JARID1B - JARID1B
Лизин-специфическая деметилаза 5B также известен как гистоновая деметилаза JARID1B это деметилаза фермент что у людей кодируется KDM5B ген.[5][6][7] JARID1B принадлежит альфа-кетоглутарат-зависимая гидроксилаза надсемейство.
Функция
Jarid1B (также известный как KDM5B или PLU1) принадлежит к семейству генов JHDM. Они ответственны за деметилирование три- и диметилированных лизинов в положении 4 гистона 3 (H3K4me3 и H3K4me2). Jarid1B - это мультидоменный фермент, входящий в подсемейство KDM5. Все семейство Jarid1 представляет собой семейство белков, которые обладают активностью гистон-деметилазы H3K4.[8]
Jarid1B был вовлечен в развитие рака простаты, груди и кожи, а также был связан с поддержанием меланомы. Полученные нокаутные мыши (Jarid1b - / -) жизнеспособны в неонатальной жизни. Эти мыши действительно демонстрируют фенотип преждевременной смертности, снижения фертильности у самок мышей, снижения массы тела и нарушения развития молочных желез. Он также снижал уровень эстрогена в сыворотке крови и вызывал уменьшение пролиферации эпителиальных клеток молочной железы на ранних стадиях полового созревания. Эти мыши Jarid1b - / -, по-видимому, в значительной степени подвержены влиянию многих регуляторов развития молочных желез, таких как FOXA1 и рецептор эстрогена α.[9] Однако другие показали, что эмбрионы с нокаутом Jarid1B обычно имеют неонатальную летальность из-за отказа их дыхательной системы. Также было замечено, что нокаутные эмбрионы имеют несколько различных нервных дефектов, включая дезорганизацию черепных нервов, повышенную частоту экзэнцефалии и дефекты развития глаз.[10]
Взаимодействия
JARID1B был показан взаимодействовать с FOXG1[11] и PAX9.[11]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000117139 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042207 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Lahoud MH, Ristevski S, Venter DJ, Jermiin LS, Bertoncello I, Zavarsek S, Hasthorpe S, Drago J, de Kretser D, Hertzog PJ, Kola I (август 2001 г.). «Нацеливание гена на Desrt, новый ДНК-связывающий белок класса ARID, вызывает задержку роста и аномальное развитие репродуктивных органов». Геномные исследования. 11 (8): 1327–34. Дои:10.1101 / гр.168801. PMID 11483573.
- ^ Чжу Л., Ху Дж., Линь Д., Уитсон Р., Итакура К., Чен Ю. (август 2001 г.). «Динамика ДНК-связывающего домена Mrf-2 в свободном состоянии и в комплексе с ДНК». Биохимия. 40 (31): 9142–50. Дои:10.1021 / bi010476a. PMID 11478881.
- ^ «Энтрез Джин: JARID1B jumonji, AT Rich Interactive domain 1B».
- ^ Кристенсен Л.Х., Нильсен А.Л., Хельгстранд С., Лис М., Клоос П., Каструп Дж. С., Хелин К., Олсен Л., Гайхеде М. (июнь 2012 г.). «Исследования деметилирования H3K4me3 с помощью KDM5B / Jarid1B / PLU1 показывают сильное распознавание субстрата in vitro и идентифицируют 2,4-пиридин-дикарбоновую кислоту как in vitro и клеточный ингибитор». Журнал FEBS. 279 (11): 1905–14. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2012.08567.x. PMID 22420752.
- ^ Zou MR, Cao J, Liu Z, Huh SJ, Polyak K, Yan Q (июнь 2014 г.). «Гистоновая деметилаза jumonji, богатая AT интерактивным доменом 1B (JARID1B), контролирует развитие молочной железы, регулируя ключевые гены онтогенетической и клональной спецификации». Журнал биологической химии. 289 (25): 17620–33. Дои:10.1074 / jbc.M114.570853. ЧВК 4067197. PMID 24802759.
- ^ Альберт М., Шмитц С.У., Коистра С.М., Малатеста М., Моралес Торрес С., Реклинг Дж. К., Йохансен СП, Абарратеги И., Хелин К. (апрель 2013 г.). «Гистоновая деметилаза Jarid1b обеспечивает правильное развитие мышей, защищая гены развития от аберрантного H3K4me3». PLOS Genetics. 9 (4): e1003461. Дои:10.1371 / journal.pgen.1003461. ЧВК 3630093. PMID 23637629.
- ^ а б Тан К., Шоу А.Л., Мэдсен Б., Дженсен К., Тейлор-Пападимитриу Дж., Фримонт П.С. (июнь 2003 г.). «Человеческий PLU-1 обладает свойствами репрессии транскрипции и взаимодействует с онтогенетическими факторами транскрипции BF-1 и PAX9». Журнал биологической химии. 278 (23): 20507–13. Дои:10.1074 / jbc.M301994200. PMID 12657635.
дальнейшее чтение
- Лу П.Дж., Сандквист К., Бэкстрем Д., Поулсом Р., Ханби А., Мейер-Эверт С., Джонс Т., Митчелл М., Пита-Роу П., Фримонт П., Тейлор-Пападимитриу Дж. (Май 1999 г.). «Новый ген (PLU-1), содержащий высококонсервативные предполагаемые мотивы связывания ДНК / хроматина, специфически активируется при раке груди». Журнал биологической химии. 274 (22): 15633–45. Дои:10.1074 / jbc.274.22.15633. PMID 10336460.
- Кашуба В., Протопопов А., Подовски Р., Гизатуллин Р., Ли Дж., Кляйн Г., Валестедт С., Забаровский Е. (июнь 2000 г.). «Выделение и хромосомная локализация нового гомолога 1a связывающего белка ретинобластомы человека 2 (RBBP2H1A)». Европейский журнал генетики человека. 8 (6): 407–13. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5200474. PMID 10878660.
- Барретт А., Мэдсен Б., Копир Дж., Лу П. Дж., Купер Л., Scibetta AG, Берчелл Дж., Тейлор-Пападимитриу Дж. (Октябрь 2002 г.). «Ядерный белок PLU-1, который активируется при раке груди, демонстрирует ограниченную экспрессию в нормальных тканях взрослого человека: новый антиген рака / семенников?». Международный журнал рака. 101 (6): 581–8. Дои:10.1002 / ijc.10644. PMID 12237901.
- Тан К., Шоу А.Л., Мэдсен Б., Дженсен К., Тейлор-Пападимитриу Дж., Фримонт П.С. (июнь 2003 г.). «Человеческий PLU-1 обладает свойствами репрессии транскрипции и взаимодействует с онтогенетическими факторами транскрипции BF-1 и PAX9». Журнал биологической химии. 278 (23): 20507–13. Дои:10.1074 / jbc.M301994200. PMID 12657635.
- Пациалу А., Вильскер Д., Моран Э. (2005). «ДНК-связывающие свойства белков семейства ARID». Исследования нуклеиновых кислот. 33 (1): 66–80. Дои:10.1093 / нар / gki145. ЧВК 546134. PMID 15640446.
- Цшах А., Ленцнер С., Мозер Б., Райнхардт Р., Челли Дж., Фринс Дж. П., Клифстра Т., Рейно М., Тернер Г., Роперс Х. Х., Кусс А., Йенсен Л. Р. (апрель 2006 г.). «Новые мутации JARID1C / SMCX у пациентов с Х-связанной умственной отсталостью». Человеческая мутация. 27 (4): 389. Дои:10.1002 / humu.9420. PMID 16541399.
- Ямане К., Татейши К., Клозе Р.Дж., Фанг Дж., Фабрицио Л.А., Эрдджумент-Бромаж Х., Тейлор-Пападимитриу Дж., Темпст П., Чжан Й. (март 2007 г.). «PLU-1 представляет собой деметилазу H3K4, участвующую в репрессии транскрипции и пролиферации клеток рака груди». Молекулярная клетка. 25 (6): 801–12. Дои:10.1016 / j.molcel.2007.03.001. PMID 17363312.
- Barrett A, Santangelo S, Tan K, Catchpole S, Roberts K, Spencer-Dene B, Hall D, Scibetta A, Burchell J, Verdin E, Freemont P, Taylor-Papadimitriou J (июль 2007 г.). «Репрессор транскрипции, связанный с раком груди, PLU-1 / JARID1B напрямую взаимодействует с гистоновыми деацетилазами». Международный журнал рака. 121 (2): 265–75. Дои:10.1002 / ijc.22673. PMID 17373667.
внешняя ссылка
- JARID1B + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.
 | Эта статья о ген на хромосома человека 1 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |