Миотонин-протеинкиназа - Myotonin-protein kinase

ДМПК
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыДМПК, DM, DM1, DM1PK, DMK, MDPK, MT-PK, Dm15, протеинкиназа dystrophia myotonica, протеинкиназа DM1
Внешние идентификаторыOMIM: 605377 MGI: 94906 ГомолоГен: 3247 Генные карты: ДМПК
Расположение гена (человек)
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человек)[1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное расположение DMPK
Геномное расположение DMPK
Группа19q13.32Начинать45,769,717 бп[1]
Конец45,782,552 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE DMPK 37996 s в формате fs.png

PBB GE DMPK 217661 x at fs.png

PBB GE DMPK 217066 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001190490
NM_001190491
NM_032418
NM_001374651
NM_001379257

RefSeq (белок)

NP_001177419
NP_001177420
NP_115794
NP_001361580
NP_001366186

Расположение (UCSC)Chr 19: 45.77 - 45.78 МбChr 7: 19.08 - 19.09 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Миотонин-протеинкиназа (MT-PK) также известный как протеинкиназа миотонической дистрофии (МДПК) или протеинкиназа миотонической дистрофии (ДМПК) - это фермент что у людей кодируется ДМПК ген.[5][6][7]

Продукт гена dmpk представляет собой протеинкиназу Ser / Thr, гомологичную р21-активируемым киназам MRCK и киназам семейства Rho.[8] Данные, полученные с использованием антител, которые обнаруживают определенные изоформы DMPK, показывают, что наиболее распространенной изоформой DMPK является белок массой 80 кДа, экспрессируемый почти исключительно в гладких, скелетных и сердечных мышцах.[9] Эта киназа существует как в ассоциированной с мембраной, так и в растворимой форме в образцах левого желудочка человека. Различные С-концы DMPK, которые возникают в результате альтернативного сплайсинга, определяют его локализацию в эндоплазматическом ретикулуме, митохондриях или цитозоле в трансфицированных клетках COS-1.[10] Среди субстратов для DMPK, предложенных исследованиями in vitro, есть фосфолемман, дигидропиридиновый рецептор и субъединица нацеливания на миозинфосфатазу. Однако демонстрация in vivo фосфорилирования этих субстратов с помощью DMPK еще предстоит установить, и связь между этими субстратами и клиническими проявлениями миотонической дистрофии (DM) неясна.[11][12]

Функция

Миотонин-протеинкиназа - это серин-треонинкиназа который тесно связан с другими киназами, которые взаимодействуют с членами Семья Ро малых GTPases. Субстраты для этого фермента включают: миогенин, то бета-субъединица из Кальциевые каналы L-типа, и фосфолемман.[7] Хотя конкретная функция этого белка неизвестна, он, по-видимому, играет важную роль в клетках мышц, сердца и мозга. Этот белок может участвовать в коммуникации внутри клеток. Он также регулирует производство и функцию важных структур внутри мышечных клеток, взаимодействуя с другими белками. Например, было показано, что протеинкиназа миотонической дистрофии выключает (ингибирует) часть мышечного белка, называемого миозинфосфатазой. Миозинфосфатаза - это фермент, который играет роль в напряжении (сокращении) и расслаблении мышц.[13]

Структура

Протеинкиназа Dystrophia myotonica (DMPK) - серин / треониновая киназа, состоящая из домена киназы и домена спиральной спирали, участвующих в мультимеризации. Кристаллическая структура киназного домена DMPK, связанного с ингибитором бисиндолилмалеимидом VIII (BIM-8), выявила димерный фермент, связанный с консервативным доменом димеризации. Сродство димеризации предполагает, что одного киназного домена недостаточно для димеризации in vivo и что домены спиральной спирали необходимы для образования стабильного димера. Киназный домен находится в активной конформации, с полностью упорядоченной и правильно расположенной спиралью а-С, и каталитическими остатками в конформации, компетентной для катализа. Консервативный гидрофобный мотив на С-концевом удлинении киназного домена связан с N-концевой долей киназного домена, несмотря на то, что он нефосфорилирован.[14]

Клиническое значение

3'-нетранслируемая область этого гена содержит 5-37 копий тринуклеотидного повтора CTG. Распространение этого нестабильного мотива до 50-5000 экземпляров вызывает миотоническая дистрофия тип I, серьезность которого возрастает с увеличением числа копий повторяющегося элемента. Расширение повторов связано с конденсацией локальной структуры хроматина, которая нарушает экспрессию генов в этой области. По мере репликации повтора DMPK образуемая шпилька приводит к расширению (а) или сокращению (b) повтора.[7]

Повторы CTG расположены в 3 'UTR гена DMPK. Повторы сокращаются или расширяются за счет образования петель шпильки.

Миотоническая дистрофия (СД) 1 - это аутосомно-доминантное нервно-мышечное заболевание, которым страдает примерно 1 человек из 8000. У больных наблюдается широкий спектр симптомов, включая миотонию, слабость и истощение скелетных мышц, нарушения сердечной проводимости и катаракту. Несмотря на клонирование локуса, сложный фенотип заболевания DM оказался трудным для интерпретации, и точная роль DMPK в патогенезе DM остается неясной.[15]

Взаимодействия

Было показано, что протеинкиназа миотонической дистрофии взаимодействовать с HSPB2[16][17] и RAC1.[18]

Регулирование

Тесная связь DMPK с Rho-киназами привела к предположениям, может ли активность DMPK регулироваться in vivo небольшими G-белками, особенно из семейства Rho. Хотя у DMPK отсутствуют очевидные сайты связывания для известного G, олигомеры DMPK-1 проявляют низкую базальную каталитическую активность из-за присутствия C-концевого аутоингибиторного домена (AI). Протеаза (P) внутри мембраны расщепляет DMPK-1, удаляя C-концевой аутоингибиторный домен и домены ассоциации с мембраной и высвобождая цитозольный базально активный DMPK-2. Это событие обработки вызовет долгосрочную активацию киназы. Кратковременная активация DMPK-1 и -2 может быть опосредована временным взаимодействием с небольшой GTPase (G).

Была предложена общая модель, которая учитывает олигомеризацию, процессинг и регулирование DMPK. В этой модели временная активация киназной активности будет происходить в ответ на вторичные мессенджеры G-белка, в то время как долговременная активация DMPK может быть опосредована мембранно-ассоциированной протеазой, которая расщепляет DMPK-1 с высвобождением цитозольного DMPK-2 в постоянно активированной форме. Было показано, что стойкая активация серин / треониновых киназ играет роль в определении судьбы клеток, а также в производстве памяти в нервной системе. В этом отношении DMPK может быть похож на PKA и PKC, две киназы, которые могут временно активироваться в ответ на вторичные мессенджеры или постоянно активироваться протеолитическим удалением аутоингибиторного домена. Таким образом, эта модель предполагает, что две эндогенные формы DMPK могут обладать разными активностями, локализацией, регуляторами и субстратами и выполнять разные физиологические функции.[15][19]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000104936 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030409 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Махадеван М., Цилфидис С., Сабурин Л., Шатлер Г., Амемия С., Янсен Г., Невилл С., Наранг М., Барсело Дж., О'Хой К. (март 1992 г.). «Мутация миотонической дистрофии: нестабильный CTG-повтор в 3'-нетранслируемой области гена». Наука. 255 (5049): 1253–5. Bibcode:1992Научный ... 255.1253M. Дои:10.1126 / science.1546325. PMID  1546325.
  6. ^ Fu YH, Pizzuti A, Fenwick RG, King J, Rajnarayan S, Dunne PW, Dubel J, Nasser GA, Ashizawa T., de Jong P (март 1992 г.). «Нестабильный тройной повтор в гене, относящемся к миотонической мышечной дистрофии». Наука. 255 (5049): 1256–8. Bibcode:1992 Наука ... 255.1256F. Дои:10.1126 / science.1546326. PMID  1546326.
  7. ^ а б c "Ген Entrez: DMPK dystrophia myotonica-протеинкиназа".
  8. ^ Амано М., Чихара К., Накамура Н., Канеко Т., Мацуура Ю., Кайбути К. (ноябрь 1999 г.). «СООН-конец Rho-киназы негативно регулирует активность rho-киназы». Журнал биологической химии. 274 (45): 32418–24. Дои:10.1074 / jbc.274.45.32418. PMID  10542285.
  9. ^ Лам Л.Т., Фам Ю.К., Нгуен Т.М., Моррис Г.Э. (сентябрь 2000 г.). «Характеристика панели моноклональных антител показывает, что протеинкиназа миотонической дистрофии, DMPK, экспрессируется почти исключительно в мышцах и сердце». Молекулярная генетика человека. 9 (14): 2167–73. Дои:10.1093 / hmg / 9.14.2167. PMID  10958655.
  10. ^ Wansink DG, van Herpen RE, Coerwinkel-Driessen MM, Groenen PJ, Hemmings BA, Wieringa B (август 2003 г.). «Альтернативный сплайсинг контролирует структуру протеинкиназы миотонической дистрофии, ферментативную активность и субклеточную локализацию». Молекулярная и клеточная биология. 23 (16): 5489–501. Дои:10.1128 / mcb.23.16.5489-5501.2003. ЧВК  166319. PMID  12897125.
  11. ^ Тимченко Л., Настаинчик В., Шнайдер Т., Патель Б., Хофманн Ф., Caskey CT (июнь 1995 г.). «Полноразмерная миотониновая протеинкиназа (72 кДа) проявляет активность серинкиназы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (12): 5366–70. Bibcode:1995PNAS ... 92.5366T. Дои:10.1073 / пнас.92.12.5366. ЧВК  41695. PMID  7777513.
  12. ^ Калиман П., Каталуччи Д., Лам Дж. Т., Кондо Р., Гутьеррес Дж. К., Редди С., Паласин М., Зорзано А., Чиен К. Р., Руис-Лозано П. (март 2005 г.). «Миотоническая дистрофическая протеинкиназа фосфорилирует фосфоламбан и регулирует поглощение кальция в саркоплазматическом ретикулуме кардиомиоцитов». Журнал биологической химии. 280 (9): 8016–21. Дои:10.1074 / jbc.M412845200. PMID  15598648.
  13. ^ «Ген ДМПК». Национальные институты здоровья.
  14. ^ Элкинс Дж. М., Амос А., Нисен Ф. Х., Пайк А. С., Федоров О., Кнапп С. (апрель 2009 г.). «Структура протеинкиназы dystrophia myotonica». Белковая наука. 18 (4): 782–91. Дои:10.1002 / pro.82. ЧВК  2762590. PMID  19309729.
  15. ^ а б Буш Э. У., Хельмке С. М., Бирнбаум Р. А., Перриман МБ (июль 2000 г.). «Домены протеинкиназы миотонической дистрофии опосредуют локализацию, олигомеризацию, новую каталитическую активность и аутоингибирование». Биохимия. 39 (29): 8480–90. Дои:10.1021 / bi992142f. PMID  10913253.
  16. ^ Судзуки А., Сугияма Й, Хаяси Й, Нью-и Н, Йошида М., Нонака И., Ишиура С., Арахата К., Оно С. (март 1998 г.). «MKBP, новый член небольшого семейства белков теплового шока, связывает и активирует протеинкиназу миотонической дистрофии». Журнал клеточной биологии. 140 (5): 1113–24. Дои:10.1083 / jcb.140.5.1113. ЧВК  2132705. PMID  9490724.
  17. ^ Sugiyama Y, Suzuki A, Kishikawa M, Akutsu R, Hirose T, Waye MM, Tsui SK, Yoshida S, Ohno S (январь 2000 г.). «Мышцы развивают специфическую форму небольшого комплекса белков теплового шока, состоящего из MKBP / HSPB2 и HSPB3, во время миогенной дифференцировки». Журнал биологической химии. 275 (2): 1095–104. Дои:10.1074 / jbc.275.2.1095. PMID  10625651.
  18. ^ Симидзу М., Ван В., Вальч Э. Т., Данн П. В., Эпштейн Х. Ф. (июнь 2000 г.). «Киназы Rac-1 и Raf-1, компоненты различных сигнальных путей, активируют протеинкиназу миотонической дистрофии». Письма FEBS. 475 (3): 273–7. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 01692-6. PMID  10869570. S2CID  46238883.
  19. ^ Эдлунд Т., Джесселл Т.М. (январь 1999 г.). «Прогресс от внешней к внутренней передаче сигналов в спецификации клеточной судьбы: взгляд со стороны нервной системы». Клетка. 96 (2): 211–24. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 80561-9. PMID  9988216. S2CID  15113604.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка