Pasteurellaceae - Pasteurellaceae
| Pasteurellaceae | |
|---|---|
 | |
| Haemophilus ducreyi | |
| Научная классификация | |
| Королевство: | |
| Тип: | |
| Учебный класс: | |
| Заказ: | Пастереллы |
| Семья: | Pasteurellaceae Кастеллани и Чалмерс, 1919 год. |
| Роды | |
Актинобациллы | |
В Pasteurellaceae составляют большую семью грамотрицательных бактерии. Большинство членов живут как комменсалы на слизистых оболочках птиц и млекопитающих, особенно в верхних дыхательных путях.[3] Pasteurellaceae обычно стержневидный, и являются заметной группой факультативные анаэробы. Их биохимические характеристики можно отличить от родственных Энтеробактерии наличием оксидаза и от большинства других подобных бактерий отсутствием жгутики.
Бактерии семейства Pasteurellaceae были разделены на несколько родов на основе метаболических свойств, но эти классификации, как правило, не являются точным отражением эволюционных взаимоотношений между различными видами. Haemophilus influenzae был первым организмом, получившим геном секвенирована и интенсивно изучается генетическими и молекулярными методами. Род Гемофильный печально известный патоген человека, связанный с бактериемия, пневмония, менингит и мягкий шанкр. К другим патогенным членам семейства Pasteurellaceae относятся: Агрегатибактер, Mannheimia, Пастерелла, и Актинобациллы разновидность.
Молекулярные подписи и филогенетическое положение
Сравнительный анализ геномов Pasteurellaceae выявил большое количество (> 20) сохраненные индели подписи (CSI) в различных важных белках, которые являются уникальными для всех секвенированных видов / штаммов Pasteurellaceae, но не обнаруживаются ни у каких других бактерий. На основании многих других CSI, специфичных для подгрупп видов Pasteurellaceae, было предложено разделить семейство как минимум на две клады.[4] Одна предлагаемая клада включает Агрегатибактер, Пастерелла, Actinobacillus succinogenes, Haemophilus influenzae, Haemophilus somnus, и Mannheimia succiniciproducens, а другой включает Актинобациллы второстепенные, Actinobacillus pleuropneumoniae, Haemophilus ducreyi, Haemophilus parasuis, и Mannheimia haemolytica.
Молекулярные сигнатуры в форме CSI также использовались, чтобы помочь решить полифилетический распространение трех основных родов в семействе Pasteurellaceae: Актинобациллы, Гемофильный, и Пастерелла.[5][6][7] Эти роды демонстрируют обширную полифилию по всему семейству, однако было обнаружено, что CSI постоянно разделяются некоторыми видами, которые образуют монофилетический группа внутри каждого соответствующего рода.[5] Распределение CSI соответствует Sensu stricto клады "истинных" Актинобациллы, Гемофильный, и Пастерелла виды соответственно. Поскольку они указывают на общее происхождение, было высказано предположение, что распределение CSI можно использовать для определения родовой идентичности, когда виды, которые не разделяют CSI, могут быть реклассифицированы как другой род. Также были обнаружены CSI, специфичные для Агрегатибактер и Mannheimia , два клинически значимых рода.[5]
Pasteurellales вместе с Enterobacterales, относятся к последним расходящимся порядкам в Гаммапротеобактерии.[8] Их отличие от всех других отрядов подтверждается наличием нескольких консервативных сигнатурных белков (CSP), которые являются общими для этих двух отрядов и отсутствуют у всех других бактерий.[8] Pasteurellales также разделяют дополнительные CSP с Enterobacterales, Вибрионалес, Aeromonadales, и Alteromonadales, добавляя дополнительное разрешение к их эволюционному ветвлению и филогенетическому положению среди большого класса Gammaproteobacteria.[8]
Рекомендации
- ^ Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (2018). «Таксономия рода Caviibacterium Adhikary et al. 2018». Дои:10.1601 / tx.31260. Цитировать журнал требует
| журнал =(помощь) - ^ Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (2018). «Таксономия рода Conservatibacter Adhikary et al. 2018». Дои:10.1601 / tx.31262. Цитировать журнал требует
| журнал =(помощь) - ^ Кокотович, Бранко; Фриис, Нильс Ф; Аренс, Питер (2007). «Mycoplasma alkalescens продемонстрирована в бронхоальвеолярном лаваже крупного рогатого скота в Дании». Acta Veterinaria Scandinavica. 49 (1): 2. Дои:10.1186/1751-0147-49-2. ISSN 1751-0147. ЧВК 1766361. PMID 17204146.
- ^ Наушад, HS; Гупта, RS (январь 2012 г.). «Молекулярные сигнатуры (консервативные индели) в белковых последовательностях, которые специфичны для отряда Pasteurellales и различают две его основные клады». Антони ван Левенгук. 101 (1): 105–24. Дои:10.1007 / s10482-011-9628-4. PMID 21830122.
- ^ а б c Наушад С., Адеолу М., Гоэль Н., Хадка Б., Аль-Дахви А., Гупта Р.С. (2015). «Филогеномное и молекулярное разграничение основных представителей полифилетических pasteurellaceae родов actinobacillus, haemophilus и pasteurella». Int J Genom. 2015: 198560. Дои:10.1155/2015/198560. ЧВК 4363679. PMID 25821780.
- ^ Olsen I., Dewhirst FE, Paster BJ, Busse HJ (2005) Семейство I. Pasteurellaceae. В: Руководство Берджи по систематической бактериологии, изд. 2, том 2, с. 851–856. Редакторы Бреннер Д. Дж., Криг Н. Р., Гаррити Г. М., Стейли Дж. Т. Спрингер-: Нью-Йорк.
- ^ Dewhirst FE, Пастер BJ, Olsen I, Fraser GJ (1992). «Филогения 54 репрезентативных штаммов видов семейства Pasteurellaceae, определенная путем сравнения последовательностей 16S рРНК». J Бактериол. 174 (6): 2002–2013. Дои:10.1128 / jb.174.6.2002-2013.1992. ЧВК 205807. PMID 1548238.
- ^ а б c Гао Б., Мохан Р., Гупта Р.С. (2009). «Филогеномика и белковые сигнатуры, выясняющие эволюционные отношения между Gammaproteobacteria». Int J Syst Evol Microbiol. 59 (Чт 2): 234–247. Дои:10.1099 / ijs.0.002741-0. PMID 19196760.