Биопленка - Biofilm

Для биографических фильмов см. Биографический фильм.
Золотистый стафилококк биопленка на жилище катетер
ИЮПАК определение
Совокупный микроорганизмов, в которых клетки, которые часто встроены в самостоятельно продуцируемую матрицу внеклеточных полимерных веществ (EPS), прилипают друг к другу и / или к поверхности.

Примечание 1. Биопленка - это система, которую ее жители могут внутренне адаптировать к условиям окружающей среды.

Примечание 2: Самостоятельная матрица внеклеточные полимерные вещества, который также называют слизью, представляет собой полимерный конгломерат, обычно состоящий из внеклеточных биополимеры в различных структурных формах.[1]

А биопленка включает любые синтрофический консорциум микроорганизмы в котором клетки придерживаться друг друга а часто и на поверхность.[2][3] Эти прилипшие клетки внедряются в слизистую оболочку. внеклеточный матрикс который состоит из внеклеточные полимерные вещества (EPS).[2][3] Клетки внутри биопленки производят компоненты EPS, которые обычно представляют собой полимерный скопление внеклеточных полисахариды, белки, липиды и ДНК.[2][3][4] Поскольку они имеют трехмерную структуру и представляют собой образ жизни сообщества для микроорганизмов, их метафорически называют «городами для микробов».[5][6]

Биопленки могут образовываться на живых или неживых поверхностях и могут преобладать в естественных, промышленных и больничных условиях.[3][7] Растущие в биопленке микробные клетки физиологически в отличие от планктонный клетки одного и того же организма, которые, напротив, являются одноклеточными, которые могут плавать или плавать в жидкой среде.[8] Биопленки могут образовываться на зубы большинства животных как зубной налет, где они могут вызвать кариес и заболевание десен.

Микробы образуют биопленку в ответ на ряд различных факторов,[9] которые могут включать клеточное распознавание специфических или неспецифических сайтов прикрепления на поверхности, пищевые сигналы или, в некоторых случаях, воздействие на планктонные клетки субингибирующих концентраций антибиотики.[10][11] Клетка, которая переходит в режим роста биопленки, подвергается фенотипический сдвиг в поведении, в котором большие наборы генов по-разному регулируемый.[12]

Биопленку также можно считать гидрогель, который представляет собой сложный полимер, который содержит воду, во много раз превышающую ее сухой вес. Биопленки - это не просто слои бактериальной слизи, но и биологические системы; бактерии организуются в скоординированное функциональное сообщество. Биопленки могут прикрепляться к поверхности, такой как зуб, камень или поверхность, и могут включать один вид или различные группы микроорганизмов. Биопленочные бактерии могут делиться питательными веществами и защищены от вредных факторов окружающей среды, таких как высыхание, антибиотики и иммунная система организма-хозяина. Биопленка обычно начинает формироваться, когда свободно плавающая бактерия прикрепляется к поверхности.[13][страница нужна ]

Происхождение и формирование

Происхождение биопленок

Предполагается, что биопленки возникли во время примитивной Земли в качестве защитного механизма для прокариот, поскольку условия в то время были слишком суровыми для их выживания. Биопленки защищают прокариотические клетки, обеспечивая им гомеостаз, способствуя развитию сложных взаимодействий между клетками в биопленке.[3]

Формирование биопленок

Формирование биопленки начинается с прикрепления к поверхности свободно плавающих микроорганизмов.[8][5] Первые бактерии-колонисты биопленки могут прилипать к поверхности сначала за счет слабого силы Ван дер Ваальса и гидрофобные эффекты.[14][15] Если колонистов сразу не отделить от поверхности, они могут закрепиться на более длительный срок, используя клеточная адгезия структуры, такие как пили. Уникальная группа архей, населяющих бескислородные грунтовые воды имеют похожие структуры, называемые хами. Каждый хамус представляет собой длинную трубку с тремя крючками, которые используются для прикрепления друг к другу или к поверхности, что позволяет сообществу развиваться.[16][17]

Гидрофобность также может влиять на способность бактерий образовывать биопленки. Бактерии с повышенной гидрофобностью имеют меньшее отталкивание между субстратом и бактерией.[18] Некоторые виды бактерий не могут успешно прикрепляться к поверхности самостоятельно из-за их ограниченной подвижности, но вместо этого могут прикрепляться к матрице или непосредственно к другим, более ранним колонистам бактерий. Неподвижные бактерии не может распознавать поверхности или объединяться вместе так же легко, как подвижные бактерии.[18]

Во время поверхностной колонизации клетки бактерий могут общаться, используя проверка кворума (QS) продукты, такие как N-ацил-гомосерин-лактон (АХЛ). Как только колонизация началась, биопленка растет за счет комбинации клеточного деления и рекрутирования. Полисахарид матрицы обычно содержат бактериальные биопленки. В дополнение к полисахаридам эти матрицы могут также содержать материал из окружающей среды, включая, помимо прочего, минералы, частицы почвы и компоненты крови, такие как эритроциты и фибрин.[18] Заключительная стадия образования биопленки известна как дисперсия и представляет собой стадию, на которой биопленка формируется и может изменяться только по форме и размеру.

Развитие биопленки может сделать совокупную клеточную колонию (или колонии) более устойчивой.[19] или устойчив к антибиотикам. Сотовая связь или проверка кворума было показано, что он участвует в формировании биопленки у нескольких видов бактерий.[20]

Развитие

Пять стадий развития биопленки: (1) начальное прикрепление, (2) необратимое прикрепление, (3) созревание I, (4) созревание II и (5) диспергирование. Каждый этап развития на диаграмме сопряжен с микрофотография развивающегося P. aeruginosa биопленка. Все микрофотографии показаны в одном масштабе.

Биопленки - продукт микробного развивающий обработать.[21] Процесс резюмируется пятью основными этапами развития биопленки (см. Иллюстрацию справа):[22]

  1. Первоначальное прикрепление
  2. Необратимая привязанность
  3. Созревание I
  4. Созревание II
  5. Дисперсия

Рассредоточение

Распространение биопленки

Распространение клеток из колонии биопленок является важным этапом жизненного цикла биопленки. Распространение позволяет биопленкам распространяться и колонизировать новые поверхности. Ферменты, разрушающие биопленка внеклеточный матрикс, такие как дисперсин B и дезоксирибонуклеаза, может способствовать диспергированию биопленок.[23][24] Ферменты, которые разрушают матрицу биопленки, могут быть полезны в качестве агентов против биопленки.[25][26] Факты показали, что посланник жирных кислот, СНГ-2-деценовая кислота, способен вызывать диспергирование и ингибировать рост колоний биопленок. Секретно Синегнойная палочка, это соединение индуцирует циклогетероморфные клетки у нескольких видов бактерий и дрожжей. грибковые микроорганизмы албиканс.[27]Было также показано, что оксид азота запускает распространение биопленок нескольких видов бактерий.[28][29] при субтоксичных концентрациях. Оксид азота имеет потенциал для лечения пациентов, страдающих хроническими инфекциями, вызванными биопленками.[30]

Принято считать, что клетки, диспергированные из биопленок, сразу переходят в фазу планктонного роста. Однако исследования показали, что физиология диспергированных клеток из Синегнойная палочка биопленки сильно отличаются от планктонных и биопленочных клеток.[31][32] Таким образом, процесс распространения является уникальным этапом перехода бактерий от биопленки к планктонному образу жизни. Обнаружено, что диспергированные клетки обладают высокой вирулентностью в отношении макрофагов и Caenorhabditis elegans, но очень чувствительны к железному стрессу по сравнению с планктонными клетками.[31]

Свойства

Биопленки обычно встречаются на твердых субстраты погружены в воду или подвергаются воздействию водный решение, хотя они могут образовывать плавающие маты на жидких поверхностях, а также на поверхности листьев, особенно в условиях высокой влажности. При наличии достаточных ресурсов для роста биопленка быстро становится макроскопической (видимой невооруженным глазом). Биопленки могут содержать много разных типов микроорганизмов, например бактерии, археи, простейшие, грибы и водоросли; каждая группа выполняет специализированные метаболический функции. Однако некоторые организмы при определенных условиях образуют одновидовые пленки. Социальная структура (сотрудничество / конкуренция) внутри биопленки сильно зависит от различных присутствующих видов.[33]

Внеклеточный матрикс

Сканирующая электронная микрофотография биопленки смешанных культур, подробно демонстрирующая пространственно неоднородное расположение бактериальных клеток и внеклеточных полимерных веществ.

Матрица EPS состоит из экзополисахариды, белки и нуклеиновые кислоты.[34][35][36] Большая часть EPS более или менее гидратирована, однако также встречаются гидрофобные EPS; один пример - целлюлоза[37] который вырабатывается рядом микроорганизмов. Эта матрица окружает клетки внутри себя и облегчает связь между ними посредством биохимических сигналов, а также обмена генами. Матрица EPS также улавливает внеклеточные ферменты и удерживает их в непосредственной близости от клеток. Таким образом, матрица представляет собой внешнюю систему пищеварения и обеспечивает стабильную синергетическую микроконсорцию различных видов.[38] Было обнаружено, что некоторые биопленки содержат водные каналы, которые помогают распространять питательные вещества и сигнальные молекулы.[39] Эта матрица достаточно прочная, чтобы при определенных условиях биопленки могли стать окаменелый (Строматолиты ).

Бактерии, живущие в биопленке, обычно имеют свойства, значительно отличающиеся от свободно плавающих бактерий того же вида, поскольку плотная и защищенная среда пленки позволяет им взаимодействовать и взаимодействовать различными способами.[40] Одно из преимуществ этой среды - повышенная устойчивость к моющие средства и антибиотики, поскольку плотный внеклеточный матрикс и внешний слой клеток защищают внутреннюю часть сообщества.[41] В некоторых случаях устойчивость к антибиотикам может быть увеличен до 5000 раз.[42] Боковой перенос генов часто способствует бактериальной и архейной биопленкам[43] и приводит к более стабильной структуре биопленки.[44] Внеклеточная ДНК является основным структурным компонентом многих различных микробных биопленок.[45] Ферментативная деградация внеклеточной ДНК может ослабить структуру биопленки и высвободить микробные клетки с поверхности.

Однако биопленки не всегда менее подвержены действию антибиотиков. Например, биопленочная форма Синегнойная палочка не имеет большей устойчивости к противомикробным препаратам, чем планктонные клетки в стационарной фазе, хотя, когда биопленка сравнивается с планктонными клетками в логарифмической фазе, биопленка действительно обладает большей устойчивостью к противомикробным препаратам. Эта устойчивость к антибиотикам как в клетках стационарной фазы, так и в биопленках может быть связана с наличием клетки-персистеры.[46]

Среды обитания

Маты из бактериальной биопленки окрашивают горячие источники в Йеллоустонский Национальный Парк. Самая длинная приподнятая площадка - около полуметра.
Термофильные бактерии в оттоке Микки Хот Спрингс, Орегон толщиной примерно 20 мм.

Биопленки повсеместно встречаются в органической жизни. Почти у каждого вида микроорганизмов есть механизмы, с помощью которых они могут прикрепляться к поверхностям и друг к другу. Биопленки образуются практически на каждой непроливающейся поверхности в нестерильный водная или влажная среда. Биопленки могут расти в самых экстремальных условиях: например, в чрезвычайно горячих соленых водах горячие источники от очень кислого до очень щелочного, до замороженного ледники.

Биопленки можно найти на камнях и гальке на дне большинства ручьев или реки и часто образуются на поверхности застойный бассейны с водой. Биопленки - важные компоненты пищевые цепочки в реках и ручьях и пасутся водными беспозвоночные которыми питаются многие рыбы. Биопленки обнаруживаются на поверхности и внутри растений. Они могут способствовать заболеванию сельскохозяйственных культур или, как в случае азотфиксирующий ризобия на корневые узелки, существует симбиотически с растением.[47] Примеры болезней сельскохозяйственных культур, связанных с биопленками, включают Citrus Canker, Болезнь Пирса винограда и бактериальных пятен растений, таких как перец и помидоры.[48]

Фильтры просачивания

Фильтры просачивания в очистных сооружениях являются высокоэффективными удалителями загрязняющих веществ из осевших сточных вод. Они работают, капая жидкость по слою твердого материала, который имеет очень большую площадь поверхности. На поверхности среды образуется сложная биопленка, которая поглощает, адсорбирует и метаболизирует загрязняющие вещества. Биопленка быстро растет, и когда она становится слишком толстой, чтобы удерживать ее на носителе, она смывается и заменяется недавно выросшей пленкой. Смытая («отслоившаяся») пленка осаждается из потока жидкости, оставляя высокоочищенный сток.[49]

Медленный песочный фильтр

Медленные песочные фильтры используются при очистке воды для обработки сырой воды с целью производства питьевого продукта. Они работают за счет образования биопленки, называемой гипогеальный слой или Schmutzdecke в верхних нескольких миллиметрах слоя мелкого песка. В Schmutzdecke образуется в первые 10–20 дней эксплуатации[50] и состоит из бактерии, грибы, простейшие, коловратка и ряд личинок водных насекомых. По мере того как эпигеальная биопленка стареет, появляется больше водорослей и могут присутствовать более крупные водные организмы, в том числе некоторые мшанки, улитки и Аннелида черви. Поверхностная биопленка - это слой, который обеспечивает эффективную очистку при очистке питьевой воды, а нижележащий песок обеспечивает среду поддержки для этого слоя биологической очистки. Когда вода проходит через гипогеальный слой, частицы посторонних веществ захватываются слизистой матрицей, и растворимый органический материал задерживается. адсорбированный. Загрязняющие вещества метаболизируются бактериями, грибами и простейшими. Вода, полученная из образцового медленного песочного фильтра, имеет отличное качество с уменьшением количества бактериальных клеток на 90–99%.[51]

Ризосфера

Полезные для растений микробы можно разделить на следующие категории: ризобактерии, способствующие росту растений.[52] Эти стимуляторы роста растений колонизируют корни растений и обеспечивают широкий спектр полезных функций для своего хозяина, включая фиксацию азота, подавление патогенов, противогрибковые свойства и разрушение органических материалов.[53] Одна из этих функций - защита от патогенных почвенных бактерий и грибков посредством индуцированной системной устойчивости (ISR).[54] или индуцированные системные ответы, запускаемые патогенными микробами (вызванная патогенами системная приобретенная устойчивость).[55] Экссудаты растений действуют как химические сигналы для колонизации специфических бактерий-хозяев.[56] Этапы колонизации ризобактерий включают в себя влечение, узнавание, привязанность, колонизацию и рост.[53] Бактерии, которые оказались полезными и образуют биопленки, включают: Бациллы, псевдомонады, и Азоспириллы.[57][58] Биопленки в ризосфере часто вызывают системную резистентность, индуцированную патогенами или растением. Молекулярные свойства на поверхности бактерии вызывают иммунный ответ у растения-хозяина.[56] Эти ассоциированные с микробами молекулы взаимодействуют с рецепторами на поверхности растительных клеток и активируют биохимический ответ, который, как считается, включает несколько различных генов в ряде локусов.[56] Несколько других сигнальных молекул были связаны как с индуцированными системными ответами, так и с системными ответами, индуцированными патогенами, такие как жасмоновая кислота и этилен.[53] Компоненты клеточной оболочки, такие как бактериальные жгутики и липополисахариды, которые распознаются растительными клетками как компоненты патогенов.[59] Некоторые метаболиты железа, продуцируемые Pseudomonas, также вызывают индуцированный системный ответ.[56] Эта функция биопленки помогает растениям повысить сопротивляемость болезнетворным микроорганизмам.

Растения, которые были заселены PGPR, образуя биопленку, приобрели системную резистентность и подготовлены к защите от патогенов. Это означает, что гены, необходимые для производства белков, которые работают для защиты растения от патогенов, были экспрессированы, и у растения есть «запас» соединений, которые нужно высвобождать для борьбы с патогенами.[56] Праймированная система защиты намного быстрее реагирует на инфекцию, вызванную патогенами, и может отклонять патогены до того, как они смогут закрепиться.[60] Растения увеличивают производство лигнина, укрепляя клеточные стенки и затрудняя проникновение патогенов в клетку, а также блокируя питательные вещества для уже инфицированных клеток, эффективно останавливая инвазию.[53] Они производят антимикробные соединения, такие как фитоалексины, хитиназы и ингибиторы протеиназ, которые предотвращают рост патогенов.[55] Эти функции подавления болезней и устойчивости к патогенам в конечном итоге приводят к увеличению сельскохозяйственного производства и уменьшению использования химических пестицидов, гербицидов и фунгицидов, поскольку уменьшается количество потерь урожая из-за болезней.[61] Индуцированная системная резистентность и индуцированная патогенами системная приобретенная резистентность являются потенциальными функциями биопленок в ризосфере, и их следует принимать во внимание при применении к новым методам ведения сельского хозяйства, поскольку они влияют на подавление болезней без использования опасных химикатов.

Кишечник млекопитающих

Исследования 2003 года показали, что иммунная система поддерживает развитие биопленок в толстой кишке. Это было подтверждено, главным образом, тем фактом, что две наиболее часто продуцируемые иммунной системой молекулы также поддерживают образование биопленок и связаны с биопленками, образующимися в кишечнике. Это особенно важно, потому что аппендикс удерживает большое количество бактериальных биопленок.[62] Это открытие помогает различить возможную функцию аппендикса и идею о том, что аппендикс может помочь повторно заселить кишечник хорошей кишечной флорой.

Человеческая среда

В среде человека биопленки могут расти в душевые очень легко, поскольку они создают влажную и теплую среду для роста биопленки. Биопленки могут образовываться внутри воды и сточные воды трубы и вызвать засорение и коррозия. Биопленки на полах и прилавках могут затруднить санитарию в зонах приготовления пищи. Биопленка в почве может вызвать биоблоггинг. Известно, что биопленки в системах охлаждения или нагрева воды снижают теплопередачу.[63] Биопленки в морских инженерных системах, таких как трубопроводы морской нефтегазовой отрасли,[64] может привести к серьезным проблемам с коррозией. Коррозия в основном вызвана абиотическими факторами; однако, по крайней мере, 20% коррозии вызвано микроорганизмами, прикрепленными к металлической поверхности (т. е. коррозия под воздействием микробов ).

Обрастание судов

Бактериальная адгезия к корпусу лодок служит основой для биообрастание морских судов. Когда образуется пленка из бактерий, другим морским организмам, таким как ракушки, становится легче прикрепиться. Такое обрастание может снизить максимальную скорость судна до 20%, увеличивая продолжительность рейса и расход топлива. Время нахождения в сухом доке для переоборудования и перекраски снижает производительность судовых активов, а также сокращается срок полезного использования судов из-за коррозии и механического удаления (соскабливания) морских организмов с корпусов судов.

Строматолиты

Строматолиты представляют собой слоистые аккреционные структуры, образованные на мелководье за ​​счет захвата, связывания и цементации осадочных зерен микробными биопленками, особенно цианобактерии. Строматолиты содержат одни из самых древних записей о жизни на Земле, и их формирование продолжается до сих пор.

Зубной налет

Внутри человеческого тела биопленки присутствуют на зубы так как зубной налет, где они могут вызвать кариес и заболевание десен. Эти биопленки могут быть в некальцинированном состоянии, которое можно удалить стоматологическими инструментами, или в кальцинированном состоянии, которое удалить труднее. Методы удаления также могут включать: противомикробные препараты.[65]

Зубной налет - это биопленка полости рта, которая прилипает к зубам и состоит из многих видов бактерий и грибков (таких как Streptococcus mutans и грибковые микроорганизмы албиканс), в слюне полимеры и микробные внеклеточные продукты. Накопление микроорганизмов подвергает зубы и ткани десен воздействию высоких концентраций бактерий. метаболиты что приводит к стоматологическому заболеванию.[66] Биопленка на поверхности зубов часто подвержена окислительному стрессу.[67] и кислотный стресс.[68] Углеводы в рационе могут вызвать резкое снижение pH в биопленках полости рта до значений 4 и ниже (кислотный стресс).[68] Значение pH 4 при температуре тела 37 ° C вызывает депуринизацию ДНК, оставляя апуриновые (AP) сайты в ДНК,[69] особенно потеря гуанина.[70]

Биопленка зубного налета может привести к заболеванию кариесом зубов, если ему дать развиваться с течением времени. Экологический сдвиг от сбалансированных популяций внутри зубной биопленки вызван определенными (кариесогенными) микробиологическими популяциями, которые начинают доминировать, когда им благоприятствует окружающая среда. Переход к ацидогенный, ацидурическая и кариесогенная микробиологическая популяция развивается и поддерживается частым потреблением ферментируемых пищевых продуктов. углевод. Результирующий сдвиг активности в биопленке (и возникающее в результате производство кислоты внутри биопленки на поверхности зуба) связан с дисбалансом между деминерализацией и реминерализацией, что приводит к чистой потере минералов в твердых тканях зуба (эмаль а потом дентин ), признаком и симптомом которого является кариозное поражение. Предотвращая созревание биопленки зубного налета или возвращая ее в некариогенное состояние, можно предотвратить и остановить кариес.[71] Это может быть достигнуто посредством поведенческого шага по уменьшению поступления ферментируемых углеводов (т. Е. Потребления сахара) и частого удаления биопленки (т. Е. Чистки зубов).

Межклеточная коммуникация

Смотрите также: Микробиология полости рта

Сигнальная система, воспринимающая кворум пептидных феромонов в S. mutans включает пептид, стимулирующий компетентность (CSP), который контролирует генетическую компетентность.[72][73] Генетическая компетентность - это способность клетки воспринимать ДНК, выпущенную другой клеткой. Компетентность может привести к генетической трансформации, форме сексуального взаимодействия, благоприятной в условиях высокой плотности клеток и / или стресса, когда существует максимальная возможность взаимодействия между компетентной клеткой и ДНК, высвобождаемой из близлежащих донорских клеток. Эта система оптимально выражается, когда S. mutans клетки находятся в активно растущей биопленке. Биопленка выращена S. mutans клетки генетически трансформируются со скоростью от 10 до 600 раз выше, чем S. mutans растет как свободно плавающие планктонные клетки, взвешенные в жидкости.[72]

Когда биопленка, содержащая S. mutans и родственные оральные стрептококки, подвергаются кислотному стрессу, индуцируется регулон компетенции, что приводит к устойчивости к гибели под действием кислоты.[68] Как указано Michod et al., Трансформация бактериальных патогенов, вероятно, обеспечивает эффективную и действенную рекомбинационную репарацию повреждений ДНК.[74] Похоже, что S. mutans могут выдержать частый кислотный стресс в биопленках полости рта, отчасти благодаря рекомбинационной репарации, обеспечиваемой компетентностью и трансформацией.

Взаимодействие хищника и жертвы

Смотрите также: Взаимодействие хищника и жертвы

Хищник -добыча взаимодействие между биопленками и бактериоядными животными, такими как почвенные нематоды Caenorhabditis elegans, были широко изучены. За счет образования липкой матрицы и образования агрегатов, Yersinia pestis биопленки могут препятствовать кормлению, закрывая рот C. elegans.[75] Более того, Синегнойная палочка биопленки могут препятствовать скольжению подвижности C. elegans, называемый «фенотип болота», приводящий к отлову C. elegans внутри биопленок и предотвращает исследование нематод, питающихся чувствительными биопленками.[76] Это значительно снизило способность хищников питаться и размножаться, тем самым способствуя выживанию биопленок.

Таксономическое разнообразие

Многие различные бактерии образуют биопленки, в том числе грамположительные (например, Бациллы spp, Listeria monocytogenes, Стафилококк spp и молочнокислые бактерии, в том числе Lactobacillus plantarum и Lactococcus lactis ) и грамотрицательные виды (например, кишечная палочка, или Синегнойная палочка ).[77] Цианобактерии также образуют биопленки в водной среде.[78]

Биопленки образуются бактериями, которые колонизируют растения, например Pseudomonas putida, Pseudomonas fluorescens и родственные псевдомонады, которые являются обычными ассоциированными с растениями бактериями, обнаруженными на листьях, корнях и в почве, и большинство их природных изолятов образуют биопленки.[79] Несколько азотфиксирующих симбионтов бобовых, таких как Rhizobium leguminosarum и Sinorhizobium meliloti образуют биопленки на корнях бобовых и других инертных поверхностях.[79]

Помимо бактерий, биопленки также образуются археи[43] и рядом эукариотический организмов, в том числе грибы например Cryptococcus laurentii[80] и микроводоросли. Среди микроводорослей одними из основных прародителей биопленок являются диатомеи, которые колонизируют как пресную, так и морскую среду по всему миру.[81][82]

Для других видов в биопленках, связанных с заболеванием, и биопленках, возникающих из эукариоты см. ниже.

Инфекционные заболевания

Было обнаружено, что биопленки участвуют в большом количестве микробных инфекций в организме, что, по одной оценке, составляет 80% всех инфекций.[83] Инфекционные процессы, в которые вовлечены биопленки, включают общие проблемы, такие как бактериальный вагиноз, инфекция мочеиспускательного канала, катетер инфекции, инфекции среднего уха, формирование зубной налет,[84] гингивит, покрытие контактные линзы,[85] и менее распространенные, но более смертельные процессы, такие как эндокардит, инфекции в кистозный фиброз и инфекции постоянных устройств, таких как суставы протезы, сердечные клапаны, и межпозвоночный диск.[86][87][88] Первое визуальное свидетельство биопленки было зарегистрировано после операции на позвоночнике.[89] Было обнаружено, что при отсутствии клинических проявлений инфекции импрегнированные бактерии могут образовывать биопленку вокруг имплантата, и эта биопленка может оставаться незамеченной с помощью современных методов диагностики, включая мазок мазка. Биопленка имплантата часто присутствует в случаях «асептического» псевдоартроза.[89][90] Кроме того, было отмечено, что бактериальные биопленки могут ухудшать заживление кожных ран и снижать эффективность местных антибактериальных средств при заживлении или лечении инфицированных кожных ран.[91] Раннее обнаружение биопленок в ранах имеет решающее значение для успешного лечения хронических ран. Хотя многие методы были разработаны для выявления планктонных бактерий в жизнеспособных ранах, лишь немногие из них смогли быстро и точно идентифицировать бактериальные биопленки. Необходимы дальнейшие исследования для поиска средств выявления и мониторинга колонизации биопленкой у постели больного, чтобы обеспечить своевременное начало лечения.[92]

Было показано, что биопленки присутствуют на удаленных тканях у 80% пациентов, перенесших операцию по поводу хронического заболевания. синусит. Показано, что пациенты с биопленками лишены реснички и бокаловидные клетки, в отличие от контроля без биопленок, у которых была нормальная морфология ресничек и бокаловидных клеток.[93] Биопленки также были обнаружены в образцах двух из 10 упомянутых здоровых людей.Виды бактерий из интраоперационных культур не соответствовали видам бактерий в биопленке на ткани соответствующего пациента. Другими словами, культуры были отрицательными, хотя бактерии присутствовали.[94] Новые методы окрашивания разрабатываются для дифференциации бактериальных клеток, растущих у живых животных, например из тканей с аллергией-воспалениями.[95]

Исследования показали, что субтерапевтические уровни β-лактамных антибиотиков вызывают образование биопленок в Золотистый стафилококк. Этот субтерапевтический уровень антибиотика может быть результатом использования антибиотиков в качестве стимуляторов роста в сельском хозяйстве или во время обычного курса антибактериальной терапии. Образование биопленок, вызванное низкоуровневым метициллином, ингибировалось ДНКазой, что позволяет предположить, что субтерапевтические уровни антибиотика также вызывают высвобождение внеклеточной ДНК.[96] Более того, с эволюционной точки зрения создание Трагедия общественного достояния в патогенных микробах может предоставить передовые терапевтические способы лечения хронических инфекций, вызванных биопленками, с помощью генно-инженерных инвазивных мошенников, которые могут вторгаться в «кооператоров» патогенных бактерий дикого типа до тех пор, пока кооперативные популяции не исчезнут или пока «кооператоры и мошенники» не вымрут.[97]

Синегнойная палочка

P. aeruginosa представляет собой широко используемую биопленку модельный организм поскольку он участвует в различных типах хронических инфекций, связанных с биопленками.[34] Примеры таких инфекций включают хронические раны, хронический средний отит, хронический простатит и хронические инфекции легких в кистозный фиброз (CF) пациенты. Около 80% пациентов с МВ имеют хроническую инфекцию легких, вызванную, главным образом, P. aeruginosa растет в биопленках, не прикрепленных к поверхности, окружающих PMN.[98] Инфекция сохраняется, несмотря на агрессивную терапию антибиотиками, и является частой причиной смерти пациентов с МВ из-за постоянного воспалительного поражения легких.[34] У пациентов с МВ одним из методов лечения раннего развития биопленок является использование ДНКаза структурно ослабить биопленку.[4][99]

Пневмококк

S. pneumoniae является основной причиной внебольничной пневмонии и менингита у детей и пожилых людей, а также сепсиса у ВИЧ-инфицированных. Когда S. pneumoniae растет в биопленках, специфически экспрессируются гены, которые реагируют на окислительный стресс и вызывают компетентность.[100] Формирование биопленки зависит от компетенции стимулирующего пептида (CSP). CSP также функционирует как пептид, чувствительный к кворуму. Он не только вызывает образование биопленок, но также увеличивает вирулентность при пневмонии и менингите.

Было высказано предположение, что развитие компетентности и формирование биопленки является адаптацией S. pneumoniae выжить под защитой хозяина.[74] В частности, полиморфно-ядерные лейкоциты хозяина производят окислительный взрыв для защиты от вторгшихся бактерий, и этот ответ может убивать бактерии, повреждая их ДНК. Компетентный S. pneumoniae в биопленке имеют преимущество в выживании, так как они могут более легко принимать трансформирующую ДНК из соседних клеток в биопленке для использования для рекомбинационной репарации окислительных повреждений в их ДНК. Компетентный S. pneumoniae может также секретировать фермент (муреин гидролаза), который разрушает некомпетентные клетки (братоубийство), вызывая высвобождение ДНК в окружающую среду для потенциального использования компетентными клетками.[101]

Противомикробный пептид насекомых цекропин А может разрушать планктонную и сидячую биопленку, образующую уропатогенный E. Coli клетки, отдельно или в сочетании с антибиотиком налидиксовая кислота, синергетически устраняя инфекцию in vivo (у насекомых-хозяев Galleria mellonella ) без нецелевой цитотоксичности. Многоцелевой механизм действия включает в себя проницаемость внешней мембраны с последующим разрушением биопленки, вызванным ингибированием активности эффлюксного насоса и взаимодействием с внеклеточными и внутриклеточными нуклеиновыми кислотами.[102]

Использование и влияние

В медицине

Предполагается, что около двух третей бактериальных инфекций у людей связаны с биопленками.[42][103] Инфекции, связанные с ростом биопленки, обычно сложно искоренить.[104] В основном это связано с тем, что зрелые биопленки антимикробная толерантность, и уклонения от иммунного ответа.[105][34] Биопленки часто образуются на инертных поверхностях имплантированных устройств, таких как катетеры, протезы сердечных клапанов и внутриматочные спирали.[106] Некоторые из наиболее сложных для лечения инфекций связаны с использованием медицинских устройств.[42][107]

Быстро развивающаяся во всем мире промышленность биомедицинских устройств и продуктов, связанных с тканевой инженерией, уже составляет 180 миллиардов долларов в год, но эта отрасль продолжает страдать от микробной колонизации. Независимо от сложности микробные инфекции могут развиваться на всех медицинских устройствах и конструкциях тканевой инженерии.[105] 60-70% внутрибольничные инфекции связаны с имплантацией биомедицинского устройства.[105] Это приводит к 2 миллионам случаев ежегодно в США, что обходится системе здравоохранения более чем в 5 миллиардов долларов дополнительных расходов на здравоохранение.[105]

Уровень устойчивости биопленки к антибиотикам намного выше, чем у небиопленочных бактерий, и может быть в 5000 раз выше.[42] Было показано, что введение небольшого электрического тока в жидкость, окружающую биопленку, вместе с небольшими количествами антибиотика может снизить уровень устойчивости к антибиотикам до уровней небиопленочных бактерий. Это называется биоэлектрический эффект.[42][108] Приложение небольшого Постоянный ток сам по себе может вызвать отделение биопленки от ее поверхности.[42] Исследование показало, что тип используемого тока не влияет на биоэлектрический эффект.[108]

В промышленности

Биопленки можно использовать и в конструктивных целях. Например, многие очистка сточных вод растения включают вторичное лечение стадия, на которой сточные воды проходят через биопленки, выращенные на фильтрах, которые извлекают и переваривают органические соединения. В таких биопленках бактерии в основном отвечают за удаление органических веществ (BOD ), в то время как простейшие и коловратки в основном отвечают за удаление взвешенных частиц (SS), включая патогены и другие микроорганизмы. Медленные песочные фильтры полагаться на развитие биопленки таким же образом, чтобы фильтровать поверхностную воду из озер, родников или речных источников для питьевых целей. То, что мы считаем чистой водой, по сути, является отходом для этих микроорганизмов. Биопленки могут помочь устранить нефть нефть из загрязненных океанов или морских систем. Масло удаляется разлагающий углеводороды деятельность сообществ углеводородокластические бактерии (HCB).[109]Биопленки используются в микробные топливные элементы (MFC) для выработки электроэнергии из различных исходных материалов, включая сложные органические отходы и возобновляемую биомассу.[7][110][111]Биопленки также важны для улучшения растворения металлов в биовыщелачивание промышленность[112][113]

Пищевая промышленность

Биопленки стали проблематичными в некоторых отраслях пищевой промышленности из-за их способности образовываться на заводах и во время производственных процессов.[114] Бактерии могут длительное время выживать в воде, навозе и почве, вызывая образование биопленки на растениях или в технологическом оборудовании.[115] Накопление биопленок может влиять на тепловой поток через поверхность и увеличивать поверхностную коррозию и сопротивление трения жидкостей.[116] Это может привести к потере энергии в системе и общей потере продукции.[116] Наряду с экономическими проблемами образование биопленки на пищевых продуктах представляет собой риск для здоровья потребителей из-за способности сделать пищу более устойчивой к дезинфицирующим средствам.[114] В результате с 1996 по 2010 гг. Центр по контролю и профилактике заболеваний по оценкам, 48 миллионов болезней пищевого происхождения в год.[114] Биопленки связаны примерно с 80% бактериальных инфекций в Соединенных Штатах.[114]

В продуктах микроорганизмы прикрепляются к поверхностям, а биопленки развиваются внутри.[114] В процессе стирки биопленки сопротивляются дезинфекции и позволяют бактериям распространяться по продуктам.[114] Эта проблема также встречается в готовых к употреблению продуктах, потому что продукты проходят ограниченные процедуры очистки перед употреблением.[114] Из-за того, что молочные продукты являются скоропортящимися, а также с ограничениями в процедурах очистки, что приводит к скоплению бактерий, молочные продукты подвержены образованию биопленок и загрязнению.[114][116] Бактерии могут быстрее испортить продукты, а загрязненные продукты представляют опасность для здоровья потребителей. Одним из видов бактерий, которые можно найти в различных отраслях промышленности и которые являются основной причиной болезней пищевого происхождения, является Сальмонелла.[117] Большое количество заражений сальмонеллой можно обнаружить в птицеперерабатывающей промышленности, поскольку около 50% штаммов сальмонеллы могут образовывать биопленки на птицефермах.[114] Сальмонелла увеличивает риск болезней пищевого происхождения, если продукты из птицы не очищаются и не готовятся правильно. Сальмонелла также встречается в индустрии морепродуктов, где биопленки образуются из переносимых морепродуктами патогенов как на самих морепродуктах, так и в воде.[117] Продукты из креветок обычно поражаются сальмонеллой из-за негигиеничных методов обработки и обращения.[117] При приготовлении креветок и других морепродуктов на них может накапливаться бактерия.[117]

Испытываются новые формы процедур очистки, чтобы уменьшить образование биопленки в этих процессах, что приведет к более безопасной и производительной пищевой промышленности. Эти новые формы очистки также оказывают сильное воздействие на окружающую среду, часто выделяя токсичные газы в резервуары подземных вод.[116] В ответ на агрессивные методы, используемые для контроля образования биопленок, существует ряд новых технологий и исследуемых химикатов, которые могут предотвратить распространение или адгезию секретирующих биопленку микробов. Последние предложенные биомолекулы, проявляющие заметную антибиотикопленочную активность, включают ряд метаболитов, таких как бактериальные рамнолипиды [118] и даже растение-[119] и алкалоиды животного происхождения.[120]

В аквакультуре

Дальнейшая информация: Аквакультура
Биопленка из Мертвое море

В моллюски и водоросль аквакультура, биообрастание виды микробов, как правило, блокируют сети и клетки и в конечном итоге вытесняют выращиваемые виды за место и пищу.[121] Бактериальные биопленки запускают процесс колонизации, создавая микросреду, более благоприятную для видов биообрастания. В морской среде биопленки могут снизить гидродинамическую эффективность кораблей и гребных винтов, привести к закупорке трубопроводов и неисправности датчиков, а также увеличить вес устройств, используемых в морской воде.[122] Многочисленные исследования показали, что биопленка может быть резервуаром для потенциально патогенных бактерий в пресноводной аквакультуре.[123][124][125][126] Как упоминалось ранее, биопленки трудно удалить, даже если антибиотики или химические вещества используются в высоких дозах.[127][128] Роль, которую играет биопленка как резервуар бактериальных патогенов рыб, не была подробно изучена, но, безусловно, заслуживает изучения.

Эукариотические биопленки

Смотрите также: Фототрофные биопленки

Наряду с бактериями биопленки часто инициируются и производятся эукариотическими микробами. Биопленки, производимые эукариотами, обычно заняты бактериями и другими эукариотами, однако поверхность культивируется, и ЭПС сначала секретируется эукариотами.[80][81][129] И то и другое грибы и микроводоросли как известно, таким образом образуют биопленки. Биопленки грибкового происхождения являются важными аспектами инфицирования человека и патогенности грибков, поскольку грибковая инфекция более устойчива к противогрибковым препаратам.[130][131]

В окружающей среде биопленки грибов являются областью постоянных исследований. Одно из ключевых направлений исследований - грибковые биопленки на растениях. Например, в почве ассоциированные с растениями грибы, включая микориза было показано, что он разлагает органические вещества, защищает растения от патогенных бактерий.[132]

Биопленки в водной среде часто создаются диатомеи. Точное назначение этих биопленок неизвестно, однако есть свидетельства того, что EPS, производимый диатомовыми водорослями, способствует как холоду, так и стрессу от солености.[82][133] Эти эукариоты взаимодействуют с множеством других организмов в регионе, известном как фикосфера, но важны бактерии, связанные с диатомовыми водорослями, поскольку было показано, что, хотя диатомеи выделяют EPS, они делают это только при взаимодействии с определенными видами бактерий.[134][135]

Устройства для выращивания биопленки

Существует множество устройств для культивирования биопленки, имитирующих природную среду. Хотя важно учитывать, что конкретная экспериментальная платформа для экспериментов с биопленками определяет, какой вид биопленки культивируется и какие данные можно извлечь. Их можно сгруппировать в следующие группы: микротитрационные планшеты, MBEC (формально известный как устройство Калгари), кольцевой тест, Роббинс и модифицированный Роббинс, реакторы с капельным потоком, вращающиеся устройства, проточные камеры и микрофлюидные подходы.[136]

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ Верт М., Дой И, Хелвич К.Х., Хесс М., Ходж П., Кубиса П., Ринаудо М., Шуэ Ф. (2012). «Терминология для биорелированных полимеров и приложений (Рекомендации IUPAC 2012)». Чистая и прикладная химия. 84 (2): 377–410. Дои:10.1351 / PAC-REC-10-12-04.
  2. ^ а б c Лопес Д., Вламакис Х., Кольтер Р. (июль 2010 г.). «Биопленки». Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии. 2 (7): a000398. Дои:10.1101 / cshperspect.a000398. ЧВК  2890205. PMID  20519345.
  3. ^ а б c d е Холл-Стодли Л., Костертон Дж. В., Стодли П. (февраль 2004 г.). «Бактериальные биопленки: от окружающей среды до инфекционных заболеваний». Обзоры природы. Микробиология. 2 (2): 95–108. Дои:10.1038 / nrmicro821. PMID  15040259. S2CID  9107205.
  4. ^ а б Аггарвал С., Стюарт П.С., Хозальский Р.М. (январь 2016 г.). «Когезионная сила биопленок как основа устойчивости биопленок: не слишком ли сконструированы бактериальные биопленки?». Microbiology Insights. 8 (Дополнение 2): 29–32. Дои:10.4137 / MBI.S31444. ЧВК  4718087. PMID  26819559.
  5. ^ а б Уотник П., Колтер Р. (май 2000 г.). «Биопленка, город микробов». Журнал бактериологии. 182 (10): 2675–9. Дои:10.1128 / jb.182.10.2675-2679.2000. ЧВК  101960. PMID  10781532.
  6. ^ "Строительные нормы для бактериальных городов | Quanta Magazine". Журнал Quanta. Получено 2017-07-25.
  7. ^ а б Лир Г., Льюис Г. Д., ред. (2012). Микробные биопленки: текущие исследования и применение. Caister Academic Press. ISBN  978-1-904455-96-7.
  8. ^ а б О'Тул Г.А., Колтер Р. (май 1998 г.). «Инициирование образования биопленки у Pseudomonas fluorescens WCS365 происходит через множественные конвергентные пути передачи сигналов: генетический анализ». Молекулярная микробиология. 28 (3): 449–61. Дои:10.1046 / j.1365-2958.1998.00797.x. PMID  9632250.
  9. ^ О'Тул Г.А., Колтер Р. (октябрь 1998 г.). «Жгутиковые и судорожные движения необходимы для развития биопленки Pseudomonas aeruginosa». Молекулярная микробиология. 30 (2): 295–304. Дои:10.1046 / j.1365-2958.1998.01062.x. PMID  9791175.
  10. ^ Каратан Э, Уотник П. (июнь 2009 г.). «Сигналы, регуляторные сети и материалы, которые создают и разрушают бактериальные биопленки». Обзоры микробиологии и молекулярной биологии. 73 (2): 310–47. Дои:10.1128 / MMBR.00041-08. ЧВК  2698413. PMID  19487730.
  11. ^ Хоффман Л. Р., Д'Аргенио Д. А., Маккосс М. Дж., Чжан З., Джонс Р. А., Миллер С. И. (август 2005 г.). «Аминогликозидные антибиотики вызывают образование бактериальной биопленки». Природа. 436 (7054): 1171–5. Bibcode:2005Натура 436.1171H. Дои:10.1038 / природа03912. PMID  16121184. S2CID  4404961. (основной источник)
  12. ^ An D, Parsek MR (июнь 2007 г.). «Перспектива и опасность транскрипционного профилирования в сообществах биопленок». Текущее мнение в микробиологии. 10 (3): 292–6. Дои:10.1016 / j.mib.2007.05.011. PMID  17573234.
  13. ^ Дело C, Funke B, Tortora G. Микробиология Введение (десятое изд.).
  14. ^ Бриандет Р., Херри Дж., Беллон-Фонтейн М. (август 2001 г.). «Определение компонентов поверхностного натяжения Ван-дер-Ваальса, донора электронов и акцептора электронов статических грамположительных микробных биопленок». Коллоиды Surf B Биоинтерфейсы. 21 (4): 299–310. Дои:10.1016 / S0927-7765 (00) 00213-7. PMID  11397632.
  15. ^ Такахаши Х, Суда Т., Танака Й, Кимура Б. (июнь 2010 г.). «Клеточная гидрофобность Listeria monocytogenes включает начальное прикрепление и образование биопленки на поверхности поливинилхлорида». Lett. Appl. Микробиол. 50 (6): 618–25. Дои:10.1111 / j.1472-765X.2010.02842.x. PMID  20438621. S2CID  24880220.
  16. ^ «7: Архея». Биология LibreTexts. 6 февраля 2018.
  17. ^ Мэдиган М (2019). Брок биология микроорганизмов (Пятнадцатое, Глобальное издание). Пирсон. п. 86. ISBN  9781292235103.
  18. ^ а б c Донлан Р.М. (2002). «Биопленки: микробная жизнь на поверхности». Возникающие инфекционные заболевания. 8 (9): 881–890. Дои:10.3201 / eid0809.020063. ЧВК  2732559. PMID  12194761.
  19. ^ Чофу, Оана; Толкер-Нильсен, Тим (2019). «Толерантность и устойчивость биопленок Pseudomonas aeruginosa к противомикробным агентам - как P. aeruginosa может избежать применения антибиотиков». Границы микробиологии. 10: 913. Дои:10.3389 / fmicb.2019.00913. ISSN  1664-302X. ЧВК  6509751. PMID  31130925.
  20. ^ Сакураги Ю., Колтер Р. (июль 2007 г.). «Кворум-чувствительная регуляция генов матрикса биопленки (Pseudomonas aeruginosa)». Журнал бактериологии. 189 (14): 5383–6. Дои:10.1128 / JB.00137-07. ЧВК  1951888. PMID  17496081.
  21. ^ О'Тул Г., Каплан Х. Б., Колтер Р. (2000). «Биопленкообразование как развитие микробов». Ежегодный обзор микробиологии. 54: 49–79. Дои:10.1146 / annurev.micro.54.1.49. PMID  11018124.
  22. ^ Монро Д. (ноябрь 2007 г.). «Ищем щели в панцире бактериальных биопленок». PLOS Биология. 5 (11): e307. Дои:10.1371 / journal.pbio.0050307. ЧВК  2071939. PMID  18001153.
  23. ^ Каплан Дж. Б., Рагунатх С., Рамасуббу Н., Fine DH (август 2003 г.). «Отделение клеток биопленки Actinobacillus actinomycetemcomitans за счет эндогенной бета-гексозаминидазной активности». Журнал бактериологии. 185 (16): 4693–8. Дои:10.1128 / JB.185.16.4693-4698.2003. ЧВК  166467. PMID  12896987.
  24. ^ Изано Е.А., Амаранте М.А., Хер В.Б., Каплан Дж.Б. (январь 2008 г.). «Дифференциальная роль поверхностного полисахарида поли-N-ацетилглюкозамина и внеклеточной ДНК в биопленках Staphylococcus aureus и Staphylococcus epidermidis». Прикладная и экологическая микробиология. 74 (2): 470–6. Дои:10.1128 / AEM.02073-07. ЧВК  2223269. PMID  18039822.
  25. ^ Каплан Дж. Б., Рагунатх С., Веллиагаундер К., Файн Д.Х., Рамасуббу Н. (июль 2004 г.). «Ферментативное отслоение биопленок Staphylococcus epidermidis». Противомикробные препараты и химиотерапия. 48 (7): 2633–6. Дои:10.1128 / AAC.48.7.2633-2636.2004. ЧВК  434209. PMID  15215120.
  26. ^ Xavier JB, Picioreanu C, Rani SA, van Loosdrecht MC, Stewart PS (декабрь 2005 г.). «Стратегии контроля биопленки, основанные на ферментативном разрушении матрикса внеклеточного полимерного вещества - модельное исследование». Микробиология. 151 (Pt 12): 3817–32. Дои:10.1099 / мик. 0.28165-0. PMID  16339929.
  27. ^ Дэвис Д.Г., Маркес С.Н. (март 2009 г.). «Посланник жирных кислот ответственен за диспергирование микробных биопленок». Журнал бактериологии. 191 (5): 1393–403. Дои:10.1128 / JB.01214-08. ЧВК  2648214. PMID  19074399.
  28. ^ Barraud N, Hassett DJ, Hwang SH, Rice SA, Kjelleberg S, Webb JS (2006). «Участие оксида азота в диспергировании биопленок синегнойной палочки». Журнал бактериологии. 188 (21): 7344–7353. Дои:10.1128 / jb.00779-06. ЧВК  1636254. PMID  17050922.
  29. ^ Барро Н., Стори М. В., Мур З. П., Уэбб Дж. С., Райс С. А., Кьеллеберг С. (2009). «Опосредованное оксидом азота диспергирование в одно- и многовидовых биопленках клинически и промышленно значимых микроорганизмов». Микробная биотехнология. 2 (3): 370–378. Дои:10.1111 / j.1751-7915.2009.00098.x. ЧВК  3815757. PMID  21261931.
  30. ^ «Распространение биопленки при кистозном фиброзе с использованием низких доз оксида азота». Саутгемптонский университет. Получено 20 января 2012.
  31. ^ а б Чуа С.Л., Лю Й., Ям Дж. К., Толкер-Нильсен Т., Кьеллеберг С., Гивсков М., Ян Л. (2014). «Диспергированные клетки представляют собой отдельную стадию перехода от бактериальной биопленки к образу жизни планктона». Nature Communications. 5: 4462. Bibcode:2014 НатКо ... 5.4462C. Дои:10.1038 / ncomms5462. PMID  25042103.
  32. ^ Чуа С.Л., Хултквист Л.Д., Юань М., Рыбтке М., Нильсен Т.Э., Гивсков М., Толкер-Нильсен Т., Ян Л. (август 2015 г.). «Создание и характеристика клеток Pseudomonas aeruginosa, диспергированных в биопленке, in vitro и in vivo с помощью манипуляций c-di-GMP». Нат Проток. 10 (8): 1165–80. Дои:10.1038 / nprot.2015.067. PMID  26158442. S2CID  20235088.
  33. ^ Наделл CD, Ксавье Дж. Б., Фостер К. Р. (январь 2009 г.). «Социобиология биопленок». Обзор микробиологии FEMS. 33 (1): 206–24. Дои:10.1111 / j.1574-6976.2008.00150.x. PMID  19067751.
  34. ^ а б c d Рыбтке М., Хультквист Л.Д., Гивсков М., Толкер-Нильсен Т. (ноябрь 2015 г.). «Инфекции биопленок Pseudomonas aeruginosa: структура сообщества, устойчивость к противомикробным препаратам и иммунный ответ». Журнал молекулярной биологии. 427 (23): 3628–45. Дои:10.1016 / j.jmb.2015.08.016. PMID  26319792.
  35. ^ Данезе П.Н., Пратт Л.А., Кольтер Р. (июнь 2000 г.). «Производство экзополисахаридов необходимо для развития архитектуры биопленок Escherichia coli K-12». Журнал бактериологии. 182 (12): 3593–6. Дои:10.1128 / jb.182.12.3593-3596.2000. ЧВК  101973. PMID  10852895.
  36. ^ Бранда СС, Ф. Чу, Кернс Д. Б., Лосик Р., Колтер Р. (февраль 2006 г.). «Главный белковый компонент матрицы биопленки Bacillus subtilis». Молекулярная микробиология. 59 (4): 1229–38. Дои:10.1111 / j.1365-2958.2005.05020.x. PMID  16430696.
  37. ^ Choong FX, Bäck M, Fahlén S, Johansson LB, Melican K, Rhen M и др. (23 ноября 2016 г.). «Биопленки сальмонелл с использованием люминесцентных олиготиофенов». Биопленки и микробиомы NPJ. 2: 16024. Дои:10.1038 / npjbiofilms.2016.24. ЧВК  5515270. PMID  28721253.
  38. ^ Flemming HC, Wingender J, Szewzyk U, Steinberg P, Rice SA, Kjelleberg S (август 2016 г.). «Биопленки: зарождающаяся форма бактериальной жизни». Обзоры природы. Микробиология. 14 (9): 563–75. Дои:10.1038 / nrmicro.2016.94. PMID  27510863. S2CID  4384131.
  39. ^ Стодли П., Дебир Д., Левандовски З. (август 1994 г.). «Течение жидкости в биопленочных системах». Прикладная и экологическая микробиология. 60 (8): 2711–6. Дои:10.1128 / aem.60.8.2711-2716.1994. ЧВК  201713. PMID  16349345.
  40. ^ Вламакис Х., Агилар С., Лосик Р., Колтер Р. (апрель 2008 г.). «Контроль судьбы клеток путем формирования архитектурно сложного бактериального сообщества». Гены и развитие. 22 (7): 945–53. Дои:10.1101 / gad.1645008. ЧВК  2279205. PMID  18381896.
  41. ^ Стюарт PS, Костертон JW (июль 2001 г.). «Устойчивость бактерий к антибиотикам в биопленках». Ланцет. 358 (9276): 135–8. Дои:10.1016 / S0140-6736 (01) 05321-1. PMID  11463434. S2CID  46125592.
  42. ^ а б c d е ж Дель Посо Дж. Л., Роуз М. С., Патель Р. (сентябрь 2008 г.). «Биоэлектрический эффект и бактериальные биопленки. Систематический обзор». Международный журнал искусственных органов. 31 (9): 786–95. Дои:10.1177/039139880803100906. ЧВК  3910516. PMID  18924090.
  43. ^ а б Chimileski S, Франклин MJ, Папке RT (август 2014 г.). «Биопленки, образованные археоном Haloferax volcanii, демонстрируют клеточную дифференциацию и социальную подвижность, а также способствуют горизонтальному переносу генов». BMC Биология. 12: 65. Дои:10.1186 / s12915-014-0065-5. ЧВК  4180959. PMID  25124934.
  44. ^ Молин С., Толкер-Нильсен Т. (июнь 2003 г.). «Перенос генов происходит с повышенной эффективностью в биопленках и вызывает усиленную стабилизацию структуры биопленок». Текущее мнение в области биотехнологии. 14 (3): 255–61. Дои:10.1016 / S0958-1669 (03) 00036-3. PMID  12849777.
  45. ^ Якубович Н.С., Шилдс Р.К., Раджараджан Н., Берджесс Дж. Г. (декабрь 2013 г.). «Жизнь после смерти: критическая роль внеклеточной ДНК в микробных биопленках». Письма по прикладной микробиологии. 57 (6): 467–75. Дои:10.1111 / lam.12134. PMID  23848166. S2CID  206168952.
  46. ^ Сперинг А.Л., Льюис К. (декабрь 2001 г.). «Биопленки и планктонные клетки Pseudomonas aeruginosa обладают аналогичной устойчивостью к уничтожению антимикробными препаратами». Журнал бактериологии. 183 (23): 6746–51. Дои:10.1128 / JB.183.23.6746-6751.2001. ЧВК  95513. PMID  11698361.
  47. ^ «Введение в биопленки: желательные и нежелательные воздействия биопленки». Архивировано из оригинал на 22 июня 2008 г. (основной источник)
  48. ^ Andersen PC, Brodbeck BV, Oden S, Shriner A, Leite B (сентябрь 2007 г.). «Влияние химического состава ксилемной жидкости на рост планктона, образование биопленок и агрегацию Xylella fastidiosa». Письма о микробиологии FEMS. 274 (2): 210–7. Дои:10.1111 / j.1574-6968.2007.00827.x. PMID  17610515.
  49. ^ «Биологические процессы очистки сточных вод; вторичная очистка». Стаффордширский университет. Архивировано из оригинал на 2011-04-18. Получено 13 декабря 2019.
  50. ^ Центр доступных технологий водоснабжения и санитарии, Руководство по фильтру биопесков: проектирование, строительство и установка, июль 2007 г.
  51. ^ Национальная информационная служба по питьевой воде (США), Моргантаун, Западная Вирджиния. «Медленная фильтрация песка». Tech Brief Fourteen, июнь 2000 г.
  52. ^ Kloepper JW (1988). «Ризобактерии, способствующие росту растений на рапсе (рапсе)». Болезнь растений. 72 (1): 42. Дои:10.1094 / pd-72-0042. ISSN  0191-2917.
  53. ^ а б c d Нихоримбере В., Кавой Х., Сейер А., Брунель А., Тонарт П., Онгена М. (январь 2012 г.). «Влияние факторов ризосферы на сигнатуру циклических липопептидов из полезного штамма растения Bacillus amyloliquefaciens S499». FEMS Microbiology Ecology. 79 (1): 176–91. Дои:10.1111 / j.1574-6941.2011.01208.x. PMID  22029651.
  54. ^ Чоудхари Д.К., Джохри Б.Н. (сентябрь 2009 г.). «Взаимодействие Bacillus spp. И растений - с особым упором на индуцированную системную резистентность (ISR)». Микробиологические исследования. 164 (5): 493–513. Дои:10.1016 / j.micres.2008.08.007. PMID  18845426.
  55. ^ а б van Loon LC (05.06.2007). «Реакция растений на ризобактерии, способствующие росту растений». Европейский журнал патологии растений. 119 (3): 243–254. Дои:10.1007 / s10658-007-9165-1. ISSN  0929-1873.
  56. ^ а б c d е Van Wees SC, Van der Ent S, Pieterse CM (август 2008 г.). «Иммунные реакции растений, вызванные полезными микробами». Текущее мнение в области биологии растений. 11 (4): 443–8. Дои:10.1016 / j.pbi.2008.05.005. HDL:1874/30010. PMID  18585955.
  57. ^ Ольгин Г., Башан Ю. (декабрь 1996 г.). «Азот-фиксация с помощью Azospirillum brasilense Cd стимулируется при совместном культивировании с ризосферными бактериями мангрового дерева (Staphylococcus sp.)». Биология и биохимия почвы. 28 (12): 1651–1660. Дои:10.1016 / с0038-0717 (96) 00251-9. ISSN  0038-0717.
  58. ^ Бабалола О.О. (ноябрь 2010 г.). «Полезные бактерии сельскохозяйственного значения». Письма о биотехнологии. 32 (11): 1559–70. Дои:10.1007 / s10529-010-0347-0. PMID  20635120. S2CID  13518392.
  59. ^ Баккер П.А., Питерс К.М., Ван Лун LC (февраль 2007 г.). «Индуцированная системная резистентность флуоресцентных Pseudomonas spp». Фитопатология. 97 (2): 239–43. Дои:10.1094 / фито-97-2-0239. PMID  18944381.
  60. ^ Бент Э (2006), «Индуцированная системная резистентность, опосредованная ризобактериями, способствующими росту растений (PGPR) и грибами (PGPF)», Мультигенная и индуцированная системная устойчивость растений, Springer, США, стр. 225–258, Дои:10.1007/0-387-23266-4_10, ISBN  9780387232652
  61. ^ Линч Дж. М., Бримкомб М. Дж., Де Лей Ф. (2001-08-21), "Ризосфера", eLS, John Wiley & Sons, Ltd, Дои:10.1038 / npg.els.0000403, ISBN  0470016175
  62. ^ Рэндал Боллинджер Р., Барбас А.С., Буш Е.Л., Лин С.С., Паркер В. (декабрь 2007 г.). «Биопленки в толстой кишке предполагают очевидную функцию червеобразного отростка человека» (PDF). Журнал теоретической биологии. 249 (4): 826–31. Дои:10.1016 / j.jtbi.2007.08.032. PMID  17936308.
  63. ^ Characklis WG, Nevimons MJ, Picologlou BF (1981). «Влияние биопленок обрастания на теплообмен». Теплообменная техника. 3 (1): 23–37. Bibcode:1981HTrEn ... 3 ... 23C. Дои:10.1080/01457638108939572.
  64. ^ Швермер К.Ю., Лавик Г., Абед Р.М. и др. (Май 2008 г.). «Влияние нитратов на структуру и функцию сообществ бактериальной биопленки в трубопроводах, используемых для закачки морской воды в нефтяные месторождения». Прикладная и экологическая микробиология. 74 (9): 2841–51. Дои:10.1128 / AEM.02027-07. ЧВК  2394879. PMID  18344353.
  65. ^ Чандки Р., Бантия П., Бантия Р. (апрель 2011 г.). «Биопленки: микробный дом». Журнал Индийского общества пародонтологии. 15 (2): 111–4. Дои:10.4103 / 0972-124X.84377. ЧВК  3183659. PMID  21976832.
  66. ^ Августин М., Чифирюк CB, Лазэр В., Стэнеску Р., Бурлибаца М., Испас, округ Колумбия (декабрь 2010 г.). «Микробные биопленки в стоматологической медицине применительно к импланто-протезной реабилитации». Revista de Chirurgie Oro-maxilo-facială și Implantologie (на румынском языке). 1 (1): 9–13. ISSN  2069-3850. 8. Получено 2012-06-03.[постоянная мертвая ссылка ](на веб-странице есть кнопка перевода)
  67. ^ Маркиз Р.Э. (сентябрь 1995 г.). «Кислородный обмен, окислительный стресс и кислотно-щелочная физиология биопленок зубного налета». Журнал промышленной микробиологии. 15 (3): 198–207. Дои:10.1007 / bf01569826. PMID  8519478. S2CID  19959528.
  68. ^ а б c Лемос Дж. А., Абранчес Дж., Бёрн Р. А. (январь 2005 г.). «Ответы кариесогенных стрептококков на стрессы окружающей среды» (PDF). Актуальные проблемы молекулярной биологии. 7 (1): 95–107. PMID  15580782.
  69. ^ Тамм Ч., Ходес МЭ, Чаргафф Э. (март 1952 г.). «Образование апуриновой кислоты из дезоксирибонуклеиновой кислоты тимуса теленка». Журнал биологической химии. 195 (1): 49–63. PMID  14938354.
  70. ^ Freese EB (апрель 1961 г.). «Переходы и трансверсии, вызванные депуринирующими агентами». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 47 (4): 540–5. Bibcode:1961ПНАС ... 47..540Б. Дои:10.1073 / pnas.47.4.540. ЧВК  221484. PMID  13701660.
  71. ^ Фейерсков О. (2015). Патология кариеса зубов. В: Кариес зубов: заболевание и его клиническое лечение.. Оксфорд (Великобритания): Уайли Блэквелл. С. 7–9. ISBN  978-1405138895.
  72. ^ а б Ли Й.Х., Лау П.С., Ли Дж.Х., Эллен Р.П., Цвиткович Д.Г. (февраль 2001 г.). «Естественная генетическая трансформация Streptococcus mutans, растущего в биопленках». J. Bacteriol. 183 (3): 897–908. Дои:10.1128 / JB.183.3.897-908.2001. ЧВК  94956. PMID  11208787.
  73. ^ Senadheera D, Cvitkovitch DG (2008). «Зондирование кворума и формирование биопленки Streptococcus mutans». Передача бактериального сигнала: сети и мишени для лекарств. Adv. Exp. Med. Биол. Успехи экспериментальной медицины и биологии. 631. стр.178–88. Дои:10.1007/978-0-387-78885-2_12. ISBN  978-0-387-78884-5. PMID  18792689.
  74. ^ а б Мичод Р.Э., Бернштейн Х., Недельку А.М. (май 2008 г.). «Адаптивное значение секса у микробных патогенов». Заразить. Genet. Evol. 8 (3): 267–85. Дои:10.1016 / j.meegid.2008.01.002. PMID  18295550.http://www.hummingbirds.arizona.edu/Faculty/Michod/Downloads/IGE%20review%20sex.pdf
  75. ^ Аткинсон С., Голдстоун Р.Дж., Джошуа Г.В., Чанг С.Й., Патрик Х.Л., Камара М. и др. (Январь 2011 г.). «Развитие биопленки на Caenorhabditis elegans с помощью Yersinia облегчается зависимым от кворума подавлением секреции типа III». Патогены PLOS. 7 (1): e1001250. Дои:10.1371 / journal.ppat.1001250. ЧВК  3017118. PMID  21253572.
  76. ^ Чан С.Ю., Лю С.Ю., Сенг З., Чуа С.Л. (сентябрь 2020 г.). «Матрикс биопленки нарушает подвижность нематод и хищное поведение». Журнал ISME: 1–10. Дои:10.1038 / s41396-020-00779-9. PMID  32958848.
  77. ^ Аби Т., Ковач А.Т., Койперс О.П., ван дер Вин С. (апрель 2011 г.). «Образование и распространение биопленок у грамположительных бактерий» (PDF). Текущее мнение в области биотехнологии. 22 (2): 172–9. Дои:10.1016 / j.copbio.2010.10.016. PMID  21109420.
  78. ^ Росси Ф., Де Филиппис Р. (апрель 2015 г.). «Роль цианобактериальных экзополисахаридов в фототрофных биопленках и в сложных микробных матах». Жизнь. 5 (2): 1218–38. Дои:10.3390 / life5021218. ЧВК  4500136. PMID  25837843.
  79. ^ а б Данхорн Т., Фукуа С. (2007). «Формирование биопленки бактериями, ассоциированными с растениями». Ежегодный обзор микробиологии. 61: 401–22. Дои:10.1146 / annurev.micro.61.080706.093316. PMID  17506679.
  80. ^ а б Жубер Л.М., Вольфардт Г.М., Бота А. (август 2006 г.). «Микробные экзополимеры связывают хищника и жертву в модельной системе биопленок дрожжей». Microb. Ecol. 52 (2): 187–97. Дои:10.1007 / s00248-006-9063-7. PMID  16897306. S2CID  20431229.
  81. ^ а б Ван Колен С., Андервуд Г.К., Серодио Дж., Патерсон Д.М. (2014). «Экология приливных микробных биопленок: механизмы, закономерности и потребности будущих исследований». Журнал морских исследований. 92: 2–5. Bibcode:2014JSR .... 92 .... 2В. Дои:10.1016 / j.seares.2014.07.003.
  82. ^ а б Аслам С.Н., Крессвелл-Мейнард Т., Томас Д.Н., Андервуд Г.Дж. (декабрь 2012 г.). «Производство и характеристика внутри- и внеклеточных углеводов и полимерных веществ (EPS) трех видов диатомовых водорослей морского льда, и доказательства криозащитной роли EPS». Дж. Фикол. 48 (6): 1494–509. Дои:10.1111 / jpy.12004. PMID  27009999. S2CID  9226690.
  83. ^ «Исследование микробных биопленок (PA-03-047)». NIH, Национальный институт сердца, легких и крови. 2002-12-20.
  84. ^ Роджерс А. (2008). Молекулярная микробиология полости рта. Caister Academic Press. С. 88–91. ISBN  978-1-904455-24-0.
  85. ^ Имамура Ю., Чандра Дж., Мукерджи П.К., Латтиф А.А., Щотка-Флинн Л.Б., Перлман Э. и др. (Январь 2008 г.). «Биопленки Fusarium и Candida albicans на мягких контактных линзах: разработка модели, влияние типа линз и восприимчивость к растворам для ухода за линзами». Противомикробные препараты и химиотерапия. 52 (1): 171–82. Дои:10.1128 / AAC.00387-07. ЧВК  2223913. PMID  17999966.
  86. ^ Capoor MN, Ruzicka F, Schmitz JE, James GA, Machackova T, Jancalek R, et al. (2017-04-03). «Биопленка Propionibacterium acnes присутствует в межпозвонковых дисках пациентов, перенесших микродискэктомию». PLOS ONE. 12 (4): e0174518. Bibcode:2017PLoSO..1274518C. Дои:10.1371 / journal.pone.0174518. ЧВК  5378350. PMID  28369127.
  87. ^ Льюис К. (апрель 2001 г.). «Загадка устойчивости биопленок». Противомикробные препараты и химиотерапия. 45 (4): 999–1007. Дои:10.1128 / AAC.45.4.999-1007.2001. ЧВК  90417. PMID  11257008.
  88. ^ Парсек М.Р., Сингх П.К. (2003). «Бактериальные биопленки: новая связь с патогенезом болезней». Ежегодный обзор микробиологии. 57: 677–701. Дои:10.1146 / annurev.micro.57.030502.090720. PMID  14527295.
  89. ^ а б Агарвал, Аакаш (2020). «Высокая распространенность биопленок на имплантатах, извлеченных из случаев асептического псевдоартроза». Хирургия позвоночника и сопутствующие исследования.
  90. ^ niamhcurran (2020-11-20). «Новое исследование, первое, в котором визуально фиксируется архитектура биопленок в имплантатах, извлеченных от живых пациентов». Spinal News International. Получено 2020-11-24.
  91. ^ Дэвис СК, Рикотти С., Каззанига А., Валлийский Е., Иглштейн WH, Мертц П.М. (2008). «Микроскопические и физиологические доказательства колонизации раны, связанной с биопленкой, in vivo». Ремонт и регенерация ран. 16 (1): 23–9. Дои:10.1111 / j.1524-475X.2007.00303.x. PMID  18211576.
  92. ^ Вяс К.С., Вонг Л.К. (январь 2016 г.). «Обнаружение биопленки в ранах как ранний индикатор риска тканевой инфекции и хроничности раны». Анналы пластической хирургии. 76 (1): 127–31. Дои:10.1097 / SAP.0000000000000440. PMID  25774966. S2CID  42078581.
  93. ^ Санклемент Дж., Вебстер П., Томас Дж., Рамадан Н. (2005). «Бактериальные биопленки в хирургических препаратах больных хроническим риносинуситом». Ларингоскоп. 115 (4): 578–82. Дои:10.1097 / 01.mlg.0000161346.30752.18. PMID  15805862. S2CID  25830188.
  94. ^ Сандерсон А.Р., Лейд Дж. Г., Хансакер Д. (июль 2006 г.). «Бактериальные биопленки на слизистой оболочке носовых пазух людей с хроническим риносинуситом». Ларингоскоп. 116 (7): 1121–6. Дои:10.1097 / 01.mlg.0000221954.05467.54. PMID  16826045. S2CID  24785016.
  95. ^ Leevy WM, Gammon ST, Jiang H и др. (Декабрь 2006 г.). «Оптическое изображение бактериальной инфекции у живых мышей с использованием флуоресцентного молекулярного зонда в ближнем инфракрасном диапазоне». Журнал Американского химического общества. 128 (51): 16476–7. Дои:10.1021 / ja0665592. ЧВК  2531239. PMID  17177377.
  96. ^ Каплан Дж. Б., Изано Е. А., Гопал П. и др. (2012). «Низкие уровни β-лактамных антибиотиков вызывают высвобождение внеклеточной ДНК и образование биопленок в Золотистый стафилококк". мБио. 3 (4): e00198–12. Дои:10,1128 / mBio.00198-12. ЧВК  3419523. PMID  22851659.
  97. ^ [1] Ибрагим, Ахмед (2015): Трагедия общества и дилемма заключенного могут улучшить наше понимание теории жизни и предоставить нам передовые терапевтические пути. фигшер.
  98. ^ Чофу О., Толкер-Нильсен Т., Йенсен По, Ван Х., Хойби Н. (май 2015 г.). «Устойчивость к противомикробным препаратам, инфекции дыхательных путей и роль биопленок в легочных инфекциях у пациентов с муковисцидозом». Расширенные обзоры доставки лекарств. 85: 7–23. Дои:10.1016 / j.addr.2014.11.017. PMID  25477303.
  99. ^ Whitchurch CB, Tolker-Nielsen T, Ragas PC, Mattick JS (февраль 2002 г.). «Внеклеточная ДНК, необходимая для образования бактериальной биопленки». Наука. 295 (5559): 1487. Дои:10.1126 / science.295.5559.1487. PMID  11859186.
  100. ^ Oggioni MR, Trappetti C, Kadioglu A, Cassone M, Iannelli F, Ricci S и др. (Сентябрь 2006 г.). «Переход от планктонной к сидячей жизни: главное событие в патогенезе пневмококков». Молекулярная микробиология. 61 (5): 1196–210. Дои:10.1111 / j.1365-2958.2006.05310.x. ЧВК  1618759. PMID  16925554.
  101. ^ Вэй Х., Ховарштейн Л.С. (август 2012 г.). «Братоубийство необходимо для эффективного переноса генов между пневмококками в биопленках». Appl. Environ. Микробиол. 78 (16): 5897–905. Дои:10.1128 / AEM.01343-12. ЧВК  3406168. PMID  22706053.
  102. ^ Кальси М., Тонк М., Хардт М., Добриндт Ю., Здибицка-Барабас А., Цитринска М., Вилчинскас А., Мукерджи К. (2020). «Противомикробный пептид насекомого цекропин А разрушает уропатогенные биопленки Escherichia coli». Биопленки и микробиомы NPJ. 6 (1): 6. Дои:10.1038 / s41522-020-0116-3. ЧВК  7016129. PMID  32051417.
  103. ^ Лазарь V (декабрь 2011 г.). «Чувство кворума в биопленках - как разрушить цитадели бактерий или их сплоченность / силу?». Анаэроб. 17 (6): 280–5. Дои:10.1016 / j.anaerobe.2011.03.023. PMID  21497662.
  104. ^ Биопленочные инфекции. Бьярнсхольт, Томас. Нью-Йорк: Спрингер. 2011 г. ISBN  9781441960832. OCLC  682907381.CS1 maint: другие (ссылка на сайт)
  105. ^ а б c d Брайерс Дж. Д. (2008). «Медицинские биопленки». Биотехнологии и биоинженерия. 100 (1): 1–18. Дои:10.1002 / бит. 21838. ЧВК  2706312. PMID  18366134.
  106. ^ Аулер М.Э., Моррейра Д., Родригес Ф.Ф., Абр Ао М.С., Маргаридо П.Ф., Мацумото Ф.Е. и др. (Февраль 2010 г.). «Формирование биопленок на внутриматочных спиралях у пациентов с рецидивирующим кандидозным вульвовагиналом». Медицинская микология. 48 (1): 211–6. Дои:10.3109/13693780902856626. PMID  20055746.
  107. ^ niamhcurran (2020-11-20). «Новое исследование, первое, в котором визуально фиксируется архитектура биопленок в имплантатах, извлеченных от живых пациентов». Spinal News International. Получено 2020-11-24.
  108. ^ а б Ким Ю.В., Субраманиан С., Герасопулос К., Бен-Йоав Х., Ву Х.С., Куан Д. и др. (2015). «Влияние электрической энергии на эффективность обработки биопленкой с использованием биоэлектрического эффекта». Биопленки и микробиомы NPJ. 1: 15016. Дои:10.1038 / npjbiofilms.2015.16. ЧВК  5515217. PMID  28721233.
  109. ^ Мартинс душ Сантуш В.А., Якимов М.М., Тиммис К.Н., Голышин П.Н. (2008). «Геномное понимание биодеградации нефти в морских системах». В Díaz E (ред.). Микробная биодеградация: геномика и молекулярная биология. Horizon Scientific Press. стр.1971. ISBN  978-1-904455-17-2.
  110. ^ Чуа С.Л., Ван В.Б., Цай З., Сивакумар К., Кьеллеберг С., Цао Б., Лу С.К., Ян Л. (2014). «Стабильный синергетический микробный консорциум для одновременного удаления азокрасителя и выработки биоэлектричества». Биоресурсные технологии. 155: 71–76. Дои:10.1016 / j.biortech.2013.12.078. PMID  24434696.
  111. ^ Чуа С.Л., Ван В.Б., Цао Б., Лу С.К., Ян Л. (2013). «Стабильный синергетический микробный консорциум для одновременного удаления азокрасителя и выработки биоэлектричества». PLOS ONE. 8 (5): e63129. Bibcode:2013PLoSO ... 863129W. Дои:10.1371 / journal.pone.0063129. ЧВК  3659106. PMID  23700414.
  112. ^ Чжан Р.Ю., Белленберг С., Санд В., Ной Т.Р., Вера М. (2016). Образ жизни биопленок ацидофильных металл-окисляющих серу микроорганизмов. В кн .: Биотехнология экстремофилов: достижения и проблемы. Рампелотто Пабуло Х (ред.). Издательство Springer International, Чам, Швейцария. С. 177-213.
  113. ^ Вера М., Шипперс А., Санд В. (сентябрь 2013 г.). «Прогресс в биовыщелачивании: основы и механизмы бактериального окисления сульфидов металлов - часть А». Appl. Microbiol. Биотехнология. 97 (17): 7529–41. Дои:10.1007 / s00253-013-4954-2. PMID  23720034. S2CID  17677624.
  114. ^ а б c d е ж г час я Срей С. "Образование биопленки в пищевой промышленности: проблема безопасности пищевых продуктов". Цитировать журнал требует | журнал = (Помогите)
  115. ^ Т. Тарвер, «Биопленки: угроза безопасности пищевых продуктов - IFT.org», Ift.org, 2016.
  116. ^ а б c d Кумар С. «Значение микробных биопленок в пищевой промышленности: обзор». Цитировать журнал требует | журнал = (Помогите)
  117. ^ а б c d Мизан Ф (2015). «Микробные биопленки в морепродуктах: проблема пищевой гигиены». Пищевая микробиология. 49: 41–55. Дои:10.1016 / j.fm.2015.01.009. PMID  25846914.
  118. ^ Де Араухо Л.В., Абреу Ф., Линс У., Санта-Анна Л.М., Ничке М., Фрейре Д.М. (январь 2011 г.). «Рамнолипид и сурфактин ингибируют адгезию Listeria monocytogenes». Food Research International. 44 (1): 481–488. Дои:10.1016 / j.foodres.2010.09.002.
  119. ^ Ван Х, Яо Х, Чжу З., Тан Т., Дай К., Садовская И. и др. (Июль 2009 г.). «Влияние берберина на образование биопленок Staphylococcus epidermidis». Международный журнал противомикробных агентов. 34 (1): 60–6. Дои:10.1016 / j.ijantimicag.2008.10.033. PMID  19157797.
  120. ^ Карвалью Д.Б., Фокс Е.Г., Сантос Д.Г., Соуза Дж.С., Фрейре Д.М., Ногейра ФК и др. (Июль 2019). "Алкалоиды яда огненных муравьев ингибируют образование биопленок". Токсины. 11 (7): 420. Дои:10.3390 / токсины11070420. ЧВК  6669452. PMID  31323790.
  121. ^ Брейтуэйт Р., Макэвой Л. (2004). Морское биообрастание на рыбных фермах и его восстановление. Достижения в морской биологии. 47. С. 215–252. Дои:10.1016 / S0065-2881 (04) 47003-5. ISBN  9780120261482. PMID  15596168.
  122. ^ Qian PY, Lau SC, Dahms HU, Добрецов С., Хардер Т. (2007). «Морские биопленки как медиаторы колонизации морскими макроорганизмами: последствия для защиты от обрастания и аквакультуры». Mar. Biotechnol. 9 (4): 399–410. Дои:10.1007 / s10126-007-9001-9. PMID  17497196. S2CID  7614961.
  123. ^ Кай В., Де Ла Фуэнте Л., Ариас ЧР (сентябрь 2013 г.). «Формирование биопленок патогеном рыб Flavobacterium columnare: развитие и параметры, влияющие на прикрепление к поверхности». Appl. Environ. Микробиол. 79 (18): 5633–42. Дои:10.1128 / AEM.01192-13. ЧВК  3754160. PMID  23851087.
  124. ^ Король Р.К., Флик-младший Г.Дж., Пирсон Д., Смит С.А., Бордман Г.Д., Коул-младший К.В. (2004). «Идентификация бактериальных патогенов в биопленках рециркуляционных систем аквакультуры». Журнал технологий водных продуктов питания. 13: 125–133. Дои:10.1300 / j030v13n01_11. S2CID  83791439.
  125. ^ Bourne DG, Høj L, Webster NS, Swan J, Hall MR (2006). «Развитие биопленки в резервуаре для выращивания личинок тропического каменного омара, Panulirus ornatus». Аквакультура. 260 (1–4): 27–38. Дои:10.1016 / j.aquaculture.2006.06.023.
  126. ^ Wietz M, Hall MR, Høj L (2009). «Влияние озонирования морской воды на развитие биопленки в аквариумах». Систематическая и прикладная микробиология. 32 (4): 266–277. Дои:10.1016 / j.syapm.2009.04.001. PMID  19446976.
  127. ^ Карунасагар I, Пай Р., Малати Г. (1994). «Массовая гибель личинок Penaeus monodon из-за устойчивой к антибиотикам инфекции Vibrio harveyi». Аквакультура. 128 (3–4): 203–209. Дои:10.1016/0044-8486(94)90309-3.
  128. ^ Лоуренс JR, Корбер DR, Hoyle BD, Costerton JW, Caldwell DE (октябрь 1991). «Оптическое сечение микробных биопленок». J. Bacteriol. 173 (20): 6558–67. Дои:10.1128 / jb.173.20.6558-6567.1991. ЧВК  208993. PMID  1917879.
  129. ^ Кукси К., Вигглсворт-Кукси Б. (1995). «Адгезия бактерий и диатомовых водорослей к поверхности в море: обзор». Экология водных микробов. 9 (1): 87–96. Дои:10.3354 / ame009087.
  130. ^ Фаннинг С., Митчелл А.П. (2012). «Грибковые биопленки». PLOS Pathog. 8 (4): e1002585. Дои:10.1371 / journal.ppat.1002585. ЧВК  3320593. PMID  22496639.
  131. ^ Чандра Дж., Кун Д.М., Мукерджи П.К., Хойер Л.Л., Маккормик Т., Ганноум Массачусетс (сентябрь 2001 г.). «Формирование биопленок грибковым патогеном Candida albicans: развитие, архитектура и лекарственная устойчивость». J. Bacteriol. 183 (18): 5385–94. Дои:10.1128 / jb.183.18.5385-5394.2001. ЧВК  95423. PMID  11514524.
  132. ^ Burmølle M, Kjøller A, Sørenses S (2012). Лир Г., Гэвин Л., Льюис Г. (ред.). Микробные биопленки: текущие исследования и применение. Horizon Scientific Press. С. 61–71. ISBN  978-1904455967.
  133. ^ Стил DJ, Франклин DJ, Андервуд GJ (сентябрь 2014 г.). «Защита клеток от солевого стресса внеклеточными полимерными веществами в биопленках диатомовых водорослей». Биообрастание. 30 (8): 987–98. Дои:10.1080/08927014.2014.960859. ЧВК  4706044. PMID  25268215.
  134. ^ Windler M, Leinweber K, Bartulos CR, Philipp B, Kroth PG (апрель 2015 г.). «Биопленка и образование капсул диатомовой водоросли Achnanthidium minutissimum поражены бактериями». Дж. Фикол. 51 (2): 343–55. Дои:10.1111 / иен.12280. PMID  26986529. S2CID  1446573.
  135. ^ Бухманн М., Крот П.Г., Шлехек Д. (февраль 2012 г.). «Фотоавтотрофно-гетеротрофные сообщества биопленок: лабораторный инкубатор, предназначенный для выращивания аксенических диатомовых водорослей и бактерий в определенных биопленках смешанного вида». Environ Microbiol Rep. 4 (1): 133–40. Дои:10.1111 / j.1758-2229.2011.00315.x. PMID  23757240.
  136. ^ Азередо, Джоана; Азеведо, Нуно Ф .; Бриандет, Ромен; Cerca, Nuno; Coenye, Том; Коста, Ана Рита; Десво, Микаэль; Бонавентура, Джованни Ди; Эбро, Мишель; Яглич, Зоран; Качаниова, Мирослава (04.05.2017). «Критический обзор методов биопленки». Критические обзоры в микробиологии. 43 (3): 313–351. Дои:10.1080 / 1040841X.2016.1208146. ISSN  1040-841X. PMID  27868469. S2CID  3991858.

дальнейшее чтение

внешние ссылки