HADHB - HADHB
Трифункциональная ферментная субъединица бета, митохондриальная (TP-beta), также известный как 3-кетоацил-КоА тиолаза, ацетил-КоА ацилтрансфераза, или бета-кетотиолаза является фермент что у людей кодируется HADHB ген.[5]
HADHB является подразделением митохондриальный трифункциональный белок и имеет тиолаза Мероприятия.
Структура
Ген HADHB расположен на хромосома 2, с его конкретным местоположением 2p23.[5] Ген содержит 17 экзонов. HADHB кодирует белок 51,2 кДа, состоящий из 474 аминокислоты; 124 пептиды наблюдались через масс-спектрометрии данные.[6][7]
Функция
Этот ген кодирует бета-субъединицу митохондриального трифункционального белка, катализатора митохондриального бета-окисление длинной цепи жирные кислоты. Белок HADHB катализирует заключительную стадию бета-окисления, на которой 3-кетоацил-КоА расщепляется тиол группа другой молекулы Коэнзим А. Тиол вставлен между C-2 и C-3, что дает ацетил-КоА молекула и ацил-КоА молекула, которая на два атома углерода короче.
Кодируемый белок также может связывать РНК и снижает стабильность некоторых мРНК. Гены альфа- и бета-субъединиц митохондриального трифункционального белка расположены рядом друг с другом в человеческий геном в прямой ориентации.[5]
Клиническое значение
Мутации в этом гене, а также мутации в ХАДХА, результат в трифункциональная белковая недостаточность.[5] Мутации в обоих генах имеют сходные клинические проявления.[8] Трифункциональная белковая недостаточность характеризуется пониженной активностью длинноцепочечной 3-гидроксиацил-КоА дегидрогеназы (LCHAD), длинноцепочечной еноил-КоА гидратазы и длинноцепочечной тиолазы. Этот дефицит можно разделить на 3 основных клинических фенотипа: неонатальный наступление тяжелого летального состояния, в результате которого синдром внезапной детской смерти (СВДС),[9] инфантильное начало печеночного Синдром Рейе, и в позднем подростковом возрасте, прежде всего, скелетной миопатия.[10] Кроме того, у некоторых присутствующих были симптомы, связанные с миопатией, рецидивирующими и эпизодическими. рабдомиолиз, сенсомоторный аксональный невропатия.[11] В некоторых случаях симптомы дефицита могут проявляться как расширенные кардиомиопатия застойный сердечная недостаточность, и дыхательная недостаточность. Дефицит проявляется в виде водянки плода и HELLP-синдрома у плода.[12] Сложная гетерозиготная мутация гена HADHB может вызывать аксональную Болезнь Шарко-Мари-Зуба, которое является неврологическим заболеванием, которое показывает, что мутации в этом гене могут приводить к дефицитам, которые проявляются в новых формах, которые в настоящее время не описаны.[13]
Взаимодействия
HADHB является функциональной молекулярной мишенью ERα в митохондриях, и взаимодействие может играть важную роль в эстроген -опосредованный липидный обмен у животных и людей.[14] Кроме того, было показано, что HADHB связывается с дистальной 3 ’нетранслируемой областью мРНК ренина, тем самым регулируя экспрессию белка ренина.[15]
использованная литература
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000138029 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000059447 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ а б c d «Ген Entrez: гидроксиацил-кофермент А дегидрогеназа / 3-кетоацил-кофермент А тиолаза / еноил-кофермент А гидратаза (трифункциональный белок)».
- ^ ]Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК 4076475. PMID 23965338.
- ^ «Трифункциональная ферментная субъединица бета, митохондриальная». Атлас кардиоорганических белков (COPaKB). Архивировано из оригинал 4 марта 2016 г.. Получено 23 марта 2015.
- ^ Spiekerkoetter, U; Хучуа, Z; Юэ, Z; Беннетт, MJ; Штраус, А.В. (февраль 2004 г.). «Общая недостаточность митохондриального трифункционального белка (TFP) в результате мутаций альфа- или бета-субъединицы демонстрирует аналогичные фенотипы, поскольку мутации в любой из субъединиц изменяют экспрессию комплекса TFP и оборот субъединицы». Педиатрические исследования. 55 (2): 190–6. Дои:10.1203 / 01.pdr.0000103931.80055.06. PMID 14630990.
- ^ Sonta, SI; Сандберг, AA (1977). «Хромосомы и причинно-следственная связь рака и лейкемии человека: XXVIII. Значение подробных исследований хромосом на большом количестве клеток при ХМЛ». Американский журнал гематологии. 3 (2): 121–6. Дои:10.1002 / ajh.2830030202. PMID 272120. S2CID 13141165.
- ^ Spiekerkoetter, U; Вс, В; Хучуа, Z; Беннетт, MJ; Штраус, AW (июнь 2003 г.). «Молекулярная и фенотипическая гетерогенность митохондриальной трифункциональной белковой недостаточности из-за мутаций бета-субъединицы». Человеческая мутация. 21 (6): 598–607. Дои:10.1002 / humu.10211. PMID 12754706. S2CID 85671653.
- ^ ден Бур, Мэн; Диониси-Вичи, К; Чакрапани, А; van Thuijl, AO; Wanders, RJ; Вейбург, ФА (июнь 2003 г.). «Митохондриальная трифункциональная белковая недостаточность: тяжелое нарушение окисления жирных кислот с сердечным и неврологическим поражением». Журнал педиатрии. 142 (6): 684–9. Дои:10.1067 / mpd.2003.231. PMID 12838198.
- ^ Джексон, S; Kler, RS; Бартлетт, К; Бриггс, H; Биндофф, Луизиана; Пурфарзам, М; Гарднер-Медвин, Д; Тернбулл, DM (октябрь 1992 г.). «Комбинированный ферментативный дефект митохондриального окисления жирных кислот». Журнал клинических исследований. 90 (4): 1219–25. Дои:10.1172 / jci115983. ЧВК 443162. PMID 1401059.
- ^ Hong, YB; Ли, JH; Парк, JM; Choi, YR; Хён, YS; Юн, BR; Ю, JH; Ку, Н; Юнг, Южная Каролина; Чанг, кВт; Чой, Б.О. (5 декабря 2013 г.). «Сложная гетерозиготная мутация в гене HADHB вызывает аксональную болезнь Шарко-Мари-Зуба». BMC Medical Genetics. 14: 125. Дои:10.1186/1471-2350-14-125. ЧВК 4029087. PMID 24314034.
- ^ Чжоу, Z; Чжоу, Дж; Du, Y (июль 2012 г.). «Рецептор эстрогена альфа взаимодействует с митохондриальным белком HADHB и влияет на активность бета-окисления». Молекулярная и клеточная протеомика. 11 (7): M111.011056. Дои:10.1074 / mcp.m111.011056. ЧВК 3394935. PMID 22375075.
- ^ Адамс, диджей; Беверидж, диджей; ван дер Вейден, L; Mangs, H; Leedman, PJ; Моррис, Би Джей (7 ноября 2003 г.). «HADHB, HuR и CP1 связываются с дистальной 3'-нетранслируемой областью мРНК ренина человека и дифференциально модулируют экспрессию ренина». Журнал биологической химии. 278 (45): 44894–903. Дои:10.1074 / jbc.m307782200. PMID 12933794.
дальнейшее чтение
- Ван Р., Ян З., Чжу Дж. М. и др. (2006). «[Скрининг мутации G1528C в гене трифункционального белка митохондрий у беременных женщин с тяжелой преэклампсией и новорожденных]». Чжунхуа Фу Чан Кэ За Чжи. 41 (10): 672–5. PMID 17199921.
- Aboulaich N; Вайнонен JP; Strålfors P; Венер А.В. (2004). «Векторная протеомика выявляет нацеливание, фосфорилирование и специфическую фрагментацию полимеразы I и фактора высвобождения транскрипта (PTRF) на поверхности кавеол в адипоцитах человека». Biochem. J. 383 (Pt 2): 237–48. Дои:10.1042 / BJ20040647. ЧВК 1134064. PMID 15242332.
- Адамс DJ, Беверидж DJ, ван дер Вейден Л. и др. (2003). «HADHB, HuR и CP1 связываются с дистальной 3'-нетранслируемой областью мРНК ренина человека и дифференциально модулируют экспрессию ренина». J. Biol. Chem. 278 (45): 44894–903. Дои:10.1074 / jbc.M307782200. PMID 12933794.
- Spiekerkoetter U, Khuchua Z, Yue Z и др. (2004). «Общая недостаточность митохондриального трифункционального белка (TFP) в результате мутаций альфа- или бета-субъединицы демонстрирует сходные фенотипы, поскольку мутации в любой из субъединиц изменяют экспрессию комплекса TFP и оборот субъединицы». Педиатр. Res. 55 (2): 190–6. Дои:10.1203 / 01.PDR.0000103931.80055.06. PMID 14630990.
- Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК 1356129. PMID 16344560.
- Богенхаген Д.Ф., Руссо Д., Берк С. (2008). «Слоистая структура нуклеоидов митохондриальной ДНК человека». J. Biol. Chem. 283 (6): 3665–75. Дои:10.1074 / jbc.M708444200. PMID 18063578.
- Миддлтон Б. (1994). «Митохондриальный длинноцепочечный трифункциональный фермент: 2-еноил-КоА-гидратаза, 3-гидроксиацил-КоА-дегидрогеназа и 3-оксоацил-КоА-тиолаза». Biochem. Soc. Транс. 22 (2): 427–31. Дои:10.1042 / bst0220427. PMID 7958339.
- Чжао Ю., Мэн Х.М., Вэй Ю.Дж. и др. (2003). «Клонирование и характеристика новой кардиоспецифической киназы, которая специфически взаимодействует с сердечным тропонином I.». J. Mol. Med. 81 (5): 297–304. Дои:10.1007 / s00109-003-0427-х. PMID 12721663. S2CID 13468188.
- Берендс К., Сова М.Э., Гиги С.П., Харпер Дж. В. (2010). «Сетевая организация системы аутофагии человека». Природа. 466 (7302): 68–76. Дои:10.1038 / природа09204. ЧВК 2901998. PMID 20562859.
- Пуревсурен Дж., Фукао Т., Хасегава Ю. и др. (2009). «Клинические и молекулярные аспекты японских пациентов с митохондриальной трифункциональной белковой недостаточностью». Мол. Genet. Метаб. 98 (4): 372–7. Дои:10.1016 / j.ymgme.2009.07.011. PMID 19699128.
- Hillier LW, Graves TA, Fulton RS и др. (2005). «Создание и аннотирование последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека». Природа. 434 (7034): 724–31. Дои:10.1038 / природа03466. PMID 15815621.
- Spiekerkoetter U, Sun B, Khuchua Z и др. (2003). «Молекулярная и фенотипическая гетерогенность митохондриальной трифункциональной белковой недостаточности из-за мутаций бета-субъединицы». Гм. Мутат. 21 (6): 598–607. Дои:10.1002 / humu.10211. PMID 12754706. S2CID 85671653.
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
- Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Фулд Б., Гарлатти В., Нойман Э. и др. (2010). «Структурная и функциональная характеристика рекомбинантного трифункционального белка митохондрий человека». Биохимия. 49 (39): 8608–17. Дои:10.1021 / bi100742w. PMID 20825197.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Ibdah JA, Tein I, Dionisi-Vici C, et al. (1998). «Умеренный трифункциональный дефицит белка связан с прогрессирующей нейропатией и миопатией и предполагает новую корреляцию генотип-фенотип». J. Clin. Вкладывать деньги. 102 (6): 1193–9. Дои:10.1172 / JCI2091. ЧВК 509102. PMID 9739053.
- Геваерт К., Геталс М., Мартенс Л. и др. (2003). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Биотехнология. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
- Хендриксон С.Л., Лаутенбергер Дж. А., Чинн Л. В. и др. (2010). «Генетические варианты в кодируемых ядром митохондриальных генах влияют на прогрессирование СПИДа». PLOS ONE. 5 (9): e12862. Дои:10.1371 / journal.pone.0012862. ЧВК 2943476. PMID 20877624.
- Frackowiak J, Mazur-Kolecka B, Kaczmarski W, Dickson D (2001). «Отложение бета-амилоида в сосудах при болезни Альцгеймера связано со сниженной экспрессией L-3-гидроксиацил-кофермента А дегидрогеназы (ERAB) в головном мозге». Мозг Res. 907 (1–2): 44–53. Дои:10.1016 / S0006-8993 (01) 02497-0. PMID 11430884. S2CID 22800813.
внешние ссылки
СМИ, связанные с HADHB в Wikimedia Commons- HADHB + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
СМИ, связанные с Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.
