Персональная геномика - Personal genomics

Часть серия на
Генетическая генеалогия
Концепции
похожие темы

Персональная геномика или же потребительская генетика это ответвляться из геномика озабочен последовательность действий, анализ и интерпретация геном человека. В генотипирование сцена использует разные техники, в том числе однонуклеотидный полиморфизм (SNP) чипы анализа (обычно 0,02% генома), или частичный или же полное секвенирование генома. После того, как генотипы известны, индивидуальные вариации можно сравнить с опубликованной литературой, чтобы определить вероятность проявления признака, заключения о происхождении и риска заболевания.

Автоматизированные высокопроизводительные секвенаторы увеличили скорость и снизили стоимость секвенирования, что позволяет предлагать потребителям секвенирование всего генома, включая интерпретацию, с 2015 г. по цене менее $1,000. Развивающийся рынок услуг по секвенированию генома напрямую к потребителю поставил новые вопросы как о медицинской эффективности, так и об этических дилеммах, связанных с широким распространением знаний об индивидуальной генетической информации.

В персонализированной медицине

Персонализированная медицина - это медицинский метод, который нацелен на структуру лечения и медицинские решения, основанные на прогнозируемой реакции пациента или риске заболевания.[1] В Национальный институт рака или NCI, рука Национальные институты здоровья, перечисляет гены, белки и окружающую среду пациента в качестве основных факторов, анализируемых для предотвращения, диагностики и лечения заболеваний с помощью персонализированной медицины.[1]

Существуют различные подкатегории концепции персонализированной медицины, такие как предсказательная медицина, точная медицина и стратифицированная медицина. Хотя эти термины используются как синонимы для описания этой практики, каждый имеет свои нюансы. Прогностическая медицина описывает область медицины, которая использует информацию, часто получаемую с помощью методов личной геномики, как для прогнозирования возможности заболевания, так и для принятия профилактических мер для конкретного человека.[2] Точная медицина это термин, очень похожий на персонализированную медицину, поскольку он фокусируется на генах пациента, окружающей среде и образе жизни; тем не менее, он используется Национальным исследовательским советом, чтобы избежать путаницы или неправильных толкований, связанных с более широким термином. Стратифицированная медицина - это версия персонализированной медицины, которая фокусируется на разделении пациентов на подгруппы на основе конкретных ответов на лечение и определении эффективных методов лечения для конкретной группы.[3]

Примеры использования персонализированной медицины включают: онкогеномика и фармакогеномика. Онкогеномика - это область исследований, сфокусированная на характеристике генов, связанных с раком. При раке конкретная информация об опухоли используется для создания индивидуального плана диагностики и лечения.[4] Фармакогеномика - это изучение того, как геном человека влияет на его реакцию на лекарства.[5] Эта область относительно новая, но быстро развивается, частично благодаря увеличению финансирования исследовательской сети фармакогеномики NIH. С 2001 г. количество научных работ в PubMed связанные с условиями поиска фармакогеномика и фармакогенетика.[6] Это поле позволяет исследователям лучше понять, как генетические различия повлияют на реакцию организма на лекарство, и сообщить, какое лекарство наиболее подходит для пациента. Эти планы лечения смогут предотвратить или, по крайней мере, свести к минимуму нежелательные реакции на лекарства, которые являются «значительной причиной госпитализаций и смертей в Соединенных Штатах». В целом исследователи считают, что фармакогеномика позволит врачам лучше адаптировать медицину к потребностям конкретного пациента.[5] По состоянию на ноябрь 2016 года FDA одобрило 204 препарата с информацией о фармакогенетике в маркировке. Эти ярлыки могут описывать, среди прочего, инструкции по дозировке, специфичные для генотипа, и риск нежелательных явлений.[7]

Риск заболевания может быть рассчитан на основе генетических маркеров и полногеномные ассоциации исследований для общих заболеваний, которые многофакторный и включать в оценку экологические компоненты. Заболевания индивидуально редкий (менее 200000 человек, затронутых в США), тем не менее, коллективно распространены (затрагивают примерно 8-10% населения США).[8]). Более 2500 из этих заболеваний (в том числе несколько более распространенных) имеют прогностическую генетику с достаточно высоким клиническим воздействием, поэтому их рекомендуют в качестве медицинских генетических тестов, доступных для отдельных генов (и при секвенировании всего генома), и число новых генетических заболеваний растет примерно на 200 в год. .[9]

Стоимость секвенирования генома человека

Динамика затрат на секвенирование
Типичная стоимость секвенирования генома размером с человека в логарифмической шкале. Обратите внимание на резкую тенденцию быстрее, чем Закон Мура начиная с января 2008 г. секвенирование после Сэнгера онлайн в центрах секвенирования.[10]

Стоимость секвенирования человеческого генома быстро снижается из-за постоянного развития новых, более быстрых и дешевых технологий секвенирования ДНК, таких как "секвенирование ДНК нового поколения ".

Национальный институт исследования генома человека, филиал Национальные институты здравоохранения США, сообщила, что стоимость секвенирования всего генома размером с человека упала с примерно 14 миллионов долларов в 2006 году до менее 1500 долларов к концу 2015 года.[11]

Есть 6 миллиардов пар оснований в диплоидном геноме человека. Статистический анализ показывает, что для охвата обоих аллелей в 90% генома человека из 25 пар оснований с помощью дробовидного секвенирования требуется охват примерно в десять раз.[12] Это означает, что в общей сложности необходимо секвенировать 60 миллиардов пар оснований. An Прикладные биосистемы Твердый, Иллюмина или Геликос[13] Секвенирующая машина может секвенировать от 2 до 10 миллиардов пар оснований за каждый прогон от 8 000 до 18 000 долларов. Стоимость также должна учитывать расходы на персонал, затраты на обработку данных, юридические, коммуникационные и другие расходы. Один из способов оценить это - через коммерческие предложения. Первое такое полное диплоидное секвенирование генома (6 миллиардов пар оснований, по 3 миллиарда от каждого родителя) было проведено Knome и их цена упала с 350 000 долларов в 2008 году до 99 000 долларов в 2009 году.[14][15] Это проверяет в 3000 раз больше оснований генома, чем на основе чипов SNP. генотипирование, идентифицируя как новые, так и известные варианты последовательностей, некоторые из которых имеют отношение к личному здоровью или происхождение.[16] В июне 2009 г. Иллюмина объявила о запуске собственной персональной Полное секвенирование генома Услуга на 30-кратной глубине за 48 000 долларов за геном.[17] В 2010 году они снизили цену до 19 500 долларов.[18]

В 2009, Полная геномика из вид на горы объявил, что предоставит полное секвенирование генома за 5000 долларов с июня 2009 года.[19] Это будет доступно только учреждениям, а не отдельным лицам.[20] Ожидается, что в ближайшие несколько лет цены будут снижаться и дальше за счет эффекта масштаба и усиления конкуренции.[21][22] По состоянию на 2014 год почти завершено экзом Gentle предложила секвенирование менее чем за 2000 долларов, включая личные консультации и результаты.[23] По состоянию на конец 2018 года было почти полностью секвенировано более миллиона геномов человека всего за 200 долларов на человека.[24] и даже при определенных обстоятельствах сверхзащищенные личные геномы по 0 долларов каждый.[25] В этих двух случаях фактическая стоимость снижается, поскольку данные могут быть монетизированы для исследователей.

Снижение стоимости геномного картирования в целом позволило генеалогический сайты, предлагающие это как услугу,[26] в той мере, в какой можно передать свой геном толпа научные усилия, такие как OpenSNP[27] или же DNA.land на Нью-Йоркский центр генома, как примеры гражданская наука.[28] Семья Корпас во главе с ученым Мануэль Корпус, разработал проект Corpasome,[29] и воодушевленный низкими ценами на секвенирование генома, был первым примером гражданская наука толпа анализ личные геномы.[30]

Этические вопросы

Генетическая дискриминация различает на основе информации, полученной из генома человека. В некоторых штатах США приняты законы о генетической недискриминации.[31] а на федеральном уровне - Закон о недискриминации в отношении генетической информации (Джина). Законодательство GINA предотвращает дискриминацию со стороны медицинских страховых компаний и работодателей, но не распространяется на страхование жизни или страхование на случай длительного ухода. Принятие Закона о доступном медицинском обслуживании в 2010 году усилило защиту GINA, запретив медицинским страховым компаниям отказывать в страховом покрытии из-за «ранее существовавших условий» пациента и лишив страховщиков возможности корректировать страховые взносы на основе определенных факторов, таких как генетические заболевания.[32] Учитывая этические соображения по поводу предсимптоматического генетического тестирования несовершеннолетних,[33][34][35][36] вполне вероятно, что персональная геномика сначала будет применена к взрослым, которые могут дать согласие на прохождение такого тестирования, хотя секвенирование генома уже оказалось полезным для детей, если присутствуют какие-либо симптомы.[37]

Есть также опасения относительно исследований генома человека в развивающихся странах. Инструменты для проведения полногеномного анализа обычно используются в странах с высоким уровнем доходов, что требует партнерских отношений между развитыми и развивающимися странами для изучения пациентов, страдающих определенными заболеваниями. Соответствующие инструменты для совместного доступа к собранным данным не одинаково доступны в странах с низким уровнем дохода, и без установленного стандарта для этого типа исследований озабоченность по поводу справедливости по отношению к местным исследователям остается нерешенной.[38]

Другие вопросы

Генетическая конфиденциальность

Основная статья: Генетическая конфиденциальность

В Соединенных Штатах биомедицинские исследования с участием людей регулируются базовыми этическими стандартами, известными как Общее правило, который направлен на защиту конфиденциальности субъекта, требуя удаления «идентификаторов», таких как имя или адрес, из собранных данных.[39] Однако в отчете президентской комиссии по изучению биоэтических проблем за 2012 год говорится, что «то, что составляет« идентифицируемые »и« деидентифицированные »данные, непостоянно и что развивающиеся технологии и растущая доступность данных могут позволить обезличенным данным быть повторно идентифицироваться ".[39] Фактически, исследование уже показало, что «возможно установить личность участника исследования путем перекрестной ссылки на данные исследования о нем и его последовательности ДНК… [с] генетической генеалогией и общедоступными базами данных».[40] Это привело к призыву к политикам разработать последовательные руководящие принципы и передовые методы обеспечения доступности и использования индивидуальных геномных данных, собранных исследователями.[41]

Также существуют разногласия относительно опасений компаний, тестирующих индивидуальную ДНК. Существуют такие проблемы, как «утечка» информации, право на неприкосновенность частной жизни и ответственность компании, чтобы этого не произошло. Правила регулирования четко не изложены. Что до сих пор не определено, так это то, кто на законных основаниях владеет информацией о геноме: компания или лицо, чей геном был прочитан. Были опубликованы примеры использования информации личного генома.[42] Дополнительные проблемы конфиденциальности, связанные, например, с генетическая дискриминация, потеря анонимности и психологические последствия все чаще отмечаются академическим сообществом.[42] а также государственные учреждения.[39]

Дополнительные проблемы возникают из-за компромисса между общественной пользой от обмена исследованиями и возможностью утечки данных и повторной идентификации. В Персональный проект генома (начат в 2005 г.) - одна из немногих, которые сделали общедоступными как последовательности генома, так и соответствующие медицинские фенотипы.[43][44]

Персонализированная утилита для генома

Полное секвенирование генома открывает большие перспективы в мире здравоохранения с точки зрения возможности точного и персонализированного лечения. Такое использование генетической информации для выбора подходящих лекарств известно как фармакогеномика. Эта технология может позволить лечить индивидуума и его определенные генетические предрасположенности (например, индивидуальную химиотерапию). Одним из наиболее эффективных и действенных способов использования личной информации о геноме является предотвращение сотен серьезных одногеновых генетические нарушения которые ставят под угрозу около 5% новорожденных (стоимостью до 20 миллионов долларов),[45] например устранение Болезнь Тея Сакса через Дор Ешорим. Другой набор из 59 генов, проверенный Американским колледжем медицинской генетики и геномики (ACMG-59), считается действенным у взрослых.[46]

В то же время полное секвенирование генома позволяет идентифицировать полиморфизмы которые являются настолько редкими и / или незначительными изменениями последовательности, что делать выводы об их влиянии сложно, что усиливает необходимость сосредоточиться на надежных и действенных аллелях в контексте клинической помощи. Чешский медицинский генетик Ева Махачкова пишет: «В некоторых случаях трудно определить, является ли обнаруженный вариант последовательности причинной мутацией или нейтральной (полиморфной) вариацией, не влияющей на фенотип. Интерпретация редкой последовательности варианты неизвестного значения обнаружение в генах, вызывающих болезни, становится все более важной проблемой ».[47] Фактически, исследователи из проекта Консорциума агрегации экзома (ExAC) подсчитали, что в среднем человек несет 54 генетические мутации, которые ранее считались патогенными, то есть имеющими 100% пенетрантность, но без каких-либо явных негативных проявлений здоровья.[48]

Как и в случае с другими новыми технологиями, врачи могут назначать геномные тесты, для которых некоторые не имеют должной подготовки для интерпретации результатов. Многие не знают, как SNP реагируют друг на друга. Это приводит к тому, что клиент получает потенциально вводящие в заблуждение и вызывающие беспокойство результаты, которые могут привести к перегрузке и без того перегруженной системы здравоохранения. Теоретически это может заставить человека принимать необразованные решения, такие как выбор нездорового образа жизни и изменения в планировании семьи. Отрицательные результаты, которые потенциально могут быть неточными, теоретически снижают качество жизни и психическое здоровье человека (например, усиление депрессии и обширного беспокойства).

Прямая к потребителю генетика

С помощью микрочипы для генотипирования. В видео показан процесс извлечения генотипов из образца слюны человека с помощью микрочипов, как это делается в большинстве крупных генетических компаний, напрямую занимающихся потребителями.

Есть также три потенциальных проблемы, связанные с валидностью персональных наборов генома. Первый вопрос - это валидность теста. Обработка ошибок образца увеличивает вероятность ошибок, которые могут повлиять на результаты теста и интерпретацию. Второй влияет на клиническую валидность, что может повлиять на способность теста выявлять или прогнозировать связанные расстройства. Третья проблема - это клиническая применимость персональных наборов генома и связанные с ними риски, а также преимущества их внедрения в клиническую практику.[49]

Людей нужно научить интерпретировать свои результаты и что им следует рационально извлекать из этого опыта. Обеспокоенность по поводу того, что клиенты неверно истолковывают информацию о здоровье, была одной из причин закрытия в 2013 г. FDA службы анализа состояния здоровья 23 & Me.[50] Не только средний человек должен быть обучен измерениям своей собственной геномной последовательности, но и профессионалы, в том числе врачи и научные журналисты, должны получить знания, необходимые для информирования и просвещения своих пациентов и общественности.[51][52][53] Примеры таких усилий включают Образовательный проект по личной генетике (pgEd), Смитсоновский институт сотрудничество с NHGRI, а также проекты MedSeq, BabySeq и MilSeq Genomes to People, инициатива Гарвардская медицинская школа и Бригам и женская больница.

Основное использование личной геномики за пределами области здоровья - это анализ предков, включая информацию об эволюционном происхождении, такую ​​как содержание неандертальцев.[54]

Популярная культура

Научно-фантастический фильм 1997 года ГАТТАКА представляет общество ближайшего будущего, в котором личная геномика будет доступна каждому, и исследует ее влияние на общество. Идеальная ДНК[55] это роман, в котором используется доктор Мануэль Корпус Собственный опыт и знания как ученого-генома, чтобы начать изучение некоторых из этих чрезвычайно сложных вопросов.

Другое использование

В 2018 году полиция арестовала Джозеф Джеймс ДеАнджело главный подозреваемый в убийстве из Голден Стэйт или Насильник восточного района[56] и Уильям Эрл Талботт II как главный подозреваемый в убийство Джея Кука и Тани Ван Куйленборг в 1987 г.[57] Эти аресты были основаны на личной геномике, загруженной в базу данных с открытым исходным кодом. GEDmatch, что позволило следователям сравнить ДНК, извлеченную с места преступления, с ДНК, загруженной в базу данных родственниками подозреваемого.[58][56] В декабре 2018 г. СемьяДеревоДНК изменил условия обслуживания, чтобы правоохранительные органы могли использовать свои услуги для выявления подозреваемых в «насильственных преступлениях» или останков жертв. Компания подтвердила, что работала с ФБР по крайней мере по нескольким делам, а это значит, что GEDmatch больше не единственная, кто это делал.[59] С тех пор почти 50 подозреваемых в нападении, изнасиловании или убийстве были арестованы с использованием того же метода.[60]

Персональная геномика также позволила исследователям идентифицировать ранее неизвестные тела с помощью GEDmatch ( Девушка из оленьей кожи,[61] Лайл Стевик[62] и Джозеф Ньютон Чендлер III ).[63]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б "Словарь терминов по раку NCI". Национальный институт рака. 2 февраля 2011 г.. Получено 5 декабря 2016.
  2. ^ «Прогностическая медицина - Последние исследования и новости | Природа». www.nature.com. Получено 5 декабря 2016.
  3. ^ MRC, Медицинский исследовательский совет (3 марта 2016 г.). «Стратифицированная медицина». www.mrc.ac.uk. Получено 5 декабря 2016.
  4. ^ Штраусберг, Роберт Л .; Симпсон, Эндрю Дж. Г .; Старый, Ллойд Дж .; Риггинс, Грегори Дж. (27 мая 2004 г.). «Онкогеномика и разработка новых методов лечения рака». Природа. 429 (6990): 469–474. Bibcode:2004Натура.429..469S. Дои:10.1038 / природа02627. PMID  15164073. S2CID  37628107.
  5. ^ а б Справка, Дом генетики. «Что такое фармакогеномика?». Домашний справочник по генетике. Получено 5 декабря 2016.
  6. ^ Джонсон, Джули А. (5 декабря 2016 г.). «Фармакогенетика в клинической практике: как далеко мы продвинулись и куда идем?». Фармакогеномика. 14 (7): 835–843. Дои:10.2217 / стр.13.52. ЧВК  3697735. PMID  23651030.
  7. ^ Исследования, Центр оценки лекарственных средств и. «Геномика - Таблица фармакогеномных биомаркеров в маркировке лекарств». www.fda.gov. Получено 5 декабря 2016.
  8. ^ «Управление редких заболеваний NIH».
  9. ^ «Генетические тесты».
  10. ^ Веттерстранд, Крис (21 мая 2012 г.). «Стоимость секвенирования ДНК: данные крупномасштабной программы секвенирования генома NHGRI». Программа крупномасштабного секвенирования генома. Национальный институт исследования генома человека. Получено 24 мая 2012.
  11. ^ «Стоимость секвенирования генома человека». Национальный институт исследования генома человека (NHGRI). Получено 5 декабря 2016.
  12. ^ Уилер, Дэвид А; Шринивасан, Майтрейан; Эгхольм, Майкл; Шен, Юфэн; Чен, Лэй; Макгуайр, Эми; Он, Вен; Чен И-Цзюй; Махиджани, Винод; Рот, Г. Томас; Гомеш, Ксавьер; Тартаро, Кэрри; Ниази, Фахим; Turcotte, Cynthia L; Ирзик, Жерар П.; Лупски, Джеймс Р.; Чиналт, Крейг; Сун, Син-чжи; Лю, Юэ; Юань, Е; Назарет, Линн; Цинь, Сян; Музны, Донна М; Маргулис, Марсель; Вайншток, Джордж М; Гиббс, Ричард А; Ротберг, Джонатан М (2008). "JDW-genome-supp-mat-march-proof.doc" (PDF). Природа. 452 (7189): 872–876. Bibcode:2008Натура 452..872Вт. Дои:10.1038 / природа06884. PMID  18421352. S2CID  4429736. Получено 19 октября 2011.
  13. ^ «Настоящее секвенирование одной молекулы (tSMS): Helicos BioSciences». Helicosbio.com. Архивировано из оригинал 4 октября 2011 г.. Получено 19 октября 2011.
  14. ^ "Knome снижает цену полного генома с 350 000 до 99 000 долларов". Генетический генеалог. 11 апреля 2009 г.
  15. ^ Кароу, Юлия (19 мая 2009 г.). «Knome добавляет функции секвенирования экзома и начинает предлагать услуги исследователям». GenomeWeb. Получено 24 февраля 2010.
  16. ^ Хармон, Кэтрин (28 июня 2010 г.). «Секвенирование генома для всех нас». Scientific American. Получено 13 августа 2010.
  17. ^ «Индивидуальное секвенирование генома - Illumina, Inc». Everygenome.com. Архивировано из оригинал 19 октября 2011 г.. Получено 19 октября 2011.
  18. ^ "Illumina снижает стоимость секвенирования личного генома на 60% | GPlus.com". Glgroup.com. 4 июня 2010 г.. Получено 19 октября 2011.
  19. ^ Каров, Юлия. «Complete Genomics предложит 5000 долларов США в качестве услуги бизнеса во втором квартале 2009 года | Последовательность | Секвенирование». GenomeWeb. Получено 19 октября 2011.
  20. ^ Лауэрман, Джон (5 февраля 2009 г.). "Полная геномика снижает стоимость геномной последовательности до 5000 долларов". Bloomberg. Получено 19 октября 2011.
  21. ^ «MSN | Outlook, Office, Skype, Bing, последние новости и последние видео». Архивировано из оригинал 25 августа 2009 г.. Получено 11 июн 2009.
  22. ^ «Illumina запускает услугу персонального секвенирования генома за 48 000 долларов: генетическое будущее». Scienceblogs.com. Архивировано из оригинал 6 июня 2011 г.. Получено 19 октября 2011.
  23. ^ {http://www.healthcarejournallr.com/the-journal/contents-index/features/563-what-a-tangled-web-we-weave.html}[постоянная мертвая ссылка ]
  24. ^ Меган Молтени (19 ноября 2018 г.). «Теперь вы можете секвенировать весь свой геном всего за 200 долларов». Проводной.
  25. ^ Шэрон Бегли (15 ноября 2018 г.). «Предлагая бесплатное секвенирование ДНК, Nebula Genomics открывается для бизнеса. Но есть небольшая загвоздка». Стат.
  26. ^ Каплан, Сара (17 апреля 2016 г.). «Как ваши 20 000 генов определяют столько совершенно разных черт? Они многозадачны». Вашингтон Пост. Получено 27 августа 2016.
  27. ^ Грешак, Бастиан (2014). "openSNP - краудсорсинговый веб-ресурс для личной геномики". PLOS One. 9 (3): e89204. Bibcode:2014PLoSO ... 989204G. Дои:10.1371 / journal.pone.0089204. ЧВК  3960092. PMID  24647222.
  28. ^ Циммер, Карл (25 июля 2016 г.). «Игра геномов, серия 13: ответы и вопросы». СТАТ. Получено 27 августа 2016.
  29. ^ Корпус, Мануэль (2013). «Краудсорсинг Корпасомы». Исходный код для биологии и медицины. 8 (1): 13. Дои:10.1186/1751-0473-8-13. ЧВК  3706263. PMID  23799911.
  30. ^ Corpas M, Valdivia-Granda W, Torres N, Greshake B, Coletta A, Knaus A, Harrison AP, Cariaso M, Moran F, Nielsen F, Swan D, Weiss Solis DY, Krawitz P, Schacherer F, Schols P, Yang H , Борри П., Глусман Г., Робинсон П.Н. (ноябрь 2015 г.). «Краудсорсинговый геномный анализ семейного квартета, прямой доступ к потребителю». BMC Genomics. 16 (910): 910. Дои:10.1186 / s12864-015-1973-7. ЧВК  4636840. PMID  26547235.
  31. ^ "Антидискриминационные законы государства о генетике и страховании здоровья".
  32. ^ «Генетическая дискриминация». Национальный институт исследования генома человека (NHGRI). Получено 5 декабря 2016.
  33. ^ McCabe LL; McCabe ER (июнь 2001 г.). «Постгеномная медицина. Пресимптоматическое тестирование для прогноза и профилактики». Клин перинатол. 28 (2): 425–34. Дои:10.1016 / S0095-5108 (05) 70094-4. PMID  11499063.
  34. ^ Нельсон Р.М.; Botkjin JR; Кодиш Э.Д .; и другие. (Июнь 2001 г.). «Этические вопросы генетического тестирования в педиатрии». Педиатрия. 107 (6): 1451–55. Дои:10.1542 / педы.107.6.1451. PMID  11389275.
  35. ^ Borry P; Fryns JP; Schotsmans P; Dierickx K (февраль 2006 г.). «Тестирование несущей способности несовершеннолетних: систематический обзор руководств и документов с изложением позиции». Евро. J. Hum. Genet. 14 (2): 133–8. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5201509. PMID  16267502.
  36. ^ Borry P; Stultiens L; Nys H; Cassiman JJ; и другие. (Ноябрь 2006 г.). «Пресимптоматическое и прогностическое генетическое тестирование несовершеннолетних: систематический обзор руководящих принципов и документов с изложением позиции». Clin. Genet. 70 (5): 374–81. Дои:10.1111 / j.1399-0004.2006.00692.x. PMID  17026616. S2CID  7066285.
  37. ^ Марк Джонсон и Кэтлин Галлахер (27 февраля 2011 г.). «Один на миллиард. Случай Ника Волкера может быть передовым фронтом волны, распространяющейся в генетической медицине». Милуоки Журнал Страж.
  38. ^ де Вриз, Янтина; Бык, Сьюзен Дж; Думбо, Огобара; Ибрагим, Мунтасер; Мерсеро-Пуйялон, Одиллия; Квятковски, Доминик; Паркер, Майкл (18 марта 2011 г.). «Этические вопросы исследований в области геномики человека в развивающихся странах». BMC Медицинская этика. 12: 5. Дои:10.1186/1472-6939-12-5. ЧВК  3076260. PMID  21418562.
  39. ^ а б c «Конфиденциальность и прогресс в секвенировании всего генома». Президентская комиссия по изучению вопросов биоэтики. Архивировано из оригинал 22 ноября 2016 г.. Получено 30 ноября 2016.
  40. ^ Отметьте Хайден, Эрика (2013). «В генетических базах данных обнаружена лазейка в конфиденциальности». Природа. Дои:10.1038 / природа.2013.12237. S2CID  211729032.
  41. ^ Гутманн, Эми; Вагнер, Джеймс У. (1 мая 2013 г.). «Нашел свою ДНК в Интернете: примирение конфиденциальности и прогресса». Отчет Центра Гастингса. 43 (3): 15–18. Дои:10.1002 / hast.162. PMID  23650063.
  42. ^ а б Де Кристофаро, Эмилиано (17 октября 2012 г.). «Секвенирование всего генома: мечта об инновациях или кошмар конфиденциальности?». arXiv:1210.4820 [cs.CR ].
  43. ^ Мао Кью, Сиотлос С., Чжан Р.Й., Болл депутат, Чин Р., Карневали П., Баруа Н., Нгуен С., Агарвал М.Р., Клегг Т., Коннелли А., Вандевеге В., Заранек А.В., Эстеп П.У., Церковный генеральный директор, Дрманак Р., Петерс Б.А. (2016). «Последовательности всего генома и экспериментально фазированные гаплотипы более 100 персональных геномов». Gigascience. 5 (1): 42. Дои:10.1186 / s13742-016-0148-z. ЧВК  5057367. PMID  27724973.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
  44. ^ Цай Б., Ли Б., Кига Н., Тусберг Дж., Бергквист Т., Чен Й., Никнафс Н., Картер Х., Токхайм К., Белева-Гатри В., Доувиль С., Бхаттачарья Р., Йео ХТГ, Фан Дж., Сенгупта С., Ким Д., Клайн М., Тернер Т., Дикханс М., Зауча Дж., Пал Л., Цао Ц, Ю Ц, Инь И, Карраро М., Джолло М., Феррари С., Леонарди Э, Тосатто СЦЭ, Бобе Дж., Болл М, Хоскинс Р., Репо С. , Черч Дж., Бреннер С., Моулт Дж., Гоф Дж., Станке М., Карчин Р., Муни С.Д. (2016). «Сопоставление фенотипов с целыми геномами: уроки, извлеченные из трех итераций проблем сообщества проекта персонального генома». Человеческая мутация. 38 (9): 1266–1276. Дои:10.1002 / humu.23265. ЧВК  5645203. PMID  28544481.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
  45. ^ Рэнди Шор (4 мая 2014 г.). «Секвенирование генома: дорогостоящий способ сэкономить». Ванкувер Сан.
  46. ^ «ACMG обновляет список генов вторичных результатов». GenomeWeb. 17 ноября 2016 г.
  47. ^ Machácková, E. (1 марта 2003 г.). «Болезненные мутации против нейтрального полиморфизма: использование биоинформатики и ДНК-диагностики». Казопис Лекару Ческих. 142 (3): 150–153. PMID  12756842.
  48. ^ Отметьте Хайден, Эрика (2016). «Переосмыслить связь между генами и болезнью: база данных ExAC показала, что многие мутации, которые считаются вредными, являются доброкачественными». Природа. 538 (7624): 140. Дои:10.1038 / 538140a. PMID  27734882.
  49. ^ Хантер, Дэвид Дж .; Хури, Муин Дж .; Дражен, Джеффри М. (10 января 2008 г.). «Выпустить геном из бутылки - исполним ли мы наше желание?». Медицинский журнал Новой Англии. 358 (2): 105–107. Дои:10.1056 / NEJMp0708162. PMID  18184955.
  50. ^ Copeland, CS (май – июнь 2014 г.). "Что за запутанная паутина мы плетем" (PDF). Журнал здравоохранения Литл-Рока.
  51. ^ Лунсхоф, Жантина; Мардис Элейн [Получено с http://www.future-science-group.com/_img/pics/Mardis_Forward.pdf[постоянная мертвая ссылка ] «Навигеника - как это работает»]. Журнал "Медицина будущего".Проверено 30 марта 2012 г. /
  52. ^ Робертс, Дж. Скотт; Горник, Мишель С. и др. [Получено из http://www.genomes2people.org/wp-content/uploads/2017/01/Roberts-et-al-PGen-PHG-2017.pdf «Прямое генетическое тестирование потребителя: мотивация пользователей, принятие решений и предполагаемая полезность результатов»]. Геномика общественного здравоохранения. Проверено 20 февраля 2017 г. /
  53. ^ Корпус, Мануэль (6 января 2012 г.). «Семейный опыт личной геномики». Журнал генетического консультирования. 21 (3): 368–391. Дои:10.1007 / s10897-011-9473-7. PMID  22223063. S2CID  10845045.
  54. ^ Copeland, CS (март – апрель 2014 г.). "Свобода личности, общественная безопасность и сложные границы личной геномики" (PDF). Журнал здравоохранения Нового Орлеана.
  55. ^ Мануэль Корпус (2016). Идеальная ДНК. Кембридж: DNAdigest. ISBN  978-1539783725.
  56. ^ а б Аранго, Тим; Гольдман, Адам; Фуллер, Томас (27 апреля 2018 г.). «Поймать убийцу: фальшивый профиль на участке ДНК и чистый образец». Нью-Йорк Таймс.
  57. ^ Чжан, Сара (19 мая 2018 г.). "Грядущая волна убийств, решаемых генеалогией". Атлантический океан. Получено 22 июн 2018.
  58. ^ «Что означает арест убийцы из Голден Стэйт для генетической конфиденциальности?». СТАТ. 26 апреля 2018.
  59. ^ Хааг, Мэтью (4 февраля 2019 г.). «FamilyTreeDNA допускает обмен генетическими данными с ФБР». Нью-Йорк Таймс. ISSN  0362-4331. Получено 11 февраля 2019.
  60. ^ https://slate.com/technology/2019/03/genetic-genealogy-law-enforcement-suspects-dna-privacy-gedmatch.html
  61. ^ "'Разрыв дела Бак Скин девушки - успех нового проекта DNA Doe ". Судебно-медицинский журнал. 16 апреля 2018 г.. Получено 22 июн 2018.
  62. ^ "Идентификаторы проекта DNA Doe 2001 Самоубийство в мотеле, с использованием генеалогии". Судебно-медицинский журнал. 9 мая 2018. Получено 22 июн 2018.
  63. ^ Канилья, Джон (21 июня 2018 г.). «Власти раскрывают холодное дело героя войны, который скрывался за личностью мертвого мальчика». cleveland.com. Получено 22 июн 2018.

Библиография