CYP4F3 - CYP4F3

CYP4F3
Идентификаторы
ПсевдонимыCYP4F3, CPF3, CYP4F, LTB4H, цитохром P450, семейство 4, член 3 подсемейства F, CYPIVF3
Внешние идентификаторыOMIM: 601270 MGI: 2158641 ГомолоГен: 73902 Генные карты: CYP4F3
Расположение гена (человек)
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человек)[1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное расположение CYP4F3
Геномное расположение CYP4F3
Группа19п13.12Начинать15,640,897 бп[1]
Конец15,662,825 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

4051

170716

Ансамбль

ENSG00000186529

ENSMUSG00000024055

UniProt

Q08477

н / д

RefSeq (мРНК)

NM_000896
NM_001199208
NM_001199209
NM_001369696

NM_130882

RefSeq (белок)

NP_000887
NP_001186137
NP_001186138
NP_001356625

н / д

Расположение (UCSC)Chr 19: 15.64 - 15.66 МбChr 17: 32.92 - 32.95 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Лейкотриен-B (4) омега-гидроксилаза 2 является фермент что у людей кодируется CYP4F3 ген.[5][6][7] CYP4F3 кодирует два разных фермента, CYP4F3A и CYP4F3B, которые происходят из альтернативное сращивание одной молекулы-предшественника пре-мРНК; выбор любой изоформы тканеспецифичен, при этом CYP3F3A экспрессируется в основном в лейкоциты и CYP4F3B в основном в печени.[8]

Функция

Белки цитохрома P450 представляют собой монооксигеназы, которые катализируют многие реакции, участвующие в метаболизме лекарств и синтезе холестерина, стероидов, жирных кислот и других липидов. CYP4F3 фактически кодирует два сплайс-варианта, CYP4F3A и CYP4F3B, суперсемейства ферментов цитохрома P450. Ген является частью кластера генов цитохрома P450 на хромосоме 19. Другой член этого семейства, CYP4F8, находится на расстоянии примерно 18 т.п.н.[7] Оба варианта локализуются на эндоплазматический ретикулум и метаболизировать лейкотриен B4 и очень вероятно 5-гидроксиэйкозатетраеновая кислота, 5-оксо-эйкозатетраеновая кислота, и 12-гидроксиэйкозатетраеновая кислота по омега-окисление реакции, т.е. добавлением гидроксил остаток к их концевому (то есть C-20) углероду.[9] Это добавление запускает процесс инактивации и разрушения всех этих хорошо известных посредников воспаление[10] CYP3FA - это главный фермент, осуществляющий окисление омега в лейкоцитах.[10]

CYP4F3A и / или CYP43FB также окисляют омега арахидоновая кислота к 20-гидроксиэйкозатетраеновая кислота (20-HETE), а также эпоксиэйкозатриеновые кислоты (EET) до 20-гидрокси-EET.[10] 20-HETE регулирует кровоток, васкуляризацию, кровяное давление и абсорбцию ионов почками у грызунов и, возможно, людей;[8] также было предложено участвовать в регулировании роста различных типов рака человека (см. 20-гидроксиэйкозатетраеновая кислота # рак ). EETS имеют аналогичный набор регулирующих функций, но часто действуют противоположно 20-HETE (см. эпоксиэйкозатриеновая кислота # рак ); поскольку, однако, активность 20-HEET не была четко определена, функция окисления омега EET неясна.[8]

Генетические варианты

Инактивация, индуцированная гидроксилированием, медиаторов воспаления, особенно лейкотриена B4, может лежать в основе предполагаемой роли этих цитохромов в подавлении воспалительных реакций, а также сообщаемых ассоциаций некоторых CYP4F3. однонуклеотидные варианты (SNP) с человеческим болезнь Крона (SNP обозначены как rs1290617[11] и rs1290620[12] и Глютеновая болезнь (RS1290622 и RS1290625).[8][13][14][15][16]

Существует также исследование, которое обнаружило связь среди населения Гуанчжоу между однонуклеотидной вариацией rs3794987 и восприимчивостью к вирусу SARS-CoV-1, обнаруженному в 2003 году. Генотип GG / AG был связан с повышенной восприимчивостью к SARS-CoV- 1 по сравнению с генотипом AA. Однако результаты этой ассоциации не были воспроизведены в другом исследовании населения Пекина. Комбинированный анализ двух исследований не показывает никакой связи анализируемых SNP CYP4F3 с восприимчивостью к SARS-CoV-1.[17]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000186529 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024055 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Кикута Ю., Кусуносе Е., Эндо К., Ямамото С., Согава К., Фудзи-Курияма Ю., Кусуносе М. (май 1993 г.). «Новая форма цитохрома P-450 семейства 4 в человеческих полиморфно-ядерных лейкоцитах. Клонирование кДНК и экспрессия лейкотриен B4 омега-гидроксилазы». Журнал биологической химии. 268 (13): 9376–80. PMID  8486631.
  6. ^ Кикута Ю., Като М., Ямасита Ю., Мияути Ю., Танака К., Камада Н., Кусуносе М. (март 1998 г.). «Ген лейкотриен B4 омега-гидроксилазы (CYP4F3): молекулярное клонирование и хромосомная локализация». ДНК и клеточная биология. 17 (3): 221–30. Дои:10.1089 / dna.1998.17.221. PMID  9539102.
  7. ^ а б «Ген Entrez: цитохром P450 CYP4F3, семейство 4, подсемейство F, полипептид 3».
  8. ^ а б c d Коркос Л., Лукас Д., Ле Жосик-Коркос С., Дреано И., Симон Б., Пле-Готье Е. и др. (Апрель 2012 г.). «Человеческий цитохром P450 4F3: структура, функции, перспективы». Метаболизм лекарств и лекарственные взаимодействия. 27 (2): 63–71. Дои:10.1515 / dmdi-2011-0037. PMID  22706230. S2CID  5258044.
  9. ^ Пауэлл В.С., Рокач Дж. (Апрель 2015 г.). «Биосинтез, биологические эффекты и рецепторы гидроксиэйкозатетраеновых кислот (HETE) и оксоэйкозатетраеновых кислот (оксо-ETE), полученных из арахидоновой кислоты». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - молекулярная и клеточная биология липидов. 1851 (4): 340–55. Дои:10.1016 / j.bbalip.2014.10.008. ЧВК  5710736. PMID  25449650.
  10. ^ а б c Джонсон А.Л., Эдсон КЗ, Тота РА, Ретти А.Е. (2015). «Цитохром P450 ω-гидроксилазы при воспалении и раке». Функция цитохрома P450 и его фармакологическая роль при воспалении и раке. Успехи фармакологии. 74. С. 223–62. Дои:10.1016 / bs.apha.2015.05.002. ISBN  9780128031193. ЧВК  4667791. PMID  26233909.
  11. ^ "1290617 рупий". SNPedia.
  12. ^ "Отчет кластера эталонного SNP (refSNP): rs1290620".
  13. ^ Curley CR, Monsuur AJ, Wapenaar MC, Rioux JD, Wijmenga C (ноябрь 2006 г.). «Функциональный скрининг кандидатов на гены целиакии». Европейский журнал генетики человека. 14 (11): 1215–22. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5201687. PMID  16835590. S2CID  10054589.
  14. ^ Костя I, Мак Д.К., Леметр Р.Н., Израиль Д., Марсиль В., Ахмад А., Амре Д.К. (апрель 2014 г.). «Взаимодействие между диетическим соотношением полиненасыщенных жирных кислот и генетическими факторами определяет предрасположенность к болезни Крона у детей». Гастроэнтерология. 146 (4): 929–31. Дои:10.1053 / j.gastro.2013.12.034. PMID  24406470.
  15. ^ Кикута Й., Кусуносе Э., Сумимото Х., Мизуками Й., Такешиге К., Сакаки Т. и др. (Июль 1998 г.). «Очистка и характеристика рекомбинантной омега-гидроксилазы нейтрофилов человека лейкотриен B4 (цитохром P450 4F3)». Архивы биохимии и биофизики. 355 (2): 201–5. Дои:10.1006 / abbi.1998.0724. PMID  9675028.
  16. ^ Hardwick JP (июнь 2008 г.). «Цитохром P450 омега-гидроксилаза (CYP4) участвует в метаболизме жирных кислот и метаболических заболеваниях». Биохимическая фармакология. 75 (12): 2263–75. Дои:10.1016 / j.bcp.2008.03.004. PMID  18433732.
  17. ^ Чжу X, Ван И, Чжан Х, Лю Х, Чен Т., Ян Р. и др. (2011). «Генетическая вариация гена гликопротеина α-2-гереманс-Шмида человека (AHSG), связанная с риском заражения SARS-CoV». PLOS ONE. 6 (8): e23730. Bibcode:2011PLoSO ... 623730Z. Дои:10.1371 / journal.pone.0023730. ЧВК  3163911. PMID  21904596.

дальнейшее чтение

  • Симпсон А.Е. (март 1997 г.). «Семейство цитохрома P450 4 (CYP4)». Общая фармакология. 28 (3): 351–9. Дои:10.1016 / S0306-3623 (96) 00246-7. PMID  9068972.
  • Кикута Й., Кусуносе Е., Кондо Т., Ямамото С., Киношита Х., Кусуносе М. (июль 1994 г.). «Клонирование и экспрессия новой формы лейкотриен B4 омега-гидроксилазы из печени человека». Письма FEBS. 348 (1): 70–4. Дои:10.1016/0014-5793(94)00587-7. PMID  8026587. S2CID  83948293.
  • Рождество П., Урсино С. Р., Фокс Дж. В., Соберман Р. Дж. (Июль 1999 г.). «Экспрессия гена CYP4F3. Тканеспецифический сплайсинг и альтернативные промоторы генерируют формы с высоким и низким K (m) лейкотриен B (4) омега-гидроксилазы». Журнал биологической химии. 274 (30): 21191–9. Дои:10.1074 / jbc.274.30.21191. PMID  10409674. S2CID  307381.
  • Кристмас П., Джонс Дж. П., Паттен С. Джей, Рок Д. А., Чжэн И, Ченг С. М. и др. (Октябрь 2001 г.). «Альтернативный сплайсинг определяет функцию CYP4F3 путем переключения субстратной специфичности». Журнал биологической химии. 276 (41): 38166–72. Дои:10.1074 / jbc.M104818200. PMID  11461919.
  • Кристмас П., Карлессо Н., Шан Х., Ченг С.М., Вебер Б.М., Преффер Ф.И. и др. (Июль 2003 г.). «Миелоидная экспрессия цитохрома P450 4F3 определяется клон-специфическим альтернативным промотором». Журнал биологической химии. 278 (27): 25133–42. Дои:10.1074 / jbc.M302106200. PMID  12709424. S2CID  31914930.
  • Мизуками Ю., Сумимото Х., Такешиге К. (январь 2004 г.). «Индукция цитохрома CYP4F3A в полностью обработанных транс-ретиноевой кислотой клетках HL60». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 314 (1): 104–9. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.12.062. PMID  14715252.
  • Кристмас П., Толентино К., Примо В., Берри К.З., Мерфи Р.С., Чен М. и др. (Март 2006 г.). «Цитохром P-450 4F18 представляет собой лейкотриен B4 омега-1 / омега-2 гидроксилазу в полиморфно-ядерных лейкоцитах мышей: идентификация в качестве функционального ортолога человеческого полиморфноядерного лейкоцита CYP4F3A в подавлении ответов на LTB4». Журнал биологической химии. 281 (11): 7189–96. Дои:10.1074 / jbc.M513101200. PMID  16380383.