GABPB2 - GABPB2

GABPB1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1AWC
Идентификаторы
Псевдонимы	GABPB1, BABPB2, E4TF1, E4TF1-47, E4TF1-53, E4TF1B, GABPB, GABPB2, NRF2B1, NRF2B2, GABPB-1, субъединица 1 фактора транскрипции GA связывающего белка, субъединица фактора транскрипции GA связывающего белка бета 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 600610 MGI: 95611 ГомолоГен: 7723 Генные карты: GABPB1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 15 (человек)
Конец	50,355,408 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	126,676,337 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • активность гетеродимеризации белков; • GO: 0001948 связывание с белками;
Сотовый компонент	• ядро клетки; • нуклеоплазма; • цитоплазматическая гранула рибонуклеопротеина;
Биологический процесс	• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • митохондриальная организация; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция, ДНК-шаблон;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	2553
	14391
	ENSG00000104064
	ENSMUSG00000027361
	Q06547
	Q00420
NM_002041; NM_005254; NM_016654; NM_016655; NM_181427;
	NM_001320910; NM_001320915
NM_001271467; NM_001271468; NM_001271469; NM_001271470; NM_001271492;
	NM_010249; NM_207669; NM_001355108; NM_001355109
NP_001307839; NP_001307844; NP_002032; NP_005245; NP_057738;
	NP_057739; NP_852092; NP_057738.1
NP_001258396; NP_001258397; NP_001258398; NP_001258399; NP_001258421;
	NP_034379; NP_997552; NP_001342037; NP_001342038
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Субъединица GA-связывающего белка бета-1 это белок что у людей кодируется GABPB1 ген.^[5]^[6]

Этот ген кодирует фактор транскрипции GA-связывающего белка, бета-субъединицу. Этот белок образует тетрамерный комплекс с альфа-субъединицей и стимулирует транскрипцию генов-мишеней. Кодируемый белок может участвовать в активации экспрессии цитохромоксидазы и ядерном контроле функции митохондрий. Кристаллическая структура подобного белка у мыши была решена как тройной белковый комплекс. Для этого гена было идентифицировано множество вариантов транскриптов, кодирующих различные изоформы.^[6]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000104064 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027361 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ de la Brousse FC, Birkenmeier EH, King DS, Rowe LB, McKnight SL (ноябрь 1994 г.). «Молекулярно-генетическая характеристика GABP beta». Genes Dev. 8 (15): 1853–65. Дои:10.1101 / gad.8.15.1853. PMID 7958862.
^ ^а ^б «Ген Entrez: фактор транскрипции GABPB2 GA, связывающий белок, бета-субъединица 2».

дальнейшее чтение

Савада Дж., Гото М., Ватанабе Х. и др. (1995). «Региональное картирование двух субъединиц фактора транскрипции E4TF1 на хромосоме человека». Jpn. J. Cancer Res. 86 (1): 10–2. Дои:10.1111 / j.1349-7006.1995.tb02981.x. ЧВК 5920589. PMID 7737900.
Гугнея С., Вирбасиус СП, Скарпулла Р.С. (1995). «Четыре структурно различных, не связывающихся с ДНК субъединицы ядерного респираторного фактора 2 человека имеют общий консервативный домен активации транскрипции». Мол. Cell. Биол. 15 (1): 102–11. Дои:10.1128 / MCB.15.1.102. ЧВК 231915. PMID 7799916.
Вирбазиус СП, Вирбазий CA, Скарпулла RC (1993). «Идентичность GABP с NRF-2, мультисубъединичным активатором экспрессии цитохромоксидазы, показывает клеточную роль активатора ETS домена вирусных промоторов». Genes Dev. 7 (3): 380–92. Дои:10.1101 / gad.7.3.380. PMID 8383622.
Ватанабе Х., Савада Дж., Яно К. и др. (1993). «Клонирование кДНК субъединиц фактора транскрипции E4TF1 с Ets и мотивами notch». Мол. Cell. Биол. 13 (3): 1385–91. Дои:10.1128 / MCB.13.3.1385. ЧВК 359448. PMID 8441384.
Гугнея С., Вирбазиус С.М., Скарпулла Р.С. (1996). «Ядерные респираторные факторы 1 и 2 используют аналогичные глутамин-содержащие кластеры гидрофобных остатков для активации транскрипции». Мол. Cell. Биол. 16 (10): 5708–16. Дои:10.1128 / mcb.16.10.5708. ЧВК 231571. PMID 8816484.
Сава С., Гото М., Сузуки Ф. и др. (1997). «Функциональные домены фактора транскрипции hGABP beta1 / E4TF1-53, необходимые для ядерной локализации и активации транскрипции». Нуклеиновые кислоты Res. 24 (24): 4954–61. Дои:10.1093 / nar / 24.24.4954. ЧВК 146336. PMID 9016666.
Sowa Y, Shiio Y, Fujita T и др. (1997). «Сайт фактора связывания 1 ретинобластомы в области корового промотора гена RB человека активируется hGABP / E4TF1». Рак Res. 57 (15): 3145–8. PMID 9242441.
Бэтчелор А.Х., Пайпер Д.Е., де ла Брус Ф.К. и др. (1998). «Структура GABPalpha / beta: гетеродимер ETS-домена и анкиринового повтора, связанный с ДНК». Наука. 279 (5353): 1037–41. Bibcode:1998Sci ... 279.1037B. Дои:10.1126 / science.279.5353.1037. PMID 9461436.
Сузуки Ф., Гото М., Сава С. и др. (1998). «Функциональные взаимодействия субъединиц человеческого GA-связывающего белка фактора транскрипции». J. Biol. Chem. 273 (45): 29302–8. Дои:10.1074 / jbc.273.45.29302. PMID 9792629.
Савада Дж., Симидзу Н., Сузуки Ф. и др. (2000). «Синергетическая активация транскрипции с помощью hGABP и избранных членов семейства белков, связывающих фактор транскрипции / ответный элемент цАМФ». J. Biol. Chem. 274 (50): 35475–82. Дои:10.1074 / jbc.274.50.35475. PMID 10585419.
Фогель JL, Кристи TM (2000). «Новый коактиватор C1 (HCF) координирует образование мультипротеинового энхансера и опосредует активацию транскрипции с помощью GABP». EMBO J. 19 (4): 683–90. Дои:10.1093 / emboj / 19.4.683. ЧВК 305606. PMID 10675337.
Сава Ч., Йошикава Т., Мацуда-Судзуки Ф. и др. (2002). «YEAF1 / RYBP и YAF-2 являются функционально разными членами семейства кофакторов для факторов транскрипции YY1 и E4TF1 / hGABP». J. Biol. Chem. 277 (25): 22484–90. Дои:10.1074 / jbc.M203060200. PMID 11953439.
Мари С., Race V, Nassogne MC и др. (2002). «Мутация сайта связывания ядерного респираторного фактора 2 в 5'-нетранслируемой области гена ADSL у трех пациентов с дефицитом аденилосукцинатлиазы». Am. J. Hum. Genet. 71 (1): 14–21. Дои:10.1086/341036. ЧВК 384970. PMID 12016589.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Jeong BC, Kim MY, Lee JH и др. (2006). «Специфический для мозга ингибитор ангиогенеза 2 регулирует VEGF через GABP, который действует как репрессор транскрипции». FEBS Lett. 580 (2): 669–76. Дои:10.1016 / j.febslet.2005.12.086. PMID 16412436. S2CID 35468847.
Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Ячейка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.

внешние ссылки

GABPB2 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q00420 (Субъединица бета-1 GA-связывающего белка мыши) на PDBe-KB.