Ундекапренил-дифосфатаза - Undecaprenyl-diphosphatase
ундекапренил-дифосфатаза | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||
Номер ЕС | 3.6.1.27 | ||||||||
Количество CAS | 9077-80-9 | ||||||||
Базы данных | |||||||||
IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
БРЕНДА | BRENDA запись | ||||||||
ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
ПРИАМ | профиль | ||||||||
PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
|
Белок устойчивости к бацитрацину | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||
Символ | ? | ||||||||
Pfam | PF02673 | ||||||||
ИнтерПро | IPR003824 | ||||||||
OPM суперсемейство | 479 | ||||||||
Белок OPM | 5oon | ||||||||
|
В энзимология, ундекапренил-дифосфатаза (EC 3.6.1.27 ) является фермент который катализирует то химическая реакция
- ундекапренил дифосфат + H2О ундекапренилфосфат + фосфат
Таким образом, два субстраты этого фермента ундекапренил дифосфат и ЧАС2О, а его два товары представляют собой ундекапренилфосфат и фосфат. Ферментативная активность усиливается двухвалентными катионами, особенно Ca2+.
У многих бактерий этот фермент является мембранный белок который участвует в биосинтез пептидогликана. Фермент участвует в обеспечении сопротивление к антибиотику бацитрацин.[1]
Номенклатура
Этот фермент принадлежит к семейству гидролазы особенно те, которые действуют на ангидриды кислот в фосфорсодержащих ангидридах. В систематическое название этого класса ферментов является ундекапренил-дифосфатфосфогидролаза. Другие широко используемые названия включают ундекапренилпирофосфатфосфатазу (Uppp), UPP фосфатазу, BacA, C55-изопренилдифосфатазу, C55-изопренилпирофосфатазу и изопренилпирофосфатазу.
Примечание. Фермент Uppp / BacA (EC 3.6.1.27) иногда неправильно назывался "ундекапренолкиназа ".[2] Однако это название следует зарезервировать для отдельного фермента (EC 2.7.1.66), который катализирует добавление фосфатной группы из АТФ к ундекапренолу (C55-изопрениловый спирт).
Структура
Рентгеновские кристаллические структуры мембранной формы фермента из Кишечная палочка[3][4] доступны (идентификаторы PDB: 5OON,[5] 6CB2[6]).
Рекомендации
- ^ Чалкер А.Ф., Ингрэхэм К.А., Лансфорд Р.Д., Брайант А.П., Брайант Дж., Уоллис Н.Г., Броски Дж. П., Пирсон С. К., Холмс Д. Д. (июль 2000 г.). «Ген bacA, который определяет чувствительность к бацитрацину у Streptococcus pneumoniae и Staphylococcus aureus, также необходим для вирулентности». Микробиология. 146 (Пт 7): 1547–53. Дои:10.1099/00221287-146-7-1547. PMID 10878119.
- ^ Эль-Гачи М., Бухсс А., Блано Д., Менжин-Лекреулкс Д. (июль 2004 г.). «Ген bacA Escherichia coli кодирует активность ундекапренилпирофосфатфосфатазы». Журнал биологической химии. 279 (29): 30106–13. Дои:10.1074 / jbc.M401701200. PMID 15138271.
- ^ Эль-Гачи М., Хау Н., Хуанг С.Й., Олиерик В., Warshamanage R, Тузе Т., Вейхерт Д., Стансфельд П.Дж., Ван М., Керфф Ф., Кэффри М. (март 2018 г.). «Кристаллическая структура ундекапренилпирофосфатфосфатазы и ее роль в биосинтезе пептидогликана». Nature Communications. 9 (1): 1078. Дои:10.1038 / s41467-018-03477-5. ЧВК 5852022. PMID 29540682.
- ^ Workman SD, Worrall LJ, Strynadka NC (март 2018 г.). «Кристаллическая структура внутримембранной фосфатазы, центральной для биосинтеза пептидогликана клеточной стенки бактерий и рециклинга липидов». Nature Communications. 9 (1): 1159. Дои:10.1038 / s41467-018-03547-8. ЧВК 5861054. PMID 29559664.
- ^ «5OON - Структура ундекапренилпирофосфатфосфатазы, BacA». Банк данных белков RCSB.
- ^ «6CB2 - Кристаллическая структура Escherichia coli UppP». Банк данных белков RCSB.
дальнейшее чтение
Этот EC 3.6 фермент -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |