Бета-актин - Beta-actin

ACTB
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	3BYH, 3D2U, 3J82, 3LUE
Идентификаторы
Псевдонимы	ACTB, BRWS1, PS1TP5BP1, бета-актин, актин, бета, актин бета
Внешние идентификаторы	OMIM: 102630 MGI: 87904 ГомолоГен: 110648 Генные карты: ACTB
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 7 (человек)
Конец	5,563,784 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 5 (мышь)
Конец	142,906,754 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II; • связывание нуклеотидов; • связывание синтазы оксида азота; • Связывание белка Tat; • структурная составляющая цитоскелета; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание кинезина; • идентичное связывание с белками; • связывание нуклеосомной ДНК; • Связывание АТФ;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • микрочастица крови; • мембрана; • очаговая адгезия; • Комплекс гистонацетилтрансферазы NuA4; • клеточная мембрана; • нуклеоплазма; • ядерный хроматин; • цитоплазматическая гранула рибонуклеопротеина; • внеклеточная экзосома; • цитоскелет; • плотное тело; • корковый цитоскелет; • цитозоль; • миелин; • внеклеточный;
Биологический процесс	• положительная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая; • движение клетки или субклеточного компонента; • развитие черной субстанции; • Путь передачи сигналов рецептора Fc-гамма, участвующий в фагоцитозе; • сигнальный путь рецептора эфрина; • АТФ-зависимое ремоделирование хроматина; • гомеостаз сетчатки; • сигнальный путь рецептора фактора роста эндотелия сосудов; • Скопление тромбоцитов; • узел соединения ячеек; • организация цитоскелета; • деубиквитинирование белков; • мембранная организация;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	60
	11461
	ENSG00000075624
	ENSMUSG00000029580
	P60709
	P60710
	NM_001101
	NM_007393
	NP_001092
	NP_031419
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Бета-актин (сокращение от человеческого гена и белка ACTB/ACTB) является одним из шести различных актин изоформы, которые были идентифицированы у людей. Это один из двух немышечных цитоскелет актины. Актины - это высококонсервативные белки^[5]^[6] которые участвуют в подвижности, структуре и целостности клеток. Альфа-актины - основная составляющая сократительного аппарата.^[7]

Взаимодействия

Бета-актин может взаимодействовать с СПТБН2.^[8]^[9] К тому же, РНК-связывающий белок Было обнаружено, что Sam68 взаимодействует с мРНК, кодирующей β-актин, который регулирует синаптическое образование дендритных шипов с его цитоскелетными компонентами.

Было показано, что бета-актин активирует eNOS, тем самым увеличивая производство NO. Было показано, что остаток из восьми аминокислот (326-333) в актине опосредует взаимодействие между актином и eNOS.^[10]

Клиническая значимость

Рецидивирующие мутации в этом гене были связаны со случаями диффузная В-клеточная лимфома большого размера.^[11]

Приложения

Бета-актин обычно используется как контроль загрузки, среди прочего, целостность клеток, деградация белка, в ПЦР и Вестерн-блоттинг. Его молекулярная масса составляет примерно 42 кДа.

внешняя ссылка

Человек ACTB расположение генома и ACTB страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P60709 (Актин, цитоплазматический 1) на PDBe-KB.

дальнейшее чтение

Vandekerckhove J, Leavitt J, Kakunaga T, Weber K (1980). «Совместная экспрессия мутантного бета-актина и двух нормальных бета- и гамма-цитоплазматических актинов в стабильно трансформированной линии клеток человека». Клетка. 22 (3): 893–9. Дои:10.1016/0092-8674(80)90566-8. PMID 6893954. S2CID 54299848.
Ливитт Дж., Ганнинг П., Поррека П., Нг С.Ю., Лин С.С., Кедес Л. (1984). «Молекулярное клонирование и характеристика мутантных генов бета-актина человека и дикого типа». Молекулярная и клеточная биология. 4 (10): 1961–9. Дои:10.1128 / mcb.4.10.1961. ЧВК 369012. PMID 6095033.
Нг С.Ю., Ганнинг П., Эдди Р., Понте П., Ливитт Дж., Шоу Т., Кедес Л. (1985). «Эволюция функционального гена бета-актина человека и его мульти-псевдогенного семейства: сохранение некодирующих областей и хромосомная дисперсия псевдогенов». Молекулярная и клеточная биология. 5 (10): 2720–32. Дои:10.1128 / mcb.5.10.2720. ЧВК 367010. PMID 3837182.
Snásel J, Pichová I (1997). «Расщепление белков клетки-хозяина протеазой ВИЧ-1». Folia Biologica. 42 (5): 227–30. Дои:10.1007 / BF02818986. PMID 8997639. S2CID 7617882.
Ганнинг П., Вайнбергер Р., Джеффри П. (апрель 1997 г.). «Изоформы актина и тропомиозина в морфогенезе». Анатомия и эмбриология. 195 (4): 311–5. Дои:10.1007 / s004290050050. PMID 9108196. S2CID 9692297.
Кимура Т., Хашимото И., Нисикава М., Фудзисава Д.И. (1997). «Роль Rev в ассоциации мРНК ВИЧ-1 gag с цитоскелетным бета-актином и экспрессией вирусного белка». Биохимия. 78 (11–12): 1075–80. Дои:10.1016 / S0300-9084 (97) 86732-6. PMID 9150887.
Сентирмай М.Н., Савадого М. (май 2000 г.). «Пространственная организация транскрипции РНК-полимеразы II в ядре». Исследования нуклеиновых кислот. 28 (10): 2019–25. Дои:10.1093 / nar / 28.10.2019. ЧВК 105382. PMID 10773068.
Андерсон Дж. Л., Надежда Т. Дж. (Апрель 2004 г.). «Вспомогательные белки ВИЧ и выживание в клетке-хозяине». Текущие отчеты о ВИЧ / СПИДе. 1 (1): 47–53. Дои:10.1007 / с11904-004-0007-х. PMID 16091223. S2CID 34731265.
Pederson T, Aebi U (ноябрь 2005 г.). «Ядерный актин расширяется, сокращения не видно». Молекулярная биология клетки. 16 (11): 5055–60. Дои:10.1091 / mbc.E05-07-0656. ЧВК 1266405. PMID 16148048.
Перрин Б.Дж., Эрвасти Дж.М. (октябрь 2010 г.). «Семейство генов актина: функция следует изоформе». Цитоскелет. 67 (10): 630–4. Дои:10.1002 / см. 20475. ЧВК 2949686. PMID 20737541.