Archaeplastida - Archaeplastida

Archaeplastida
Временной диапазон: Калиммианский - Подарок, 1600–0 млн лет
Река Спраг (живописные изображения округа Кламат, штат Орегон) (klaDA0073) .jpg
Деревья, травы и водоросли внутри и вокруг Река Спраг, штат Орегон
Научная классификация е
Домен:Эукариоты
(без рейтинга):Потогонные
(без рейтинга):Archaeplastida
Адл и другие., 2005[1]
Подгруппы
Синонимы
  • Plantae Кавалер-Смит, 1981[2]
  • Примопластобиота Reviers, 2002[нужна цитата ]
  • Primoplantae Палмер и др. 2004 г.[3]

В Archaeplastida (или королевство Plantae Sensu lato ) являются основной группой автотрофный эукариоты, включая красные водоросли (Rhodophyta), зеленые водоросли, а наземные растения, вместе с небольшой группой пресноводных одноклеточных водорослей, называемых глаукофиты.[4] Археопластиды имеют хлоропласты которые окружены двумя мембранами, что позволяет предположить, что они были получены непосредственно из эндосимбиотический цианобактерии. Все остальные группы, кроме амебоидных Паулинелла хроматофора, имеют хлоропласты, окруженные тремя или четырьмя мембранами, что позволяет предположить, что они вторично получены из красных или зеленых водорослей. В отличие от красных и зеленых водорослей, глаукофиты никогда не участвовали во вторичных эндосимбиозах.[5]

В клетках Archaeplastida обычно отсутствуют центриоли и имеют митохондрии с квартирой кристы. У них обычно есть клеточная стенка который содержит целлюлоза, а еда хранится в виде крахмал. Однако эти характеристики присущи и другим эукариотам. Главное свидетельство того, что Archaeplastida образуют монофилетический группа исходит из генетических исследований, которые указывают на их пластиды вероятно, имел единое происхождение. Это свидетельство оспаривается.[6][7] На основании имеющихся на сегодняшний день данных невозможно подтвердить или опровергнуть альтернативные сценарии эволюции одному единственному сценарию. первичный эндосимбиоз.[8] Фотосинтезирующие организмы с пластидами разного происхождения (например, бурые водоросли ) не принадлежат к Archaeplastida.

Археопластиданы делятся на две основные эволюционные линии. Красные водоросли пигментированы хлорофилл а и фикобилипротеины, как и большинство цианобактерий, накапливают крахмал вне хлоропластов. Зеленые водоросли и наземные растения - вместе известные как Viridiplantae (Лат. «Зеленые растения») или Chloroplastida - пигментированы хлорофиллами. а и б, но лишены фикобилипротеинов, и крахмал накапливается внутри хлоропластов.[9] Глаукофиты имеют типичные цианобактериальные пигменты и необычно удерживают клеточную стенку в своих пластидах (так называемых цианеллах).[1]

Archaeplastida не следует путать с более старым и устаревшим названием Archiplastideae, которое относится к цианобактерии и другие группы бактерий.[10][11]

Таксономия

Смотрите также: Эукариот § Филогения

Консенсус 2005 года, когда группа, состоящая из глаукофитов, красных и зеленых водорослей и наземных растений, была названа «Archaeplastida»,[1] было то, что это был клады, т.е. было монофилетический. Многие исследования, опубликованные с тех пор, подтвердили согласие.[12][13][14][15] Однако другие исследования показали, что группа парафилетический.[16][17][18][7] На сегодняшний день ситуация кажется нерешенной, но в недавнем исследовании (с обогащением генов красных водорослей) был продемонстрирован сильный сигнал для монофилии Plantae (Archaeplastida).[19] Сделанное здесь предположение состоит в том, что Archaeplastida является действительной кладой.

Группе были даны разные названия. Некоторые авторы просто называют эту группу растениями или Plantae.[20][21] Однако название Plantae неоднозначно, так как оно также применяется к менее инклюзивным клады, Такие как Viridiplantae и эмбриофиты. Чтобы различать, большую группу иногда называют Plantae. Sensu lato («растения в широком смысле»).

Чтобы избежать двусмысленности, были предложены другие названия. Primoplantae, появившаяся в 2004 г., кажется, является первым новым названием, предложенным для этой группы.[3] Другое название, применяемое к этому узлу, - Plastida, определяемое как клады, разделяющие пластиды первичного (прямого прокариотного) происхождения [как] в Магнолия виргинская Линней 1753 г. ".[22]

Хотя многие исследования предполагают, что Archaeplastida образует монофилетический группа,[23] в статье 2009 г. утверждается, что они на самом деле парафилетический.[18] Обогащение новыми генами красных водорослей в недавнем исследовании демонстрирует сильный сигнал для монофилии Plantae (Archaeplastida) и столь же сильный сигнал об истории обмена генами между красными / зелеными водорослями и другими линиями.[19] Это исследование дает представление о том, насколько обширные данные о мезофильных генах красных водорослей имеют решающее значение для проверки спорных вопросов эволюции эукариот и для понимания сложных закономерностей наследования генов у простейших.

Название Archaeplastida было предложено в 2005 году большим международным коллективом авторов (Adl. и другие.), который стремился составить классификацию эукариоты который учитывал морфологию, биохимию и филогенетику и имел «некоторую стабильность в ближайшем будущем». Они отказались от использования формальных таксономических рангов в пользу иерархического расположения, при котором названия клад не означают ранг. Таким образом, название типа «Glaucophyta» и название класса «Rhodophyceae» появляются на одном уровне в их классификации. Подразделения, предлагаемые для Archaeplastida, показаны ниже как в табличной форме, так и в схематическая форма.[1]

Archaeplastida:

В глаукофит Глаукоцистис
  • Глаукофита Скуя, 1954 г. (Glaucocystophyta Кис и Кремер, 1986) - глаукофиты
  • Глаукофиты - это небольшая группа пресноводных одноклеточных водорослей. Их хлоропласты, называемые цианеллы, есть пептидогликан слой, что делает их более похожими на цианобактерии, чем у остальных Archaeplastida.
В родофит Лауренсия
  • Rhodophyceae Thuret, 1855, исправление. Rabenhorst, 1863, исправление. Адл и другие., 2005 (Родофита Веттштейн 1901) - красные водоросли
Красные водоросли составляют одну из самых больших групп водорослей. Большинство из них - это водоросли, многоклеточные и морские. Их красный цвет происходит от фикобилипротеины, используется как вспомогательные пигменты в светозахвате для фотосинтеза.
  • Хлоропластида Адл и другие., 2005 (Viridiplantae Кавалер-Смит 1981; Хлоробионта Джеффри 1982, поправить. Бремер 1985, исправление. Льюис и МакКорт 2004; Хлоробиота Кендрик и Крейн 1997)
Хлоропластида - это термин, выбранный Adl. и другие. для группы, состоящей из зеленых водорослей и наземных растений (эмбриофитов). За исключением вторичных потерь, все они имеют хлоропласты без пептидогликанового слоя и без фикобилипротеинов.
В хлорофит Стигеоклониум
  • Хлорофита Пашер, 1914 г., исправил. Льюис и МакКорт, 2004 г. - зеленые водоросли (часть)
  • Adl et al. используйте узкое определение Chlorophyta; другие источники включают Chlorodendrales и Prasinophytae, которые сами по себе могут быть объединены.
  • Ulvophyceae Маттокс и Стюарт, 1984
  • Trebouxiophyceae Фридл, 1995 г. (Pleurastrophyceae Mattox et al. 1984; Microthamniales Мелконян 1990)
  • Chlorophyceae Кристенсен, 1994
  • Chlorodendrales Фрич, 1917 год. - зеленые водоросли (часть)
  • Празинофиты Кавальер-Смит, 1998 г., поправить. Льюис и МакКорт, 2004 г. - зеленые водоросли (часть)
  • Мезостигма Лаутерборн, 1894 г., поправить. Маккорт в Адл и другие., 2005 (Мезостигматы Турмель, Отис и Лемье, 2002 г.)
  • Charophyta Кароль и другие., 2001, поправить. Льюис и МакКорт, 2004 г. (Charophyceae Смит 1938 г., поправить. Маттокс и Стюарт 1984) - зеленые водоросли (часть) и наземные растения
Charophyta Sensu lato, как используется Adl и другие., представляет собой монофилетическую группу, состоящую из некоторых зеленых водорослей, в том числе каменных (Charophyta Sensu stricto), а также наземные растения (эмбриофиты).
  • Подразделы, отличные от Streptophytina (см. Ниже), не приводятся Adl et al.
Другие источники включают группы зеленых водорослей. Хлорокибалес, Klebsormidiales, Zygnematales и Coleochaetales.[24]
  • Charales Линдли 1836 (Charophytae Энглер, 1887 г.) - керамогранит
  • Plantae Геккель 1866 г. (Кормофита Эндлихер, 1836 г.; Эмбриофита Endlicher, 1836, исправление. Льюис и МакКорт, 2004 г.) - наземные растения (зародыши)

Кладограмма

Ниже приводится согласованная реконструкция взаимоотношений зеленых водорослей, в основном основанная на молекулярных данных.[25][26][27][28][29][30][31][32][33][34] Хотя Glaucophyta обычно считается самой глубоко укоренившейся Archeaplastida,[35][36][37][38] некоторые геномные исследования указывают на Rhodophyta как на базальное, возможно, с Cryptista и picozoa, появившимися в Archaeplastida.[39][40][41][42][43][44][45]

Потогонные
Archaeplastida + криптиста
 
 

Глаукофита (сине-зеленые водные растения)

 
Viridiplantae /
 
 

Mesostigmatophyceae

 
 
 

Спиротения

 
 

Chlorokybophyceae

 
 
 
 
 

Хлорофита

 
Streptophyta /
 

Klebsormidiophyceae

 
Phragmoplastophyta
 

Charophyceae

 
 
 

Coleochaetophyceae

 
 
 
 

Zygnematophyceae

 
 

Mesotaeniaceae

 
 
 

Эмбриофиты (наземные растения)

 
 
 
 
Charophyta
 
зеленые водоросли
 
 
 

Родофита (красные водоросли / красные водные растения)

 
 

Пикозоа

 
 

Родельфидия (хищник)

 
 
 

Криптиста

 
 (+ Gloeomargarita lithophora ) 
 
 

Гаптиста

 
ЦАРЬ
 

Телонемия

 
SAR
Халвария
 

Страменопилы

 
 

Альвеолаты

 
 
 

Ризария

 
 
 
 
 

Однако вокруг корня Archaeplastida есть много споров, например являются ли Glaucophyta или Rhodophyta базальными, или, например, Криптиста возникла внутри архепластиды. В 2014 году был опубликован подробный обзор этих несоответствий.[46] Положение Телонемия и Пикозоа непонятны. Также Хакробия (Haptista + Cryptista) может быть полностью связана с кладой SAR. SAR часто рассматриваются как гибриды эукариот-эукариот, что вносит путаницу в генетический анализ. Сестра Gloeomargarita lithophora был поглощен предком Archaeplastida, что привело к пластиды которые живут в постоянном эндосимбиозе в большинстве потомков. Поскольку и Gloeomargarita, и родственные цианобактерии, в дополнение к наиболее примитивным архепластидам, все живут в пресной воде, кажется, что Archaeplastida возникла в пресной воде и колонизировала океаны только в конце протерозоя.[47][48]

Морфология

У всех archaeplastidans есть пластиды (хлоропласты), которые осуществляют фотосинтез и, как полагают, происходят от эндосимбиотических цианобактерий. У глаукофитов, возможно, самых примитивных представителей этой группы, хлоропласт называется Cyanelle и имеет несколько общих черт с цианобактериями, включая клеточную стенку пептидогликана, которые не сохраняются у других членов группы. Сходство цианелл с цианобактериями подтверждает эндосимбиотическая теория.

Клетки большинства archaeplastidans имеют стенки, обычно, но не всегда, из целлюлозы.

Archaeplastida широко различаются по степени своей клеточной организации: от изолированных клеток до нитей, колоний и многоклеточных организмов. Самые ранние были одноклеточными, и многие группы остаются таковыми и сегодня. Многоклеточность развивалась отдельно в нескольких группах, включая красные водоросли, ульвофитные зеленые водоросли, и в зеленых водорослях, которые дали начало каменная кладка и наземные растения.

Эндосимбиоз

Основная статья: Эндосимбиотическая теория

Поскольку предполагается, что предковый архепластидан приобрел свои хлоропласты непосредственно в результате поглощения цианобактерий, это событие известно как первичный эндосимбиоз (что отражено в названии, выбранном для группы «Archaeplastida», т.е. «древний пластид»). Один вид зеленых водорослей, Cymbomonas tetramitiformis в порядке Pyramimonadales, это миксотроф и в состоянии поддерживать себя как фаготрофия и фототрофия. Пока не известно, является ли это примитивным признаком и, следовательно, определяет последнего общего предка Archaeplastida, который мог бы объяснить, как он получил свои хлоропласты, или это признак, восстановленный горизонтальный перенос генов.[49]

Доказательства первичного эндосимбоза включают наличие двойной мембраны вокруг хлоропластов; одна мембрана принадлежала бактерии, а другая - захватившему ее эукариоту. Со временем многие гены из хлоропласта были перенесены в ядро ​​клетки-хозяина. Присутствие таких генов в ядрах эукариот без хлоропластов предполагает, что этот перенос произошел на ранней стадии эволюции группы.[50]

Другие эукариоты с хлоропластами, по-видимому, получили их, поглотив одноклеточный архепластидан своими собственными хлоропластами, полученными из бактерий. Поскольку эти события связаны с эндосимбиозом клеток, у которых есть собственные эндосимбионты, этот процесс называется вторичный эндосимбиоз. Хлоропласты таких эукариот обычно окружены более чем двумя мембранами, что отражает историю многократного поглощения. Хлоропласты эвглениды, хлорарахниофиты и небольшая группа динофлагелляты кажутся пойманными зелеными водорослями,[51] тогда как у остальных фотосинтезирующих эукариот, таких как гетероконт водоросли криптофиты, гаптофиты, и динофлагелляты, по-видимому, являются захваченными красными водорослями.

Окаменелости

Возможно, самые древние останки Archaeplastida - это предполагаемые красные водоросли (Рафатазмия ) в строматолиты в горных породах Индии 1600 млн лет назад.[52] Несколько более свежие микрофоссилий из группы Ропер в северной Австралии. Структура этих одноклеточных окаменелостей напоминает структуру современных зеленых водорослей. Они датируются Мезопротерозойский Эра, примерно 1500-1300 млн лет.[53] Эти окаменелости соответствуют молекулярные часы исследование, которое подсчитало, что эта клада расходилась около 1500 млн лет назад.[54] Самая старая окаменелость, которую можно отнести к определенной современной группе, - это красная водоросль. Bangiomorpha, с 1200 млн лет.[55]

В конце Неопротерозойский Эра окаменелости водорослей стали более многочисленными и разнообразными. В конце концов, в Палеозой Эра, растения появились на суше и продолжают процветать до настоящего времени.

Рекомендации

  1. ^ а б c d Adl, S.M .; и другие. (2005). «Новая классификация эукариот более высокого уровня с упором на таксономию протистов». Журнал эукариотической микробиологии. 52 (5): 399–451. Дои:10.1111 / j.1550-7408.2005.00053.x. PMID  16248873. S2CID  8060916.
  2. ^ Кавальер-Смит, Т. (1981). «Царства эукариотов: семь или девять?"". Биосистемы. 14 (3–4): 461–481. Дои:10.1016/0303-2647(81)90050-2. PMID  7337818.
  3. ^ а б Палмер, Джеффри Д .; Солтис, Дуглас Э .; Чейз, Марк В. (2004). «Растение древо жизни: обзор и некоторые точки зрения». Американский журнал ботаники. 91 (10): 1437–1445. Дои:10.3732 / ajb.91.10.1437. PMID  21652302.
  4. ^ Болл С., Коллеони К., Ченчи Ю., Радж Дж. Н., Тиртио С. (январь 2011 г.). «Эволюция метаболизма гликогена и крахмала у эукариот дает молекулярные ключи к пониманию возникновения пластидного эндосимбиоза». Журнал экспериментальной ботаники. 62 (6): 1775–1801. Дои:10.1093 / jxb / erq411. PMID  21220783.
  5. ^ Справочник морских микроводорослей: достижения биотехнологии
  6. ^ Парфри. L. W .; Barbero, E .; Лассер, Э; и другие. (Декабрь 2006 г.). «Оценка поддержки текущей классификации эукариотического разнообразия». PLOS Genetics. 2 (12): e220. Дои:10.1371 / journal.pgen.0020220. ЧВК  1713255. PMID  17194223.
  7. ^ а б Ким, Э; Грэм, Л. Э. (июль 2008 г.). Редфилд, Розмари Жанна (ред.). "Анализ EEF2 бросает вызов монофилии Archaeplastida и Chromalveolata". PLOS ONE. 3 (7): e2621. Bibcode:2008PLoSO ... 3,26 21 тыс.. Дои:10.1371 / journal.pone.0002621. ЧВК  2440802. PMID  18612431.
  8. ^ Mackiewicz, P .; Гагат П. (2014). «Монофилия супергруппы Archaeplastida и отношения между ее линиями в свете филогенетических и филогеномных исследований. Близки ли мы к консенсусу?». Acta Societatis Botanicorum Poloniae. 83 (4): 263–280. Дои:10.5586 / asbp.2014.044.
  9. ^ Альт, Р .; Nyvall, P .; Педерсен, М. (2001). «Уникальные особенности метаболизма крахмала в красных водорослях». Труды Королевского общества B: биологические науки. 268 (1474): 1417–1422. Дои:10.1098 / rspb.2001.1644. ЧВК  1088757. PMID  11429143.
  10. ^ Коупленд, Х. Ф. (1956). Классификация низших организмов. Пало-Альто: Pacific Books, стр. 29, [1].
  11. ^ Бесси, К. Э. (1907). "Краткое описание типа растений". Univ. Небраска Исследования. 7: 275–358.
  12. ^ Бурки, Фабьен; Камран Шалчян-Тебризи; Марианна Минге; Осмунд Скьевеланд; Сергей Иванович Николаев; Кжетил С. Якобсен; Ян Павловский (2007). Батлер, Джеральдин (ред.). «Филогеномика меняет эукариотические супергруппы». PLOS ONE. 2 (8): e790. Bibcode:2007PLoSO ... 2..790B. Дои:10.1371 / journal.pone.0000790. ЧВК  1949142. PMID  17726520.
  13. ^ Бурки, Ф .; Inagaki, Y .; Brate, J .; Archibald, J.M .; Килинг, П. Дж .; Кавальер-Смит, Т .; и другие. (2009). «Крупномасштабные филогеномные анализы показывают, что две загадочные протистские линии, Telonemia и Centroheliozoa, связаны с фотосинтетическими хромальвеолатами». Геномная биология и эволюция. 1: 231–238. Дои:10.1093 / gbe / evp022. ЧВК  2817417. PMID  20333193.
  14. ^ Кавальер-Смит, Томас (2009). «Царства Protozoa и Chromista и эозойный корень эукариотического дерева». Письма о биологии. 6 (3): 342–345. Дои:10.1098 / rsbl.2009.0948. ЧВК  2880060. PMID  20031978.
  15. ^ Рогозин, И. Б .; Basu, M. K .; Чюрош, М. и Кунин, Э. В. (2009). «Анализ редких геномных изменений не подтверждает филогению Униконт-Биконт и предполагает, что цианобактериальный симбиоз является точкой первичного облучения эукариот». Геномная биология и эволюция. 1: 99–113. Дои:10.1093 / gbe / evp011. ЧВК  2817406. PMID  20333181.
  16. ^ Балдауф, С.Л., Роджер, А.Дж., Венк-Зиферт, И., Дулиттл, В.Ф. 2000. Филогения эукариот на уровне царства, основанная на комбинированных данных о белках. Наука 290: 972-977 (researchgate.net)
  17. ^ Липскомб, Диана. 1991. Широкая классификация: царства и простейшие. В: Parasitic Protozoa, Vol. 1, 2-е изд., J.P. Kreier, J.R. Baker (eds.), Стр. 81-136. Academic Press, Сан-Диего.
  18. ^ а б Nozaki, H .; Maruyama, S .; Matsuzaki, M .; Nakada, T .; Kato, S .; Мисава, К. (декабрь 2009 г.). «Филогенетическое положение Glaucophyta, зеленых растений (Archaeplastida) и Haptophyta (Chromalveolata) по данным медленно развивающихся ядерных генов». Молекулярная филогенетика и эволюция. 53 (3): 872–80. Дои:10.1016 / j.ympev.2009.08.015. PMID  19698794.
  19. ^ а б Chan, C. X .; Yang, E.C .; Banerjee, T .; Yoon, H. S .; Martone, P.T .; Estevez, J.M .; Бхаттачарья, Д. (2011). «Монофилия красных и зеленых водорослей и обширное совместное использование генов, обнаруженное в богатом репертуаре генов красных водорослей». Текущая биология. 21 (4): 328–333. Дои:10.1016 / j.cub.2011.01.037. PMID  21315598. S2CID  7162977.
  20. ^ Т. Кавалье-Смит (1981). «Царства эукариотов: семь или девять?». Биосистемы. 14 (3–4): 461–481. Дои:10.1016/0303-2647(81)90050-2. PMID  7337818.
  21. ^ Бхаттачарья, Дебашиш; Юн, Хван Су; Хакетт, Иеремия (2003). «Фотосинтезирующие эукариоты объединяются: эндосимбиоз соединяет точки». BioEssays. 26 (1): 50–60. Дои:10.1002 / bies.10376. PMID  14696040.
  22. ^ Симпсон, А. Г. Б. (2004). «Таксоны высшего уровня в эукариотах». Первое международное совещание по филогенетической номенклатуре. Париж, 6–9 июля.
  23. ^ Виноградов С. Н .; Fernández, I .; Hoogewijs, D .; Арредондо-Питер Р. (октябрь 2010 г.). «Филогенетические отношения 3/3 и 2/2 гемоглобинов в геномах археопластид с бактериальными и другими гемоглобинами эукариот». Молекулярный завод. 4 (1): 42–58. Дои:10.1093 / mp / ssq040. PMID  20952597. Архивировано из оригинал на 2012-12-09. Получено 2011-01-08.
  24. ^ Turmel, M .; Otis, C .; Лемье, К. (2005). "Полные последовательности ДНК хлоропластов зеленых водорослей charophycean Стаураструм и Зигнема показывают, что геном хлоропластов претерпел значительные изменения в ходе эволюции Zygnematales ». BMC Биология. 3: 22. Дои:10.1186/1741-7007-3-22. ЧВК  1277820. PMID  16236178.
  25. ^ Лелиаерт, Фредерик; Смит, Дэвид Р .; Моро, Эрве; Херрон, Мэтью Д.; Verbruggen, Heroen; Delwiche, Charles F .; Де Клерк, Оливье (2012). «Филогения и молекулярная эволюция зеленых водорослей» (PDF). Критические обзоры в науках о растениях. 31: 1–46. Дои:10.1080/07352689.2011.615705. S2CID  17603352.
  26. ^ Марин, Биргер (2012). «Вложенные в хлореллы или независимый класс? Филогения и классификация Pedinophyceae (Viridiplantae), выявленная молекулярным филогенетическим анализом полных ядерных и кодируемых пластидом оперонов рРНК». Протист. 163 (5): 778–805. Дои:10.1016 / j.protis.2011.11.004. PMID  22192529.
  27. ^ Лорин-Лемей, Саймон; Бринкманн, Хеннер; Филипп, Эрве (2012). «Происхождение наземных растений пересмотрено в свете загрязнения последовательностей и отсутствующих данных». Текущая биология. 22 (15): R593 – R594. Дои:10.1016 / j.cub.2012.06.013. PMID  22877776.
  28. ^ Лелиаерт, Фредерик; Тронхольм, Ана; Лемье, Клод; Турмель, Моник; DePriest, Michael S .; Бхаттачарья, Дебашиш; Karol, Kenneth G .; Фредерик, Сюзанна; Зехман, Фредерик В. (09.05.2016). «Филогеномный анализ хлоропластов выявил наиболее разветвленную ветвь Chlorophyta, класс Palmophyllophyceae. Nov». Научные отчеты. 6: 25367. Bibcode:2016НатСР ... 625367Л. Дои:10.1038 / srep25367. ISSN  2045-2322. ЧВК  4860620. PMID  27157793.
  29. ^ Кук, Марта Э .; Грэм, Линда Э. (2017). Арчибальд, Джон М .; Симпсон, Аластер Г. Б.; Сламовиц, Клаудио Х. (ред.). Справочник протистов. Издательство Springer International. С. 185–204. Дои:10.1007/978-3-319-28149-0_36. ISBN  9783319281476.
  30. ^ Льюис, Луиза А .; Ричард М. МакКорт (2004). «Зеленые водоросли и происхождение наземных растений» (Абстрактные). Американский журнал ботаники. 91 (10): 1535–1556. Дои:10.3732 / ajb.91.10.1535. PMID  21652308.
  31. ^ Ruhfel, Brad R .; Gitzendanner, Matthew A .; Soltis, Pamela S .; Солтис, Дуглас Э .; Берли, Дж. Гордон (17 февраля 2014 г.). «От водорослей до покрытосеменных - определение филогении зеленых растений (Viridiplantae) на основе 360 геномов пластид». BMC Эволюционная биология. 14: 23. Дои:10.1186/1471-2148-14-23. ISSN  1471-2148. ЧВК  3933183. PMID  24533922.
  32. ^ Adl, Sina M .; Симпсон, Аластер Г. Б.; Lane, Christopher E .; Лукеш, Юлий; Басс, Дэвид; Bowser, Samuel S .; Браун, Мэтью У .; Бурки, Фабьен; Данторн, Мика (01.09.2012). «Пересмотренная классификация эукариот». Журнал эукариотической микробиологии. 59 (5): 429–514. Дои:10.1111 / j.1550-7408.2012.00644.x. ISSN  1550-7408. ЧВК  3483872. PMID  23020233.
  33. ^ Лемье, Клод; Отис, Кристиан; Турмель, Моник (12 января 2007 г.). «Клада, объединяющая зеленые водоросли Mesostigma viride и Chlorokybus atmophyticus, представляет собой самую глубокую ветвь Streptophyta в основанной на хлоропластном геноме филогении». BMC Биология. 5: 2. Дои:10.1186/1741-7007-5-2. ISSN  1741-7007. ЧВК  1781420. PMID  17222354.
  34. ^ Умен, Джеймс Г. (2014-11-01). «Зеленые водоросли и истоки многоклеточности в растительном мире». Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии. 6 (11): a016170. Дои:10.1101 / cshperspect.a016170. ISSN  1943-0264. ЧВК  4413236. PMID  25324214.
  35. ^ Фрис, Ян де; Гулд, Свен Б. (01.01.2017). «Монопластидное узкое место в эволюции водорослей и растений». J Cell Sci. 131 (2): jcs.203414. Дои:10.1242 / jcs.203414. ISSN  0021-9533. PMID  28893840.
  36. ^ Понсе-Толедо, Рафаэль I .; Дешам, Филипп; Лопес-Гарсия, Пурификасьон; Живанович, Иван; Бензерара, Карим; Морейра, Дэвид (2017). «Пресноводная цианобактерия с ранним ветвлением и у истоков пластид». Текущая биология. 27 (3): 386–391. Дои:10.1016 / j.cub.2016.11.056. ЧВК  5650054. PMID  28132810.
  37. ^ Диттами, Саймон М .; Хиш, Свенья; Olsen, Jeanine L .; Коллен, Йонас (2017-08-01). «Переходы между морской и пресноводной средами дают новые ключи к разгадке происхождения многоклеточных растений и водорослей» (PDF). Журнал психологии. 53 (4): 731–745. Дои:10.1111 / JPY.12547. ISSN  1529-8817. PMID  28509401. S2CID  43325392.
  38. ^ Смит, Дэвид Р. (2018). «Затерянные в свете: эволюция пластидного генома нефотосинтетических водорослей». Эволюция пластидного генома. Успехи ботанических исследований. 85. С. 29–53. Дои:10.1016 / bs.abr.2017.10.001. ISBN  9780128134573.
  39. ^ Бурки, Фабьен; Каплан, Майя; Тихоненков, Денис В .; Златогурский, Василий; Минь, Буй Куанг; Радайкина, Людмила В .; Смирнов, Алексей; Мыльников, Александр П .; Килинг, Патрик Дж. (27 января 2016 г.). «Распутывая раннюю диверсификацию эукариот: филогеномное исследование эволюционного происхождения Centrohelida, Haptophyta и Cryptista». Proc. R. Soc. B. 283 (1823): 20152802. Дои:10.1098 / rspb.2015.2802. ISSN  0962-8452. ЧВК  4795036. PMID  26817772.
  40. ^ Браун, Мэтью У .; Хейсс, Аарон; Камикава, Риома; Инагаки, Юдзи; Ябуки, Акинори; Тайс, Александр К .; Ширатори, Такаши; Исида, Кен; Хасимото, Тецуо (03.12.2017). «Филогеномика помещает сиротские протистанские линии в новую эукариотическую супергруппу». Геном Биол Эвол. 10 (2): 427–433. Дои:10.1093 / gbe / evy014. ЧВК  5793813. PMID  29360967.
  41. ^ Ли, ДжунМо; Чо, Чон Хён; Парк, Сын Ин; Чой, Джи Вон; Сон, Хён Сок; West, John A .; Бхаттачарья, Дебашиш; Юн, Хван Су (2016-09-02). «Параллельная эволюция высококонсервативной архитектуры пластидного генома у красных морских водорослей и семенных растений». BMC Биология. 14: 75. Дои:10.1186 / s12915-016-0299-5. ISSN  1741-7007. ЧВК  5010701. PMID  27589960.
  42. ^ Бодел, Анджей (2018). «Некоторые пластиды, полученные из красных водорослей, эволюционировали посредством клептопластии? Гипотеза». Биологические обзоры. 93 (1): 201–222. Дои:10.1111 / brv.12340. ISSN  1464-7931. PMID  28544184. S2CID  24613863.
  43. ^ Gitzendanner, Matthew A .; Soltis, Pamela S .; Wong, Gane K.-S .; Ruhfel, Brad R .; Солтис, Дуглас Э. (2018). «Пластидный филогеномный анализ зеленых растений: миллиард лет эволюционной истории». Американский журнал ботаники. 105 (3): 291–301. Дои:10.1002 / ajb2.1048. ISSN  0002-9122. PMID  29603143.
  44. ^ Штрассерт, Юрген Ф. Х .; Джейми, Махваш; Мыльников, Александр П .; Тихоненков, Денис В .; Бурки, Фабьен (30.08.2018). «Новый филогеномный анализ загадочного типа Telonemia позволяет еще раз раскрыть древо жизни эукариот». bioRxiv: 403329. Дои:10.1101/403329.
  45. ^ Гаврилюк, Райан М. Р .; Тихоненков, Денис В .; Хехенбергер, Элизабет; Хусник, Филип; Мыльников, Александр П .; Килинг, Патрик Дж. (2019-09-08). «Нефотосинтезирующие хищники - сестра красных водорослей». Природа. 572 (7768): 240–243. Дои:10.1038 / s41586-019-1398-6. ISSN  0028-0836. PMID  31316212. S2CID  197542583.
  46. ^ Мацкевич, Павел; Гагат, Пшемыслав (31 декабря 2014 г.). «Монофилия супергруппы Archaeplastida и отношения между ее линиями в свете филогенетических и филогеномных исследований. Близки ли мы к консенсусу?». Acta Societatis Botanicorum Poloniae. 83 (4): 263–280. Дои:10.5586 / asbp.2014.044. ISSN  2083-9480.
  47. ^ де Фрис, Ян; Арчибальд, Джон М. (2017). «Эндосимбиоз: развились ли пластиды из пресноводных цианобактерий?». Текущая биология. 27 (3): R103 – R105. Дои:10.1016 / j.cub.2016.12.006. PMID  28171752.
  48. ^ Льюис, Л. А. (2017). «Держите соль: пресноводное происхождение первичных пластид». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 114 (37): 9759–9760. Дои:10.1073 / pnas.1712956114. ЧВК  5604047. PMID  28860199.
  49. ^ Рэйвен, Джон А. (2013). «Клетки внутри клеток: симбиоз и продолжающаяся фаготрофия». Текущая биология. 23 (12): R530 – R531. Дои:10.1016 / j.cub.2013.05.006. PMID  23787050.
  50. ^ Андерссон, Ян О .; Роджер, Эндрю Дж. (2002). «Ген цианобактерии у нефотосинтезирующих протистов - раннее приобретение хлоропластов у эукариот?». Текущая биология. 12 (2): 115–119. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00649-2. PMID  11818061. S2CID  18809784.
  51. ^ Килинг, Патрик Дж. (2010). «Эндосимбиотическое происхождение, разнообразие и судьба пластид». Философские труды Королевского общества B: биологические науки. 365 (1541): 729–748. Дои:10.1098 / rstb.2009.0103. ЧВК  2817223. PMID  20124341.
  52. ^ Бенгтсон, Стефан; Салльштедт, Тереза; Беливанова, Венета; Белый дом, Мартин (2017). «Трехмерное сохранение клеточных и субклеточных структур предполагает, что красные водоросли группы кроны возрастом 1,6 миллиарда лет». PLOS Биология. 15 (3): e2000735. Дои:10.1371 / journal.pbio.2000735. ЧВК  5349422. PMID  28291791.
  53. ^ Javaux, Emmanuelle J .; Knoll, Andrew H .; Уолтер, Малкольм Р. (2004). «Свидетельства ТЕА для эукариотического разнообразия в среднем протерозое океанов». Геобиология. 2 (3): 121–132. Дои:10.1111 / j.1472-4677.2004.00027.x. S2CID  53600639.
  54. ^ Юн, Хван Су; Hackett, Jeremiah D .; Чинилья, Клаудиа; Пинто, Габриэле; Бхаттачарья, Дебашиш (2004). «Молекулярный график происхождения фотосинтезирующих эукариот». Молекулярная биология и эволюция. 21 (5): 809–818. Дои:10.1093 / молбев / мш075. PMID  14963099.
  55. ^ Баттерфилд, Николас Дж. (2000). "Bangiomorpha pubescens п. gen., n.sp .: значение для эволюции пола, многоклеточности и мезопротерозойского / неопротерозойского излучения эукариот ». Палеобиология. 26 (3): 386–404. Дои:10.1666 / 0094-8373 (2000) 026 <0386: BPNGNS> 2.0.CO; 2.

внешняя ссылка