Сквален монооксигеназа - Squalene monooxygenase
| Скваленэпоксидаза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Химическая реакция, катализируемая скваленэпоксидазой. | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 1.14.13.132 | ||||||||
| Количество CAS | 9029-62-3 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
| БРЕНДА | BRENDA запись | ||||||||
| ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
| КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Сквален монооксигеназа (также называется скваленэпоксидаза) является фермент который использует НАДФН и молекулярный кислород окислять сквален к 2,3-оксидосквален (эпоксид сквалена). Скваленэпоксидаза катализирует первую стадию оксигенации в стерол биосинтез и считается одним из ферментов, ограничивающих скорость этого пути.[5] У человека скваленэпоксидаза кодируется SQLE ген.[6]Несколько эукариот В геномах отсутствует ген, кодирующий скваленмонооксигеназу, но вместо этого кодируется альтернативная скваленэпоксидаза, которая катализирует окисление сквален.[7]
Механизм
Каноническая скваленмонооксигеназа представляет собой флавопротеин монооксигеназа. Форма флавопротеинмонооксигеназы флавин гидропероксиды на фермент активный сайт, которые затем передают терминал атом кислорода из гидропероксид к субстрат. Скваленмонооксигеназа отличается от других флавинмонооксигеназ тем, что кислород вставляется как эпоксид а не как гидроксил группа. Скваленмонооксигеназа содержит слабосвязанный FAD флавин и получает электроны от НАДФН -цитохром Р450 редуктаза вместо того, чтобы связывать никотинамид кофактор НАДФН напрямую. Альтернативная скваленэпоксидаза принадлежит к суперсемейству гидроксилаз жирных кислот и получает электроны от цитохром b5.[7]
Ингибиторы
Ингибиторы скваленэпоксидазы нашли применение в основном в качестве противогрибковые препараты:[8]
Поскольку скваленэпоксидаза участвует в биосинтетическом пути, ведущем к холестерину, ингибиторы этого фермента также могут найти применение при лечении гиперхолестеринемия.[10]
Локализация
В дрожжах Saccharomyces cerevisiae, скваленэпоксидаза локализуется как в эндоплазматическом ретикулуме, так и в липидных каплях. Активен только белок, локализованный в ER.
Дополнительные продукты
Скваленэпоксидаза также катализирует образование диэпоксисквалена (DOS). DOS превращается в 24 (S), 25-эпоксиланостерин под действием ланостеринсинтазы.
Модельные организмы
Модельные организмы были использованы при изучении функции SQLE. Условный нокаутирующая мышь линия называется Sqletm1a (EUCOMM) Wtsi был создан на Wellcome Trust Sanger Institute.[11] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг[12] для определения последствий удаления.[13][14][15][16] Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование[17]
| Характеристика | Фенотип |
|---|---|
| Все данные доступны на сайте.[12][17] | |
| Лейкоциты периферической крови 6 недель | Нормальный |
| Инсулин | Нормальный |
| Гематология 6 недель | Нормальный |
| Гомозиготная жизнеспособность на P14 | Аномальный |
| Рецессивный смертельное исследование | Аномальный |
| Масса тела | Нормальный |
| Неврологический осмотр | Нормальный |
| Сила захвата | Нормальный |
| Дисморфология | Нормальный |
| Косвенная калориметрия | Нормальный |
| Тест толерантности к глюкозе | Нормальный |
| Слуховой ответ ствола мозга | Нормальный |
| DEXA | Нормальный |
| Рентгенография | Нормальный |
| Морфология глаза | Нормальный |
| Клиническая химия | Нормальный |
| Гематология 16 недель | Нормальный |
| Лейкоциты периферической крови 16 недель | Нормальный |
| Вес сердца | Нормальный |
| Сальмонелла инфекция | Нормальный |
| Функция цитотоксических Т-клеток | Нормальный |
| Иммунофенотипирование селезенки | Нормальный |
| Иммунофенотипирование мезентериальных лимфатических узлов | Нормальный |
| Иммунофенотипирование костного мозга | Нормальный |
| Состав эпидермального иммунитета | Нормальный |
Смотрите также
использованная литература
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000104549 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000022351 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Entrez Gene: SQLE скваленэпоксидаза".
- ^ Нагай М., Сакакибара Дж., Вакуи К., Фукусима Ю., Игараси С., Цудзи С., Аракава М., Оно Т. (август 1997 г.). «Локализация гена скваленэпоксидазы (SQLE) в области хромосомы человека 8q24.1». Геномика. 44 (1): 141–3. Дои:10.1006 / geno.1997.4825. PMID 9286711.
- ^ а б Pollier J, Vancaester E, Kuzhiumparambil U, Vickers CE, Vandepoele K, Goossens A, Fabris M (2019). «Широко распространенная альтернатива скваленэпоксидазе участвует в биосинтезе стероидов эукариот». Природная микробиология. 4 (2): 226–233. Дои:10.1038 / s41564-018-0305-5. PMID 30478288. S2CID 53726187.
- ^ Фавр Б., Райдер Н.С. (февраль 1996 г.). «Характеристика активности скваленэпоксидазы дерматофита Trichophyton rubrum и ее ингибирования тербинафином и другими антимикотическими средствами». Противомикробные препараты и химиотерапия. 40 (2): 443–7. Дои:10.1128 / AAC.40.2.443. ЧВК 163131. PMID 8834895.
- ^ Райдер Н.С. (февраль 1992 г.). «Тербинафин: механизм действия и свойства ингибирования скваленэпоксидазы». Британский журнал дерматологии. 126 Дополнение 39: 2–7. Дои:10.1111 / j.1365-2133.1992.tb00001.x. PMID 1543672. S2CID 19780957.
- ^ Chugh A, Ray A, Гупта JB (январь 2003 г.). «Пересмотр скваленэпоксидазы как мишени для гипохолестеринемического лекарства». Прогресс в исследованиях липидов. 42 (1): 37–50. Дои:10.1016 / S0163-7827 (02) 00029-2. PMID 12467639.
- ^ Гердин А.К. (2010). «Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
- ^ а б «Международный консорциум по фенотипированию мышей».
- ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК 3572410. PMID 21677750.
- ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
- ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Ячейка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
- ^ Уайт Дж. К., Гердин А. К., Карп Н. А., Райдер Э., Бульян М., Басселл Дж. Н., Солсбери Дж., Клэр С., Ингем Нью-Джерси, Подрини С., Хоутон Р., Эстабель Дж., Боттомли Дж. Р., Мелвин Д. Дж., Сантер Д., Адамс, Северная Каролина, Таннахилл Д. , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (июль 2013 г.). «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов». Ячейка. 154 (2): 452–64. Дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. ЧВК 3717207. PMID 23870131.
- ^ а б «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)».
дальнейшее чтение
- Ма Дж., Демпси А.А., Стаматиу Д., Маршалл К.В., Лью С.К. (март 2007 г.). «Определение паттернов экспрессии лейкоцитарных генов, связанных с уровнями липидов в плазме у людей». Атеросклероз. 191 (1): 63–72. Дои:10.1016 / j.atherosclerosis.2006.05.032. PMID 16806233.
- Ладен Б.П., Тан Й., Портер Т.Д. (февраль 2000 г.). «Клонирование, гетерологичная экспрессия и ферментологическая характеристика скваленмонооксигеназы человека». Архивы биохимии и биофизики. 374 (2): 381–8. Дои:10.1006 / abbi.1999.1629. PMID 10666321.
- Helms MW, Kemming D, Pospisil H, Vogt U, Buerger H, Korsching E, Liedtke C, Schlotter CM, Wang A, Chan SY, Brandt BH (сентябрь 2008 г.). «Скваленэпоксидаза, расположенная на хромосоме 8q24.1, активируется при раке молочной железы 8q + и указывает на плохой клинический результат при I и II стадии заболевания». Британский журнал рака. 99 (5): 774–80. Дои:10.1038 / sj.bjc.6604556. ЧВК 2528137. PMID 18728668.
- Нагаи М., Сакакибара Дж., Накамура Ю., Гэджио Ф., Оно Т. (июль 2002 г.). «SREBP-2 и NF-Y участвуют в регуляции транскрипции скваленэпоксидазы». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 295 (1): 74–80. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00623-X. PMID 12083769.
- Лю И, Сун В., Чжан К., Чжэн Х, Ма И, Линь Д., Чжан Х, Фенг Л., Лей В., Чжан З., Го С., Хан Н, Тонг В., Фенг Х, Гао И, Ченг С. (июнь 2007 г. ). «Идентификация генов, дифференциально экспрессируемых в первичной плоскоклеточной карциноме легких человека». Рак легких. 56 (3): 307–17. Дои:10.1016 / j.lungcan.2007.01.016. PMID 17316888.
- Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Лу И, Долле М.Э., Имхольц С., Ван 'т Слот Р., Вершурен В.М., Вейменга С., Фескенс Э.Дж., Бур Д.М. (декабрь 2008 г.). «Множественные генетические варианты по пути-кандидату влияют на концентрацию холестерина липопротеинов высокой плотности в плазме». Журнал липидных исследований. 49 (12): 2582–9. Дои:10.1194 / мл. M800232-JLR200. PMID 18660489.
- Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К. Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D415-8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК 1347501. PMID 16381901.
- Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК 310948. PMID 11076863.
- Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Накамура Ю., Сакакибара Дж., Изуми Т., Шибата А., Оно Т. (апрель 1996 г.). «Регулирование транскрипции скваленэпоксидазы стеринами и ингибиторами в клетках HeLa». Журнал биологической химии. 271 (14): 8053–6. Дои:10.1074 / jbc.271.14.8053. PMID 8626488.
- Нагай М., Сакакибара Дж., Вакуи К., Фукусима Ю., Игараси С., Цудзи С., Аракава М., Оно Т. (август 1997 г.). «Локализация гена скваленэпоксидазы (SQLE) в области хромосомы человека 8q24.1». Геномика. 44 (1): 141–3. Дои:10.1006 / geno.1997.4825. PMID 9286711.
- Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК 528930. PMID 15489336.
внешние ссылки
- Сквален + монооксигеназа в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.