SMG1 - SMG1
Серин / треонин-протеинкиназа SMG1 является фермент что у людей кодируется SMG1 ген.[5][6][7][8] SMG1 принадлежит к киназа, относящаяся к фосфатидилинозитол-3-киназе семейство белков.
Функция
Этот ген кодирует белок, участвующий в нонсенс-опосредованный распад мРНК (NMD) как часть комплекса наблюдения за мРНК. Этот белок обладает киназной активностью и, как полагают, функционирует в NMD, фосфорилируя регулятор белка бессмысленных транскриптов 1. Описаны альтернативные варианты сплайсированных транскриптов, но их полноразмерная природа не определена.[8]
Взаимодействия
Было показано, что SMG1 (ген) взаимодействовать с участием PRKCI[9] и UPF1.[10]
использованная литература
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000157106 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000030655 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Исикава К., Нагасе Т., Накадзима Д., Секи Н., Охира М., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (1998). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VIII. 78 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 4 (5): 307–13. Дои:10.1093 / днарес / 4.5.307. PMID 9455477.
- ^ Деннинг Дж., Джеймисон Л., Макват Л. Е., Томпсон Е. А., Филдс А. П. (июнь 2001 г.). «Клонирование новой киназы, связанной с фосфатидилинозитолкиназой: характеристика белка наблюдения РНК SMG-1 человека». J. Biol. Chem. 276 (25): 22709–14. Дои:10.1074 / jbc.C100144200. PMID 11331269.
- ^ Морита Т., Ямасита А., Кашима И., Огата К., Ишиура С., Оно С. (март 2007 г.). «Отдаленные N- и C-концевые домены необходимы для внутренней киназной активности SMG-1, критического компонента нонсенс-опосредованного распада мРНК». J. Biol. Chem. 282 (11): 7799–808. Дои:10.1074 / jbc.M610159200. PMID 17229728.
- ^ а б «Ген Entrez: SMG1 PI-3-киназа-родственная киназа SMG-1».
- ^ Diaz-Meco MT, Municio MM, Sanchez P, Lozano J, Moscat J (январь 1996 г.). «Лямбда-взаимодействующий белок, новый белок, который специфически взаимодействует с доменом« цинковые пальцы »атипичной протеинкиназы C изотипа лямбда / йота и стимулирует его киназную активность in vitro и in vivo». Мол. Cell. Биол. 16 (1): 105–14. Дои:10.1128 / mcb.16.1.105. ЧВК 230983. PMID 8524286.
- ^ Ямасита А., Охниши Т., Кашима И., Тая Ю., Оно С. (сентябрь 2001 г.). «Человеческий SMG-1, новая протеинкиназа, связанная с фосфатидилинозитол-3-киназой, ассоциируется с компонентами комплекса наблюдения за мРНК и участвует в регуляции нонсенс-опосредованного распада мРНК». Genes Dev. 15 (17): 2215–28. Дои:10.1101 / gad.913001. ЧВК 312771. PMID 11544179.
дальнейшее чтение
- Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Х., Кикуно Р., Охара О, Нагасе Т. (2002). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Res. 9 (3): 99–106. CiteSeerX 10.1.1.500.923. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID 12168954.
- Авраам RT (2005). «Связанная с ATM киназа, hSMG-1, связывает геном и пути наблюдения за РНК». Ремонт ДНК (Amst.). 3 (8–9): 919–25. Дои:10.1016 / днареп.2004.04.003. PMID 15279777.
- Diaz-Meco MT, Municio MM, Sanchez P, Lozano J, Moscat J (1996). «Лямбда-взаимодействующий белок, новый белок, который специфически взаимодействует с доменом« цинковые пальцы »атипичной протеинкиназы C изотипа лямбда / йота и стимулирует его киназную активность in vitro и in vivo». Мол. Cell. Биол. 16 (1): 105–14. Дои:10.1128 / MCB.16.1.105. ЧВК 230983. PMID 8524286.
- Санчес П., Де Карсер Дж., Сандовал И.В., Москат Дж., Диас-Меко МТ (1998). «Локализация изоформ атипичной протеинкиназы C в эндосомах, нацеленных на лизосомы, посредством взаимодействия с p62». Мол. Cell. Биол. 18 (5): 3069–80. Дои:10.1128 / mcb.18.5.3069. ЧВК 110686. PMID 9566925.
- Carmeliet P, Lampugnani MG, Moons L, Breviario F, Compernolle V, Bono F, Balconi G, Spagnuolo R, Oosthuyse B, Dewerchin M, Zanetti A, Angellilo A, Mattot V, Nuyens D, Lutgens E, Clotman F, de Ruiter MC, Гиттенбергер-де Гроот А., Пельманн Р., Лупу Ф., Герберт Дж. М., Коллен Д., Дежана Е. (1999). «Целенаправленная недостаточность или цитозольное усечение гена VE-кадгерина у мышей ухудшает VEGF-опосредованную выживаемость эндотелия и ангиогенез». Ячейка. 98 (2): 147–57. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81010-7. PMID 10428027. S2CID 2668221.
- Лофтус Б.Дж., Ким Ю.Дж., Снеддон В.П., Калуш Ф., Брэндон Р., Фурманн Дж., Мейсон Т., Кросби М.Л., Барнстед М., Кронин Л., Деслаттес Мейс А., Цао Y, Сюй RX, Канг Х.Л., Митчелл С., Эйхлер Э. ПК, Вентер Дж. К., Адамс Мэриленд (1999). «Дупликации генома и другие особенности в 12 Mb последовательности ДНК из хромосомы 16p и 16q человека». Геномика. 60 (3): 295–308. Дои:10.1006 / geno.1999.5927. PMID 10493829.
- Диас Нето Э, Корреа Р., Верджовски-Алмейда С., Брионес М. Р., Нагаи М. А., Да Силва В., Заго М. А., Бордин С., Коста Ф. Ф., Голдман Г. Х., Карвалью А. Ф., Мацукума А., Байя Г. С., Симпсон Д. Г., Брунштейн А., де Оливейра П.С., Бучер П., Джонженил К.В., О'Хара М.Дж., Соарес Ф., Брентани Р.Р., Рейс Л.Ф., де Соуза С.Дж., Симпсон А.Дж. (2000). «Секвенирование человеческого транскриптома с использованием тегов последовательности, экспрессируемой ORF». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (7): 3491–6. Дои:10.1073 / pnas.97.7.3491. ЧВК 16267. PMID 10737800.
- Ямасита А., Охниши Т., Кашима И., Тая Ю., Оно С. (2001). «Человеческий SMG-1, новая протеинкиназа, связанная с фосфатидилинозитол-3-киназой, ассоциируется с компонентами комплекса наблюдения за мРНК и участвует в регуляции нонсенс-опосредованного распада мРНК». Genes Dev. 15 (17): 2215–28. Дои:10.1101 / gad.913001. ЧВК 312771. PMID 11544179.
- Eichler EE, Johnson ME, Alkan C, Tuzun E, Sahinalp C, Misceo D, Archidiacono N, Rocchi M (2002). «Дивергентное происхождение и согласованное распространение двух сегментарных дупликаций на хромосоме 16». Дж. Херед. 92 (6): 462–8. Дои:10.1093 / jhered / 92.6.462. PMID 11948212.
- Чиу С.Ю., Серин Г., Охара О, Макват Л.Е. (2003). «Характеристика человеческого Smg5 / 7a: белка, сходного с Caenorhabditis elegans SMG5 и SMG7, который участвует в дефосфорилировании Upf1». РНК. 9 (1): 77–87. Дои:10.1261 / rna.2137903. ЧВК 1370372. PMID 12554878.
- Охниши Т., Ямасита А., Кашима И., Шелл Т., Андерс К.Р., Гримсон А., Хачия Т., Хентце М.В., Андерсон П., Оно С. (2003). «Фосфорилирование hUPF1 индуцирует образование комплексов наблюдения мРНК, содержащих hSMG-5 и hSMG-7». Мол. Ячейка. 12 (5): 1187–200. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00443-X. PMID 14636577.
- Брамбо К.М., Оттернес Д.М., Гейзен С., Оливейра В., Брогнард Дж., Ли Х, Лежен Ф., Тиббетс Р.С., Макват Л.Е., Абрахам Р.Т. (2004). «Белок наблюдения мРНК hSMG-1 функционирует в путях ответа на генотоксический стресс в клетках млекопитающих». Мол. Ячейка. 14 (5): 585–98. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.05.005. PMID 15175154.
- Кашима И., Ямасита А., Изуми Н., Катаока Н., Моришита Р., Хосино С., Оно М., Дрейфус Г., Оно С. (2006). «Связывание нового комплекса SMG-1-Upf1-eRF1-eRF3 (SURF) с комплексом соединения экзонов запускает фосфорилирование Upf1 и нонсенс-опосредованный распад мРНК». Genes Dev. 20 (3): 355–67. Дои:10.1101 / gad.1389006. ЧВК 1361706. PMID 16452507.
- Аззалин CM, Лингнер Дж (2006). «Фактор надзора за РНК человека UPF1 необходим для прогрессирования S-фазы и стабильности генома». Curr. Биол. 16 (4): 433–9. Дои:10.1016 / j.cub.2006.01.018. PMID 16488880. S2CID 17197870.
 | Эта белок -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |