Пептидогликангликозилтрансфераза - Википедия - Peptidoglycan glycosyltransferase

В энзимология, а пептидогликангликозилтрансфераза (EC 2.4.1.129 ) является фермент который катализирует то химическая реакция

[GlcNAc- (1-> 4) -Mur₂Ac (oyl-L-Ala-гамма-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)] n-дифосфоундекапренол + GlcNAc- (1-> 4) -Mur₂Ас (оил-L-Ala-гамма-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala) - дифосфоундекапренол

⇌

[GlcNAc- (1-> 4) -Mur₂Ас (оил-L-Ala-гамма-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)] n⁺1-дифосфоундекапренол + ундекапренилдифосфат

4 субстраты этого фермента

• [GlcNAc- (1-> 4) -Mur2Ac (оил-L-Ala-гамма-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)] n-,
• дифосфоундекапренол,
• GlcNAc- (1-> 4) -Mur2Ac (oyl-L-Ala-gamma-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala) - и
• дифосфоундекапренол,

тогда как его 3 товары находятся

• [GlcNAc- (1-> 4) -Mur2Ac (оил-L-Ala-гамма-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)] n + 1-,
• дифосфоундекапренол и
• ундекапренил дифосфат.

Этот фермент принадлежит к семейству гликозилтрансферазы, в частности гексозилтрансферазы. В систематическое название этого класса ферментов ундекапренилдифосфо- (N-ацетил-D-глюкозаминил- (1-> 4) - (N-ацетил-D-мурамоилпентапептид): ундекапренилдифосфо- (N-ацетил-D-глюкозаминил- (1-> 4) -N-ацетил -D-мурамоилпентапептид) дисахаридтрансфераза. Другие широко используемые имена включают PG-II, бактопренилдифосфо-N-ацетилмурамоил- (N-ацетил-D-глюкозаминил) -, пентапептид: пептидогликан, N-ацетилмурамоил-N-ацетил-D-глюкозаминилтрансфераза, связывающий пенициллин белок (3 или 1B), и пептидогликантрансгликозилаза. Этот фермент участвует в биосинтез пептидогликана.

Структурные исследования

На конец 2007 г. 3 структуры были решены для этого класса ферментов, с PDB коды доступа 2BG1, 2UWX, и 2UWY.

Рекомендации

• Таку А., Стаки М., Фан ДП (1982). «Очистка пептидогликантрансгликозилазы Bacillus megaterium». J. Biol. Chem. 257 (9): 5018–22. PMID  6802846.
• Гоффин С., Гуйсен Дж. М. (1998). «Мультимодульные пенициллин-связывающие белки: загадочное семейство ортологов и паралогов». Microbiol. Мол. Биол. Rev. 62 (4): 1079–93. Дои:10.1128 / MMBR.62.4.1079-1093.1998. ЧВК  98940. PMID  9841666.
• ван Хейенорт Дж (2001). «Формирование гликановых цепей при синтезе бактериального пептидогликана». Гликобиология. 11 (3): 25R – 36R. Дои:10.1093 / гликоб / 11.3.25R. PMID  11320055.