SOX9 - Википедия - SOX9

SOX9
Белок SOX9 PDB 1S9M.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSOX9, CMD1, CMPD1, SRA1, SRXX2, SRXY10, SRY-box 9, SRY-box фактор транскрипции 9
Внешние идентификаторыOMIM: 608160 MGI: 98371 ГомолоГен: 294 Генные карты: SOX9
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение SOX9
Геномное расположение SOX9
Группа17q24.3Начинать72,121,020 бп[1]
Конец72,126,416 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SOX9 202935 s на fs.png

PBB GE SOX9 202936 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

6662

20682

Ансамбль

ENSG00000125398

ENSMUSG00000000567

UniProt

P48436

Q04887

RefSeq (мРНК)

NM_000346

NM_011448

RefSeq (белок)

NP_000337

NP_035578

Расположение (UCSC)Chr 17: 72.12 - 72.13 МбChr 11: 112.78 - 112.79 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции SOX-9 это белок что у людей кодируется SOX9 ген.[5][6]

Функция

SOX-9 распознает последовательность CCTTGAG вместе с другими членами HMG-коробка класс ДНК-связывающих белков. Он экспрессируется пролиферирующими, но не гипертрофическими хондроцитами, что важно для дифференцировки клеток-предшественников в хондроциты[7] и с стероидогенный фактор 1, регулирует транскрипцию антимюллерова гормона (AMH ) ген.[6]

SOX-9 также играет ключевую роль в половом развитии мужчин; работая с Sf1, SOX-9 может производить AMH в Клетки Сертоли препятствовать созданию женской репродуктивной системы.[8] Он также взаимодействует с некоторыми другими генами, способствуя развитию мужских половых органов. Процесс начинается, когда фактор транскрипции Определяющий фактор яичек (кодируется областью определения пола SRY из Y-хромосома ) активирует активность SOX-9, связываясь с усилитель последовательность вверх по течению гена.[9] Далее Sox9 активирует FGF9 и формирует петли прямой связи с FGF9[10] и PGD2.[9] Эти петли важны для производства SOX-9; без этих петель SOX-9 закончился бы, и почти наверняка последовало бы развитие самки. Активация FGF9 с помощью SOX-9 запускает жизненно важные процессы в развитии мужчин, такие как создание тяжи яичка и умножение Клетки Сертоли.[10] Объединение SOX-9 и Dax1 фактически создает клетки Сертоли, еще один жизненно важный процесс в развитии мужчин.[11] В развитии мозга его мышиный ортолог Sox-9 индуцирует экспрессию Wwp1, Wwp2 и miR-140, чтобы регулировать вход в кортикальную пластинку новорожденных нервных клеток и регулировать ветвление аксонов и образование аксонов в корковых нейронах.[12]

Клиническое значение

Мутации приводят к синдрому порока скелета кампомелическая дисплазия, часто с аутосомной сменой пола[6] и волчья пасть.[13]

SOX9 находится в генная пустыня на 17q24 у человека. Удаление, сбои по перемещение точки останова и единичная мутация высококонсервативных некодирующих элементов, расположенных> 1 МБ из единицы транскрипции по обе стороны от SOX9 были связаны с Последовательность Пьера Робена, часто с волчья пасть.[13][14]

Белок Sox9 участвует как в инициации, так и в развитии множественных солидных опухолей.[15] Его роль в качестве главного регулятора морфогенез в течение человеческое развитие делает его идеальным кандидатом на нарушения в злокачественных тканях. В частности, Sox9, по-видимому, вызывает инвазивность и резистентность к терапии в простате,[16] колоректальный,[17] грудь[18] и другие виды рака, и поэтому способствует летальному метастазированию.[19] Многие из этих онкогенных эффектов Sox9 кажутся дозозависимыми.[20][16][15]

Локализация и динамика SOX9

SOX9 в основном локализован в ядре и очень подвижен. Исследования клеточной линии хондроцитов показали, что почти 50% SOX9 связано с ДНК и напрямую регулируется внешними факторами. Его полупериод нахождения на ДНК составляет ~ 14 секунд.[21]

Роль в смене пола

Мутации в Sox9 или любых связанных генах может вызывать изменение пола и гермафродитизм (или же интерсексуальность в людях). Если Fgf9, который активируется Sox9, отсутствует, плод как с X, так и с Y хромосомы могут развиваться женские гонады;[9] то же самое верно, если Dax1 нет.[11] Связанные с этим явления гермафродитизма могут быть вызваны необычной активностью SRY, обычно когда он перемещается на Х-хромосому и его активность активируется только в некоторых клетках.[22]

Взаимодействия

SOX9 был показан взаимодействовать с Стероидогенный фактор 1,[8] MED12[23] и MAF.[24]

Смотрите также

дальнейшее чтение

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000125398 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000567 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Томмеруп Н., Шемпп В., Мейнеке П., Педерсен С., Болунд Л., Брандт С. и др. (Июнь 1993 г.). «Отнесение аутосомного локуса смены пола (SRA1) и кампомелической дисплазии (CMPD1) к 17q24.3-q25.1». Природа Генетика. 4 (2): 170–4. Дои:10.1038 / ng0693-170. PMID  8348155. S2CID  12263655.
  6. ^ а б c «Ген Entrez: SOX9 SRY (область определения пола Y) -бокс 9 (кампомелическая дисплазия, аутосомное изменение пола)».
  7. ^ Кумар, Винай; Аббас, Абул К .; Астер, Джон С. (2015). Патологические основы болезни Роббинса и Котрана (Девятое изд.). п. 1182. ISBN  9780808924500.
  8. ^ а б Де Санта-Барбара П., Бонно Н., Буазе Б., Десклозо М., Монио Б., Садбек П. и др. (Ноябрь 1998 г.). «Прямое взаимодействие SRY-родственного белка SOX9 и стероидогенного фактора 1 регулирует транскрипцию гена антимюллерова гормона человека». Молекулярная и клеточная биология. 18 (11): 6653–65. Дои:10.1128 / mcb.18.11.6653. ЧВК  109250. PMID  9774680.
  9. ^ а б c Монио Б., Деклосменил Ф, Баррионуево Ф., Шерер Г., Аритаке К., Малки С. и др. (Июнь 2009 г.). «Путь PGD2, независимо от FGF9, усиливает активность SOX9 в клетках Сертоли во время мужской половой дифференцировки». Разработка. 136 (11): 1813–21. Дои:10.1242 / dev.032631. ЧВК  4075598. PMID  19429785.
  10. ^ а б Ким Й., Кобаяши А., Секидо Р., ДиНаполи Л., Бреннан Дж., Шабоассье М.С. и др. (Июнь 2006 г.). «Fgf9 и Wnt4 действуют как антагонистические сигналы для регулирования определения пола млекопитающих». PLOS Биология. 4 (6): e187. Дои:10.1371 / journal.pbio.0040187. ЧВК  1463023. PMID  16700629.
  11. ^ а б Баума Г.Дж., Альбрехт К.Х., Уошберн Л.Л., Рекнагель А.К., Черчилль Г.А., Эйхер Э.М. (июль 2005 г.). «Изменение пола гонад у мутантных мышей Dax1 XY: неспособность активировать Sox9 в клетках пре-Сертоли». Разработка. 132 (13): 3045–54. Дои:10.1242 / dev.01890. PMID  15944188.
  12. ^ Амброзкевич М.С., Шварк М., Кишимото-Суга М., Борисова Е., Хори К., Салазар-Лазаро А. и др. (Декабрь 2018 г.). "Приобретение полярности в корковых нейронах обусловлено синергическим действием Sox9-регулируемых Wwp1 и Wwp2 E3 убиквитиновых лигаз и интронных miR-140". Нейрон. 100 (5): 1097–1115.e15. Дои:10.1016 / j.neuron.2018.10.008. PMID  30392800.
  13. ^ а б Диксон MJ, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC (март 2011 г.). «Расщелина губы и неба: понимание генетических влияний и факторов окружающей среды». Обзоры природы. Генетика. 12 (3): 167–78. Дои:10.1038 / nrg2933. ЧВК  3086810. PMID  21331089.
  14. ^ Benko S, Fantes JA, Amiel J, Kleinjan DJ, Thomas S, Ramsay J, et al. (Март 2009 г.). «Высококонсервативные некодирующие элементы по обе стороны от SOX9, связанные с последовательностью Пьера Робена». Природа Генетика. 41 (3): 359–64. Дои:10,1038 / нг.329. PMID  19234473. S2CID  29933548.
  15. ^ а б Джо, А; Дендулури, S; Чжан, Б; Ван, З; Инь, L; Ян, З; Канг, Р. Ши, LL; Mok, J; Ли, MJ; Хейдон, RC (декабрь 2014 г.). «Универсальные функции Sox9 в развитии стволовых клеток и болезней человека». Гены и болезни. 1 (2): 149–161. Дои:10.1016 / j.gendis.2014.09.004. ЧВК  4326072. PMID  25685828.
  16. ^ а б Нури, М; Масса, S; Карадек, Дж; Любик А.А.; Ли, Н; Чыонг, S; Ли, АР; Фазли, L; Рамнарин, VR; Ловницки, JM; Мур, Дж; Ван, М; Фу, Дж; Gleave, ME; Hollier, BG; Нельсон, К; Коллинз, К; Донг, Х; Буттян Р. (9 января 2020 г.). «Преходящая экспрессия Sox9 способствует устойчивости к терапии, направленной на андрогены, при раке простаты». Клинические исследования рака. 26 (7): 1678–1689. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-19-0098. PMID  31919137.
  17. ^ Превостель, С; Блаш, П. (ноябрь 2017 г.). «Дозозависимый эффект SOX9 и его частота при колоректальном раке». Европейский журнал рака. 86: 150–157. Дои:10.1016 / j.ejca.2017.08.037. PMID  28988015.
  18. ^ Гримм, Д.; Бауэр, Дж; Мудрый, P; Крюгер, М; Simonsen, U; Wehland, M; Инфангер, М; Коридон, TJ (23 марта 2019 г.). «Роль членов семьи SOX в солидных опухолях и метастазах». Семинары по биологии рака. Дои:10.1016 / j.semcancer.2019.03.004. PMID  30914279.
  19. ^ Агилар-Медина, М.; Avendaño-Félix, M; Lizárraga-Verdugo, E; Bermúdez, M; Ромеро-Кинтана, JG; Рамос-Паян, Р. Ruíz-García, E; Лопес-Камарильо, К. (2019). «Фактор стволовых клеток SOX9: клиническая и функциональная значимость при раке». Журнал онкологии. 2019: 6754040. Дои:10.1155/2019/6754040. ЧВК  6463569. PMID  31057614.
  20. ^ Ян, Х; Liang, R; Лю, К; Лю, JA; Чунг, МПЛ; Лю, X; Man, OY; Гуань, XY; Легкое, HL; Чунг, М. (14 января 2019 г.). «SOX9 - это дозозависимый детерминант метастатической судьбы меланомы». Журнал экспериментальных и клинических исследований рака: CR. 38 (1): 17. Дои:10.1186 / s13046-018-0998-6. ЧВК  6330758. PMID  30642390.
  21. ^ Говиндарадж К., Хендрикс Дж., Лидке Д.С., Карпериен М., Post JN (январь 2019 г.). «Изменения в восстановлении флуоресценции после фотообесцвечивания (FRAP) как индикатор активности фактора транскрипции SOX9». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - механизмы регуляции генов. 1862 (1): 107–117. Дои:10.1016 / j.bbagrm.2018.11.001. PMID  30465885.
  22. ^ Маргарит Э., Колл доктор медицины, Олива Р., Гомес Д., Солер А., Баллеста Ф. (январь 2000 г.). «Ген SRY перенесен в длинное плечо Х-хромосомы у Y-положительного XX истинного гермафродита». Американский журнал медицинской генетики. 90 (1): 25–8. Дои:10.1002 / (SICI) 1096-8628 (20000103) 90: 1 <25 :: AID-AJMG5> 3.0.CO; 2-5. PMID  10602113.
  23. ^ Чжоу Р., Бонно Н., Юань С.Х., де Санта-Барбара П., Буазе Б., Шомбер Т. и др. (Июль 2002 г.). «SOX9 взаимодействует с компонентом белкового комплекса, связанного с рецептором тироидного гормона человека». Исследования нуклеиновых кислот. 30 (14): 3245–52. Дои:10.1093 / nar / gkf443. ЧВК  135763. PMID  12136106.
  24. ^ Хуанг В., Лу Н., Эберспехер Х., Де Кромбругге Б. (декабрь 2002 г.). «Новая длинная форма c-Maf взаимодействует с Sox9 для активации гена коллагена типа II». Журнал биологической химии. 277 (52): 50668–75. Дои:10.1074 / jbc.M206544200. PMID  12381733.

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.