PDGFB - PDGFB

PDGFB
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1ПДГ, 3MJG, 4HQU, 4HQX, 4QCI
Идентификаторы
Псевдонимы	PDGFB, IBGC5, PDGF-2, PDGF2, SIS, SSV, c-sis, субъединица B фактора роста тромбоцитов
Внешние идентификаторы	OMIM: 190040 MGI: 97528 ГомолоГен: 74303 Генные карты: PDGFB
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 22 (человек)
Конец	39,244,982 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 15 (мышь)
Конец	80,014,977 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• активность гомодимеризации белков; • активность гетеродимеризации белков; • хемоаттрактантная активность; • связывание с рецептором фактора роста тромбоцитов; • связывание фактора роста тромбоцитов; • супероксид-генерирующая активность активатора НАДФН-оксидазы; • активность фактора роста; • идентичное связывание с белками; • связывание коллагена; • GO: 0001948 связывание с белками; • Активность фактора обмена Ras-гуанил-нуклеотидов; • активность фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфат-3-киназы;
Сотовый компонент	• просвет альфа-гранул тромбоцитов; • цитоплазма; • внеклеточная область; • Мембрана Гольджи; • базолатеральная плазматическая мембрана; • поверхность клетки; • просвет эндоплазматического ретикулума; • мембрана; • внеклеточный матрикс; • внеклеточный; • Просвет Гольджи; • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс;
Биологический процесс	• активация активности протеинкиназы B; • положительная регуляция процесса биосинтеза ДНК; • положительная регуляция хемотаксиса; • клеточный ответ на стимул фактора роста; • положительная регуляция активности протеинтирозинкиназы; • фосфорилирование пептидилтирозина; • положительная регуляция деления клеток; • развитие сердца; • положительная регуляция клубочковой фильтрации; • положительная регуляция митотического деления ядра; • положительная регуляция активности киназы MAP; • положительная регуляция миграции метанефрических мезенхимальных клеток; • положительная регуляция процесса биосинтеза гиалуроновой кислоты; • Каскад MAPK; • фосфорилирование белков; • положительная регуляция пролиферации мезангиальных клеток клубочков; • клеточный ответ на микофеноловую кислоту; • положительное регулирование пролиферации фибробластов; • активация активности протеинкиназы; • развитие многоклеточного организма; • положительная регуляция аутофосфорилирования белков; • положительная регуляция метаболических процессов активных форм кислорода; • метаболический процесс активных форм кислорода; • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • передача сигналов протеинкиназы C; • развитие метанефрических гломерулярных мезангиальных клеток; • отрицательная регуляция процесса биосинтеза фосфатидилинозитола; • ответ на ранение; • положительная регуляция активности фосфатидилинозитол-3-киназы; • хемотаксис клеток; • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2; • дегрануляция тромбоцитов; • положительное регулирование пролиферации клеток; • положительная регуляция репликации ДНК; • положительная регуляция экспрессии генов; • эмбриональное развитие плаценты; • паракринная передача сигналов; • хемотаксис моноцитов; • положительная регуляция пролиферации эндотелиальных клеток; • положительная регуляция передачи сигналов фосфатидилинозитол-3-киназы; • положительное регулирование импорта ионов кальция; • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • фосфорилирование пептидил-серина; • положительное регулирование миграции метанефрических мезенхимальных клеток посредством сигнального пути рецептора бета-фактора роста тромбоцитов; • положительное регулирование миграции эндотелиальных клеток кровеносных сосудов; • кроветворение; • положительное регулирование миграции клеток; • положительная регуляция фосфорилирования пептидилтирозина; • организация внеклеточного матрикса; • отрицательная регуляция связывания белков; • положительное регулирование каскада МАПК; • положительная регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы; • отрицательная регуляция активации тромбоцитов; • фосфатидилинозитол фосфорилирование; • положительное регулирование миграции клеток гладких мышц, связанных с сосудами; • положительный хемотаксис; • отрицательная регуляция дифференцировки клеток гладких мышц сосудов; • сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-18; • положительная регуляция транскрипции pri-miRNA с промотора РНК-полимеразы II; • отрицательная регуляция транскрипции pri-miRNA с промотора РНК-полимеразы II; • отрицательная регуляция экспрессии генов; • положительное регулирование миграции клеток гладких мышц; • положительное регулирование пролиферации гладкомышечных клеток; • положительная регуляция дедифференцировки гладкомышечных клеток сосудов; • сигнальный путь рецептора фактора роста тромбоцитов; • положительное регулирование пролиферации гладкомышечных клеток сосудов; • отрицательная регуляция сигнального пути рецептора фактора роста тромбоцитов-бета; • регуляция рецепторной активности; • положительная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5155
	18591
	ENSG00000100311
	ENSMUSG00000000489
	P01127
	P31240
	NM_033016; NM_002608
	NM_011057
	NP_002599; NP_148937
	NP_035187
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Субъединица В фактора роста тромбоцитов это белок что у людей кодируется PDGFB ген.^[5]^[6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом фактор роста тромбоцитов семья. Четыре члена этого семейства являются митогенными факторами для клеток мезенхимального происхождения и характеризуются мотивом из восьми цистеинов. Этот генный продукт может существовать либо в виде гомодимера (PDGF-BB), либо в виде гетеродимера с тромбоцитарным фактором роста альфа (PDGFA ) полипептид (PDGF-AB), димеры которого связаны дисульфидными связями.

Клиническое значение

Мутации в этом гене связаны с менингиома. Взаимные транслокации между хромосомами 22 и 17 в сайтах, где этот ген и ген для COL1A1 расположены, связаны с определенным типом опухоли кожи, называемым протуберанская дерматофибросаркома в результате нерегулируемой экспрессии фактора роста. Для этого гена были идентифицированы два варианта сплайсинга.^[7]

Смотрите также

Фактор роста тромбоцитов

дальнейшее чтение

Куруп С., Абрамссон А., Ли Дж. П., Линдаль Ю., Кьеллен Л., Бетсгольц С., Герхардт Х., Спиллманн Д. (2006). «Потребность в гепарансульфате в рекрутинге перицитов, опосредованном тромбоцитов фактором роста B». Biochem. Soc. Транс. 34 (Pt 3): 454–5. Дои:10.1042 / BST0340454. PMID 16709185.

Эта статья о ген на хромосома человека 22 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100311 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000489 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid2991848-5] Ратнер Л., Джозефс С.Ф., Джарретт Р., Рейц М.С., Вонг-Стаал Ф. (сентябрь 1985 г.). «Нуклеотидная последовательность трансформирующих клонов c-sis кДНК человека, гомологичных фактору роста тромбоцитов». Нуклеиновые кислоты Res. 13 (14): 5007–18. Дои:10.1093 / nar / 13.14.5007. ЧВК 321845. PMID 2991848.

[pmid1661670-6] Клементс Дж. М., Боуден Л. Дж., Блоксидж Р. Е., Кэтлин Г., Кук А. Л., Крейг С., Драммонд А. Х., Эдвардс Р. М., Фэллон А., Грин Д. Р. (январь 1992 г.). «Два остатка цепи PDGF-B, аргинин 27 и изолейцин 30, опосредуют связывание и активацию рецептора». EMBO J. 10 (13): 4113–20. ЧВК 453161. PMID 1661670.

[7] «Ген Entrez: полипептид бета-фактора роста тромбоцитов PDGFB (гомолог онкогена вируса обезьяньей саркомы (v-sis))».

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

PDGFB - PDGFB

Содержание

Функция

Клиническое значение

Смотрите также

Рекомендации

дальнейшее чтение