Ундекапренил-дифосфатаза - Undecaprenyl-diphosphatase

ундекапренил-дифосфатаза
Идентификаторы
Номер ЕС3.6.1.27
Количество CAS9077-80-9
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтологияAmiGO / QuickGO
Белок устойчивости к бацитрацину
Идентификаторы
Символ?
PfamPF02673
ИнтерПроIPR003824
OPM суперсемейство479
Белок OPM5oon

В энзимология, ундекапренил-дифосфатаза (EC 3.6.1.27 ) является фермент который катализирует то химическая реакция

ундекапренил дифосфат + H2О ундекапренилфосфат + фосфат

Таким образом, два субстраты этого фермента ундекапренил дифосфат и ЧАС2О, а его два товары представляют собой ундекапренилфосфат и фосфат. Ферментативная активность усиливается двухвалентными катионами, особенно Ca2+.

У многих бактерий этот фермент является мембранный белок который участвует в биосинтез пептидогликана. Фермент участвует в обеспечении сопротивление к антибиотику бацитрацин.[1]

Номенклатура

Этот фермент принадлежит к семейству гидролазы особенно те, которые действуют на ангидриды кислот в фосфорсодержащих ангидридах. В систематическое название этого класса ферментов является ундекапренил-дифосфатфосфогидролаза. Другие широко используемые названия включают ундекапренилпирофосфатфосфатазу (Uppp), UPP фосфатазу, BacA, C55-изопренилдифосфатазу, C55-изопренилпирофосфатазу и изопренилпирофосфатазу.

Примечание. Фермент Uppp / BacA (EC 3.6.1.27) иногда неправильно назывался "ундекапренолкиназа ".[2] Однако это название следует зарезервировать для отдельного фермента (EC 2.7.1.66), который катализирует добавление фосфатной группы из АТФ к ундекапренолу (C55-изопрениловый спирт).

Структура

Рентгеновские кристаллические структуры мембранной формы фермента из Кишечная палочка[3][4] доступны (идентификаторы PDB: 5OON,[5] 6CB2[6]).

Рекомендации

  1. ^ Чалкер А.Ф., Ингрэхэм К.А., Лансфорд Р.Д., Брайант А.П., Брайант Дж., Уоллис Н.Г., Броски Дж. П., Пирсон С. К., Холмс Д. Д. (июль 2000 г.). «Ген bacA, который определяет чувствительность к бацитрацину у Streptococcus pneumoniae и Staphylococcus aureus, также необходим для вирулентности». Микробиология. 146 (Пт 7): 1547–53. Дои:10.1099/00221287-146-7-1547. PMID  10878119.
  2. ^ Эль-Гачи М., Бухсс А., Блано Д., Менжин-Лекреулкс Д. (июль 2004 г.). «Ген bacA Escherichia coli кодирует активность ундекапренилпирофосфатфосфатазы». Журнал биологической химии. 279 (29): 30106–13. Дои:10.1074 / jbc.M401701200. PMID  15138271.
  3. ^ Эль-Гачи М., Хау Н., Хуанг С.Й., Олиерик В., Warshamanage R, Тузе Т., Вейхерт Д., Стансфельд П.Дж., Ван М., Керфф Ф., Кэффри М. (март 2018 г.). «Кристаллическая структура ундекапренилпирофосфатфосфатазы и ее роль в биосинтезе пептидогликана». Nature Communications. 9 (1): 1078. Дои:10.1038 / s41467-018-03477-5. ЧВК  5852022. PMID  29540682.
  4. ^ Workman SD, Worrall LJ, Strynadka NC (март 2018 г.). «Кристаллическая структура внутримембранной фосфатазы, центральной для биосинтеза пептидогликана клеточной стенки бактерий и рециклинга липидов». Nature Communications. 9 (1): 1159. Дои:10.1038 / s41467-018-03547-8. ЧВК  5861054. PMID  29559664.
  5. ^ «5OON - Структура ундекапренилпирофосфатфосфатазы, BacA». Банк данных белков RCSB.
  6. ^ «6CB2 - Кристаллическая структура Escherichia coli UppP». Банк данных белков RCSB.

дальнейшее чтение

  • Гольдман Р., Строминджер Дж. Л. (август 1972 г.). «Очистка и свойства C 55 -изопренилпирофосфатфосфатазы из Micrococcus lysodeikticus». Журнал биологической химии. 247 (16): 5116–22. PMID  4341539.