Пептидаза 1 (клещ) - Википедия - Peptidase 1 (mite)

Пептидаза 1 (клещ)
Der P-1-3F5V.png
Кристаллическая структура аллергена Der p 1[1] из записи pdb 3Ф5В​
Идентификаторы
Номер ЕС3.4.22.65
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum

Пептидаза 1 (клещ) (EC 3.4.22.65 ), также известный как эндопептидаза 1 (клещ), является фермент найдено в различных разновидность из клещи.[2][3] Этот фермент проявляет цистеиновая протеаза деятельность с широким эндопептидаза специфичность.[4]

Различные формы пептидазы 1, относящиеся к отдельным видам клещей, включают клещей группы 1. аллергены.[5] Следуя правилам наименования аллергенов, эти варианты пептидазы 1 включают: Der p 1 европейского клещ домашней пыли Dermatophagoides pteronyssinus;[6] Der f 1 американского клеща домашней пыли Dermatophagoides farinae;[1] Евро м 1 клеща домашней пыли Мейна Euroglyphus maynei;[7] и Псо о 1 клеща парши овец Psoroptes ovis.[8] Аллергены клещей группы 1, особенно Der p 1 и Der f 1, являются основными источниками клещей домашней пыли (HDM). аллергия в умеренный климат.[6][9][10]

История

Первым аллергеном, который был очищен и охарактеризован, был Der p 1, в исследовании 1980 г., проведенном Мартином Д. Чепменом и Томас Платтс-Миллс.[10][11] К концу десятилетия возникло подозрение, что Der p 1 представляет собой цистеиновую протеазу, когда его структура показала сходство со структурой актинидин и папаин.[12] В середине 1990-х Хьюитт и другие., Шакиб и другие., и король и другие. предлагаемые методы продвижения Der p 1 аллергические реакции через его протеаза виды деятельности.[12]

В 2002 году Pso o 1 был идентифицирован и охарактеризован Ли. и другие., который определил ее аминокислота последовательность и обнаружил, что он гомологичен другим аллергенам клещей группы 1.[10]

В 2009 году Der f 1 был первым обнаруженным экземпляром природного аллергена в виде мономер.[1][13]

Структура

Пептидаза 1 представляет собой цистеиновую протеазу, принадлежащую к C1 белковая семья, со структурой, аналогичной папаину.[4][13][14][15][16] Первоначально пептидаза 1 синтезируется как неактивная зимоген, который активируется ферментативным расщеплением.[10][12][15]

Структурно ферменты пептидазы 1 почти идентичны; например, двухдоменная структура и около 81% идентичность последовательности сохраняются между Der p 1 и Der f 1.[1][12][14] Благодаря консервативным структурам, один аллерген может быть использован в качестве модели при разработке лекарств, предназначенных для нацеливания на аллергены клещей группы 1, причем Der p 1 обычно считается архетипом.[14][17] Специфика и перекрестная реактивность между множественными аллергенами группы 1, как считается, происходит из-за различий и гомологий в структуре, особенно в отношении положения эпитопы.[1][18]

Der p 1

Пептидаза 1
Идентификаторы
ОрганизмDermatophagoides pteronyssinus
СимволDERP1
PDB1XKG
UniProtP08176

Der p 1 - это 25 кДа гликопротеин состоит из 222-аминокислотной последовательности, кодируемой ген DERP1.[4][19][20] Der p 1 синтезируется как неактивная 80-аминокислота. предшественник белка известный как proDer p 1, который затем расщепляется и активируется зрелым Der p 1.[12][15][17]

Благодаря своей структуре цистеинпротеазы Der p 1 может необратимо подавленный к E-64 или же йодацетамид, которые связаны с цистеин активный сайт и заблокировать субстрат доступ.[12][14][21] Главная киви ингибитор цистеиновой протеиназы Также было показано, что KCPI1 способен ингибировать Der p 1.[3]

Der f 1

Пептидаза 1
Идентификаторы
ОрганизмDermatophagoides farinae
СимволDERF1
PDB3RVV
UniProtP16311

Der f 1 представляет собой протеазу 25 кДа, состоящую из 223-аминокислотной последовательности.[20][22] В состоянии неактивного предшественника proDer f 1 имеет продомен из 80 аминокислот.[17][22]

В отличие от Der p 1, Der f 1 не имеет участок связывания для металлов, таких как магний и кальций.[13] Через секрецию Pichia pastoris, Der f 1 легче получить в рекомбинантный формы, чем Der p 1 из-за удаления N-гликозилирование сайт.[16] В растворе или кристалл, Der f 1 - мономер.[1][13] Было показано, что Der f 1 выражает полиморфизм, минимум с двумя гаплотипы наблюдается в разных регионах.[18]

Der f 1 может подавляться каштан цистатин, что, как полагают, связано с присутствием аминокислоты Gln152 (вместо Der p 1 Arg151 ) рядом с активным центром фермента.[1][3]

Евро м 1

Пептидаза 1
Идентификаторы
ОрганизмEuroglyphus maynei
СимволEURM1
UniProtP25780

Eur m 1 состоит из 223-аминокислотной последовательности.[7] В состоянии неактивного предшественника Eur m 1 имеет продомен из 80 аминокислот.[7][17]

Eur m 1 делит 88% идентичности с Der f 1, что привело к предложению, что Euroglyphus maynei может быть более тесно связан с Dermatophagoides farinae чем Dermatophagoides pteronyssinus.[9]

Псо о 1

Пептидаза 1
Идентификаторы
ОрганизмPsoroptes ovis
СимволPSOO1
UniProtQ1EIQ3

Pso o 1 представляет собой протеазу 36 кДа, состоящую из 223-аминокислотной последовательности.[10][23] Предполагается, что форма предшественника Pso o 1 состоит из 81-аминокислотной последовательности.[23]

По сравнению с другими формами пептидазы 1, Pso o 1 имеет 54% идентичности с Der f 1, 53% идентичности с Der p 1 и 53% идентичности с Eur m 1.[10] Показано, что ряд аминокислотных последовательностей других ферментов пептидазы 1 является консервативным в Pso o 1, включая ферментативные аминокислоты, сайт N-гликозилирования и эпитоп Der p 1. Лея147 -Gln160.[10]

Биологическая функция

Ферменты пептидазы 1 обнаружены в фекальные гранулы клещей. Некоторые из этих ферментов также были обнаружены в клещах. кишка, предполагая, что эти ферменты играют роль в пищеварение.[8][15][24] Как цистеиновая протеаза, пептидаза 1 действует, расщепляя другие протеазы клещей в биохимический каскад что приводит к активации других аллергенов.[14][15]

Гранулы фекалий клещей, несущие пептидазу 1, попадают в дыхательные пути через вдыхание.[25] Там, как аллергены клещей группы 1, ферменты пептидазы 1 способствуют развитию аллергии. сенсибилизация, обычно либо вызывая эпителиальный утечка в дыхательные пути через расщепление клеток ' узкие стыки или с помощью врожденного хемокин выпуск через активацию преобразование сигнала пути.[12][14][26]

Der p 1

Der p 1 находится в средней кишке и в фекальных гранулах европейского клеща домашней пыли. Dermatophagoides pteronyssinus.[15][27][28] Было высказано предположение, что клетки желудочно-кишечного тракта клеща продуцируют Der p 1.[24] У клеща Der p 1 отвечает за активацию зимогенов, находящихся в пищеварительном тракте клеща, включая его самого и сериновые протеазы Der p 3, Der p 6 и Der p 9, которые затем секретируются как сильнодействующие аллергены и тем самым усиливают патогенез аллергии.[15]

Der p 1 является основным источником аллергии на HDM, вызывая иммуноглобулин E уровни связывания 80-90% и в сочетании с аллергеном 2 группы Der p 2, что составляет более 50% всего связывания HDM-связанных IgE.[15][16][25][27][29] CD23 и CD25 являются мишенями для Der p 1, который отщепляет эти рецепторы от поверхностей активных В-клетки и Т-клетки соответственно, и тем самым запускает высвобождение большего количества IgE.[12][21] Из-за преобладания Der p 1 при аллергии на клещей разработчики вакцины против аллергии HDM считают необходимым учитывать Der p 1.[29] В результате Der p 1 является основным компонентом сырых экстрактов аллергенов клещей и часто используется в качестве основы для множества гипоаллергенных производных, созданных при переработке специфическая иммунотерапия.[16][29] Даже путем ингибирования только Der p 1 можно заметно ослабить аллергические реакции.[14]

Der f 1

Der f 1 содержится в фекалиях американского клеща домашней пыли. Dermatophagoides farinae.[1] Der f 1 считается основным аллергеном клещей и, как было показано, вызывает аллергические реакции у легкие и кожа.[1][30][31] Der f 1 показывает перекрестную реактивность более 80% с Der p 1.[32] Подобно Der p 1, Der f 1 действует путем расщепления CD23, чтобы вызвать ответ IgE.[20] Der f 1 также вызывает иммунный ответ через эозинофил дегрануляция.[33]

Евро м 1

Eur m 1 выделяется клещом домашней пыли Майна Euroglyphus maynei.[7] Eur m 1 вызывает аллергические реакции Т-клеток.[34] Der p 1 и Der f 1 показывают только низкие уровни перекрестной реактивности с Eur m 1.[34]

Псо о 1

Pso o 1 содержится в кишечнике и фекалиях клещей, вызывающих паршу овец. Psoroptes ovis.[8][24] Псороптоз в овца стимулируется цистеиновой протеазной активностью Pso o 1, нацеленной на соединительной ткани и молекулы внеклеточный матрикс.[24] Несмотря на то что Псороптес принадлежит к другому порядок из клещей домашней пыли Pso o 1 классифицируется как аллерген клещей группы 1 наряду с Der p 1, Der f 1 и Eur m 1.[10][23]

Рекомендации

  1. ^ а б c d е ж грамм час я Chruszcz M, Chapman MD, Vailes LD, Stura EA, Saint-Remy JM, Minor W, Pomés A (2009). «Кристаллические структуры аллергенов клещей Der f 1 и Der p 1 обнаруживают различия в остатках на поверхности, которые могут влиять на связывание антител». J. Mol. Биол. 386 (2): 520–30. Дои:10.1016 / j.jmb.2008.12.049. ЧВК  2677027. PMID  19136006.
  2. ^ Meighan, P .; Пирзад Р. (2004). «Эндопептидаза клещей 1». В Barrett, A.J .; Rawlings, N.D .; Весснер, Дж. Ф. (ред.). Справочник протеолитических ферментов (2-е изд.). Лондон: Эльзевьер. С. 1187–1189.
  3. ^ а б c Рассам, М; Лэйнг, Вашингтон (январь 2004 г.). «Очистка и характеристика фитоцистатинов из коры и семян киви». Фитохимия. 65 (1): 19–30. Дои:10.1016 / j.phytochem.2003.09.019. PMID  14697268.
  4. ^ а б c Харрис, Дж .; Mason, D.E .; Li, J .; Burdick, K.W .; Backes, B.J .; Chen, T .; Шипвей, А .; Van Heeke, G .; Gough, L .; Ghaemmaghami, A .; Шакиб, Ф .; Debaene, F .; Винссингер, Н. (2004). «Профиль активности экстракта аллергена пылевого клеща с использованием библиотек субстратов и функциональных протеомных микрочипов». Chem. Биол. 11 (10): 1361–1372. Дои:10.1016 / j.chembiol.2004.08.008. PMID  15489163.
  5. ^ «Информация по ЭК 3.4.22.65 - пептидаза 1 (клещ)». База данных ферментов - BRENDA. Январь 2015. Получено 11 апреля 2015.
  6. ^ а б Schulz, O .; Sewell, H.F .; Шакиб, Ф. (1998). «Чувствительный флуоресцентный анализ для измерения активности цистеиновой протеазы Der p 1, основного аллергена пылевого клеща. Dermatophagoides pteronyssinus". Мол. Патол. 51 (4): 222–224. Дои:10.1136 / mp.51.4.222. ЧВК  395641. PMID  9893750.
  7. ^ а б c d «EURM1 - предшественник пептидазы 1 - Euroglyphus maynei (клещ домашней пыли Майна)». UniProt. Получено 27 марта 2015.
  8. ^ а б c Макнейр, Кэрол М .; Биллингсли, Питер Ф .; Nisbet, Alasdair J .; Нокс, Дэйв П. (27 октября 2009 г.). «Связанная с кормлением экспрессия генов у клещей парши овец (Psoroptes ovis)». Ветеринарные исследования. 41 (2): 16. Дои:10.1051 / vetres / 2009064. ЧВК  2789330. PMID  19852923.
  9. ^ а б Cui, Y .; Чжоу, П .; Peng, J .; Peng, M .; Zhou, Y .; Lin, Y .; Лю Л. (май 2008 г.). «Клонирование, анализ последовательности и экспрессия кДНК, кодирующей основной аллерген клеща домашней пыли, Der f 1, в Escherichia coli». Бразильский журнал медико-биологических исследований. 41 (5): 380–388. Дои:10.1590 / S0100-879X2008000500006. PMID  18545812.
  10. ^ а б c d е ж грамм час Ли, AJ; Machell, J; Ван Ден Брук, AH; Нисбет, Эй-Джей; Миллер, HR; Исаак, RE; Хантли, Дж. Ф. (август 2002 г.). «Идентификация антигена клеща парши овцы Psoroptes ovis, гомологичного аллергенам клеща домашней пыли группы I». Иммунология паразитов. 24 (8): 413–22. Дои:10.1046 / j.1365-3024.2002.00480.x. PMID  12406195.
  11. ^ Чепмен, доктор медицины; Platts-Mills, TA (август 1980 г.). «Очистка и характеристика основного аллергена Dermatophagoides pteronyssinus-antigen P1». Журнал иммунологии. 125 (2): 587–92. PMID  6771329.
  12. ^ а б c d е ж грамм час Чепмен, Мартин Д .; Вуэншманн, Сабина; Помес, Анна (сентябрь 2007 г.). «Протеазы как адъюванты Th2». Текущие отчеты об аллергии и астме. 7 (5): 363–367. Дои:10.1007 / s11882-007-0055-6. PMID  17697645.
  13. ^ а б c d Томас, WR; Хейлз, Би Джей; Смит, Вашингтон (июль 2010 г.). «Аллергены клещей домашней пыли при астме и аллергии». Тенденции в молекулярной медицине. 16 (7): 321–8. Дои:10.1016 / j.molmed.2010.04.008. PMID  20605742.
  14. ^ а б c d е ж грамм Ньютон, Гэри К .; Perrior, Trevor R .; Дженкинс, Керри; Major, Meriel R .; Ки, Ребекка Э .; Стюарт, Марк Р .; Ферт-Кларк, Стюарт; Ллойд, Стивен М .; Чжан, Цзихуэй; Фрэнсис-Ньютон, Никола Дж .; Ричардсон, Джонатан П .; Чен, Цзе; Лай, Пей; Гаррод, Дэвид Р .; Робинсон, Клайв (26 ноября 2014 г.). «Открытие сильнодействующих, селективных и обратимых ингибиторов аллергена пептидазы клещей домашней пыли Der p 1: инновационный подход к лечению аллергической астмы». Журнал медицинской химии. 57 (22): 9447–9462. Дои:10.1021 / jm501102h. ЧВК  4257840. PMID  25365789.
  15. ^ а б c d е ж грамм час Герман, Дж; Thelen, N; Smargiasso, N; Mailleux, AC; Люксен, А; Cloes, M; Де Пау, Э; Chevigné, A; Галлени, М; Думез, МЭ (март 2014 г.). «Der p 1 является основным активатором Der p 3, Der p 6 и Der p 9 - протеолитических аллергенов, продуцируемых клещом домашней пыли Dermatophagoides pteronyssinus». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Общие предметы. 1840 (3): 1117–24. Дои:10.1016 / j.bbagen.2013.11.017. PMID  24291687.
  16. ^ а б c d Вртала, S; Huber, H; Томас, WR (1 марта 2014 г.). «Рекомбинантные аллергены клещей домашней пыли». Методы. 66 (1): 67–74. Дои:10.1016 / j.ymeth.2013.07.034. ЧВК  4582397. PMID  23911838.
  17. ^ а б c d Zhang, J .; Гамильтон, Дж. М .; Garrod, D. R .; Робинсон, К. (ноябрь 2007 г.). «Взаимодействия между зрелым Der p 1 и его свободным продоменом указывают на принадлежность к новому семейству C1-пептидаз». Аллергия. 62 (11): 1302–1309. Дои:10.1111 / j.1398-9995.2007.01492.x. PMID  17919146.
  18. ^ а б Шафик, Рубаба Хамид; Климов, Павел Б .; Инам, Мухаммад; Чаудхари, Фархана Риаз; ОКоннор, Барри М. (10 декабря 2014 г.). «Гены аллергенов группы 1 у двух видов клещей домашней пыли, Dermatophagoides farinae и D-pteronyssinus (Acari: Pyroglyphidae): прямое секвенирование, характеристика и полиморфизм». PLOS ONE. 9 (12): e114636. Дои:10.1371 / journal.pone.0114636. ЧВК  4262422. PMID  25494056.
  19. ^ «Антиген р 1 Dermatophagoides pteronyssinus». Национальная медицинская библиотека США Медицинские предметные рубрики. Получено 3 апреля 2015.
  20. ^ а б c Круз, Луз Мэри; Лопес-Мальпика, Фернандо; Диас, Ана Мария (июнь 2008 г.). «Анализ перекрестной реактивности между аллергенами 1 группы от клещей». Журнал медицинских наук Пуэрто-Рико. 27 (2): 163–170. PMID  18616045.
  21. ^ а б Томас, WR; Хейлз, Би Джей; Смит, Вашингтон (сентябрь 2005 г.). «Структурная биология аллергенов». Текущие отчеты об аллергии и астме. 5 (5): 388–393. Дои:10.1007 / s11882-005-0012-1. PMID  16091212.
  22. ^ а б «DERF1 - предшественник пептидазы 1 - Dermatophagoides farinae (американский клещ домашней пыли)». UniProt. Получено 12 апреля 2015.
  23. ^ а б c «Предшественник пептидазы 1 - Psoroptes ovis (клещ овечьей парши)». UniProt. Получено 12 апреля 2015.
  24. ^ а б c d NISBET, A.J .; MacKELLAR, A .; McLEAN, K .; BRENNAN, G.P .; ХАНТЛИ, Дж. Ф. (18 сентября 2006 г.). «Эукариотическая экспрессия рекомбинантного Pso o 1, аллергена из Psoroptes ovis, и его локализация в клещах». Паразитология. 134 (1): 83–9. Дои:10.1017 / S0031182006001235. PMID  16978441.
  25. ^ а б Калшекер, Н.А.; Deam, S .; Chambers, L .; Sreedharan, S .; Brocklehurst, K .; Ломас, Д.А. (1996). «Аллерген клеща домашней пыли Der p1 каталитически инактивирует α1-антитрипсин за счет специфического расщепления петли реактивного центра: механизма, который способствует воспалению дыхательных путей и астме». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 221 (1): 59–61. Дои:10.1006 / bbrc.1996.0544. PMID  8660343.
  26. ^ Ван, Хонг; Winton, Helen L .; Соллер, Кристиан; Тови, Юан Р .; Gruenert, Dieter C .; Томпсон, Филип Дж .; Стюарт, Джеффри А .; Тейлор, Грэм В .; Гаррод, Дэвид Р .; Каннелл, Марк Б .; Робинсон, Клайв (1 июля 1999 г.). «Der p 1 способствует трансэпителиальной доставке аллергенов за счет разрушения плотных контактов». Журнал клинических исследований. 104 (1): 123–133. Дои:10.1172 / JCI5844. ЧВК  408401. PMID  10393706.
  27. ^ а б Schulz, O .; Sewell, H.F .; Шакиб, Ф. (1998). «Протеолитическое расщепление CD25, α-субъединицы рецептора интерлейкина 2 человеческих Т-клеток, Der p 1, основным аллергеном клещей с активностью цистеиновой протеазы». J. Exp. Med. 187 (2): 271–275. Дои:10.1084 / jem.187.2.271. ЧВК  2212095. PMID  9432986.
  28. ^ Томас, B; Куча, P; Карсвелл, Ф (1991). «Ультраструктурная локализация аллергена Der p I в кишечнике клеща домашней пыли Dermatophagoides pteronyssinus». Международный архив аллергии и прикладной иммунологии. 94 (1–4): 365–7. Дои:10.1159/000235405. PMID  1937901.
  29. ^ а б c Banerjee, S; Вебер, М; Блатт, К; Свобода, я; Фокке-Тейкл, М; Valent, P; Valenta, R; Вртала, С. (15 мая 2014 г.). «Превращение Der p 23, нового основного аллергена клещей домашней пыли, в гипоаллергенную вакцину». Журнал иммунологии. 192 (10): 4867–75. Дои:10.4049 / jimmunol.1400064. ЧВК  4582415. PMID  24733847.
  30. ^ "Dermatophagoides farinae антиген f 1". Национальная медицинская библиотека США Медицинские предметные рубрики. Получено 3 апреля 2015.
  31. ^ Takai, T .; Като, Т .; Sakata, Y .; Yasueda, H .; Izuhara, K .; Окумура, К .; Огава, Х. (2005). «Рекомбинантные Der p 1 и Der f 1 проявляют активность цистеиновой протеазы, но не обладают активностью сериновой протеазы». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 328 (4): 944–952. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.01.051. PMID  15707969.
  32. ^ Престер, Лерка (апрель 2012 г.). «Аллергены членистоногих в городских домах». Arhiv Za Higijenu Rada I Toksikologiju. 63 (Приложение-1): 47–51. Дои:10.2478/10004-1254-63-2012-2125. PMID  22548852.
  33. ^ Като, Т .; Takai, T .; Fujimura, T .; Matsuoka, H .; Ogawa, T .; Мураяма, К .; Ishii, A .; Ikeda, S .; Окумура, К .; Огава, Х. (сентябрь 2009 г.). «Сериновая протеаза клеща активирует рецептор-2, активируемый протеазой, и вызывает высвобождение цитокинов в кератиноцитах человека». Аллергия. 64 (9): 1366–1374. Дои:10.1111 / j.1398-9995.2009.02023.x. PMID  19416145.
  34. ^ а б Хейлз, Би Джей; Томас, WR (август 1997 г.). «Сенсибилизация Т-лимфоцитов к эпитопам клещей домашней пыли Dermatophagoides pteronyssinus и Euroglyphus maynei». Клиническая и экспериментальная аллергия. 27 (8): 868–875. Дои:10.1046 / j.1365-2222.1997.840895.x. PMID  9291282.

внешняя ссылка