Коронавирус тяжелого острого респираторного синдрома - Severe acute respiratory syndrome coronavirus

Эта статья о штамме вируса, вызывающем атипичную пневмонию. О штамме, вызывающем COVID-19, см. Тяжелый острый респираторный синдром коронавирус 2. Для видов, к которым принадлежат оба штамма, см. Коронавирус, связанный с тяжелым острым респираторным синдромом.

Коронавирус тяжелого острого респираторного синдрома
SARS virion.gif
Изображение электронного микроскопа ОРВИ вирион
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Писувирикота
Учебный класс:Pisoniviricetes
Заказ:Нидовиралес
Семья:Coronaviridae
Род:Бетакоронавирус
Подрод:Сарбековирус
Разновидность:
Коронавирус, связанный с тяжелым острым респираторным синдромом
Напряжение:
Коронавирус тяжелого острого респираторного синдрома
Синонимы
  • SARS коронавирус
  • Коронавирус, связанный с SARS
  • Коронавирус тяжелого острого респираторного синдрома[1]

Коронавирус тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV или же SARS-CoV-1)[2] это напряжение из вирус что вызывает Острое респираторное заболевание (SARS).[3] Это окутанный, положительный смысл, одноцепочечный РНК-вирус который заражает эпителиальные клетки в легких.[4] Вирус проникает в клетку-хозяин, связываясь с ангиотензин-превращающий фермент 2.[5] Он заражает люди, летучие мыши, и пальмовые циветты.[6][7]

16 апреля 2003 г. вспышка атипичной пневмонии в Азия и вторичные случаи в других странах мира, Всемирная организация здоровья (ВОЗ) выпустила пресс-релиз, в котором говорилось, что коронавирус Выявленная рядом лабораторий была официальной причиной SARS. В Центры по контролю и профилактике заболеваний (CDC) в США и Национальная лаборатория микробиологии (NML) в Канаде идентифицировали SARS-CoV-1. геном в апреле 2003 г.[8][9] Ученые из Университет Эразма в Роттердам, Нидерланды, продемонстрировали, что коронавирус SARS выполнил Постулаты Коха тем самым подтверждая его как возбудителя. В экспериментах макаки у инфицированных вирусом развились те же симптомы, что и у людей, пострадавших от SARS.[10]

Аналогичный вирус был обнаружен в декабре 2019 года. Этот вирус, названный Тяжелый острый респираторный синдром коронавирус 2 (SARS-CoV-2) является возбудителем продолжающейся COVID-19 пандемия.[11]

ОРВИ

Сканирующая электронная микрофотография ОРВИ вирионы

Острое респираторное заболевание (SARS) - это заболевание, вызываемое SARS-CoV-1. Он часто вызывает тяжелое заболевание и первоначально характеризуется системными симптомами боли в мышцах, Головная боль, и высокая температура с последующим появлением респираторных симптомов через 2–14 дней,[12] в основном кашель, одышка, и пневмония. Еще одна частая находка у пациентов с ОРВИ - уменьшение количества лимфоцитов, циркулирующих в крови.[13]

Во время вспышки атипичной пневмонии в 2003 году умерло около 9% пациентов с подтвержденной инфекцией SARS-CoV-1.[14] Смертность была намного выше у лиц старше 60 лет, при этом уровень смертности приближался к 50% для этой подгруппы пациентов.[14]

История

Передача SARS-CoV-1-1 от млекопитающих в качестве биологических носителей человеку

17 марта 2003 г. ВОЗ создала глобальную сеть ведущих лабораторий для сотрудничества в выявлении возбудителя SARS. Вначале лаборатории в сети сузили поиск до членов парамиксовирус и семьи с коронавирусом. Первые результаты, которыми поделились лаборатории, указали на коронавирусы с растущей последовательностью. 21 марта ученые из Университет Гонконга объявила о выделении нового вируса, который подозревался в возбудителе атипичной пневмонии.[15]

12 апреля ученые, работающие в Центре геномных наук Майкла Смита в г. Ванкувер закончил картирование генетическая последовательность коронавируса, предположительно связанного с атипичной пневмонией. Команду возглавил Марко Марра и работал в сотрудничестве с британская Колумбия Центр по контролю за заболеваниями и Национальная лаборатория микробиологии в Виннипег, Манитоба, используя образцы от инфицированных пациентов в Торонто. Карта, которую ВОЗ провозгласила важным шагом вперед в борьбе с атипичной пневмонией, распространяется среди ученых всего мира через веб-сайт GSC (см. Ниже). Дональд Лоу из Больница горы Синай в Торонто описал открытие, как «беспрецедентную скорость».[16] Последовательность коронавируса SARS с тех пор подтверждена другими независимыми группами.

Молекулярно-эпидемиологический исследования показали, что вирус вспышки 2002–2003 годов на юге Китая и вирус, выделенный в том же районе в конце 2003 и начале 2004 года, различаются, что указывает на отдельные случаи скрещивания видов.[17] Филогения Из штаммов вспышек видно, что юго-западные провинции, включая Юньнань, Гуйчжоу и Гуанси, сравниваются с человеческим SARS-CoV-1 лучше, чем в других провинциях, но эволюция вирусов является продуктом взаимодействия и особенностей хозяина.[18]

В конце мая 2003 г. исследования образцов диких животных, продаваемых в пищу на местном рынке в г. Гуандун, Китай, обнаружили, что штамм коронавируса SARS может быть выделен из пальмовые циветты в масках (Paguma sp.), но животные не всегда проявляли клинические признаки. Предварительный вывод заключался в том, что вирус атипичной пневмонии пересек ксенографический барьер от пальмовых циветт к людям, и более 10 000 пальмовых циветт в масках были убиты в провинции Гуандун. Позже вирус был обнаружен в енотовидные собаки (Никтерейтеус sp.), хорек барсуки (Melogale spp.) и домашних кошек. В 2005 году в двух исследованиях был выявлен ряд коронавирусов, похожих на SARS, в Китае. летучие мыши.[19][20] Хотя вирус SARS летучих мышей не реплицировался в культуре клеток, в 2008 году американские исследователи[21] изменил генетическую структуру вируса SARS летучих мышей с человеческим рецептор-связывающий домен как у вируса летучих мышей, так и у мышей, которые продемонстрировали, как зооноз может произойти в эволюции.[22]Филогенетический анализ этих вирусов показал высокую вероятность того, что коронавирус SARS возник от летучих мышей и распространился среди людей напрямую или через животных, находящихся на китайских рынках. У летучих мышей не было никаких видимых признаков заболевания, но они, вероятно, являются естественными резервуарами коронавирусов, подобных атипичной пневмонии. В конце 2006 года ученые из Китайского центра по контролю и профилактике заболеваний Университет Гонконга и Гуанчжоу Центр по контролю и профилактике заболеваний установил генетическую связь между коронавирусом SARS, появляющимся у циветт, и людьми, подтвердив утверждения о том, что вирус перескочил между видами.[23]

Вирусология

SARS-CoV-1 следует стратегии репликации, типичной для коронавирус подсемейство. Первичный человеческий рецептор вируса ангиотензин-превращающий фермент 2 (ACE2) и гемаглютинин (HE),[24] впервые обнаружен в 2003 году.[25][26]

SARS-CoV-1 у человека, по-видимому, имел сложную историю рекомбинация между наследственными коронавирусы которые были размещены в нескольких различных группах животных.[27][28] Для того, чтобы рекомбинация произошла как минимум два SARS-CoV-1 геномы должны присутствовать в одной и той же клетке-хозяине. Рекомбинация может происходить во время репликации генома, когда РНК-полимераза переключается с одного шаблона на другой (рекомбинация с выбором копии).[28]


SARS-CoV-1 - один из семи известных коронавирусов, заражающих людей. Остальные шесть:[29]

Лечение

В настоящее время исследования продолжаются.

Примеры многообещающих методов лечения включают: глицирризин (лакрица ),[30][31][32][33] фавипиравир и Т. Д.

Смотрите также

Примечания

  1. ^ "История таксономии ICTV: Коронавирус, связанный с тяжелым острым респираторным синдромом". Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Получено 2019-01-27.
  2. ^ Нилтье ван Дормален; Трентон Бушмейкер; Дилан Х. Моррис; Минди Дж. Холбрук; Амандин Гэмбл; Брэнди Н. Уильямсон; Азайби Тамин; Дженнифер Л. Харкорт; Натали Дж. Торнбург; Сьюзен И. Гербер; Джеймс О. Ллойд-Смит; Эмми де Вит; Винсент Дж. Мюнстер (17 марта 2020 г.). «Аэрозоль и стабильность поверхности SARS-CoV-2 по сравнению с SARS-CoV-1». Медицинский журнал Новой Англии. 382 (16): 1564–1567. Дои:10.1056 / NEJMc2004973. ЧВК  7121658. PMID  32182409.
  3. ^ Тиль, В., изд. (2007). Коронавирусы: молекулярная и клеточная биология (1-е изд.). Caister Academic Press. ISBN  978-1-904455-16-5.
  4. ^ Fehr, Anthony R .; Перлман, Стэнли (2015). «Коронавирусы: обзор их репликации и патогенеза». Коронавирусы. Методы молекулярной биологии. 1282. Клифтон, Нью-Джерси, США. С. 1–23. Дои:10.1007/978-1-4939-2438-7_1. ISBN  978-1-4939-2437-0. ISSN  1064-3745. ЧВК  4369385. PMID  25720466. SARS-CoV в первую очередь поражает эпителиальные клетки легких. Вирус способен проникать в макрофаги и дендритные клетки, но приводит только к абортивной инфекции [87,88].
  5. ^ Xing-Yi Ge; Цзя-Лу Ли; Син-Лу Ян; и другие. (2013). «Выделение и характеристика коронавируса, похожего на SARS у летучих мышей, который использует рецептор ACE2». Природа. 503 (7477): 535–538. Bibcode:2013Натура.503..535Г. Дои:10.1038 / природа12711. ЧВК  5389864. PMID  24172901.
  6. ^ Wong, Antonio C.P .; Ли, Синь; Lau, Susanna K. P .; Ву, Патрик С. Ю. (20 февраля 2019 г.). «Глобальная эпидемиология коронавирусов летучих мышей». Вирусы. 11 (2): 174. Дои:10.3390 / v11020174. ISSN  1999-4915. ЧВК  6409556. PMID  30791586. В частности, было обнаружено, что подковообразные летучие мыши являются резервуаром SARS-подобных CoV, в то время как пальмовые циветты считаются промежуточным хозяином для SARS-CoV [43,44,45].
  7. ^ Ли, Фанг (октябрь 2013 г.). «Распознавание рецепторов и межвидовые инфекции коронавируса SARS». Противовирусные исследования. 100 (1): 246–254. Дои:10.1016 / j.antiviral.2013.08.014. ISSN  0166-3542. ЧВК  3840050. PMID  23994189. См. Рисунок 6.
  8. ^ «Вспоминая атипичную пневмонию: смертельная загадка и попытки ее разгадать». Центры по контролю и профилактике заболеваний. 2013-04-11. В архиве из оригинала от 01.08.2013. Получено 2013-08-03.
  9. ^ «Коронавирус, которого раньше не было у людей, является причиной атипичной пневмонии». Всемирная организация здравоохранения ООН. 2006-04-16. В архиве из оригинала 12.08.2004. Получено 2006-07-05.
  10. ^ Fouchier, R.A .; Kuiken, T .; Schutten, M .; и другие. (2003). «Этиология: постулаты Коха выполнены для вируса атипичной пневмонии». Природа. 423 (6937): 240. Bibcode:2003Натура.423..240F. Дои:10.1038 / 423240a. ЧВК  7095368. PMID  12748632.
  11. ^ Lau, Susanna K. P .; Luk, Hayes K. H .; Wong, Antonio C.P .; Li, Kenneth S.M .; Чжу, Лунчао; Он, Зиронг; Фунг, Джошуа; Чан, Тони Т. Й .; Fung, Kitty S.C .; Ву, Патрик С. Ю. (2020). «Возможное происхождение тяжелого острого респираторного синдрома, вызванного коронавирусом 2 от летучих мышей, - Том 26, номер 7 - июль 2020 года - Журнал Emerging Infectious Diseases - CDC». Emerg Infect Dis. 26 (7): 1542–1547. Дои:10.3201 / eid2607.200092. ЧВК  7323513. PMID  32315281.
  12. ^ Chan-Yeung, M .; Сюй Р. Х. (ноябрь 2003 г.). «ОРВИ: эпидемиология». Респирология. Карлтон, Виктория, США. 8 (Прил.): S9 – S14. Дои:10.1046 / j.1440-1843.2003.00518.x. ЧВК  7169193. PMID  15018127.
  13. ^ Ян, М .; Лизать.; Ли, К .; Hon, K. L .; Ng, M. H .; Chan, P.K .; Фок, Т. Ф. (август 2004 г.). «Гематологические данные у пациентов с ОРВИ и возможные механизмы». Международный журнал молекулярной медицины (рассмотрение). 14 (2): 311–315. Дои:10.3892 / ijmm.14.2.311. PMID  15254784. В архиве из оригинала от 24.09.2015.
  14. ^ а б Соренсен, М. Д .; Соренсен, В .; Gonzalez-Dosal, R .; Melchjorsen, C.J .; Weibel, J .; Wang, J .; Jun, C.W .; Huanming, Y .; Кристенсен, П. (май 2006 г.). «Тяжелый острый респираторный синдром (ОРВИ): разработка средств диагностики и противовирусных препаратов». Летопись Нью-Йоркской академии наук. 1067 (1): 500–505. Bibcode:2006НЯСА1067..500С. Дои:10.1196 / летопись.1354.072. ЧВК  7167626. PMID  16804033.
  15. ^ «Тяжелый острый респираторный синдром (SARS) - вспышка в нескольких странах - Обновление 12». ВОЗ. 27 марта 2003 г.
  16. ^ «Лаборатория Британской Колумбии раскрыла код подозреваемого в атипичной пневмонии». Канада: CBC Новости. Апрель 2003 г. В архиве из оригинала от 26.11.2007.
  17. ^ Ван, Лин-Фа и др. «Обзор летучих мышей и атипичной пневмонии». Возникающие инфекционные заболевания т. 12,12 (2006): 1834–40. Веб-сайт Национальной медицинской библиотеки DOI: 10.3201 / eid1212.060401
  18. ^ Ю, Пинг и др. «Географическая структура коронавирусов, связанных с SARS летучих мышей». Инфекция, генетика и эволюция: Журнал молекулярной эпидемиологии и эволюционной генетики инфекционных заболеваний т. 69 (2019): 224–229. Веб-сайт Национальной медицинской библиотеки DOI: 10.1016 / j.meegid.2019.02.001
  19. ^ Li, W .; Ши, З .; Ю, М .; и другие. (2005). «Летучие мыши - естественные резервуары SARS-подобных коронавирусов». Наука. 310 (5748): 676–679. Bibcode:2005Sci ... 310..676L. Дои:10.1126 / science.1118391. PMID  16195424. S2CID  2971923.
  20. ^ Lau, S.K .; Woo, P.C .; Ли, К. С .; и другие. (2005). «Коронавирусоподобный вирус тяжелого острого респираторного синдрома у китайских подковоносов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 102 (39): 14040–14045. Bibcode:2005ПНАС..10214040Л. Дои:10.1073 / pnas.0506735102. ЧВК  1236580. PMID  16169905.
  21. ^ Беккер, Мишель М. и др. «Синтетический рекомбинантный коронавирус, похожий на SARS летучих мышей, заразен в культивируемых клетках и у мышей». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки т. 105,50 (2008): 19944-9. DOI: 10.1073 / pnas.0808116105. Веб-сайт Национальной медицинской библиотеки Проверено 13 апреля 2020.
  22. ^ Национальные академии наук, инженерии и медицины, Отдел исследований Земли и жизни, Совет по наукам о жизни, Совет по химическим наукам и технологиям, Комитет по стратегиям выявления и устранения потенциальных уязвимостей биологической защиты, создаваемых синтетической биологией. (5 декабря 2018 г.). Биозащита в эпоху синтетической биологии. Вашингтон, округ Колумбия: Пресса национальных академий. С. 44–45. ISBN  978-0-309-46518-2 DOI 10.17226 / 24890. Google Книги. Проверено 13 апреля 2020.
  23. ^ «Ученые доказывают связь SARS с циветтой». China Daily. 2006-11-23. В архиве из оригинала от 14.06.2011.
  24. ^ Mesecar, Andrew D .; Ратиа, Киира (23.06.2008). «Вирусное разрушение рецепторов клеточной поверхности: рис. 1» (PDF). Труды Национальной академии наук. 105 (26): 8807–8808. Дои:10.1073 / pnas.0804355105. ЧВК  2449321. PMID  18574141. В архиве (PDF) из оригинала от 07.12.2020.
  25. ^ Ли, Вэньхуэй; Мур, Майкл Дж .; Васильева Наталья; Суй, Цзяньхуа; Вонг, Су Ки; Берн, Майкл А .; Сомасундаран, Мохан; Салливан, Джон Л .; Лузуриага, Катерина; Greenough, Thomas C .; Чхве, Херюн (ноябрь 2003 г.). «Ангиотензин-превращающий фермент 2 является функциональным рецептором коронавируса SARS». Природа. 426 (6965): 450–454. Bibcode:2003Натура 426..450л. Дои:10.1038 / природа02145. ISSN  0028-0836. ЧВК  7095016. PMID  14647384.
  26. ^ «Адаптация бетакоронавируса к человеку, связанная с прогрессирующей потерей лектиновой активности гемагглютинин-эстеразы». Клеточный хозяин и микроб. 21 (3): 356–366. 2017-03-08. Дои:10.1016 / j.chom.2017.02.008. ISSN  1931-3128.
  27. ^ Стэнхоуп М.Дж., Браун Дж. Р., Амрин-Мадсен Х. Данные эволюционного анализа нуклеотидных последовательностей для рекомбинантной истории SARS-CoV. Заразить Genet Evol. 2004 Март; 4 (1): 15-9. PMID  15019585
  28. ^ а б Чжан XW, Яп Ю.Л., Данчин А. Проверка гипотезы о рекомбинантном происхождении коронавируса, ассоциированного с SARS. Arch Virol. 2005 Янв; 150 (1): 1–20. Epub 2004 11 октября. PMID  15480857
  29. ^ Люнг, Дэниел. «Коронавирусы (включая ОРВИ)». Консультант по инфекционным заболеваниям. Поддержка принятия решений в медицине, ООО. Получено 2020-08-01.
  30. ^ Cinatl, J .; Morgenstern, B .; Bauer, G .; Chandra, P .; Rabenau, H .; Дорр, Х. У. (14 июня 2003 г.). «Глицирризин, активный компонент корней лакрицы и репликация коронавируса, связанного с SARS». Ланцет. 361 (9374): 2045–2046. Дои:10.1016 / с0140-6736 (03) 13615-х. ISSN  1474-547X. ЧВК  7112442. PMID  12814717.
  31. ^ «Глицирризин: альтернативный препарат для лечения инфекции COVID-19 и связанного с ней респираторного синдрома?». Фармакология и терапия. 214: 107618. 2020-10-01. Дои:10.1016 / j.pharmthera.2020.107618. ISSN  0163-7258.
  32. ^ Pilcher, HelenR. (13.06.2003). «Лакрица может вылечить ОРВИ». Природа: news030609–16. Дои:10.1038 / news030609-16.
  33. ^ Ховер, Джеральд; Балтина, Лидия; Кондратенко, Римма; Балтина, Лия; Толстиков, Генрих А .; Doerr, Hans W .; Цинатль, Йиндрих младший (19 января 2005 г.). «Противовирусная активность производных глицирризиновой кислоты против SARS-коронавируса». Журнал медицинской химии. 48 (4): 1256–1259. Дои:10.1021 / jm0493008. PMID  15715493 - через ResearchGate.

Рекомендации

внешняя ссылка