GMP-синтаза - Википедия - GMP synthase
| GMP синтетаза (гидролизует глутамин) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 GMP синтетаза, человек | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 6.3.5.2 | ||||||||
| Количество CAS | 37318-71-1 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
| БРЕНДА | BRENDA запись | ||||||||
| ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
| КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Концевой домен С GMP-синтетазы | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Escherichia coli gmp синтетаза в комплексе с amp и пирофосфатом.[1] | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | GMP_synt_C | ||||||||
| Pfam | PF00958 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR001674 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00405 | ||||||||
| SCOP2 | 1 галлон в минуту / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
Гуанозинмонофосфатсинтетаза, (EC 6.3.5.2), также известный как GMPS является фермент что обращает ксантозин монофосфат к монофосфат гуанозина.[6]
В синтезе пуриновых нуклеотидов de novo IMP является метаболитом точки ветвления, в которой путь расходится до синтеза гуаниновых или адениновых нуклеотидов. В пути гуаниновых нуклеотидов есть 2 фермента, участвующих в преобразовании IMP в GMP, а именно IMP-дегидрогеназа (IMPD1), которая катализирует окисление IMP до XMP, и GMP-синтетаза, которая катализирует аминирование XMP в GMP.[6]
Энзимология
В энзимология, а GMP-синтетаза (гидролиз глютамина) (EC 6.3.5.2 ) является фермент который катализирует то химическая реакция
- АТФ + ксантозин 5'-фосфат + L-глютамин + H2О AMP + дифосфат + GMP + L-глутамат
4 субстраты этого фермента АТФ, ксантозин 5'-фосфат, L-глютамин, и ЧАС2О, а его 4 товары находятся AMP, дифосфат, GMP, и L-глутамат.
Этот фермент принадлежит к семейству лигазы, особенно те, которые образуют углерод-азотные связи углерод-азотные лигазы с глутамином в качестве амидо-N-донора. В систематическое название этого класса ферментов ксантозин-5'-фосфат:L-глутамин амидолигаза (AMP-образующая). Другие широко используемые имена включают GMP-синтетаза (гидролиз глютамина), гуанилатсинтетаза (гидролизующий глутамин), гуанозинмонофосфатсинтетаза (гидролизующий глутамин), ксантозин-5'-фосфатамидотрансфераза, и гуанозин-5'-монофосфатсинтетаза. Этот фермент участвует в метаболизм пуринов и метаболизм глутамата. По крайней мере одно соединение, Псикофуранин известно подавлять этот фермент.
Структурные исследования
На конец 2007 г. 5 структуры были решены для этого класса ферментов, с PDB коды доступа 1 галлон в минуту, 1WL8, 2А9В, 2D7J, и 2DPL.
Рекомендации
- ^ Тесмер Дж. Дж., Клем Т. Дж., Дерас М. Л., Дэвиссон В. Дж., Смит Дж. Л. (январь 1996 г.). «Кристаллическая структура синтетазы GMP раскрывает новую каталитическую триаду и является структурной парадигмой для двух семейств ферментов». Структурная биология природы. 3 (1): 74–86. Дои:10.1038 / nsb0196-74. PMID 8548458. S2CID 30864133.
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163655 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027823 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ а б «Энтрез Ген: гуанинмонфосфатсинтетаза GMPS».
дальнейшее чтение
- Пейдж Т., Бакай Б., Нихан В.Л. (1984). «Синтетаза GMP человека». Международный журнал биохимии. 16 (1): 117–20. Дои:10.1016 / 0020-711X (84) 90061-2. PMID 6698284.
- Накамура Дж., Страуб К., Ву Дж., Лу Л. (октябрь 1995 г.). «Функция гидролиза глутамина человеческой GMP-синтетазы. Идентификация основного активного центра цистеина». Журнал биологической химии. 270 (40): 23450–5. Дои:10.1074 / jbc.270.40.23450. PMID 7559506.
- Накамура Дж., Лу Л. (март 1995 г.). «Биохимическая характеристика синтетазы GMP человека». Журнал биологической химии. 270 (13): 7347–53. Дои:10.1074 / jbc.270.13.7347. PMID 7706277.
- Херст М., Халидей Е., Накамура Дж., Лу Л. (сентябрь 1994 г.). «Синтетаза GMP человека. Очистка белков, клонирование и функциональная экспрессия кДНК». Журнал биологической химии. 269 (38): 23830–7. PMID 8089153.
- Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Федорова Л., Кост-Алимова М., Гизатуллин Р.З., Алимов А., Забаровская В.И., Селеш А. и др. (1997). «Отнесение и упорядочение двадцати трех уникальных NotI-связывающих клонов, содержащих экспрессированные гены, включая ген гуанозин-5'-монофосфатсинтетазы, с хромосомой 3 человека». Европейский журнал генетики человека. 5 (2): 110–6. Дои:10.1159/000484744. PMID 9195163.
- Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Pegram LD, Megonigal MD, Lange BJ, Nowell PC, Rowley JD, Rappaport EF, Felix CA (декабрь 2000 г.). «Транслокация t (3; 11) при остром миелоидном лейкозе, связанном с лечением, сливает MLL с геном GMPS (гуанозин-5'-монофосфат-синтетаза)». Кровь. 96 (13): 4360–2. Дои:10.1182 / кровь.V96.13.4360. PMID 11110714.
- Гуо Д., Хан Дж., Адам Б.Л., Колберн Н.Х., Ван М.Х., Донг З. и др. (Декабрь 2005 г.). «Протеомный анализ субстратов SUMO4 в клетках HEK293 в условиях стресса, вызванного сывороточным голоданием». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 337 (4): 1308–18. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.09.191. PMID 16236267.
- Абрамс Р., Бентли М. (1959). «Биосинтез пуринов нуклеиновых кислот. III. Образование гуанозин-5'-фосфата из ксантозин-5'-фосфата и L-глутамина». Arch. Biochem. Биофизы. 79: 91–110. Дои:10.1016/0003-9861(59)90383-2.
- Лагерквист У (июль 1958 г.). «Биосинтез гуанозин-5'-фосфата. II. Аминирование ксантозин-5'-фосфата очищенным ферментом из печени голубя». Журнал биологической химии. 233 (1): 143–9. PMID 13563458.
внешняя ссылка
- GMP + синтетаза в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
- PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для GMP-синтазы человека [глутамин-гидролизный]
| Этот EC 6.3 фермент -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |