Ауксилин - Auxilin
Предполагаемый тирозин-протеинфосфатаза ауксилин является фермент что у людей кодируется DNAJC6 ген.[5][6][7]
Функция
DNAJC6 принадлежит к эволюционно консервативному семейству белков DNAJ / HSP40, которые регулируют активность молекулярных шаперонов путем стимуляции активности АТФазы. Белки DNAJ могут иметь до 3 различных доменов: консервативный J-домен из 70 аминокислот, обычно на N-конце, богатый глицином / фенилаланином (G / F) участок и богатый цистеином домен, содержащий 4 мотива, напоминающих цинк. -finger домен (Оцука и Хата, 2000).[7]
Структура
В протеинтирозинфосфатаза домен и C2 домен пара ауксилинов, расположенных около N-конца полипептида, составляет супердомен, тандемное расположение двух или более номинально неродственных доменов, которые образуют единую наследуемую единицу.[8] Домен фосфатазы принадлежит к группе подсемейство ауксилинов липидных фосфатаз и, как ожидается, будет каталитически неактивным.[9][10]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000116675 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000028528 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Секи Н., Охира М., Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н., Накадзима Д., Номура Н., Охара О. (октябрь 1997 г.). «Характеристика клонов кДНК в библиотеках кДНК, фракционированных по размеру, из человеческого мозга». ДНК исследования. 4 (5): 345–9. Дои:10.1093 / днарес / 4.5.345. PMID 9455484.
- ^ Оцука К., Хата М. (апрель 2000 г.). «Гомологи HSP40 / DNAJ млекопитающих: клонирование новых кДНК и предложение по их классификации и номенклатуре». Клеточный стресс и шапероны. 5 (2): 98–112. Дои:10.1379 / 1466-1268 (2000) 005 <0098: MHDHCO> 2.0.CO; 2. ЧВК 312896. PMID 11147971.
- ^ а б «Ген Entrez: гомолог DNAJC6 DnaJ (Hsp40), подсемейство C, член 6».
- ^ Haynie DT, Xue B (май 2015 г.). «Супердомены в иерархии белковой структуры: случай PTP-C2». Белковая наука. 24 (5): 874–82. Дои:10.1002 / pro.2664. ЧВК 4420535. PMID 25694109.
- ^ "Ауксилин подсемейства фосфатаз - PhosphataseWiki". phosphatome.net.
- ^ Чен MJ, Диксон Дж., Мэннинг Дж. (Апрель 2017 г.). «Геномика и эволюция протеинфосфатаз». Научная сигнализация. 10 (474): eaag1796. Дои:10.1126 / scisignal.aag1796. PMID 28400531.
внешняя ссылка
- Человек DNAJC6 расположение генома и DNAJC6 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.
дальнейшее чтение
- Судзуки Ю., Ямасита Р., Широта М., Сакакибара Ю., Чиба Дж., Мидзусима-Сугано Дж., Накай К., Сугано С. (сентябрь 2004 г.). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях». Геномные исследования. 14 (9): 1711–8. Дои:10.1101 / гр.2435604. ЧВК 515316. PMID 15342556.
- Шееле У., Алвес Дж., Франк Р., Дювель М., Калтофф С., Унгвикелл Э. (июль 2003 г.). «Молекулярная и функциональная характеристика детерминант связывания клатрина и AP-2 в неупорядоченном домене ауксилина». Журнал биологической химии. 278 (28): 25357–68. Дои:10.1074 / jbc.M303738200. PMID 12732633.
- Scheele U, Kalthoff C, Ungewickell E (сентябрь 2001 г.). «Множественные взаимодействия ауксилина 1 с клатрином и адаптерным комплексом AP-2». Журнал биологической химии. 276 (39): 36131–8. Дои:10.1074 / jbc.M106511200. PMID 11470803.
- Исикава К., Нагасе Т., Накадзима Д., Секи Н., Охира М., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (октябрь 1997 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VIII. 78 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК исследования. 4 (5): 307–13. Дои:10.1093 / днарес / 4.5.307. PMID 9455477.
Галерея PDB | |
|---|---|
|
