ISLR - ISLR

ISLR
Идентификаторы
ПсевдонимыISLR, HsT17563, Мефлин, суперсемейство иммуноглобулинов, содержащее богатый лейцином повтор, суперсемейство иммуноглобулинов, содержащее богатые лейцином повтор
Внешние идентификаторыOMIM: 602059 MGI: 1349645 ГомолоГен: 4050 Генные карты: ISLR
Расположение гена (человек)
Хромосома 15 (человек)
Chr.Хромосома 15 (человек)[1]
Хромосома 15 (человек)
Геномное расположение ISLR
Геномное расположение ISLR
Группа15q24.1Начинать74,173,710 бп[1]
Конец74,176,872 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

3671

26968

Ансамбль

ENSG00000129009
ENSG00000288508

ENSMUSG00000037206

UniProt

O14498

Q6GU68

RefSeq (мРНК)

NM_201526
NM_005545

NM_001195431
NM_012043

RefSeq (белок)

NP_005536
NP_958934

NP_001182360
NP_036173

Расположение (UCSC)Chr 15: 74.17 - 74.18 МбChr 9: 58.16 - 58.2 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши
Рисунок 1. Прогнозируемая третичная структура ISLR белка, полученная с помощью i-TASSER. Расчетный TM-Score = 0,47 ± 0,15 Расчетное RMSD = 11,8 ± 4,5Å

У людей суперсемейство иммуноглобулинов, содержащее богатый лейцином повтор (ISLR) белок кодируется геном ISLR.[5] Текущий РНК-последовательность исследования показывают, что белок сильно экспрессируется в эндометрий и яичник и проявляет экспрессию среди 25 других тканей.[6] Видно, что белок локализован в цитоплазма,[7] плазматическая мембрана,[8] внеклеточный экзосома,

[9]

и просвет альфа-гранул тромбоцитов.[5] Кроме того, известно, что белок играет роль в тромбоцит дегрануляция,[5] клеточная адгезия,[10] и ответ на повышение цитозольного Ca тромбоцитов2+.[11]

Ген

Псевдонимами для ISLR являются Meflin, HsT17563 и паралог Linx, экспрессирующие мезенхимальные стромальные клетки и фибробласты.[5] Ген является частью I-set семья.[5]

Самая обновленная аннотация показывает ген, охватывающий от 74 173 710 до 74 176 871 пару оснований (3161 п.н.) с расположением на плюс-цепи в положении 15q24.1 (хромосома 15).[5] Ген содержит 3 экзона и 4 различных интрона.[5][12]

Транскрипция

Известные изоформы

Ген ISLR имеет два известных транскрипта изоформы на положительных сторонах: вариант 1 транскрипции ISLR[13] и вариант 2 транскрипта ISLR.[14] Оба варианта кодируют один и тот же белок.[15]

Вариант транскрипта 1 кодирует самую длинную изоформу белка длиной 2331 п.н., содержащую 2 экзона.[13]

Вариант транскрипта 2 кодирует более короткую изоформу белка длиной 2128 п.н., содержащую 2 экзона.[14] Этот вариант отличается 5 'UTR по сравнению с вариантом 1.[14]

Протеин

Внешность

Человеческий ген ISLR имеет две идентичные изоформы, подвергнутые альтернативному сплайсингу.[11] Домены гена ISLR следующие: LRR_8 (богатый лейцином повтор ), LRR_RI (ингибитор рибонуклеазы ), PCC (катионный канал полицистина белок) Суперсемейство и Ig (иммуноглобулин).[16]

Предсказанный изоэлектрическая точка немодифицированного белка ISLR составляет 5,3.[17] Расчетный молярная масса составляет 46,0 кДа.[10]

Белок ISLR у человека состоит из 428 аминокислот (а.о.).[18] С помощью инструмента статистического анализа белковых последовательностей (SAPS) процент большинства аминокислотных остатков составляет примерно средний процент среди белков человека, за исключением лейцин который показывает высокое содержание по сравнению с нормальным белком.[19] Это ожидается с геном, содержащим несколько LRR (богатые лейцином повторы). структурные мотивы.[5] Значительно низкая численность метионин (прогнозируется на уровне 0,5%).[19] Таким образом, положительно заряженные аминокислотные остатки больше, чем отрицательно заряженные аминокислотные остатки.[19]

Рисунок 2. Прогнозирование сигнального пептида и трансмембранного домена Фобиусом.

С помощью инструмента SAPS есть две предсказанные идентичные повторяющиеся структуры длиной четыре блока, которые попадают в структурные мотивы LRR: ЛСХЛ 97-100 п.н. и 172-175 п.н.[19]

Один результативный трансмембранный сегмент было предсказано с помощью инструмента SAPS от 411 до 428 а.о. (длина 18) с карманом от 417 до 418 а.о. [19] Прогноз Фобиуса для последовательности белка ISLR проиллюстрировал потенциальный трансмембранный домен и сигнальный пептид (рис. 2).[20] Прогноз SignalP-5.0 для сигнального пептида сообщил о вероятности 0,9989 с сайтом расщепления между положениями 18 и 19 с вероятностью 0,9146.[21]

Посттрансляционные модификации

Сайты фосфорилирования

Существует 31 предполагаемый сайт фосфорилирования в последовательности белка ISLR у людей из NetPhos.[22] Результаты были отфильтрованы для получения наилучшего прогноза для каждого отображения остатков и учтены. серин, треонин, и тирозин.

Благодаря предсказаниям Eukaryotic Structural Motif (инструмент ELM) восемь различных сайты фосфорилирования были идентифицированы для белка:[23]

  1. Гликогенсинтаза киназа-3 (GSK3)[24] сайт фосфорилирования в положениях 234-241 а.о.
  2. Киназа, родственная фосфатидилинозитол-3-киназе (PIKK) сайт фосфорилирования[25] в позиции 238-244 а.о.
  3. Казеин киназа (CK1) сайт фосфорилирования[26] в позиции 335-341 а.о.
  4. Два сайта фосфорилирования CK2[27] в положениях 343-349 а.о. и 376-382 а.о.
  5. Пролин-направленный (MAPK) сайт фосфорилирования[28] в позиции 343-349 а.о.
  6. Поло-подобная киназа фосфозиты 1 (Plk1 ) в положениях 336-342 а.о. и 351-357 а.о. Остатки Ser / Thr фосфорилируются киназой.[29]
  7. Plk4 фосфозит в положении 415-421 а.о. Остатки Ser / Thr фосфорилируются киназой.[30]
  8. Два NEK2 сайты фосфорилирования[31] в позициях 415-420 п.н. и 423-428 а.о.
Посттрансляционные модификации, предсказанные с помощью предсказания структурных мотивов эукариот (ELM) в человеческом белке ISLR
ИмяПозиция (аа)Ячейки отсека
N-degron[32]1-3Цитозоль
Эндосома-лизосома-базолатеральные сигналы сортировки[33]2-7Цитозоль, эндоцитарный пузырек
Ядерный экспортный сигнал (ЯЭС)[34]3-17Ядро, цитозоль
Фосфотирозиновые лиганды, связанные

Src Homology 2 (SH2) домены[35]

238-241Цитозоль
Лиганды домена WW класса IV[36]343-348Цитозоль, ядро
Лиганд субъединицы 1 циклин-зависимой киназы (Cks1)[37]344-349Цитозоль, ядро
Факторы, связанные с TNFR 6

(TRAF6 ) сайт привязки[38]

345-353Цитозоль
Сайт амидирования пептидов[39]355-358Внеклеточные секреторные гранулы
сигнал удержания / извлечения di-Arg[40]357-359Мембрана эндоплазматического ретикулума, мембрана транспортных пузырьков ER-Golgi, грубый эндоплазматический ретикулум,

цистерна эндоплазматического ретикулума, цитозоль, интегральный белок

N-аргинин двухосновный (NRD) сайт расщепления[41]357-359Внеклеточный, аппарат Гольджи, клеточная поверхность
Src Homology 3 (SH3 ) лиганд[42]375-381Плазматическая мембрана, очаговая адгезия, цитозоль
Гликозаминогликан сайт прикрепления[43]379-381Внеклеточный, аппарат Гольджи
Мотив связывания домена SH2 STAT5[44]370-373

389-392

Цитозоль
ПДЗ доменные лиганды[45]423-428Цитозоль, внутренняя сторона плазматической мембраны
Pex14 мотив лиганда[46]424-428Цитозоль, пероксисома, гликосома

Таблица 1. Результаты поиска мотива ELM после контекстной, структурной и глобулярной фильтрации с приемлемой структурной оценкой (оценка выше среднего порога).[23] Всего выявлено 23 посттрансляционных модификации, включая сайты фосфорилирования в человеческом белке ISLR.

Гликозилирование Места

С помощью инструмента исследования простой модульной архитектуры (SMART)[47] на рисунке 3 аннотация предсказывает три сайта N-связанного гликозилирования (красные кружки, начиная слева): 51 аминокислоту, 60 аминокислот и 309 аминокислот. Структурные мотивы LRR и домен иммуноглобулина C-2 типа (IGc2) показаны на схеме (рис. 3).

Рисунок 3. Прогнозируемые сайты N-связанного гликозилирования в SMART для человеческого белка ISLR. Три PTM представляют собой N-связанное гликозилирование (размноженные, красные кружки).

Сайты амидации

Прогнозируется с помощью MyHits, который исследует взаимосвязь между последовательностями белков и мотивами,[48] мотив сайта амидирования был уверенно предсказан в положениях 355-358 а.о.

Сайты пальмитоилирования

Три сайты пальмитоилирования были предсказаны (таблица 2).

Предсказанные сайты пальмитоилирования в CSS-Palm для человеческого белка ISLR
ПозицияПептидСчетОтрезать
19LLGLAQACPEPCDCG21.1943.717
23AQACPEPCDCGEKYG13.2210.722
25ACPEPCDCGEKYGFQ4.4633.717

Таблица 2. Результаты CSS-Palm[49] для человеческого белка ISLR.

GPI-модификации

Прогнозируется с помощью предиктора большого ИП,[50] один глюкозофосфат изомераза (GPI) модификация была обнаружена на позиции 401 а.о. (лучший сайт) с оценкой P-значения 1,71e-03.[51]

Вторичная и третичная структура

Из всего предсказанного бета-листы четыре отрезка в 253–260 а.о., 265–272 а.о., 323–331 а.о. и 335–346 а.о. были идентифицированы с высокой достоверностью с помощью CFSSP.[52] и Phyre2.[53] Из всего предсказанного альфа спирали три альфа-спирали 5-15 а.о., 189-195 а.о. и 214-216 а.о. также были идентифицированы с высокой достоверностью. Третичная модель человеческого белка ISLR, предсказанная I-TASSER[54] показывает комбинацию некоторых альфа-спиралей и бета-листов (Рисунок 1). Основываясь на предсказании вторичной структуры белка в I-TASSER, расположение четырех бета-листов и трех альфа-спиралей подтверждает предсказания с высокой степенью достоверности, сделанные CFSSP и Phyre2.

Субклеточная локализация

Ожидается, что белок ISLR у человека будет локализоваться по всей клетке, включая внеклеточную область, на основании предсказанных результатов PSORT II.[55] Метод Райнхардта для цитоплазматической / ядерной дискриминации предсказал, что белок будет более цитоплазматическим с надежностью 76,7. Кроме того, было показано, что ISLR локализуется в цитоплазме на основе поликлональное антитело приводит к иммуногистохимически окрашенные человеческие ткани в миоциты, железистые клетки, кожа, гепатоциты.[7] Иммунофлуоресцентное окрашивание ISLR в линии клеток человека BJ (фибробласты) также показало локализацию на плазматической мембране с использованием поликлональных антител ISLR.[56]

Выражение

У людей РНК-секвенирование проводилось на образцах тканей 95 человек, представляющих 27 различных тканей, для определения тканеспецифичности всех генов, кодирующих белок.[57] Примечательно, что существует высокая экспрессия ISLR в эндометрии и яичниках и видимая экспрессия среди 25 других тканей. Другое исследование РНК-секвенирования общей РНК из 20 тканей человека продемонстрировало высокую экспрессию ISLR в матке.[58] Тканевый кольцевая РНК индукция во время внутриутробного развития человека показала устойчивую экспрессию ISLR на протяжении всего развития с высоким увеличением в желудке через 10 недель.[59] Экспрессия желудка оставалась заметно высокой до 20 недель.

Рисунок 4. На месте Гибридизация на мозге мыши. Сагиттальный разрез. 5 окрашенных ИГХ для экспрессии ISLR. Были обнаружены два исходных значения экспрессии: (а) обонятельные области с 3,18 и (б) формирование гиппокампа с 1,10.

На аннотированном рисунке знак на месте Гибридизация на 56-дневном самце мыши мозг (сагиттальный разрез ) продемонстрировала экспрессию в обонятельных областях и образование гиппокампа (Рисунок 4).[60]

Основываясь на базе данных обилия белков (PAXdb 4.1), человеческий белок ISLR демонстрирует высокое содержание белка (значение ppm> 1) относительно всего организма.[61]

Выражение в клинических исследованиях

Профилирование экспрессии ISLR с помощью микроматрицы у женщин-людей продемонстрировало сверхэкспрессию ISLR в белой жировой ткани после липотрансфера CD34 + клетки и значительно более низкая экспрессия в лейкаферез CD34 + клетки.[62]

Профилирование экспрессии с помощью микроматрицы ISLR у людей продемонстрировало сверхэкспрессию в не союз переломы скелета по сравнению с низкой экспрессией при нормальных переломах.[63]

Профилирование экспрессии ISLR с помощью микроматрицы у женщин с ожирением продемонстрировало устойчивую низкую экспрессию ISLR у субъектов, которые следовали краткосрочной гипокалорийной диете с низким содержанием жиров.[64]

Регулирование выражения

Регулирование уровня генов

Существует один промоутер область в гене ISLR с прогнозируемой длиной 1912 п.н. (Рисунок 5), извлеченная из Genomatix.[65] Кроме того, в нуклеотидной последовательности ISLR (человек) присутствует сигнал полиаденилирования на уровне 3142 п.н.[66]

Есть шесть различных факторы транскрипции которые связываются с промоторной областью ISLR из предсказаний Genomatix: два SMAD факторы, sine oculis homeobox (SIX), коэффициент теплового шока (HSF), PRDM, Snail и область гомологии генов клеточных циклов (CHR).[65]

Результаты Genomatix предсказывают, что в ISLR больше сайтов связывания факторов транскрипции с наибольшим матричным сходством (0,97 ~ 0,99), таких как:

  1. Миелоидный цинковый палец 1 фактор (MZF1)
  2. Ядерный фактор активированного Т-клетки
  3. Ядерный фактор гепатоцитов 3 (альфа, бета) (FOXA1, FOXA2 )
  4. Фактор транскрипции E2F 1
  5. Эомесодермин, ТБР-2 (Т-бокс, мозг, 2) (Брачьюры ген, мезодерма фактор развития)
  6. Фактор гомеодомена Nkx-2.5 / Csx
  7. Связанный с эстрогеном рецептор альфа (предпочтение вторичного связывания ДНК)
  8. Ранний B-клеточный фактор 1 (обонятельный фактор, специфичный для нейронов)
  9. Возникающий полипептид-ассоциированный комплекс субъединица альфа 1
  10. Цинковый палец семейства IKAROS 3 (Aiolos)
  11. 3'-полусайт мотива ZTRE (регулятор транскрипции цинка)
  12. AREB6 (фактор связывания регуляторного элемента Atp1a1 6)
Рисунок 5. Схема промоутера ISLR. Общие положения экзона 1, 2 и 3, наиболее надежной промоторной области и UTR были извлечены из Genomatix.

Регулирование уровня транскрипции

Прогнозируется, что человеческий ген ISLR станет мишенью для 85 человек. миРНК в miRDB.[67] Лучшие (> 88) миРНК - это hsa-miR-5197-3p, hsa-miR-4688, hsa-miR-3150a-3p, hsa-miR-16-5p, hsa-miR-195-5p, hsa-miR. -15a-5p и hsa-miR-6763-5p.

RBPmap,[68] который отображает предсказанные места связывания РНК-связывающие белки, показал множественные консервативные мотивы в эволюции по сравнению с последовательностью варианта 1 транскрипта мРНК человеческого ISLR[69] Такие как:

  1. БРУНОЛ6
  2. CPEB 2 и CPEB4
  3. ESRP2
  4. FMR1
  5. FUS
  6. FXR1 и FXR2
  7. G3BP2
  8. HNRNPA1, HNRNPA1L2, HNRNPA2B 1, HNRNPC, HNRNPCL1, HNRNPF, HNRNPH1, HNRNPH2, ГНРНПК, HNRNPL, HNRNPM, HNRNPU, HNRPLL.
  9. HuR
  10. IGF2BP2 и IGF2BP3
  11. KHDRBS2
  12. LIN28A

Гомология и эволюционная история

Паралоги

В настоящее время у людей есть еще один паралог, известный как ISLR 2.[70] и два паралогичных домена: LRRN4 (предшественник белка 4) и LRRN4CL (предшественник белка 4, подобный С-концу).[71]

Ортологи / далекие гомологи

По состоянию на август 2020 года насчитывалось более 190 известных ортологов человеческого гена ISLR,[72] самый далекий ортолог и гомолог, найденный в Exaiptasia pallida (актинии).[73] В таблице ниже показаны взаимосвязи между характеристиками белка ISLR человека и выбранными ортологами, охватывающими диапазон от наиболее близких до Homo sapiens в самые далекие.

Таблица эволюции ортологов белка ISLR (человека)
Вид 1Виды 2Распространенное имяТаксономическая группаРегистрационный номерДата расхожденияДлина последовательностиИдентичность белка в процентахСходство белковой последовательности
(Миллион лет назад [MYA])(аа)
Человек vs.Homo sapiensЧеловекПриматыBAA85970.10428100%100%
Человек vs.Macaca fascicularisМакака-крабояднаяПриматыXP_005560108.12942898.33%99.00%
Человек vs.Tursiops truncatusБутылконосый ДельфинКитообразныеXP_0337078709642891.58%94.00%
Человек vs.Mus musculusДомовая мышьRodentiaBAA85973.116042888.24%91.00%
Люди vs.Myotis brandtiiЛетучая мышь БрандтаТерапсидXP_005882850.19642285.68%89%
Человек vs.Monodelphis domesticaСерый короткохвостый опоссумДидельфиморфияXP_00747820518041875.66%83.00%
Человек vs.Орниторинхус анатинусУтконосМонотрематаXP_007663289.217741761.29%72.00%
Человек vs.Lacerta AgilisЯщерицаSquamataXP_033016939.131241848.90%58.00%
Человек vs.Apteryx rowiОкарито кивиApterygiformesXP_025924151.131842948.03%62.00%
Люди vs.Haliaeetus leucocephalusБелоголовый орланAccipitriformesXP_01056989931241648.01%61%
Человек vs.Exaiptasia pallidaЭкзаиптазияАктиниарияKXJ26782.182430429.89%46.00%
Человек vs.Bactrocera dorsalisВосточная плодовая мухаДвукрылыеJAC38616.179732626.43%48.00%
Человек vs.Фопий аризанскийОса (парастический тип)ПерепончатокрылыеJAG75735.179771327.25%42.00%

Взаимодействующий белок

Белковые взаимодействия

PSIQUIC View получил в общей сложности 284 результатов.[74] ISLR (человека), что демонстрирует его связывание с множеством различных белков. iRefIndex показал 97 результатов с множественными физическими связями, такими как ISLR с Rho GTP-семейство (RHOBTB3 ), BMP7, Сфингозо-1-фосфатлиаза (SGPL1), Карнитин-ацилкарнитин транслоказа (SLC25A20), сигнальный регулятор 3 Canopy FGF (CNPY3) и Лейшманолизин-подобная пептидаза (LMLN).[75] Физические ассоциации были идентифицированы с подход двух гибридных пулов, аффинная хроматография технология, ферментативное исследование или антитаг коиммунопреципитация. В целом результаты iRefIndex предполагают, что ISLR участвует в различных механизмах, таких как миграция клеток, транспорт различных комплексов и метаболизм (ферментативные механизмы). Напр., RHOBTB3 участвует в транспортировке различных комплексов по путям, таким как эндосомы в транс-сеть Гольджи и Гольджи в ER.[76] Более того, было показано, что LMLN играет роль в миграции клеток, потенциально митотической прогрессии.[77] Что касается метаболизма, SGPL1 участвует в метаболизме сфинголипиды.[78]

Взаимодействие со штаммами коронавируса

На основе предыдущих результатов iRefindex[75] что указывало на физические ассоциации между ISLR и другими белками, два разных взаимодействия были идентифицированы с разными штаммами коронавирус. Взаимодействие с полипротеином orf1ab штамма коронавируса человека HKU1 (HCov-HKU1) была показана в физической ассоциации с ISLR посредством подхода двух гибридных пулов, где ISLR обозначен как «жертва», а полипротеин orf1ab обозначен как «приманка».[79]

Есть еще одно обнаруженное взаимодействие ISLR и Human ОРВИ коронавируса через прямой контакт на основе подхода двух гибридных пулов.[79]

Клиническое значение

Прошлые исследования

Доставка ISLR-экспресс лентивирус в строму опухоли подавлял рост опухоли протоковой аденокарциномы поджелудочной железы (PDAC).[80] В PDAC низкая экспрессия ISLR (Meflin) была связана с агрессивными опухолями, характеризующимися прямой коллаген волокна в строме.[80] Что касается туморогенеза в IBD пациентов, исследование изучило Сигнал бегемота путь в кишечной регенерации эпителиальные клетки.[81] ETS1, онкогенный Фактор транскрипции в стромальных клетках индуцировал экспрессию белка ISLR, который ингибировал передачу сигналов Hippo, тем самым способствуя регенерации кишечника.[81] На мышах было продемонстрировано, что делеция ISLR в стромальных клетках может подавлять онкогенез в кишечнике.[81] Для паралога ISLR 2 исследование показало, что врожденная гидроцефалия, артрогрипоз, и вздутие живота связан с аутосомно-рецессивным нокаутом фенотипа ISLR 2 в мультиплексном кровнородственный семья.[82] ISLR 2 кодирует белок, который играет роль в управление аксоном в развитии мозга, следовательно, раскрывая потенциальные связи с некоторыми врожденными неврологическими нарушениями.[82]

Рекомендации

  1. ^ а б c ENSG00000288508 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000129009, ENSG00000288508 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037206 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c d е ж грамм час "Суперсемейство иммуноглобулинов ISLR, содержащее богатый лейцином повтор [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  6. ^ "Суперсемейство иммуноглобулинов ISLR, содержащее богатый лейцином повтор [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  7. ^ а б «Первичные антитела ISLR». www.thermofisher.com. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  8. ^ «Антитело ISLR (PA5-65263)». www.thermofisher.com. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  9. ^ Principe S, Jones EE, Kim Y, Sinha A, Nyalwidhe JO, Brooks J, et al. (Май 2013). «Углубленный протеомный анализ экзосом, выделенных из секрета простаты в моче». Протеомика. 13 (10–11): 1667–1671. Дои:10.1002 / pmic.201200561. ЧВК  3773505. PMID  23533145.
  10. ^ а б Нагасава А., Кубота Р., Имамура Ю., Нагамин К., Ван Ю., Асакава С. и др. (Сентябрь 1997 г.). «Клонирование кДНК для нового члена суперсемейства иммуноглобулинов (ISLR), содержащего богатый лейцином повтор (LRR)». Геномика. 44 (3): 273–9. Дои:10.1006 / geno.1997.4889. PMID  9325048. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  11. ^ а б "Ген ISLR - Генные карты | Белок ISLR | Антитело ISLR". www.genecards.org. В архиве из оригинала 17 сентября 2017 г.. Получено 2 августа 2020.
  12. ^ «AceView: Gene: ISLR, исчерпывающая аннотация генов человека, мыши и червя с мРНК или ESTsAceView». www.ncbi.nlm.nih.gov. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  13. ^ а б «Суперсемейство иммуноглобулинов человека Homo sapiens, содержащее богатый лейцином повтор (ISLR), вариант транскрипта 1, мРНК». 4 июля 2020. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  14. ^ а б c «Суперсемейство иммуноглобулинов человека Homo sapiens, содержащее богатый лейцином повтор (ISLR), вариант транскрипта 2, мРНК». 7 июня 2020. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  15. ^ «Суперсемейство иммуноглобулинов человека Homo sapiens, содержащее богатый лейцином повтор (ISLR), вариант транскрипта 2, мРНК». 16 февраля 2019. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  16. ^ «Отчет по символам HGNC для ISLR». genenames.org. В архиве из оригинала от 24 сентября 2019 г.
  17. ^ «AceView: Gene: ISLR, исчерпывающая аннотация генов человека, мыши и червя с мРНК или ESTsAceView». www.ncbi.nlm.nih.gov. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  18. ^ "ISLR [Homo sapiens] - белок - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  19. ^ а б c d е «Инструмент для анализа белков ISLR SAPS». 27 июля 2020. В архиве с оригинала 9 августа 2020 года.
  20. ^ «Фобий». В архиве с оригинала 27 апреля 2019 г.
  21. ^ «СигналП-5.0». В архиве с оригинала 31 июля 2020 г.
  22. ^ "Прогноз NetPhos для BAA85970.1_ISLR (Homo sapiens)". 27 июля 2020. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.
  23. ^ а б "Ресурс Eukaryotic Linear Motif (ELM) для функциональных сайтов в белках (BAA85970.1 ISLR_Human)".
  24. ^ "ELM - Деталь для MOD_GSK3_1". elm.eu.org. В архиве из оригинала 29 января 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  25. ^ "ELM - Деталь для MOD_PIKK_1". elm.eu.org. В архиве из оригинала 20 февраля 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  26. ^ "ELM - Деталь для MOD_CK1_1". elm.eu.org. В архиве с оригинала 30 августа 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  27. ^ "ELM - Деталь для MOD_CK2_1". elm.eu.org. В архиве из оригинала 15 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  28. ^ "ELM - Деталь для MOD_ProDKin_1". elm.eu.org. В архиве из оригинала 29 января 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  29. ^ "ELM - Деталь для MOD_Plk_1". elm.eu.org. В архиве из оригинала 20 февраля 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  30. ^ «ELM - Деталь для MOD_Plk_4». elm.eu.org. В архиве из оригинала 20 февраля 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  31. ^ "ELM - Деталь для MOD_NEK2_1". elm.eu.org. В архиве из оригинала 20 февраля 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  32. ^ "ELM - деталь для DEG_Nend_UBRbox_3". elm.eu.org. В архиве из оригинала 20 февраля 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  33. ^ "ELM - Деталь для TRG_LysEnd_APsAcLL_1". elm.eu.org. В архиве из оригинала 21 февраля 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  34. ^ "ELM - деталь для TRG_NES_CRM1_1". elm.eu.org. В архиве из оригинала 29 января 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  35. ^ "ELM - Деталь для LIG_SH2_SRC". elm.eu.org. В архиве из оригинала 22 февраля 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  36. ^ "ELM - Деталь для DOC_WW_Pin1_4". elm.eu.org. В архиве из оригинала 29 января 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  37. ^ "ELM - деталь для DOC_CKS1_1". elm.eu.org. В архиве из оригинала 20 февраля 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  38. ^ "ELM - Деталь для LIG_TRAF6". elm.eu.org. В архиве из оригинала 22 февраля 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  39. ^ "ELM - Деталь для MOD_Cter_Amidation". elm.eu.org. В архиве из оригинала 22 февраля 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  40. ^ "ELM - деталь для TRG_ER_diArg_1". elm.eu.org. В архиве из оригинала 22 февраля 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  41. ^ "ELM - деталь для CLV_NRD_NRD_1". elm.eu.org. В архиве из оригинала 22 февраля 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  42. ^ "ELM - Деталь для LIG_SH3_3". elm.eu.org. В архиве с оригинала на 30 января 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  43. ^ "ELM - Деталь для MOD_GlcNHglycan". elm.eu.org. В архиве из оригинала 21 февраля 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  44. ^ "ELM - Деталь для LIG_SH2_STAT5". elm.eu.org. В архиве из оригинала 22 февраля 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  45. ^ "ELM - деталь для LIG_PDZ_Class_1". elm.eu.org. В архиве из оригинала 20 февраля 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  46. ^ "ELM - Деталь для LIG_Pex14_2". elm.eu.org. В архиве из оригинала 21 февраля 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  47. ^ «SMART: Главная страница». smart.embl-heidelberg.de. В архиве из оригинала 27 июля 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  48. ^ "MyHits". myhits.sib.swiss. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  49. ^ «CSS-Palm - Прогнозирование сайта пальмитоилирования». csspalm.biocuckoo.org. Архивировано из оригинал 15 февраля 2009 г.. Получено 2 августа 2020.
  50. ^ «Прогнозирование места модификации GPI». mendel.imp.ac.at. Архивировано из оригинал 21 июля 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  51. ^ «Предиктор большого ИП для BAA85970.1_ISLR (Homo sapiens)». В архиве с оригинала от 20 февраля 2018 г.
  52. ^ "CFSSP: Сервер прогнозирования вторичной структуры Chou & Fasman". www.biogem.org. В архиве из оригинала 9 августа 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  53. ^ "Сервер распознавания складок PHYRE2". www.sbg.bio.ic.ac.uk. В архиве с оригинала 11 августа 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  54. ^ «Сервер I-TASSER для предсказания структуры и функции белков». zhanglab.ccmb.med.umich.edu. В архиве с оригинала 30 июля 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  55. ^ «PSORT: инструмент для прогнозирования субклеточной локализации белка». www.genscript.com. В архиве из оригинала 11 июня 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  56. ^ «Поликлональные антитела», Определения, Qeios, 7 февраля 2020 г., Дои:10.32388 / lwiy89, в архиве из оригинала 23 сентября 2020 г., получено 2 августа 2020
  57. ^ Fagerberg L, Hallström BM, Oksvold P, Kampf C, Djureinovic D, Odeberg J, et al. (Февраль 2014). «Анализ тканеспецифической экспрессии человека путем полногеномной интеграции транскриптомики и протеомики на основе антител». Молекулярная и клеточная протеомика. 13 (2): 397–406. Дои:10.1074 / mcp.M113.035600. ЧВК  3916642. PMID  24309898. В архиве с оригинала 25 июля 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  58. ^ Дафф М.О., Олсон С., Вей Х, Гаррет С.К., Осман А., Болисетти М. и др. (Май 2015 г.). «Полногеномная идентификация нулевого рекурсивного сплайсинга нуклеотидов у дрозофилы». Природа. 521 (7552): 376–9. Bibcode:2015Натура.521..376D. Дои:10.1038 / природа14475. ЧВК  4529404. PMID  25970244. В архиве из оригинала на 3 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  59. ^ Сабо Л., Мори Р., Пальпант Нью-Джерси, Ван П.Л., Афари Н., Цзян С. и др. (Июнь 2015 г.). «Статистически обоснованное обнаружение сплайсинга показывает обогащение нейронов и тканеспецифическую индукцию кольцевой РНК во время внутриутробного развития человека». Геномная биология. 16: 126. Дои:10.1186 / s13059-015-0690-5. ЧВК  4506483. PMID  26076956. В архиве с оригинала 10 августа 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  60. ^ "Деталь гена :: Атлас мозга Аллена: Мозг мыши". mouse.brain-map.org. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  61. ^ "PAXdb: База данных по изобилию белков". pax-db.org. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  62. ^ Мартин-Падура I, Грегато Дж., Маригетти П., Манкузо П., Каллери А., Корсини С. и др. (Январь 2012 г.). «Белая жировая ткань, используемая в процедурах липотрансфера, является богатым резервуаром предшественников CD34 +, способных способствовать прогрессированию рака». Исследования рака. 72 (1): 325–34. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-11-1739. PMID  22052460. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  63. ^ "Браузер GEO DataSet". www.ncbi.nlm.nih.gov. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  64. ^ Хиетаниеми М., Йокела М., Рантала М., Уккола О., Вуористо Дж. Т., Ильвес М. и др. (Март 2009 г.). «Влияние краткосрочной гипокалорийной диеты на экспрессию генов печени и метаболические факторы риска у женщин с ожирением». Питание, обмен веществ и сердечно-сосудистые заболевания. 19 (3): 177–83. Дои:10.1016 / j.numecd.2008.06.009. PMID  18804985. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  65. ^ а б "genomatix - Поиск в Google". www.google.com. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 3 августа 2020.
  66. ^ «Хромосома 15 Homo sapiens, первичная сборка GRCh38.p13». 29 мая 2020. В архиве из оригинала 5 октября 2016 г.. Получено 3 августа 2020. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  67. ^ "miRDB - База данных прогнозирования мишеней микроРНК". mirdb.org. В архиве из оригинала 6 августа 2020 г.. Получено 3 августа 2020.
  68. ^ «RBPmap - Анализ мотивов и прогнозирование РНК-связывающих белков». rbpmap.technion.ac.il. В архиве из оригинала 22 февраля 2020 г.. Получено 3 августа 2020.
  69. ^ «Суперсемейство иммуноглобулинов человека Homo sapiens, содержащее богатый лейцином повтор (ISLR), вариант транскрипта 1, мРНК». 4 июля 2020. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  70. ^ "Суперсемейство иммуноглобулинов ISLR2, содержащее богатый лейцином повтор 2 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 2 августа 2020.
  71. ^ "Ген ISLR - Генные карты | Белок ISLR | Антитело ISLR". www.genecards.org. В архиве из оригинала 17 сентября 2017 г.. Получено 2 августа 2020.
  72. ^ "Ортологи ISLR". NCBI. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 3 августа 2020.
  73. ^ "LOC110239154 неохарактеризованный LOC110239154 [Exaiptasia diaphana] - Ген - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 3 августа 2020.
  74. ^ "PSICQUIC View". В архиве из оригинала 21 февраля 2020 года.
  75. ^ а б "PSICQUIC View для ISLR (человек)". www.ebi.ac.uk. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 3 августа 2020.
  76. ^ Эспиноза Э.Дж., Калеро М., Шридеви К., Пфеффер С.Р. (май 2009 г.). «RhoBTB3: АТФаза семейства Rho GTPase, необходимая для транспортировки эндосом по Гольджи». Клетка. 137 (5): 938–48. Дои:10.1016 / j.cell.2009.03.043. ЧВК  2801561. PMID  19490898.
  77. ^ «Лейшманолизиноподобная пептидаза LMLN [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. В архиве с оригинала 7 декабря 2019 г.. Получено 3 августа 2020.
  78. ^ Тейлор В.А., Стоун Х.К., Шу М.П., ​​Чжао Х, Сетчелл К.Д., Эркан Э. (декабрь 2019 г.). «Нарушение метаболизма сфинголипидов из-за дефицита сфингозин-1-фосфатлиазы приводит к врожденному нефротическому синдрому». Международные отчеты почек. 4 (12): 1763–1769. Дои:10.1016 / j.ekir.2019.07.018. ЧВК  6895586. PMID  31844815.
  79. ^ а б Pfefferle S, Schöpf J, Kögl M, Friedel CC, Müller MA, Carbajo-Lozoya J, et al. (Октябрь 2011 г.). «Взаимодействие SARS-коронавирус-хозяин: идентификация циклофилинов как мишени для ингибиторов пан-коронавируса». PLoS Патогены. 7 (10): e1002331. Дои:10.1371 / journal.ppat.1002331. ЧВК  3203193. PMID  22046132. В архиве с оригинала 25 июля 2020 г.. Получено 3 августа 2020.
  80. ^ а б Mizutani Y, Kobayashi H, Iida T, Asai N, Masamune A, Hara A, et al. (Октябрь 2019 г.). «Мефлин-положительные ассоциированные с раком фибробласты ингибируют канцерогенез поджелудочной железы». Исследования рака. 79 (20): 5367–5381. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-19-0454. PMID  31439548. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 3 августа 2020.
  81. ^ а б c Xu J, Tang Y, Sheng X, Tian Y, Deng M, Du S и др. (20 августа 2019 г.). Стромальный ISLR способствует регенерации кишечника и раку, подавляя эпителиальную передачу сигналов Hippo. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 3 августа 2020.
  82. ^ а б Алазами А.М., Маддиревула С., Сейдахмед М.З., Албхлал Л.А., Алькурая Ф.С. (январь 2019 г.). «Новый ISLR2-связанный аутосомно-рецессивный синдром врожденной гидроцефалии, артрогрипоза и вздутия живота». Генетика человека. 138 (1): 105–107. Дои:10.1007 / s00439-018-1963-3. PMID  30483960. S2CID  53781275. В архиве из оригинала 23 сентября 2020 г.. Получено 3 августа 2020.