Эфрин А5 - Ephrin A5

EFNA5
Белок EFNA5 PDB 1shw.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыEFNA5, AF1, EFL5, EPLG7, GLC1M, LERK7, RAGS, эфрин A5
Внешние идентификаторыOMIM: 601535 MGI: 107444 ГомолоГен: 1482 Генные карты: EFNA5
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человек)[1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение EFNA5
Геномное расположение EFNA5
Группа5q21.3Начинать107,376,889 бп[1]
Конец107,670,937 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE EFNA5 214036 в формате fs.png

PBB GE EFNA5 207301 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001962

NM_010109
NM_207654

RefSeq (белок)

NP_001953

NP_034239
NP_997537

Расположение (UCSC)Chr 5: 107,38 - 107,67 МбChr 17: 62,6 - 62,88 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Эфрин А5 это белок что у людей кодируется EFNA5 ген.[5][6][7]

Ephrin A5 - это гликозилфосфатидилинозитол (GPI) -защищенный белок подкласса эфрина-A лиганды эфрина который связывается с подклассом EphA Рецепторы Eph. Также было показано, что эфрин A5 связывается с EphB2 рецептор.[8]

Обратная передача сигналов при выживании конуса роста

«Обратная» передача сигналов - одно из уникальных свойств лигандов эфрина, которое позволяет передавать внутриклеточный сигнал в экспрессирующих эфрин клетках, отличный от сигнала, передаваемого в клетках, экспрессирующих рецептор Eph. Хотя механизм «обратной» передачи сигналов с помощью эфрина-А не совсем понятен, это относительно удивительно, учитывая, что лиганды эфрина-А прикреплены к клеточная мембрана исключительно за счет связи GPI и, в отличие от эфрина-B, отсутствует потенциальный внутриклеточный сигнальный домен. Тем не менее, некоторые лиганды эфрина-A, как известно, инициируют каскады обратной передачи сигналов, такие как эфрин A5, который, как было показано, стимулирует распространение шишки в культурах спинного мозга мышей двигательные нейроны.[9] Было продемонстрировано, что обратная передача сигналов с помощью эфрина A5 является GPI-зависимой, поскольку устранение всех связей GPI путем применения фосфатидлинозитол-специфичного фосфолипаза C отменил положительное влияние эфрина А5 на распространение конуса роста. Кроме того, было показано, что рецепторы EphA оказывают противоположное действие на ростовые конусы моторных нейронов за счет уменьшения размера конусов роста.

Формирование ретинотопической карты

Этот вывод о том, что эфрин A5 способствует выживанию конусов роста, что противоположно передаче сигналов EphA и непосредственно опосредуется обратной передачей сигналов эфрина A5, имеет важное значение для управление аксоном поскольку он обеспечивает механизм, с помощью которого мигрирующие аксоны, экспрессирующие EphAs, будут предпочтительно избегать клеток, экспрессирующих эфрин A5, и, возможно, мигрировать к клеткам с более низкой экспрессией эфрина A5.[9] Фактически, этот механизм является тем же механизмом, который обеспечивает руководство ганглиозные клетки сетчатки в отдельные регионы в верхний холмик во время формирования ретинотопный карта. Высокая экспрессия эфрина A5 на клетках задний область SC связывается с EphAs, экспрессируемыми в RGC, мигрирующих из височной сетчатки, вызывая коллапс конуса роста и отталкивая эти RGC от задней SC к области низкой экспрессии эфрина A5 в сетчатке. передний SC.[10]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000184349 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000048915 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Cerretti DP, Copeland NG, Gilbert DJ, Jenkins NA, Kuefer MU, Valentine V, Shapiro DN, Cui X, Morris SW (сентябрь 1996 г.). «Ген, кодирующий LERK-7 (EPLG7, Epl7), лиганд для Eph-родственных рецепторных тирозинкиназ, отображается на хромосоме 5 человека в полосе q21 и на хромосоме 17 мыши». Геномика. 35 (2): 376–9. Дои:10.1006 / geno.1996.0371. PMID  8661153.
  6. ^ Козлоски CJ, VandenBos T, Park L, Cerretti DP, Carpenter MK (октябрь 1997 г.). «LERK-7: лиганд киназ, связанных с Eph, регулируется в мозге в процессе развития». Цитокин. 9 (8): 540–9. Дои:10.1006 / cyto.1997.0199. PMID  9245480.
  7. ^ «Энтрез Ген: EFNA5, эфрин-А5».
  8. ^ Химанен Дж. П., Чамли М. Дж., Лакманн М., Ли К., Бартон В. А., Джеффри П. Д., Веринг С., Гелейк Д., Фельдхейм Д. А., Бойд А. В., Хенкемейер М., Николов Д. Б. (май 2004 г.). «Отталкивающая дискриминация классов: эфрин-A5 связывается и активирует передачу сигналов рецептора EphB2». Nat. Неврологи. 7 (5): 501–9. Дои:10.1038 / nn1237. PMID  15107857. S2CID  15643420.
  9. ^ а б Марквардт Т., Ширасаки Р., Гош С., Эндрюс С.Е., Картер Н., Хантер Т., Пфафф С.Л. (апрель 2005 г.). «Коэкспрессированные рецепторы EphA и лиганды эфрина-A опосредуют противоположные действия по навигации конусов роста из разных мембранных доменов». Клетка. 121 (1): 127–39. Дои:10.1016 / j.cell.2005.01.020. PMID  15820684. S2CID  16818608.
  10. ^ Дрешер Ю., Кремозер С., Хандверкер С., Лешингер Дж., Нода М., Бонхёффер Ф. (август 1995 г.). «Направление in vitro аксонов ганглиозных клеток сетчатки с помощью RAGS, тектального белка 25 кДа, связанного с лигандами тирозинкиназ рецептора Eph». Клетка. 82 (3): 359–70. Дои:10.1016/0092-8674(95)90425-5. PMID  7634326. S2CID  2537692.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P52803 (Эфрин-A5 человека) в PDBe-KB.
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: O08543 (Мышь Эфрин-А5) на PDBe-KB.