DDR1 - DDR1

Тип памяти компьютера см. DDR SDRAM.
DDR1
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыDDR1, CAK, CD167, DDR, EHGK2, MCK10, NEP, NTRK4, PTK3, PTK3A, RTK6, TRKE, тирозинкиназа 1 рецептора дискоидинового домена
Внешние идентификаторыOMIM: 600408 MGI: 99216 ГомолоГен: 68212 Генные карты: DDR1
Расположение гена (человек)
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человек)[1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение DDR1
Геномное расположение DDR1
Группа6п21.33Начните30,876,421 бп[1]
Конец30,900,156 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE DDR1 1007 s в формате fs.png

PBB GE DDR1 207169 x в формате fs.png

PBB GE DDR1 208779 x в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

780

12305

Ансамбль

ENSMUSG00000003534

UniProt

Q08345

Q03146

RefSeq (мРНК)

NM_001198831
NM_001198833
NM_007584
NM_172962

RefSeq (белок)

NP_001185760
NP_001185762
NP_031610
NP_766550

Расположение (UCSC)Chr 6: 30,88 - 30,9 МбChr 17: 35.68 - 35.7 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Семейство рецепторов дискоидинового домена, член 1, также известен как DDR1 или CD167a (кластер дифференциации 167а), человек ген.[5]

Функция

Рецепторные тирозинкиназы (RTK) играют ключевую роль в коммуникации клеток с их микросредой. Эти молекулы участвуют в регуляции роста, дифференцировки и метаболизма клеток. Белок, кодируемый этим геном, представляет собой RTK, который широко экспрессируется в нормальных и трансформированных эпителиальных клетках и активируется различными типами коллаген. Этот белок принадлежит к подсемейству рецепторов тирозинкиназы с областью гомологии с Dictyostelium discoideum белок дискоидин Я в их внеклеточной области. Его аутофосфорилирование достигается всеми до сих пор протестированными коллагенами (от типа I до типа VI). Близкородственный член семьи - DDR2 белок.[6] Исследования in situ и анализ Нозерн-блоттинга показали, что экспрессия этого кодируемого белка ограничена эпителиальными клетками, особенно в почках, легких, желудочно-кишечном тракте и головном мозге. Кроме того, этот белок значительно сверхэкспрессируется в некоторых опухолях груди, яичников и других людей. пищеводный, и детский мозг. Этот ген расположен на хромосоме 6p21.3 в непосредственной близости от нескольких HLA класса I гены. Альтернативная сварка этого гена приводит к множественным вариантам транскрипта.[5]

использованная литература

  1. ^ а б c ENSG00000137332, ENSG00000229767, ENSG00000230456, ENSG00000234078, ENSG00000204580, ENSG00000223680 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000215522, ENSG00000137332, ENSG00000215522, ENSG4580000137332, ENSG000002278202, ENSG0000022782030 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000003534 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Entrez: семейство рецепторов дискоидинового домена DDR1, член 1».
  6. ^ Фу Х.Л., Валиафан Р.Р., Аркрайт Р., Сохаил А., Михай С., Кумарасири М., Махасенан К.В., Мобашери С., Хуанг П., Агарвал Г., Фридман Р. (март 2013 г.). «Рецепторы дискоидинового домена: уникальные рецепторные тирозинкиназы в коллаген-опосредованной передаче сигналов». Журнал биологической химии. 288 (11): 7430–7. Дои:10.1074 / jbc.R112.444158. ЧВК  3597784. PMID  23335507.

дальнейшее чтение

  • Edelhoff S, Sweetser DA, Disteche CM (январь 1995 г.). «Картирование гена тирозинкиназы рецептора NEP на хромосоме 6p21.3 человека и хромосоме 17C мыши». Геномика. 25 (1): 309–11. Дои:10.1016 / 0888-7543 (95) 80144-Б. PMID  7774938.
  • Шеллинг А.Н., Батлер Р., Джонс Т., Лаваль С., Бойл Дж. М., Ганесан Т.С. (январь 1995 г.). «Локализация эпителиально-специфической рецепторной киназы (EDDR1) на хромосоме 6q16». Геномика. 25 (2): 584–7. Дои:10.1016 / 0888-7543 (95) 80065-Т. PMID  7789998.
  • Weiner TM, Liu ET, Craven RJ, Cance WG (январь 1994 г.). «Экспрессия рецепторов фактора роста, киназы фокальной адгезии и других тирозинкиназ в опухолях мягких тканей человека». Анналы хирургической онкологии. 1 (1): 18–27. Дои:10.1007 / BF02303537. PMID  7834423. S2CID  2737602.
  • Лаваль С., Батлер Р., Шеллинг А.Н., Ханби А.М., Поулсом Р., Ганесан Т.С. (ноябрь 1994 г.). «Выделение и характеристика эпителиально-специфической рецепторной тирозинкиназы из линии клеток рака яичников». Рост и дифференциация клеток. 5 (11): 1173–83. PMID  7848919.
  • Като Д.Ю., Мацуока М., Стром Д.К., Шерр С.Дж. (апрель 1994 г.). «Регулирование циклин D-зависимой киназы 4 (cdk4) с помощью cdk4-активирующей киназы». Молекулярная и клеточная биология. 14 (4): 2713–21. Дои:10.1128 / MCB.14.4.2713. ЧВК  358637. PMID  8139570.
  • Ди Марко Е., Кутули Н., Герра Л., Канседда Р., Де Лука М. (ноябрь 1993 г.). «Молекулярное клонирование trkE, нового связанного с trk предполагаемого рецептора тирозинкиназы, выделенного из нормальных кератиноцитов человека и широко экспрессируемого нормальными тканями человека». Журнал биологической химии. 268 (32): 24290–5. PMID  8226977.
  • Перес Дж. Л., Шен Х, Финкернагель С., Шиорра Л., Дженкинс Н. А., Гилберт Д. Д., Коупленд Н. Г., Вонг Т. В. (январь 1994 г.). «Идентификация и картирование хромосом рецепторной тирозинкиназы с предполагаемой последовательностью связывания фосфолипидов в ее эктодомене». Онкоген. 9 (1): 211–9. PMID  8302582.
  • Джонсон Дж. Д., Эдман Дж. К., Раттер В. Дж. (Июнь 1993 г.). «Рецепторная тирозинкиназа, обнаруженная в клетках карциномы груди, имеет внеклеточный дискоидин I-подобный домен». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 90 (12): 5677–81. Bibcode:1993PNAS ... 90.5677J. Дои:10.1073 / pnas.90.12.5677. ЧВК  46784. PMID  8390675.
  • Perez JL, Jing SQ, Wong TW (апрель 1996 г.). «Идентификация двух изоформ киназы рецептора Cak, которые коэкспрессируются в клеточных линиях опухоли груди». Онкоген. 12 (7): 1469–77. PMID  8622863.
  • Валент А., Меддеб М., Данглот Дж., Дюверже А., Нгуен В.К., Бернхейм А. (июль 1996 г.). «Присвоение гена NTRK4 (trkE) хромосоме 6p21». Генетика человека. 98 (1): 12–5. Дои:10.1007 / s004390050152. PMID  8682498. S2CID  9450185.
  • Член парламента Плейфорда, Батлер Р.Дж., Ван XC, Кацо Р.М., Кук И.Е., Ганесан Т.С. (июль 1996 г.). «Геномная структура тирозинкиназы рецептора дискоидина». Геномные исследования. 6 (7): 620–7. Дои:10.1101 / гр.6.7.620. PMID  8796349.
  • Сакума С., Сая Х., Тада М., Накао М., Фудзивара Т., Рот Дж. А., Савамура И., Шинохе И., Абэ Х. (декабрь 1996 г.). «Рецепторная протеинтирозинкиназа DDR активируется белком p53». Письма FEBS. 398 (2–3): 165–9. Дои:10.1016 / S0014-5793 (96) 01234-3. PMID  8977099. S2CID  7573214.
  • Немото Т., Охаши К., Акаси Т., Джонсон Дж. Д., Хирокава К. (1998). «Сверхэкспрессия протеинтирозинкиназ при раке пищевода человека». Патобиология. 65 (4): 195–203. Дои:10.1159/000164123. PMID  9396043.
  • Танака К., Нагаяма И., Накано Т., Такамура Н., Намба Х., Фукада С., Кума К., Ямасита С., Нива М. (март 1998 г.). «Профиль экспрессии генов протеинтирозинкиназ рецепторного типа в щитовидной железе человека». Эндокринология. 139 (3): 852–8. Дои:10.1210 / en.139.3.852. PMID  9492013.
  • Фогель В., Гиш Г. Д., Алвес Ф., Поусон Т. (декабрь 1997 г.). «Тирозинкиназы рецептора дискоидинового домена активируются коллагеном». Молекулярная клетка. 1 (1): 13–23. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80003-9. PMID  9659899.
  • Шривастава А., Радзеевски С., Кэмпбелл Е., Ковач Л., МакГлинн М., Райан Т.Э., Дэвис С., Гольдфарб М.П., ​​Гласс Д.Д., Лемке Г., Янкопулос Г.Д. (декабрь 1997 г.). «Семейство сиротских рецепторов тирозинкиназ, члены которого служат неинтегриновыми рецепторами коллагена». Молекулярная клетка. 1 (1): 25–34. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80004-0. PMID  9659900.
  • Фогель В., Брейкбуш С., Фесслер Р., Алвес Ф., Руджеро Ф., Поусон Т. (февраль 2000 г.). «Рецептор 1 дискоидинового домена активируется независимо от бета (1) интегрина». Журнал биологической химии. 275 (8): 5779–84. Дои:10.1074 / jbc.275.8.5779. PMID  10681566.
  • Foehr ED, Tatavos A, Tanabe E, Raffioni S, Goetz S, Dimarco E, De Luca M, Bradshaw RA (май 2000 г.). «Передача сигналов рецептора 1 дискоидинового домена (DDR1) в клетках PC12: активация юкстамембранных доменов в химерных рецепторах PDGFR / DDR / TrkA». Журнал FASEB. 14 (7): 973–81. Дои:10.1096 / fasebj.14.7.973. PMID  10783152. S2CID  43317719.
  • Вайнер Х.Л., Хуанг Х., Загзаг Д., Бойс Х., Лихтенбаум Р., Зифф Е.Б. (декабрь 2000 г.). «Последовательная и селективная экспрессия тирозинкиназы рецептора-1 дискоидинового домена в опухолях головного мозга человека». Нейрохирургия. 47 (6): 1400–9. Дои:10.1097/00006123-200012000-00028. PMID  11126911. S2CID  2299503.
  • Мохан Р.Р., Мохан Р.Р., Уилсон С.Е. (январь 2001 г.). «Рецептор дискоидинового домена (DDR) 1 и 2: рецепторы тирозинкиназы, активируемые коллагеном, в роговице». Экспериментальные исследования глаз. 72 (1): 87–92. Дои:10.1006 / exer.2000.0932. PMID  11133186.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.