Эфрин B3 - Ephrin B3

EFNB3
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыEFNB3, EFL6, EPLG8, LERK8, эфрин B3
Внешние идентификаторыOMIM: 602297 MGI: 109196 ГомолоГен: 1076 Генные карты: EFNB3
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение EFNB3
Геномное расположение EFNB3
Группа17p13.1Начните7,705,202 бп[1]
Конец7,711,372 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE EFNB3 205031 в формате fs.png

PBB GE EFNB3 210883 x at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001406

NM_007911

RefSeq (белок)

NP_001397

NP_031937

Расположение (UCSC)Chr 17: 7.71 - 7.71 МбChr 11: 69,55 - 69,56 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Эфрин-В3 это белок что у людей кодируется EFNB3 ген.[5][6]

EFNB3, член эфрин семейство генов, важно как для развития мозга, так и для его поддержания. Рецепторы, связанные с EPH и EPH, составляют самое большое подсемейство рецепторные протеин-тирозинкиназы. Рецепторы EPH обычно имеют один киназа домен и внеклеточная область, содержащая богатый цистеином домен и 2 повтора фибронектина типа III. Лиганды и рецепторы эфрина были названы Номенклатурным комитетом Eph (1997) на основании их структур и взаимосвязей последовательностей. Эфрины делятся на класс эфрина-A (EFNA), которые прикреплены к мембране с помощью гликозилфосфатидилинозитол связь и класс эфрина-B (EFNB), которые являются трансмембранными белками. Лиганды эфрина-B также содержат внутриклеточный хвост с высококонсервативным тирозин остатков и PDZ-связывающий мотив на C-конец.[7] Этот хвост функционирует как механизм обратной передачи сигналов, при котором передача сигналов происходит в клетку, содержащую лиганд, в отличие от клетки с рецептором. При взаимодействии рецептор-лиганд остатки тирозина фосфорилируются, и происходит рекрутирование PDZ домен -содержащие белки.[7] Семейство рецепторов Eph аналогично разделено на две группы на основании сходства последовательностей их внеклеточных доменов и их сродства к связыванию лигандов эфрина-A и эфрина-B.[6]EphrinB3 участвует в опосредовании различных событий развития, особенно в нервная система. Обратная передача сигналов EphrinB3 важна для отсечения аксонов и формирования синапсов и шипов во время постнатального развития нервной системы.[8][9] Предыдущая работа также показала, что передача сигналов через этот лиганд важна для радиальной миграции во время кортикального развития.[8] Более того, уровни экспрессии EFNB3 особенно высоки в нескольких передний мозг субрегионов по сравнению с другими подобластями мозга, и могут играть ключевую роль в функции переднего мозга. Было высказано предположение, что передача сигналов ephrinB3 необходима для синаптическая пластичность происходить в гиппокамп; это подразумевает, что ephrinB3 играет важную роль в обучении и памяти.[9] Совсем недавно было показано, что эфринB3 регулирует пролиферацию нервные стволовые клетки во взрослом субвентрикулярная зона (СВЗ).[8][10]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000108947 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000003934 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Тан XX, Pleasure DE, Ikegaki N (май 1997 г.). «Клонирование кДНК, хромосомная локализация и паттерн экспрессии EPLG8, нового члена семейства генов EPLG, кодирующих лиганды рецепторов протеин-тирозинкиназ, связанных с EPH». Геномика. 41 (1): 17–24. Дои:10.1006 / geno.1997.4615. PMID  9126477.
  6. ^ а б «Энтрез Ген: EFNB3, эфрин-B3».
  7. ^ а б Кляйн, Рюдигер (15 ноября 2012 г.). «Передача сигналов эфрина / эфрина во время развития». Развитие. 139 (22): 4105–9. Дои:10.1242 / dev.074997. PMID  23093422.
  8. ^ а б c Роджер, Дженнифер; Лорена Сальваторе; Паоло Мигани (2012). «Остаться или уйти? Эфс и Эфрин в миграции нейронов». Нейросигналы. 20 (3): 190–201. Дои:10.1159/000333784. PMID  22456188.
  9. ^ а б Хруска, Мартин; Мэтью Б. Далва (2012). «Эфриновая регуляция образования, функции и пластичности синапсов». Молекулярная и клеточная неврология. 50 (1): 35–44. Дои:10.1016 / j.mcn.2012.03.004. ЧВК  3631567. PMID  22449939.
  10. ^ Рикар, Джером; Джессика Салинас; Лиссетт Гарсия; Даниэль Дж. Либл (2006). «EphrinB3 регулирует пролиферацию и выживание клеток в нейрогенезе взрослых». Молекулярная и клеточная неврология. 31 (4): 713–22. Дои:10.1016 / j.mcn.2006.01.002. PMID  16483793. S2CID  206830930.

дальнейшее чтение