Эпоксидредуктаза витамина К - Vitamin K epoxide reductase
| Эпоксидредуктаза витамина К (чувствительная к варфарину) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Реакция | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 1.17.4.4 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
| БРЕНДА | BRENDA запись | ||||||||
| ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
| КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Эпоксидредуктаза витамина К | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ВКОР | ||||||||
| Pfam | PF07884 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR012932 | ||||||||
| CATH | 3kp9 | ||||||||
| TCDB | 9.B.265 | ||||||||
| OPM суперсемейство | 18 | ||||||||
| Белок OPM | 3kp9 | ||||||||
| |||||||||
Эпоксидредуктаза витамина К (ВКОР) является фермент (EC 1.17.4.4 ) который уменьшает витамин К после окисления при карбоксилировании глютаминовая кислота остатки в коагуляция крови ферменты. VKOR является членом большого семейства предсказанных ферментов, которые присутствуют у позвоночных, Дрозофила, растения, бактерии и археи.[1] В некоторых растение и бактериальный гомологи, ВКОР домен сливается с домены из тиоредоксин семья оксидоредуктазы.[1]
Четыре цистеин остатки и один остаток, который либо серин или треонин, идентифицируются как вероятные активные сайты остатки.[1] Решенные бактериальные структуры VKOR позволили лучше понять каталитический механизм. Все VKOR являются трансмембранными белками с по крайней мере тремя спиралями TM в каталитическом ядре. Восстанавливаемый хинон связывается окислительно-восстановительным мотивом CXXC в С-концевых спиралях, подобно DsbB активный сайт. Два других цистеина на N-конце расположены в петле вне трансмембранной области; они передают электроны с окислительно-восстановительным белком (или, в случае бактериального гомолога, с его собственным слитым доменом).[2][3]
Человеческий ген ВКОР называется ВКОРЦ1 (Субъединица 1 комплекса VKOR). Это цель антикоагулянт варфарин. Его партнер - редокс-белок с неизвестной идентичностью.[4][5] Также есть похожий ген, называемый VKORC1L1.
Рекомендации
- ^ а б c Goodstadt L, Ponting CP (июнь 2004 г.). «Эпоксидредуктаза витамина К: гомология, активный центр и каталитический механизм». Тенденции в биохимических науках. 29 (6): 289–92. Дои:10.1016 / j.tibs.2004.04.004. PMID 15276181.
- ^ Ли В., Шульман С., Даттон Р. Дж., Бойд Д., Беквит Дж., Рапопорт Т.А. (январь 2010 г.). «Структура бактериального гомолога эпоксидредуктазы витамина К». Природа. 463 (7280): 507–12. Bibcode:2010Натура.463..507L. Дои:10.1038 / природа08720. ЧВК 2919313. PMID 20110994.
- ^ Ришавы М.А., Усубалиева А., Халльгрен К.В., Беркнер К.Л. (март 2011 г.). «Новое понимание механизма действия оксидоредуктазы витамина K (VKOR): электронное реле через Cys43 и Cys51 снижает VKOR, что позволяет снизить уровень витамина K и облегчить витамин K-зависимое карбоксилирование белка». Журнал биологической химии. 286 (9): 7267–78. Дои:10.1074 / jbc.M110.172213. ЧВК 3044983. PMID 20978134.
- ^ Ли Т., Чанг CY, Джин Д.Й., Лин П.Дж., Хворова А., Стаффорд Д.В. (февраль 2004 г.). «Идентификация гена эпоксидредуктазы витамина К». Природа. 427 (6974): 541–4. Bibcode:2004 Натур.427..541L. Дои:10.1038 / природа02254. PMID 14765195.
- ^ Рост С., Фрегин А., Иваскявичюс В., Конзельманн Е., Хёртнагель К., Пельц Х. Дж., Лаппегард К., Зайфрид Е., Шаррер И., Тудденхэм Е. Г., Мюллер С. Р., Стром TM, Ольденбург Дж. (Февраль 2004 г.). «Мутации в VKORC1 вызывают устойчивость к варфарину и множественный дефицит факторов свертывания крови типа 2». Природа. 427 (6974): 537–41. Bibcode:2004Натура.427..537R. Дои:10.1038 / природа02214. PMID 14765194.
