ТАНК-связывающая киназа 1 - TANK-binding kinase 1

TBK1
TBK1 .png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTBK1, Tbk1, 1200008B05Rik, AI462036, AW048562, NAK, T2K, FTDALS4, TANK-связывающая киназа 1, IIAE8
Внешние идентификаторыOMIM: 604834 MGI: 1929658 ГомолоГен: 22742 Генные карты: TBK1
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человек)[1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение TBK1
Геномное расположение TBK1
Группа12q14.2Начните64,452,092 бп[1]
Конец64,502,114 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TBK1 218520 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_013254

NM_019786

RefSeq (белок)

NP_037386

NP_062760

Расположение (UCSC)Chr 12: 64,45 - 64,5 МбChr 10: 121,55 - 121,59 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

TBK1 (TANK-связывающая киназа 1) является фермент с участием киназа Мероприятия. В частности, это серин / треонин протеинкиназа.[5] Он кодируется TBK1 ген в людях.[6] Эта киназа в основном известна своей ролью в врожденный иммунитет противовирусный ответ. Однако TBK1 также регулирует распространение клеток, апоптоз, аутофагия, и анти-опухоль иммунитет.[5] Недостаточная регуляция активности TBK1 приводит к аутоиммунный, нейродегенеративный болезни или онкогенез.[7][8]

Структура и регулирование деятельности

TBK1 - неканоническая киназа IKK, которая фосфорилаты ядерный фактор kB (NFkB). Он разделяет гомология последовательностей с каноническим ИКК.[5]

В N-конец белка содержит киназный домен (регион 9-309) и убиквитин -подобный домен (регион 310-385). В C-конец состоит из двух спиральная катушка структуры (области 407-713), которые обеспечивают поверхность для гомодимеризация.[5][6]

В аутофосфорилирование из серин 172, что требует гомодимеризации и убиквитинилирования лизины 30 и 401, необходим для активности киназы.[9]

Участие в сигнальных путях

TBK1 участвует во многих сигнальные пути и образует узел между ними. По этой причине необходима регуляция его участия в индивидуальных сигнальных путях. Это обеспечивается адаптерные белки которые взаимодействуют с доменом димеризации TBK1, чтобы определить его местоположение и доступ к субстраты. Привязка к TANK приводит к локализации на перинуклеарная область и фосфорилирование субстратов, которое необходимо для последующего производства типа I интерфероны (INF-I). Напротив, привязка к NAP1 и СИНТБАД приводит к локализации в цитоплазма и участие в аутофагия. Другой адаптерный белок, определяющий расположение TBK1, - это ЛЕНТА. TAPE нацелен на TBK1 эндолизосомы.[5]

Ключевой интерес к TBK1 связан с его ролью в врожденный иммунитет, особенно в антивирусных реакциях. TBK1 дублируется с ИКК[необходимо разрешение неоднозначности ], но TBK1, кажется, играет более важную роль. После запуска противовирусной передачи сигналов через PRR (рецепторы распознавания образов ), TBK1 активирован. Впоследствии он фосфорилирует фактор транскрипции. IRF3, который перемещается в ядро, и способствует производству INF-I.[7]

Как неканонический IKK, TBK1 также участвует в неканоническом NFkB путь. Фосфорилирует p100 / NF-κB2, который впоследствии обрабатывается в протеасома и выпущен как p52 субъединица. Это подразделение димеризуется с RelB и посредниками экспрессия гена.[10]

В каноническом пути NFkB комплекс белков NF-каппа-B (NFKB) ингибируется I-каппа-B (ИКБ ) белки, которые инактивируют NFKB, улавливая его в цитоплазма. Фосфорилирование сериновых остатков на белках IKB киназами IKB отмечает их разрушение через убиквитинирование путь, тем самым позволяя активацию и ядерную транслокацию комплекса NFKB. Белок, кодируемый этим геном, похож на киназы IKB и может опосредовать активацию NFkB в ответ на определенные факторы роста.[6]

TBK1 продвигает аутофагия вовлечены в патоген и митохондриальный оформление. Фосфорилаты TBK1 аутофагия рецепторы [11][12][13] и компоненты аппарата аутофагии. [14][15] Кроме того, TBK1 также участвует в регуляции распространение клеток, апоптоз и глюкоза метаболизм.[10]

Взаимодействия

Было показано, что TANK-связывающая киназа 1 взаимодействовать с участием:

Факторы транскрипции, активируемые при активации TBK1, включают: IRF3, IRF7 [21] и ZEB1.[22]

Клиническое значение

Дерегуляция активности TBK1 и мутации с этим белком связаны со многими заболеваниями. Из-за роли TBK1 в выживаемость клеток дерегулирование его деятельности связано с онкогенез.[8] Также много аутоиммунный (например., ревматоидный артрит, симпатичный волчанка ), нейродегенеративный (например., боковой амиотрофический склероз ) и инфантильные (например, герпесвирусный энцефалит ) болезней.[9][7]

Потеря TBK1 приводит к гибели эмбрионов у мышей.[21]

Подавление IκB киназа (IKK) и IKK-родственные киназы, ИКБКЕ (IKKε) и TANK-связывающая киназа 1 (TBK1) была исследована в качестве терапевтического варианта для лечения воспалительные заболевания и рак.[23]

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000183735 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020115 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c d е Helgason E, Phung QT, Dueber EC (апрель 2013 г.). «Недавние исследования сложности сигнальных сетей Tank-связывающей киназы 1: новая роль клеточной локализации в активации и субстратной специфичности TBK1». Письма FEBS. 587 (8): 1230–7. Дои:10.1016 / j.febslet.2013.01.059. PMID  23395801.
  6. ^ а б c «Ген Entrez: TBK1 TANK-связывающая киназа 1».
  7. ^ а б c Луи С., Бернс К., Уикс I (2018-03-06). «Ответы, зависимые от TANK-связывающей киназы 1, в состоянии здоровья и аутоиммунитета». Границы иммунологии. 9: 434. Дои:10.3389 / fimmu.2018.00434. ЧВК  5845716. PMID  29559975.
  8. ^ а б Круз В.Х., Бреккен Р.А. (март 2018 г.). «Оценка TANK-связывающей киназы 1 как терапевтической мишени при раке». Журнал сотовой связи и сигнализации. 12 (1): 83–90. Дои:10.1007 / s12079-017-0438-у. ЧВК  5842199. PMID  29218456.
  9. ^ а б Оукс Дж. А., Дэвис М. С., Коллинз Миссури (февраль 2017 г.). «TBK1: новый игрок в БАС, связывающий аутофагию и нейровоспаление». Молекулярный мозг. 10 (1): 5. Дои:10.1186 / s13041-017-0287-х. ЧВК  5288885. PMID  28148298.
  10. ^ а б Дюран Дж. К., Чжан К., Болдуин А. С. (сентябрь 2018 г.). «Роль IKK-связанных киназ TBK1 и IKKε в раке». Клетки. 7 (9): 139. Дои:10.3390 / ячейки7090139. ЧВК  6162516. PMID  30223576.
  11. ^ фон Мухлинен, Наталья; Терстон, Тереза; Рыжаков, Григорий; Блур, Стюарт; Рандоу, Феликс (февраль 2010 г.). «NDP52, новый рецептор аутофагии для декорированных убиквитином цитозольных бактерий». Аутофагия. 6 (2): 288–289. Дои:10.4161 / авто.6.2.11118. ISSN  1554-8635. PMID  20104023. S2CID  1059428.
  12. ^ Пилли, Манохар; Арко-Менса, Иоанн; Понпуак, Мариса; Робертс, Эстебан; Мастер, Шэрон; Mandell, Michael A .; Дюпон, Николас; Орнатовский, Войцех; Цзян, Шанья; Bradfute, Стивен Б .; Бруун, Джек-Ансгар (24.08.2012). «TBK-1 способствует опосредованной аутофагией антимикробной защите, контролируя созревание аутофагосом». Иммунитет. 37 (2): 223–234. Дои:10.1016 / j.immuni.2012.04.015. ISSN  1097-4180. ЧВК  3428731. PMID  22921120.
  13. ^ Рихтер, Бенджамин; Sliter, Danielle A .; Херхаус, Лина; Штольц, Александра; Ван, Чуньсинь; Бели, Петра; Заффаньини, Габриэле; Вайлд, Филипп; Мартенс, Саша; Вагнер, Себастьян А .; Юл, Ричард Дж. (2016-04-12). «Фосфорилирование OPTN с помощью TBK1 усиливает его связывание с цепями Ub и способствует селективной аутофагии поврежденных митохондрий». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 113 (15): 4039–4044. Bibcode:2016PNAS..113.4039R. Дои:10.1073 / pnas.1523926113. ISSN  1091-6490. ЧВК  4839414. PMID  27035970.
  14. ^ Кумар, Суреш; Гу, Юэси; Абуду, княжеский Якубу; Бруун, Джек-Ансгар; Джайн, ашиш; Фарзам, Фарзин; Мадд, Михал; Анонсен, Ян Хауг; Рустен, Тор Эрик; Касоф, Гэри; Ктистакис, Николай (04 08, 2019). «Фосфорилирование синтаксина 17 TBK1 контролирует инициирование аутофагии». Клетка развития. 49 (1): 130–144.e6. Дои:10.1016 / j.devcel.2019.01.027. ISSN  1878-1551. ЧВК  6907693. PMID  30827897. Проверить значения даты в: | дата = (Помогите)
  15. ^ Херхаус, Лина; Бхаскара, Рамачандра М; Листад, Альф Хокон; Гештал-Мато, Уксия; Коваррубиас ‐ Пинто, Адриана; Бонн, Флориан; Симонсен, Энн; Хаммер, Герхард; Дикич, Иван (07.01.2020). «TBK1-опосредованное фосфорилирование LC3C и GABARAP-L2 контролирует отщепление аутофагосом протеазой ATG4». Отчеты EMBO. 21 (1): e48317. Дои:10.15252 / наб.201948317. ISSN  1469-221X. ЧВК  6945063. PMID  31709703.
  16. ^ Чжоу М.М., Ханафуса Х. (март 1995 г.). «Новый лиганд для доменов SH3. Адаптерный белок Nck связывается с серин / треониновой киназой через домен SH3». Журнал биологической химии. 270 (13): 7359–64. Дои:10.1074 / jbc.270.13.7359. PMID  7706279.
  17. ^ Померанц Дж. Л., Балтимор Д. (декабрь 1999 г.). «Активация NF-kappaB сигнальным комплексом, содержащим TRAF2, TANK и TBK1, новую IKK-родственную киназу». Журнал EMBO. 18 (23): 6694–704. Дои:10.1093 / emboj / 18.23.6694. ЧВК  1171732. PMID  10581243.
  18. ^ а б Bouwmeester Т., Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K и др. (Февраль 2004 г.). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Природа клеточной биологии. 6 (2): 97–105. Дои:10.1038 / ncb1086. PMID  14743216. S2CID  11683986.
  19. ^ Боннар М., Мирцос С., Сузуки С., Грэм К., Хуанг Дж., Нг М. и др. (Сентябрь 2000 г.). «Дефицит T2K приводит к апоптотической дегенерации печени и нарушению транскрипции NF-kappaB-зависимого гена». Журнал EMBO. 19 (18): 4976–85. Дои:10.1093 / emboj / 19.18.4976. ЧВК  314216. PMID  10990461.
  20. ^ «TANK-связывающая киназа 1-связывающий белок 1». UniProt. Получено 30 июн 2018.
  21. ^ а б Икеда Ф., Хеккер С.М., Розенкноп А., Нордмайер Р.Д., Рогов В., Хофманн К. и др. (Июль 2007 г.). «Участие убиквитиноподобного домена киназ TBK1 / IKK-i в регуляции IFN-индуцибельных генов». Журнал EMBO. 26 (14): 3451–62. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601773. ЧВК  1933404. PMID  17599067.
  22. ^ Лю В., Хуан Ю. Дж., Лю Ц., Ян Ю. Ю., Лю Х., Цуй Дж. Г. и др. (Апрель 2014 г.). «Ингибирование TBK1 ослабляет радиационно-индуцированный эпителиально-мезенхимальный переход клеток рака легкого человека A549 посредством активации GSK-3β и репрессии ZEB1». Лабораторные исследования; Журнал технических методов и патологии. 94 (4): 362–70. Дои:10.1038 / labinvest.2013.153. PMID  24468793.
  23. ^ Ллона-Мингез С., Байгет Дж., Маккей С.П. (июль 2013 г.). «Низкомолекулярные ингибиторы киназы IκB (IKK) и IKK-родственных киназ». Фармацевтический патентный аналитик. 2 (4): 481–98. Дои:10.4155 / п.п. 13.31. PMID  24237125.

дальнейшее чтение