EXT2 (ген) - EXT2 (gene)

EXT2
Идентификаторы
ПсевдонимыEXT2, SOTV, SSMS, экзостозингликозилтрансфераза 2
Внешние идентификаторыOMIM: 608210 MGI: 108050 ГомолоГен: 345 Генные карты: EXT2
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человек)[1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение EXT2
Геномное расположение EXT2
Группа11p11.2Начните44,095,673 бп[1]
Конец44,251,981 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE EXT2 202013 s на fs.png

PBB GE EXT2 202012 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_000401
NM_001178083
NM_207122

NM_010163
NM_001355075
NM_001355076

RefSeq (белок)

NP_000392
NP_001171554
NP_997005

NP_034293
NP_001342004
NP_001342005

Расположение (UCSC)Chr 11: 44,1 - 44,25 МбChr 2: 93,66 - 93,82 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Экзостозингликозилтрансфераза-2 это белок что у людей кодируется EXT2 ген.[5][6][7]

Этот ген кодирует одну из двух гликозилтрансфераз, участвующих в стадии удлинения цепи гепарансульфат биосинтез. Мутации в этом гене вызывают форму II типа Наследственные множественные экзостозы (HME).[7]

Расположение гена

Ген EXT2 расположен на хромосоме 11 в геноме человека, на плече p этой хромосомы.[8] Плечо хромосомы - это более короткое плечо хромосомы.[9]

Взаимодействия

В семейство EXT входят EXT2, EXT1, EXTL1, EXTL2, и EXTL3. Белки, образованные этими генами, работают вместе, образуя и удлиняя цепи гепарансульфата. Цепи гепарансульфата являются протеогликаны присутствует во внеклеточном матриксе большинства типов тканей. Многое из его функций не совсем понятно, однако известно, что они играют важную роль для костей и хрящ формирование.[10] Хрящ находится в пластины роста длинных костей и размещается в определенном порядке до того, как позже окостенеет в кость, когда она отрастет все дальше от пластинки роста. Новый хрящ в растущей кости размещается посредством сигнальных белков, которые связываются с цепями гепарансульфата.[11]EXT2 (белок) также показал взаимодействовать с участием TRAP1, белок теплового шока.[12] Белки теплового шока связываются с определенными белками, чтобы помочь им сохранять форму при стрессе клетки.[13] Было обнаружено, что TRAP1 связывается с областью (на c-конце) белков EXT1 и EXT2, чтобы помочь ему сохранять желаемую форму и функцию.[14]

Распространение видов

Было обнаружено, что этот ген присутствует у многих видов, помимо человека, таких как мыши, куры, собаки, коровы и многие другие. Другой ортологи были найдены в том числе Drosophila melanogaster и Caenorhabditis elegans.[15]

Мутации

Мутации, которые изменяют аминокислотную последовательность белка экзостозингликозилтрансферазы-2, могут привести к тому, что он станет нефункциональным. Когда этот белок не функционирует, он приводит к укорачиванию цепей гепарансульфата. Цепи по-прежнему образуются и расширяются другими белками, кодируемыми генами семейства EXT, хотя и не в такой степени. Это увеличивает вероятность того, что хрящевые клетки будут размещены неправильно, поскольку гепарансульфат является супрессором опухолей костей и хрящей. Поскольку кость имеет очень специфическую структуру, неправильная установка хрящевой клетки на раннем этапе роста сравнима с неправильной заменой кирпича на ранней стадии строительства стены. Неправильное смещение хряща приведет к опухоли хряща или опухолям на пластинах роста длинных костей. Это состояние известно как наследственные множественные экзостозы (HME) или наследственные множественные остеохондромы (HMO).[16] HME также может быть результатом мутации гена EXT1 или других генов семейства EXT.[17] Мутации EXT1 имеют тенденцию быть более серьезными с большим количеством экзостозов и являются причиной 56-78% случаев HME у людей, за исключением Китая, где мутации гена EXT2 более распространены. HME влияет на 1 из 50 000 человек и чаще встречается у мужчин в соотношении 1,5: 1.[18]

Наследственность гена EXT2

Мутации гена EXT2 являются доминирующими аутосомный (не связано с полом) и является летальным в гомозиготный форма. Это означает, что если мутировавший ген унаследован от обоих родителей, дав потомству две копии мутировавшего гена (гомозиготная форма мутантного гена), это приведет к ранней гибели эмбриона в гаструла стадия развития. Причины этого в том, что гепарансульфат играет не только роль в формировании костей, но и в эмбриональном развитии. Гепарансульфат может связывать сигнальные молекулы, используемые при разработке, такие как трансформирующий фактор роста β, Белки Fgf и Wnt белки. Единственные люди с этой мутацией существуют в гетерозиготный формы, это означает, что у них есть один нормальный ген EXT2 и один мутировавший. Что касается наследования мутации этого гена, то для мутировавшего родителя и не мутировавшего родителя существует 50% -ная вероятность того, что потомство также будет иметь мутацию EXT2. У двух родителей с мутацией EXT2 из их живых потомков 2 из 3 будут иметь мутацию.[19]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000151348 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027198 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Wu YQ, Heutink P, de Vries BB, Sandkuijl LA, van den Ouweland AM, Niermeijer MF и др. (Январь 1994 г.). «Присвоение второго локуса множественных экзостозов перицентромерной области хромосомы 11». Молекулярная генетика человека. 3 (1): 167–71. Дои:10.1093 / hmg / 3.1.167. PMID  8162019.
  6. ^ Бридж Дж. А., Нельсон М., Орндал С., Бхатиа П., Нефф Дж. Р. (май 1998 г.). «Клональные кариотипические аномалии наследственных множественных экзостозов хромосомных локусов 8q24.1 (EXT1) и 11p11-12 (EXT2) у пациентов со спорадическими и наследственными остеохондромами». Рак. 82 (9): 1657–63. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0142 (19980501) 82: 9 <1657 :: AID-CNCR10> 3.0.CO; 2-3. PMID  9576285.
  7. ^ а б "Entrez Gene: EXT2 экзостозы (множественные) 2".
  8. ^ «EXT2 экзостозингликозилтрансфераза 2 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. NCBI. Получено 14 ноября 2019.
  9. ^ «Как генетики указывают местонахождение гена?». Домашний справочник по генетике. Медицинская библиотека США NIH. Получено 14 ноября 2019.
  10. ^ Буссе М., Фета А., Престо Дж., Вилен М., Грённинг М., Кьеллен Л., Куше-Гуллберг М. (ноябрь 2007 г.). «Вклад EXT1, EXT2 и EXTL3 в удлинение цепи гепарансульфата». Журнал биологической химии. 282 (45): 32802–10. Дои:10.1074 / jbc.M703560200. PMID  17761672.
  11. ^ Хюгель Дж., Сгарилья Ф., Эномото-Ивамото М., Кояма Э., Дорманс Дж. П., Пасифици М. (сентябрь 2013 г.). «Гепарансульфат в развитии, росте и патологии скелета: случай наследственных множественных экзостозов». Динамика развития. 242 (9): 1021–32. Дои:10.1002 / dvdy.24010. ЧВК  4007065. PMID  23821404.
  12. ^ Симмонс А.Д., Муси М.М., Лопес С.С., Хван Л.Й., Ян Ю.П., Ловетт М. (ноябрь 1999 г.). «Прямое взаимодействие между белками EXT и гликозилтрансферазами нарушено в наследственных множественных экзостозах». Молекулярная генетика человека. 8 (12): 2155–64. Дои:10.1093 / hmg / 8.12.2155. PMID  10545594.
  13. ^ Бактисаран, Раман; Тангирала, Рамакришна; Рао, гл. Мохан (1 апреля 2015 г.). «Малые белки теплового шока: роль в клеточных функциях и патологии». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Белки и протеомика. 1854 (4): 291–319. Дои:10.1016 / j.bbapap.2014.12.019. ISSN  1570-9639. PMID  25556000.
  14. ^ Симмонс, Эндрю Д .; Musy, Maurice M .; Lopes, Carla S .; Хван, Ларн-Юань; Ян, Я-Пин; Ловетт, Майкл (1 ноября 1999 г.). «Прямое взаимодействие между белками EXT и гликозилтрансферазами нарушено при наследственных множественных экзостозах». Молекулярная генетика человека. 8 (12): 2155–2164. Дои:10.1093 / hmg / 8.12.2155. ISSN  0964-6906. PMID  10545594.
  15. ^ "Ортологи EXT2". NCBI. Получено 15 ноября 2019.
  16. ^ Буссе М., Фета А., Престо Дж., Вилен М., Грённинг М., Кьеллен Л., Куше-Гуллберг М. (ноябрь 2007 г.). «Вклад EXT1, EXT2 и EXTL3 в удлинение цепи гепарансульфата». Журнал биологической химии. 282 (45): 32802–10. Дои:10.1074 / jbc.M703560200. PMID  17761672.
  17. ^ «Остеохондрома: рак кости: опухоль кости». www.tumorsurgery.org. (3) Хирург-саркома и онколог-ортопед. Получено 15 ноября 2019.
  18. ^ Chen XJ, Zhang H, Tan ZP, Hu W, Yang YF (ноябрь 2016 г.). «Новая мутация EXT2 идентифицирована в большой семье с множественными остеохондромами». Отчеты по молекулярной медицине. 14 (5): 4687–4691. Дои:10.3892 / mmr.2016.5814. ЧВК  5102042. PMID  27748933.
  19. ^ Стикенс Д., Зак Б.М., Ружье Н., Эско Д.Д., Верб Z (ноябрь 2005 г.). «Мыши с дефицитом Ext2 испытывают недостаток гепарансульфата и развивают экзостозы». Развитие. 132 (22): 5055–68. Дои:10.1242 / dev.02088. ЧВК  2767329. PMID  16236767.

дальнейшее чтение

внешние ссылки