JARID2 - JARID2
Протеин Джумонджи это белок что у людей кодируется JARID2 ген.[5][6] JARID2 является членом альфа-кетоглутарат-зависимая гидроксилаза надсемейство.
Jarid2 (jumonji, AT rich interactive domain 2) - ген, кодирующий белок, который функционирует как предполагаемый фактор транскрипции. Отличился как ядерный белок необходимо для мыши эмбриогенез, Jarid2 является членом семейства jumonji, которое содержит ДНК-связывающий домен, известный как AT-богатый домен взаимодействия (ARID).[7][8][9][10] В пробирке исследования Jarid2 показывают, что ARID наряду с другими функциональными доменами участвует в связывании ДНК, ядерной локализации, транскрипционный репрессии[11] и рекрутирование Polycomb-репрессивного комплекса 2 (PRC2).[12][13] Внутриклеточные механизмы, лежащие в основе этих взаимодействий, остаются в значительной степени неизвестными.
В поисках генов, важных для развития, Jarid2 был ранее идентифицирован генная ловушка технологии как важный фактор, необходимый для развитие органов.[7][11][14] Во время органогенеза мыши Jarid2 участвует в формировании нервная трубка и развитие печени, селезенки, тимуса и сердечно-сосудистой системы.[15][16] Непрерывная экспрессия Jarid2 в тканях сердца подчеркивает его ведущую роль в развитии как эмбрионального, так и взрослого сердца.[7] Мутантные модели эмбрионов Jarid2 демонстрируют серьезные пороки развития сердца, дефекты межжелудочковой перегородки, несжатие стенки желудочка, и увеличение предсердий.[7] Гомозиготные мутанты Jarid2 умирают вскоре после рождения.[7] Сообщалось, что сверхэкспрессия мышиного гена Jarid2 подавляет пролиферацию кардиомиоцитов за счет его тесного взаимодействия с белком ретинобластомы (Rb), главным регулятором клеточного цикла.[11][14][17] Белок-2, связывающий ретинобластому, и белок SMCX человека имеют общие области гомологии между мышами и людьми.[5]
Модельные организмы
| Характеристика | Фенотип |
|---|---|
| Гомозигота жизнеспособность | Аномальный |
| Рецессивный смертельное исследование | Аномальный |
| Плодородие | Нормальный |
| Масса тела | Нормальный |
| Беспокойство | Нормальный |
| Неврологический осмотр | Нормальный |
| Сила захвата | Нормальный |
| Горячая тарелка | Нормальный |
| Дисморфология | Нормальный |
| Косвенная калориметрия | Нормальный |
| Тест толерантности к глюкозе | Нормальный |
| Слуховой ответ ствола мозга | Нормальный |
| DEXA | Нормальный |
| Рентгенография | Нормальный |
| Температура тела | Нормальный |
| Морфология глаза | Нормальный |
| Клиническая химия | Нормальный |
| Плазма иммуноглобулины | Нормальный |
| Гематология | Нормальный |
| Лимфоциты периферической крови | Нормальный |
| Микроядерный тест | Нормальный |
| Вес сердца | Нормальный |
| Гистопатология кожи | Нормальный |
| Гистопатология головного мозга | Нормальный |
| Сальмонелла инфекционное заболевание | Нормальный[18] |
| Citrobacter инфекционное заболевание | Нормальный[19] |
| Все тесты и анализы от[20][21] |
Модельные организмы были использованы при изучении функции JARID2. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Джарид2tm1a (КОМП) Wtsi[22][23] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект мутагенеза с высокой пропускной способностью для создания и распространения животных моделей болезней среди заинтересованных ученых - в Wellcome Trust Sanger Institute.[24][25][26]
Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[20][27] Было проведено 26 испытаний и два фенотипы сообщалось. Гомозиготный мутант эмбрионы были идентифицированы во время беременности, но почти половина из них демонстрировала признаки отек, а в отдельном исследовании только 1% дожили до отлучение от груди (значительно меньше, чем Менделирующее соотношение ). Остальные испытания проводились на гетерозиготный мутантные взрослые мыши; у этих животных не наблюдалось никаких значительных отклонений от нормы.[20]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000008083 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000038518 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ а б Берже-Лефранк Дж. Л., Джей П., Масасриер А., Кау П., Маттей М. Г., Бауэр С., Марсолье С., Берта П., Фонтес М. (февраль 1997 г.). «Характеристика гена дзюмондзи человека». Хум Мол Генет. 5 (10): 1637–41. Дои:10.1093 / hmg / 5.10.1637. PMID 8894700.
- ^ "Entrez Gene: JARID2 jumonji, AT Rich Interactive domain 2".
- ^ а б c d е Ким Т.Г., Краус Дж.С., Чен Дж., Ли Й (2004). «Джумонджи, критический фактор развития сердца, функционирует как репрессор транскрипции». J. Biol. Chem. 278 (43): 42247–55. Дои:10.1074 / jbc.M307386200. PMID 12890668.
- ^ Mysliwiec MR, Kim TG, Lee Y (2007). «Характеристика белка 496 цинковых пальцев, который взаимодействует с jumonji / jarid2». Письма FEBS. 581 (14): 2633–40. Дои:10.1016 / j.febslet.2007.05.006. ЧВК 2002548. PMID 17521633.
- ^ Такахаши М., Кодзима М., Накадзима К., Судзуки-Мигишима Р., Мотеги Ю., Йокояма М., Такеучи, Т. (2004). «Сердечные аномалии вызывают раннюю летальность мутантных мышей jumonji». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 324 (4): 1319–23. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.09.203. PMID 15504358.
- ^ Тойода М., Кодзима М., Такеучи Т. (2000). «Джумонджи - это ядерный белок, который участвует в негативной регуляции роста клеток». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 274 (2): 332–6. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3138. PMID 10913339.
- ^ а б c Классен С.С., Рабкин С.В. (2008). «Оксид азота индуцирует экспрессию генов белка jumonji и ретинобластомы 2, одновременно снижая экспрессию предшественника предсердного натрийуретического пептида типа B в кардиомиоцитах». Folia Biologica. 54 (2): 65–70. PMID 18498724.
- ^ Pasini D, Cloos PA, Walfridsson J, Olsson L, Bukowski JP, Johansen JV, Helin K (2010). «JARID2 регулирует связывание репрессивного комплекса polycomb 2 с генами-мишенями в ES-клетках». Природа. 464 (7286): 306–10. Bibcode:2010Натура.464..306П. Дои:10.1038 / природа08788. PMID 20075857. S2CID 205219740.
- ^ Сон Дж., Шен С.С., Маргарон Р., Рейнберг Д. (2013). «Активность связывания нуклеосом в JARID2 и EZH1 регулирует функцию PRC2 на хроматине». Гены и развитие. 27 (24): 2663–77. Дои:10.1101 / gad.225888.113. ЧВК 3877756. PMID 24352422.
- ^ а б Юнг Дж, Mysliwiec MR, Ли Y (2005). «Роль Jumonji в эмбриональном развитии мышей». Динамика развития. 232 (1): 21–32. Дои:10.1002 / dvdy.20204. PMID 15580614. S2CID 31338749.
- ^ Мотояма Дж., Китадзима К., Кодзима М., Кондо С., Такеучи Т. (1997). «Органогенез печени, тимуса и селезенки нарушен у мутантных мышей jumonji». Механизмы развития. 66 (1–2): 27–37. Дои:10.1016 / s0925-4773 (97) 00082-8. PMID 9376320. S2CID 6531281.
- ^ Такеучи Т., Ямадзаки Ю., Катох-Фукуи Ю., Цучия Р., Кондо С., Мотояма Дж., Хигасинакагава Т. (1995). «Захват генной ловушки нового гена мыши, jumonji, необходимого для формирования нервной трубки». Гены и развитие. 9 (10): 1211–22. Дои:10.1101 / gad.9.10.1211. PMID 7758946.
- ^ Mysliwiec MR, Chen J, Powers PA, Bartley CR, Schneider MD, Lee Y (2000). «Генерация условного нулевого аллеля jumonji». Бытие. 44 (9): 407–11. Дои:10.1002 / dvg.20221. ЧВК 2002517. PMID 16900512.
- ^ "Сальмонелла данные о заражении Jarid2 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ "Citrobacter данные о заражении Jarid2 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ а б c Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88 (S248). Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
- ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
- ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
- ^ "Информатика генома мыши".
- ^ Skarnes, W. C .; Rosen, B .; West, A. P .; Koutsourakis, M .; Бушелл, Вт .; Iyer, V .; Mujica, A.O .; Thomas, M .; Harrow, J .; Cox, T .; Джексон, Д .; Severin, J .; Biggs, P .; Fu, J .; Нефедов, М .; Де Йонг, П. Дж .; Стюарт, А. Ф .; Брэдли, А. (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК 3572410. PMID 21677750.
- ^ Долгин Е. (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
- ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
- ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК 3218837. PMID 21722353.
дальнейшее чтение
- Ли Й, Сонг А.Дж., Бейкер Р. и др. (2000). «Джумонджи, ядерный белок, необходимый для нормального развития сердца». Circ. Res. 86 (9): 932–8. Дои:10.1161 / 01.res.86.9.932. PMID 10807864.
- Тойода М., Кодзима М., Такеучи Т. (2000). «Джумонджи - это ядерный белок, который участвует в негативной регуляции роста клеток». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 274 (2): 332–6. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3138. PMID 10913339.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID 14574404.
- Волчик К.А., Чжу Х., Финнелл Р.Х. и др. (2004). «Оценка гена jumonji и риска расщелины позвоночника и врожденных пороков сердца». Являюсь. J. Med. Genet. А. 126 (2): 215–7. Дои:10.1002 / ajmg.a.20574. PMID 15057990. S2CID 221248186.
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
- Ким Т.Г., Чен Дж., Садошима Дж., Ли Й. (2005). «Jumonji подавляет экспрессию гена предсердного натрийуретического фактора, подавляя транскрипционную активность сердечных факторов транскрипции». Мол. Клетка. Биол. 24 (23): 10151–60. Дои:10.1128 / MCB.24.23.10151-10160.2004. ЧВК 529025. PMID 15542826.
- Педроса Э., Йе К., Нолан К.А. и др. (2007). «Положительная ассоциация шизофрении с геном JARID2». Являюсь. J. Med. Genet. B Neuropsychiatr. Genet. 144 (1): 45–51. Дои:10.1002 / ajmg.b.30386. PMID 16967465. S2CID 25560999.
внешняя ссылка
- JARID2 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.
