, Франция: Flying Publisher. ISBN 3-924774-51-X. Получено 2006-04-18.
Эта электронная книга постоянно обновляется и является отличным справочником по птичьему гриппу. - ^ Чен Х, Дэн Дж, Ли Зи и др. (Июль 2004 г.). «Эволюция вирусов гриппа H5N1 у уток на юге Китая». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (28): 10452–7. Bibcode:2004PNAS..10110452C. Дои:10.1073 / pnas.0403212101. ЧВК 478602. PMID 15235128.
- ^ Вебстер Р.Г., Говоркова Е.А. (ноябрь 2006 г.). «Грипп H5N1 - продолжающаяся эволюция и распространение». N. Engl.J. Med. 355 (21): 2174–7. Дои:10.1056 / NEJMp068205. PMID 17124014.
- ^ «ВОЗ заменяет штаммы H5N1 на пандемические вакцины, вызывая обеспокоенность по поводу эволюции вируса». CIDRAP. 18 августа 2006 г.
- ^ «Антигенные и генетические характеристики вирусов H5N1 и вакцинных вирусов-кандидатов H5N1, разработанных для потенциального использования в качестве предпандемических вакцин» (PDF). ВОЗ. 18 августа 2006 г. Архивировано с оригинал (PDF) 24 августа 2006 г.
дальнейшее чтение
- Отчет о гриппе 2006 г. Электронная книга.
- Ghedin E, Sengamalay NA, Shumway M, Zaborsky J, Feldblyum T., Subbu V, Spiro DJ (ноябрь 2005 г.). «Крупномасштабное секвенирование вируса гриппа человека раскрывает динамический характер эволюции вирусного генома». Природа. 437 (7062): 1162–1166. Bibcode:2005 Натур.437.1162G. Дои:10.1038 / природа04239. PMID 16208317. представляет собой резюме того, что было обнаружено в Проект секвенирования генома гриппа.
- Ссылки и описания на аннотации и полные тексты Эта библиография публикаций по птичьему гриппу была составлена совместными усилиями Национального центра здоровья дикой природы Геологической службы США и Информационного узла по болезням дикой природы.
- Ищите исследовательские публикации о H5N1: Энтез ПабМед
- Бейгель Дж. Х., Фаррар Дж., Хан А. М., и другие.; Авторский комитет Консультации Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) по гриппу человека A / H5. (Сентябрь 2005 г.). «Инфекция птичьего гриппа A (H5N1) у людей». N. Engl. J. Med. 353 (13): 1374–85. Дои:10.1056 / NEJMra052211. HDL:10722/45195. PMID 16192482.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- Эволюционное «Древо жизни» для H5N1:
- Здесь филогенетическое дерево сегмента гена гемагглютинина вируса гриппа. Аминокислотные изменения в трех ветвях (птица, свинья, человек) сегмента белка гемагглютинина вируса гриппа HA1.
- Здесь это дерево, показывающее эволюцию перегруппировка H5N1 с 1999 по 2004 год, создавший генотип Z в 2002 году.
- Здесь это дерево, показывающее эволюцию антигенный дрейф с 2002 года были созданы десятки высокоэффективных патогенный разновидности Z-генотипа вируса птичьего гриппа H5N1, некоторые из которых все в большей степени адаптируются к млекопитающим.
- ВОЗ (PDF) содержит последнее «Древо жизни» по эволюционному вирусу H5N1. статья Антигенные и генетические характеристики вирусов H5N1 и вакцинных вирусов-кандидатов H5N1, разработанных для потенциального использования в качестве предпандемических вакцин опубликовано 18 августа 2006 г.
- Хиромото Ю., Ямазаки Ю., Фукусима Т. и др. (Май 2000 г.). «Эволюционная характеристика шести внутренних генов вируса гриппа A человека H5N1». J. Gen. Virol. 81 (Pt 5): 1293–303. Дои:10.1099/0022-1317-81-5-1293. PMID 10769072. Архивировано из оригинал на 2007-12-19. Получено 2006-04-10.
- База данных генома Страница содержит ссылку на полную последовательность генома вируса гриппа A (A / Goose / Guangdong / 1/96 (H5N1)).
внешняя ссылка
- База данных исследований гриппа - База данных геномных последовательностей гриппа и сопутствующей информации.