Эфрин B1 - Ephrin B1

EFNB1
Идентификаторы
ПсевдонимыEFNB1, CFND, CFNS, EFB1, EFL3, EPLG2, Elk-L, LERK2, эфрин B1
Внешние идентификаторыOMIM: 300035 MGI: 102708 ГомолоГен: 3263 Генные карты: EFNB1
Расположение гена (человек)
Х-хромосома (человек)
Chr.Х-хромосома (человек)[1]
Х-хромосома (человек)
Геномное расположение EFNB1
Геномное расположение EFNB1
ГруппаXq13.1Начинать68,829,021 бп[1]
Конец68,842,160 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE EFNB1 202711 в fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_004429

NM_010110

RefSeq (белок)

NP_004420

NP_034240

Расположение (UCSC)Chr X: 68,83 - 68,84 МбChr X: 99,14 - 99,15 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Эфрин-В1 это белок что у людей кодируется EFNB1 ген.[5][6] Он является членом эфрин семья. Кодируемый белок представляет собой мембранный белок типа I и лиганд Eph-родственного рецепторные тирозинкиназы. Это может сыграть роль в клеточная адгезия и функционируют в развитии или поддержании нервной системы.[7]

Клиническое значение

Мутации в этом белке ответственны за большинство случаев краниофронтоназальный синдром.[8][9][10]

Взаимодействия

EFNB1 был показан взаимодействовать с SDCBP.[11]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000090776 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031217 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Fletcher FA, Huebner K, Shaffer LG, Fairweather ND, Monaco AP, Muller U, Druck T, Simoneaux DK, Chelly J, Belmont JW и др. (Июль 1995 г.). «Отнесение гена (EPLG2), кодирующего высокоаффинный связывающий белок для рецепторной тирозинкиназы Elk, к 200-килобазной парной области в хромосоме Xq12 человека». Геномика. 25 (1): 334–5. Дои:10.1016 / 0888-7543 (95) 80156-Г. PMID  7774950.
  6. ^ Шотелерсук В., Сириван П., Аусаварат С. (март 2006 г.). «Новая мутация в EFNB1, вероятно, с доминирующим отрицательным эффектом, лежащая в основе краниофронтоназального синдрома». Краниофак Нёба J. 43 (2): 152–4. Дои:10.1597/05-014.1. PMID  16526919.
  7. ^ «Энтрез Ген: EFNB1, эфрин-B1».
  8. ^ Виланд I, Вайднер С., Чикконе Р. и др. (Декабрь 2007 г.). «Смежные делеции генов с участием EFNB1, OPHN1, PJA1 и EDA у пациентов с краниофронтоназальным синдромом». Clin. Genet. 72 (6): 506–16. Дои:10.1111 / j.1399-0004.2007.00905.x. PMID  17941886.
  9. ^ Твигг С.Р., Кан Р., Бэббс С., Бочукова Е.Г., Робертсон С.П., Уолл С.А., Моррис-Кей Г.М., Уилки А.О. (июнь 2004 г.). «Мутации эфрина-B1 (EFNB1), маркера формирования границ тканей, вызывают краниофронтоназальный синдром». Proc Natl Acad Sci U S A. 101 (23): 8652–7. Bibcode:2004ПНАС..101.8652Т. Дои:10.1073 / pnas.0402819101. ЧВК  423250. PMID  15166289.
  10. ^ Виланд И., Якубичка С., Мушке П., Коэн М., Тиле Х., Герлах К.Л., Адамс Р.Х., Виккер П. (июнь 2004 г.). «Мутации гена эфрина-B1 вызывают краниофронтоназальный синдром». Am J Hum Genet. 74 (6): 1209–15. Дои:10.1086/421532. ЧВК  1182084. PMID  15124102.
  11. ^ Лин, Д; Gish G D; Songyang Z; Поусон Т. (февраль 1999 г.). «Карбоксильный конец эфринов класса B составляет мотив связывания домена PDZ». J. Biol. Chem. 274 (6): 3726–33. Дои:10.1074 / jbc.274.6.3726. ISSN  0021-9258. PMID  9920925.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P98172 (Эфрин-B1 человека) в PDBe-KB.
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P52795 (Мышь Эфрин-В1) на PDBe-KB.