Голо- (ацил-белок-носитель) синтаза - Holo-(acyl-carrier-protein) synthase
| фосфопантетеинилтрансфераза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 тример голо- [ацил-носитель-белок] синтазы, Helicobacter pylori | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 2.7.8.7 | ||||||||
| Количество CAS | 37278-30-1 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
| БРЕНДА | BRENDA запись | ||||||||
| ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
| КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| ACPS | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура комплекса 4'-фосфопантетеинилтрансфераза sfp-кофермент а | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ACPS | ||||||||
| Pfam | PF01648 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR008278 | ||||||||
| SCOP2 | 1qr0 / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
В энзимология и молекулярная биология, а холо- [ацил-белок-носитель] синтаза (ACPS, EC 2.7.8.7 ) является фермент это катализирует химическая реакция:
- КоА- [4'-фосфопантетеин] + апо-белок-носитель ацила аденозин 3 ', 5'-бисфосфат + голо-белок-носитель ацила
Этот фермент принадлежит к семейству трансферазы особенно те, которые переносят нестандартные замещенные фосфатные группы. Он также известен как 4'-фосфопантетеинилтрансфераза после группы переходит.
Функция
Все известные до сих пор ферменты ACPS эволюционно связаны друг с другом в одном суперсемействе белки. Он передает 4'-фосфопантетеин (4'-PP) фрагмент из кофермент А (CoA) к инварианту серин в белок-носитель ацила (ACP), небольшой белок, ответственный за активацию ацильной группы в жирная кислота биосинтез. Эта посттрансляционная модификация делает holo-ACP способным ацил групповая активация через тиоэтерификацию цистеамин тиол из 4'-ПП.[1] Это суперсемейство состоит из двух подтипов: тримерного типа ACPS, такого как Кишечная палочка ACPS и мономерный Sfp (синтезирующий PCP) тип, такой как Б. subtilis SFP. Сейчас известны конструкции из обоих семейств. В активный сайт вмещает магний ион. Самый высокий консервированные регионы белка участвуют в привязка то магний ион.[2][3]
Номенклатура
В систематическое название этого класса ферментов КоА- [4'-фосфопантетеин]: апо [ацил-белок-носитель] 4'-пантетеинфосфотрансфераза. Другие широко используемые названия, не обращая внимания на различие в написании синтетазы / синтазы, включают ацильный белок-носитель холопротеинсинтетазу, голо-АСР-синтетазу, кофермент A: синтетаза жирных кислот, апофермент 4'-фосфопантетеин, ацильный белок-носитель-синтетаза (ACPS), PPTase, ацильный носитель. протеин-синтаза, трансфераза P-pant и КоА: апо [ацил-белок-носитель] пантетеинфосфотрансфераза.
Структурные исследования
На конец 2007 г. 8 структуры были решены для этого класса ферментов, с PDB коды доступа 1F7L, 1F7T, 1F80, 1FTE, 1FTF, 1FTH, 2JBZ, и 2JCA.
использованная литература
- ^ Lambalot RH, Walsh CT (октябрь 1995 г.). «Клонирование, перепроизводство и характеристика синтазы белка-носителя голоацила Escherichia coli». Журнал биологической химии. 270 (42): 24658–61. Дои:10.1074 / jbc.270.42.24658. PMID 7559576.
- ^ Рейтер К., Мофид М.Р., Марахиэль М.А., Фичнер Р. (декабрь 1999 г.). «Кристаллическая структура фермента, активирующего сурфактинсинтетазу, sfp: прототип суперсемейства 4'-фосфопантетеинилтрансфераз». Журнал EMBO. 18 (23): 6823–31. Дои:10.1093 / emboj / 18.23.6823. ЧВК 1171745. PMID 10581256.
- ^ Марселла А.М., Калбертсон С.Дж., Шогрен-Кнаак М.А., Барб А.В. (24 ноября 2017 г.). «Структура, высокое сродство и отрицательная кооперативность комплекса Holo- (ацил-несущий белок): голо- (ацил-несущий белок) комплекса Escherichia coli». Журнал молекулярной биологии. 429 (23): 3763–3775. Дои:10.1016 / j.jmb.2017.10.015. PMID 29054754.
дальнейшее чтение
- Эловсон Дж., Вагелос PR (июль 1968 г.). "Ацильный протеин-носитель. X. Ацил-протеин-синтетаза". Журнал биологической химии. 243 (13): 3603–11. PMID 4872726.
- Прескотт DJ, Вагелос PR (1972). «Ацильный белок-носитель». Достижения в энзимологии и смежных областях молекулярной биологии. Достижения в энзимологии и смежных областях молекулярной биологии. 36. С. 269–311. Дои:10.1002 / 9780470122815.ch8. ISBN 9780470122815. PMID 4561013.
- Lambalot RH, Gehring AM, Flugel RS, Zuber P, LaCelle M, Marahiel MA, Reid R, Khosla C, Walsh CT (ноябрь 1996). «Новое суперсемейство ферментов - фосфопантетеинилтрансферазы». Химия и биология. 3 (11): 923–36. Дои:10.1016 / S1074-5521 (96) 90181-7. PMID 8939709.
- Walsh CT, Gehring AM, Weinreb PH, Quadri LE, Flugel RS (октябрь 1997 г.). «Посттрансляционная модификация поликетидных и негрибосомных пептидных синтаз». Современное мнение в области химической биологии. 1 (3): 309–15. Дои:10.1016 / S1367-5931 (97) 80067-1. PMID 9667867.
- Mootz HD, Finking R, Marahiel MA (октябрь 2001 г.). «Перенос 4'-фосфопантетеина в первичном и вторичном метаболизме Bacillus subtilis». Журнал биологической химии. 276 (40): 37289–98. Дои:10.1074 / jbc.M103556200. PMID 11489886.
- Джоши А.К., Чжан Л., Ранган В.С., Смит С. (август 2003 г.). «Клонирование, экспрессия и характеристика человеческой 4'-фосфопантетеинилтрансферазы с широкой субстратной специфичностью». Журнал биологической химии. 278 (35): 33142–9. Дои:10.1074 / jbc.M305459200. PMID 12815048.
| Эта EC 2.7 фермент -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |