Альфакоронавирус - Alphacoronavirus

Альфакоронавирус
12985 2015 421 Рис1 HTML.webp
Вирус эпидемической диареи свиней структура генома и вириона
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Писувирикота
Учебный класс:Pisoniviricetes
Заказ:Нидовиралес
Семья:Coronaviridae
Подсемейство:Ортокоронавирины
Род:Альфакоронавирус
Подроды и виды

См. Текст

Альфакоронавирусы (Alpha-CoV) являются представителями первого из четырех родов (Альфа-, Бета-, Гамма-, и Дельта ) из коронавирусы. Они есть положительный смысл, одноцепочечный РНК-вирусы которые заражают как людей, так и млекопитающие. У них сферические вирионы с булавовидными выступы на поверхности и вирусный конверт.

Альфа-коронавирусы относятся к подсемейству Ортокоронавирины семьи Coronaviridae. Оба Альфа- и Бетакоронавирус родословные происходят от вирусный генофонд летучих мышей.[1][2][3] Альфакоронавирусы ранее были известны как "филогруппа 1 коронавирусы ».

Этимология

Название альфа-коронавирус происходит от Древнегреческий ἄλφα (альфа, "первый письмо из Греческий алфавит «) и κορώνη (korṓnē,« гирлянда, венок »), что означает корона, которая описывает внешний вид поверхностных выступов, видимых под электронной микроскопией, которые напоминают солнечная корона.[4]

Структура

Вирион имеет сферическую оболочку диаметром 120–160 нм и оболочку ядра около 65 нм. Гликопротеины и тримеры образуют большие выступы на поверхности, которые создают вид солнечной короны. Этот род, как и другие коронавирусы, имеет белок-шип с машиной слияния типа II (S2) и рецептор-связывающим доменом (S1). Он собирается в тример. В отличие от бета- и гаммакоронавирусов, этот белок не расщепляется на две половины.[5]

Геном

Генетические отношения между различными генотипами коронавирусов кошек (FCov) и коронавирусов собак (CCoV). Рекомбинация у стрелок.[6]

Геном позитивный смысл, одноцепочечная РНК длиной от 27 до 29 килобазы и 3’-polyA хвост. Два больших, перекрывающихся ORF на 5'-конце генома кодируют основные неструктурные белки, выраженные как гибридный белок к рибосомальный сдвиг рамки. К ним относятся регионы с протеаза, геликаза и мотивы РНК-полимеразы. Далее идут семь других генов, которые кодируют структурные белки. Они выражаются из 3'-концевого вложенного набора субгеномные мРНК.

Рекомбинация

Оба типа Альфакоронавирус 1, кошачий коронавирус (FCoV) и собачий коронавирус (CCoV), как известно, существуют в двух серотипах. Мишени серотипа II Аминопептидаза N, в то время как рецептор серотипа I неизвестен. Разница связана с другим белком-шипом.[7] Есть общий предок для FCoV и CCoV. Этот предок постепенно превратился в FCoV I и CCoV I. Белок S из неизвестного вируса был рекомбинирован в предка и дал начало CCoV II. CCoV II снова рекомбинировал с FCoV, чтобы создать FCoV II. CCoV II постепенно превратился в TGEV. Удаление пика в TGEV создает PRCV. Все эти вирусы разделены на подроды Тегаковирус.[7]

Классификация

Филогенетическое дерево рода Альфакоронавирусы с животными-хозяевами, указанными справа.

Выделяют следующие подроды и виды:[8]

Коронавирус
Вирус H1N1

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Woo, P.C .; Wang, M .; Lau, S.K .; Xu, H .; Poon, R.W .; Guo, R .; Wong, B.H .; Gao, K .; Tsoi, H.W .; Huang, Y .; Ли, К. С .; Lam, C. S .; Chan, K. H .; Zheng, B.J .; Юэнь, К. Я. (2007). «Сравнительный анализ двенадцати геномов трех новых коронавирусов группы 2c и 2d выявил уникальные особенности группы и подгруппы». Журнал вирусологии. 81 (4): 1574–85. Дои:10.1128 / JVI.02182-06. ЧВК  1797546. PMID  17121802.
  2. ^ Lau, S.K .; Woo, P.C .; Yip, C. C .; Fan, R. Y .; Huang, Y .; Wang, M .; Guo, R .; Lam, C. S .; Цанг, А. К .; Lai, K. K .; Chan, K. H .; Che, X. Y .; Zheng, B.J .; Юэнь, К. Я. (2012). «Выделение и характеристика нового коронавируса бета-коронавируса подгруппы А, кроличьего коронавируса HKU14, от домашних кроликов». Журнал вирусологии. 86 (10): 5481–96. Дои:10.1128 / JVI.06927-11. ЧВК  3347282. PMID  22398294.
  3. ^ Lau, S.K .; Пун, Р. У .; Wong, B.H .; Wang, M .; Huang, Y .; Xu, H .; Guo, R .; Ли, К. С .; Gao, K .; Chan, K. H .; Zheng, B.J .; Woo, P.C .; Юэн, К. Я. (2010). «Сосуществование разных генотипов в одной и той же летучей мыши и серологическая характеристика коронавируса летучих мышей Rousettus HKU9, принадлежащего к новой подгруппе бета-коронавируса». Журнал вирусологии. 84 (21): 11385–94. Дои:10.1128 / JVI.01121-10. ЧВК  2953156. PMID  20702646.
  4. ^ Декаро, Никола (2011). «Альфакоронавирус». Индекс вирусов Спрингера. С. 371–383. Дои:10.1007/978-0-387-95919-1_56. ISBN  978-0-387-95918-4.
  5. ^ Рэпп, Дэниел; Маклеллан, Джейсон С .; Галлахер, Том (13 ноября 2019 г.). «Крио-электронная микроскопия структуры 3,1 Ангстрема белка-шипа вируса эпидемической диареи свиней в префузионной конформации». Журнал вирусологии. 93 (23): e00923-19. Дои:10.1128 / JVI.00923-19. ЧВК  6854500. PMID  31534041.
  6. ^ Ле Подер, Софи (31.07.2011). «Коронавирусы кошек и собак: общие генетические и патобиологические особенности». Достижения вирусологии. Получено 2020-06-29.
  7. ^ а б Jaimes, Javier A .; Millet, Jean K .; Стаут, Элисон Э .; Андре, Николь М .; Уиттакер, Гэри Р. (10 января 2020 г.). "Сказка о двух вирусах: отличительные гликопротеины шипованных коронавирусов кошек". Вирусы. 12 (1): 83. Дои:10.3390 / v12010083. ЧВК  7019228. PMID  31936749.
  8. ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2019 г.». talk.ictvonline.org. Международный комитет по таксономии вирусов. Получено 20 июн 2020.

внешняя ссылка