PRKAB1 - Википедия - PRKAB1
5'-AMP-активированная субъединица протеинкиназы бета-1 является фермент что у людей кодируется ПРКАБ1 ген.[5][6]
Белок, кодируемый этим геном, является регуляторной субъединицей АМФ-активированная протеинкиназа (АМПК). AMPK представляет собой гетеротример, состоящий из альфа-каталитической субъединицы и некаталитических бета- и гамма-субъединиц. AMPK - важный чувствительный к энергии фермент, который контролирует энергетический статус клеток. В ответ на клеточные метаболические стрессы AMPK активируется и, следовательно, фосфорилаты и инактивирует ацетил-КоА карбоксилаза (ACC) и бета-гидрокси-бета-метилглутарил-КоА редуктаза (HMGCR), ключевые ферменты, участвующие в регуляции биосинтеза de novo жирная кислота и холестерин. Эта субъединица может быть положительным регулятором активности AMPK. В миристоилирование и фосфорилирование этой субъединицы, как было показано, влияет на активность фермента и клеточную локализацию AMPK. Эта субъединица может также служить адаптерной молекулой, опосредующей ассоциацию комплекса AMPK.[6]
Модельные организмы
| Характеристика | Фенотип |
|---|---|
| Гомозигота жизнеспособность | Нормальный |
| Рецессивный смертельное исследование | Нормальный |
| Плодородие | Нормальный |
| Масса тела | Нормальный |
| Беспокойство | Нормальный |
| Неврологический осмотр | Нормальный |
| Сила захвата | Нормальный |
| Горячая тарелка | Нормальный |
| Дисморфология | Нормальный |
| Косвенная калориметрия | Нормальный |
| Тест толерантности к глюкозе | Аномальный[7] |
| Слуховой ответ ствола мозга | Нормальный |
| DEXA | Нормальный |
| Рентгенография | Нормальный |
| Температура тела | Нормальный |
| Морфология глаза | Нормальный |
| Клиническая химия | Аномальный[8] |
| Плазма иммуноглобулины | Аномальный |
| Гематология | Аномальный[9] |
| Лимфоциты периферической крови | Нормальный |
| Микроядерный тест | Нормальный |
| Вес сердца | Нормальный |
| Гистопатология глаз | Нормальный |
| Сальмонелла инфекционное заболевание | Нормальный[10] |
| Citrobacter инфекционное заболевание | Нормальный[11] |
| Все тесты и анализы от[12][13] |
Модельные организмы были использованы при изучении функции PRKAB1. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Пркаб1tm1a (КОМП) Wtsi[14][15] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.[16][17][18]
Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[12][19] Было проведено двадцать пять испытаний мутант мышей и четыре значительных отклонения от нормы.[12] Отображены гомозиготные мутантные самцы нарушенной толерантности к глюкозе. Животные обоего пола имели повышенную циркуляцию крови. билирубин уровни, повышенные уровни IgG3 и ряд атипичных гематология параметры.[12]
Взаимодействия
PRKAB1 был показан взаимодействовать с ПРКАГ2[20] и ПРКАГ1.[20]
Домен взаимодействия бета-субъединицы 5'-АМФ-активированной протеинкиназы (AMPKBI) представляет собой консервативный домен, обнаруженный в бета-субъединице комплекса 5-АМФ-активированной протеинкиназы, и его дрожжи гомологи Sip1 (SNF1-взаимодействующий белок 1), Sip2 (SNF1-взаимодействующий белок 2) и Gal83 (метаболизм галактозы 83), которые обнаруживаются в SNF1 (сахароза неферментирующая) киназа сложный.[21] Этой области достаточно для взаимодействия этой субъединицы с киназным комплексом, но она не несет единоличной ответственности за взаимодействие, и партнер по взаимодействию неизвестен.[22]
| AMPKBI | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | AMPKBI | ||||||||
| Pfam | PF04739 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR006828 | ||||||||
| |||||||||
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000111725 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029513 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Стэплтон Д., Митчелхилл К.И., Гао Дж., Видмер Дж., Мичелл Б.Дж., Те Т., Хаус К.М., Фернандес С.С., Кокс Т., Виттерс Л.А., Кемп Б.Е. (февраль 1996 г.). «Подсемейство AMP-активированных протеинкиназ млекопитающих». J Biol Chem. 271 (2): 611–4. Дои:10.1074 / jbc.271.2.611. PMID 8557660.
- ^ а б «Ген Entrez: протеинкиназа PRKAB1, AMP-активированная, некаталитическая субъединица бета-1».
- ^ «Данные теста на толерантность к глюкозе для Пркаб1». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ «Данные клинической химии для Пркаб1». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ «Гематологические данные для Пркаб1». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ "Сальмонелла данные о заражении Prkab1 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ "Citrobacter данные о заражении Prkab1 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ а б c d Гердин А.К. (2010). «Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
- ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
- ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
- ^ "Информатика генома мыши".
- ^ Skarnes, W. C .; Rosen, B .; West, A. P .; Koutsourakis, M .; Бушелл, Вт .; Iyer, V .; Mujica, A.O .; Thomas, M .; Harrow, J .; Cox, T .; Джексон, Д .; Severin, J .; Biggs, P .; Fu, J .; Нефедов, М .; Де Йонг, П. Дж .; Стюарт, А. Ф .; Брэдли, А. (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК 3572410. PMID 21677750.
- ^ Долгин Э (2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
- ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (2007). «Мышь на все случаи жизни». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
- ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК 3218837. PMID 21722353.
- ^ а б Cheung, P C; Соль I P; Дэвис С. П.; Hardie DG; Карлинг Д. (март 2000 г.). «Характеристика изоформ гамма-субъединиц AMP-активированной протеинкиназы и их роль в связывании AMP». Biochem. J. 346 (3): 659–69. Дои:10.1042/0264-6021:3460659. ISSN 0264-6021. ЧВК 1220898. PMID 10698692.
- ^ Гао Г., Фернандес С.С., Стэплтон Д., Остер А.С., Видмер Дж., Дайк Дж. Р., Кемп Б. Е., Виттерс Л. А. (апрель 1996 г.). «Некаталитические изоформы бета- и гамма-субъединиц 5'-AMP-активированной протеинкиназы». J. Biol. Chem. 271 (15): 8675–81. Дои:10.1074 / jbc.271.15.8675. PMID 8621499.
- ^ Ян X, Цзян Р., Карлсон М. (декабрь 1994 г.). «Семейство белков, содержащих консервативный домен, который опосредует взаимодействие с дрожжевым протеинкиназным комплексом SNF1». EMBO J. 13 (24): 5878–86. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06933.x. ЧВК 395563. PMID 7813428.
дальнейшее чтение
- Карлинг Д. (2004). «Каскад AMP-активируемых протеинкиназ - объединяющая система для контроля энергии». Trends Biochem. Наука. 29 (1): 18–24. Дои:10.1016 / j.tibs.2003.11.005. PMID 14729328.
- Гао Г., Фернандес С.С., Стэплтон Д. и др. (1996). «Некаталитические изоформы бета- и гамма-субъединиц 5'-AMP-активированной протеинкиназы». J. Biol. Chem. 271 (15): 8675–81. Дои:10.1074 / jbc.271.15.8675. PMID 8621499.
- Вудс А., Чунг П.С., Смит Ф.К. и др. (1996). «Характеристика AMP-активированных протеинкиназ бета и гамма субъединиц. Сборка гетеротримерного комплекса in vitro». J. Biol. Chem. 271 (17): 10282–90. Дои:10.1074 / jbc.271.48.30517. PMID 8626596.
- Дайк Дж. Р., Гао Дж., Видмер Дж. И др. (1996). «Регулирование активности 5'-AMP-активированной протеинкиназы некаталитическими бета- и гамма-субъединицами». J. Biol. Chem. 271 (30): 17798–803. Дои:10.1074 / jbc.271.30.17798. PMID 8663446.
- Стэплтон Д., Вуллатт Э., Митчелхилл К.И. и др. (1997). «Семейство изоферментов AMP-активированной протеинкиназы: субъединичная структура и положение в хромосоме». FEBS Lett. 409 (3): 452–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (97) 00569-3. PMID 9224708. S2CID 39329574.
- Митчелхилл К.И., Мичелл Б.Дж., House CM и др. (1997). «Посттрансляционные модификации субъединицы 5'-AMP-активированной протеинкиназы бета1». J. Biol. Chem. 272 (39): 24475–9. Дои:10.1074 / jbc.272.39.24475. PMID 9305909.
- Торнтон С., Сноуден М.А., Карлинг Д. (1998). «Идентификация новой изоформы бета-субъединицы АМФ-активированной протеинкиназы, которая высоко экспрессируется в скелетных мышцах». J. Biol. Chem. 273 (20): 12443–50. Дои:10.1074 / jbc.273.20.12443. PMID 9575201.
- Cheung PC, Salt IP, Davies SP и др. (2000). «Характеристика изоформ гамма-субъединиц AMP-активированной протеинкиназы и их роль в связывании AMP». Biochem. J. 346 (3): 659–69. Дои:10.1042/0264-6021:3460659. ЧВК 1220898. PMID 10698692.
- да Силва, Ксавье Дж., Леклерк И., Соль И.П. и др. (2000). «Роль AMP-активированной протеинкиназы в регуляции глюкозой экспрессии гена островковых бета-клеток». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (8): 4023–8. Bibcode:2000PNAS ... 97.4023D. Дои:10.1073 / pnas.97.8.4023. ЧВК 18135. PMID 10760274.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Лемье К., Конрад Д., Клип А., Маретт А. (2003). «Активатор АМФ-активируемой протеинкиназы AICAR не вызывает транслокацию GLUT4 в поперечные канальцы, но стимулирует захват глюкозы и митоген-активируемые протеинкиназы p38 альфа и бета в скелетных мышцах». FASEB J. 17 (12): 1658–65. Дои:10.1096 / fj.02-1125com. PMID 12958172. S2CID 84040744.
- Ландри Л. Е., Хэнлон А. Л., Стронг Д. В. и др. (2004). «C75, ингибитор синтазы жирных кислот, модулирует АМФ-активированную протеинкиназу, чтобы изменить энергетический метаболизм нейронов». J. Biol. Chem. 279 (5): 3817–27. Дои:10.1074 / jbc.M310991200. PMID 14615481.
- Иноки К., Чжу Т., Гуань К.Л. (2004). «TSC2 опосредует клеточный энергетический ответ для контроля роста и выживания клеток». Клетка. 115 (5): 577–90. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00929-2. PMID 14651849. S2CID 18173817.
- Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Андерссон Ю., Филипссон К., Эбботт С. Р. и др. (2004). «АМФ-активированная протеинкиназа играет роль в контроле приема пищи» (PDF). J. Biol. Chem. 279 (13): 12005–8. Дои:10.1074 / jbc.C300557200. PMID 14742438. S2CID 9226598.
- Пилон Г., Даллер П., Маретт А. (2004). «Ингибирование индуцибельной синтазы оксида азота активаторами AMP-активированной протеинкиназы: новый механизм действия инсулино-сенсибилизирующих препаратов». J. Biol. Chem. 279 (20): 20767–74. Дои:10.1074 / jbc.M401390200. PMID 14985344.
- Шоу Р.Дж., Косматка М., Бардиси Н. и др. (2004). «Киназа-супрессор опухолей LKB1 напрямую активирует AMP-активированную киназу и регулирует апоптоз в ответ на энергетический стресс». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (10): 3329–35. Bibcode:2004ПНАС..101.3329С. Дои:10.1073 / pnas.0308061100. ЧВК 373461. PMID 14985505.
- Ким Е.К., Миллер И., Аджа С. и др. (2004). «C75, ингибитор синтазы жирных кислот, снижает потребление пищи за счет гипоталамической AMP-активируемой протеинкиназы». J. Biol. Chem. 279 (19): 19970–6. Дои:10.1074 / jbc.M402165200. PMID 15028725.
внешняя ссылка
- PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческой 5'-AMP-активированной субъединицы протеинкиназы бета-1 (PRKAB1)
PDB галерея | |
|---|---|
|
